MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella sp. MR-4 chromosome

Total Repeats: 71525

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16501	NC_008321	CAC	2	6	1083436	1083441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113969272
16502	NC_008321	CGA	2	6	1083526	1083531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969272
16503	NC_008321	TAT	2	6	1083532	1083537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113969272
16504	NC_008321	CTT	2	6	1083652	1083657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113969273
16505	NC_008321	CGG	2	6	1083802	1083807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969273
16506	NC_008321	ACG	2	6	1083870	1083875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969273
16507	NC_008321	GTG	2	6	1083892	1083897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969273
16508	NC_008321	AAT	2	6	1083902	1083907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113969273
16509	NC_008321	AAG	2	6	1083987	1083992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113969273
16510	NC_008321	CGC	2	6	1084015	1084020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969273
16511	NC_008321	TAA	2	6	1084073	1084078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113969273
16512	NC_008321	GCA	2	6	1084117	1084122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969273
16513	NC_008321	ATA	2	6	1084361	1084366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113969273
16514	NC_008321	GCA	2	6	1084429	1084434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969273
16515	NC_008321	GGT	2	6	1084511	1084516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969273
16516	NC_008321	GCCA	2	8	1084524	1084531	25 %	0 %	25 %	50 %	113969273
16517	NC_008321	TTTCAA	2	12	1084546	1084557	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	113969273
16518	NC_008321	CTG	2	6	1084602	1084607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969273
16519	NC_008321	GGC	2	6	1084706	1084711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969273
16520	NC_008321	GCG	2	6	1084770	1084775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969273
16521	NC_008321	GCA	3	9	1084873	1084881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969273
16522	NC_008321	GAT	2	6	1084958	1084963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969273
16523	NC_008321	ATA	2	6	1084970	1084975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113969273
16524	NC_008321	GCT	2	6	1084979	1084984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969273
16525	NC_008321	GCC	2	6	1084995	1085000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969273
16526	NC_008321	CGC	2	6	1085012	1085017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969273
16527	NC_008321	TCA	2	6	1085085	1085090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969273
16528	NC_008321	GCC	2	6	1085121	1085126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969273
16529	NC_008321	TAAGGC	2	12	1085132	1085143	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	113969273
16530	NC_008321	AGC	2	6	1085145	1085150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969273
16531	NC_008321	GCC	2	6	1085163	1085168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969273
16532	NC_008321	TAA	2	6	1085246	1085251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113969273
16533	NC_008321	GC	3	6	1085265	1085270	0 %	0 %	50 %	50 %	113969273
16534	NC_008321	GGC	2	6	1085366	1085371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969273
16535	NC_008321	TAA	2	6	1085399	1085404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113969273
16536	NC_008321	CAG	2	6	1085534	1085539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969273
16537	NC_008321	TGAG	2	8	1085569	1085576	25 %	25 %	50 %	0 %	113969273
16538	NC_008321	GCC	2	6	1085657	1085662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969273
16539	NC_008321	CAG	2	6	1085741	1085746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969273
16540	NC_008321	AGC	2	6	1085841	1085846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969273
16541	NC_008321	GCC	2	6	1085864	1085869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969273
16542	NC_008321	AGC	2	6	1085943	1085948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969273
16543	NC_008321	GCCC	2	8	1086062	1086069	0 %	0 %	25 %	75 %	113969273
16544	NC_008321	T	6	6	1086070	1086075	0 %	100 %	0 %	0 %	113969273
16545	NC_008321	CCCG	2	8	1086089	1086096	0 %	0 %	25 %	75 %	113969273
16546	NC_008321	AAT	2	6	1086098	1086103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113969273
16547	NC_008321	CAG	2	6	1086125	1086130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969273
16548	NC_008321	TGAT	2	8	1086156	1086163	25 %	50 %	25 %	0 %	113969273
16549	NC_008321	TGA	2	6	1086202	1086207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969273
16550	NC_008321	ATG	2	6	1086306	1086311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969273
16551	NC_008321	ATA	2	6	1086328	1086333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113969273
16552	NC_008321	ATC	2	6	1086410	1086415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969273
16553	NC_008321	CTG	2	6	1086416	1086421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969273
16554	NC_008321	TTC	2	6	1086533	1086538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113969273
16555	NC_008321	TGC	2	6	1086543	1086548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969273
16556	NC_008321	AATC	2	8	1086568	1086575	50 %	25 %	0 %	25 %	113969273
16557	NC_008321	GTG	2	6	1086621	1086626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969273
16558	NC_008321	TGC	2	6	1086642	1086647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969273
16559	NC_008321	GGC	2	6	1086697	1086702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969273
16560	NC_008321	TGC	2	6	1086714	1086719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969273
16561	NC_008321	TGC	2	6	1086726	1086731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969273
16562	NC_008321	AGT	2	6	1087038	1087043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969274
16563	NC_008321	TAAA	2	8	1087052	1087059	75 %	25 %	0 %	0 %	113969274
16564	NC_008321	GCC	2	6	1087113	1087118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969274
16565	NC_008321	CG	3	6	1087135	1087140	0 %	0 %	50 %	50 %	113969274
16566	NC_008321	TCGCC	2	10	1087175	1087184	0 %	20 %	20 %	60 %	113969274
16567	NC_008321	ATC	2	6	1087251	1087256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969274
16568	NC_008321	GTTG	2	8	1087286	1087293	0 %	50 %	50 %	0 %	113969274
16569	NC_008321	ATC	2	6	1087335	1087340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969274
16570	NC_008321	GGC	2	6	1087374	1087379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969274
16571	NC_008321	GAGG	2	8	1087439	1087446	25 %	0 %	75 %	0 %	113969274
16572	NC_008321	TGCG	2	8	1087460	1087467	0 %	25 %	50 %	25 %	113969274
16573	NC_008321	GGC	2	6	1087485	1087490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969274
16574	NC_008321	TGA	2	6	1087589	1087594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969274
16575	NC_008321	TTC	2	6	1087603	1087608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113969274
16576	NC_008321	TTGA	2	8	1087669	1087676	25 %	50 %	25 %	0 %	113969274
16577	NC_008321	ACCA	2	8	1087689	1087696	50 %	0 %	0 %	50 %	113969274
16578	NC_008321	TGG	2	6	1087741	1087746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969274
16579	NC_008321	AAGT	2	8	1087750	1087757	50 %	25 %	25 %	0 %	113969274
16580	NC_008321	TCA	2	6	1087775	1087780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969274
16581	NC_008321	GAT	2	6	1087859	1087864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969274
16582	NC_008321	A	6	6	1087879	1087884	100 %	0 %	0 %	0 %	113969274
16583	NC_008321	GTC	2	6	1088119	1088124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969274
16584	NC_008321	GCT	2	6	1088349	1088354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969275
16585	NC_008321	GCC	2	6	1088399	1088404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969275
16586	NC_008321	ATT	2	6	1088422	1088427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113969275
16587	NC_008321	GCA	2	6	1088438	1088443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969275
16588	NC_008321	AGG	2	6	1088458	1088463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113969275
16589	NC_008321	ACT	2	6	1088560	1088565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969275
16590	NC_008321	TATT	2	8	1088578	1088585	25 %	75 %	0 %	0 %	113969275
16591	NC_008321	GCA	2	6	1088653	1088658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969275
16592	NC_008321	GAT	2	6	1088715	1088720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969275
16593	NC_008321	TAAACA	2	12	1088789	1088800	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	113969275
16594	NC_008321	CAG	2	6	1088801	1088806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969275
16595	NC_008321	GTG	2	6	1088833	1088838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969275
16596	NC_008321	GCA	2	6	1088864	1088869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969275
16597	NC_008321	ATTG	2	8	1088939	1088946	25 %	50 %	25 %	0 %	113969275
16598	NC_008321	AAG	2	6	1089143	1089148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113969276
16599	NC_008321	GTC	2	6	1089245	1089250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969276
16600	NC_008321	TGA	2	6	1089253	1089258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969276
16601	NC_008321	TGCA	2	8	1089333	1089340	25 %	25 %	25 %	25 %	113969276
16602	NC_008321	TTGC	2	8	1089643	1089650	0 %	50 %	25 %	25 %	113969277
16603	NC_008321	GGTG	2	8	1089670	1089677	0 %	25 %	75 %	0 %	113969277
16604	NC_008321	GACTC	2	10	1089727	1089736	20 %	20 %	20 %	40 %	113969277
16605	NC_008321	CGC	2	6	1089942	1089947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969277
16606	NC_008321	TAT	2	6	1089952	1089957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113969277
16607	NC_008321	T	7	7	1089985	1089991	0 %	100 %	0 %	0 %	113969277
16608	NC_008321	GGCT	2	8	1090030	1090037	0 %	25 %	50 %	25 %	113969277
16609	NC_008321	TGG	2	6	1090044	1090049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969277
16610	NC_008321	GGA	2	6	1090065	1090070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113969277
16611	NC_008321	TAT	2	6	1090089	1090094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113969277
16612	NC_008321	GGC	2	6	1090129	1090134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969277
16613	NC_008321	TAA	2	6	1090140	1090145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113969277
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16615	NC_008321	GCG	2	6	1090291	1090296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969277
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16732	NC_008321	ATG	2	6	1097707	1097712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969283
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16964	NC_008321	GCGG	2	8	1113953	1113960	0 %	0 %	75 %	25 %	113969295
16965	NC_008321	ATG	2	6	1114085	1114090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969295
16966	NC_008321	TGTGGT	2	12	1114138	1114149	0 %	50 %	50 %	0 %	113969295
16967	NC_008321	GT	3	6	1114148	1114153	0 %	50 %	50 %	0 %	113969295
16968	NC_008321	ATT	2	6	1114202	1114207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113969295
16969	NC_008321	TCA	2	6	1114218	1114223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969295
16970	NC_008321	ATTT	2	8	1114294	1114301	25 %	75 %	0 %	0 %	113969295
16971	NC_008321	AAT	2	6	1114482	1114487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113969296
16972	NC_008321	CGC	2	6	1114510	1114515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969296
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16974	NC_008321	TAT	2	6	1114634	1114639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113969296
16975	NC_008321	GCC	2	6	1114657	1114662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969296
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16977	NC_008321	TTA	2	6	1114717	1114722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113969296
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16979	NC_008321	AG	3	6	1114828	1114833	50 %	0 %	50 %	0 %	113969296
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16983	NC_008321	CTG	2	6	1114969	1114974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969296
16984	NC_008321	TG	3	6	1114973	1114978	0 %	50 %	50 %	0 %	113969296
16985	NC_008321	TTG	2	6	1114996	1115001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113969296
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16987	NC_008321	GGT	2	6	1115104	1115109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969296
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16989	NC_008321	TCA	2	6	1115205	1115210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969296
16990	NC_008321	A	6	6	1115224	1115229	100 %	0 %	0 %	0 %	113969296
16991	NC_008321	GTC	2	6	1115230	1115235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969296
16992	NC_008321	AG	3	6	1115283	1115288	50 %	0 %	50 %	0 %	113969296
16993	NC_008321	CGC	2	6	1115316	1115321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969296
16994	NC_008321	CT	3	6	1115386	1115391	0 %	50 %	0 %	50 %	113969296
16995	NC_008321	ATT	2	6	1115398	1115403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113969296
16996	NC_008321	GTG	2	6	1115426	1115431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969296
16997	NC_008321	CGA	2	6	1115529	1115534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969296
16998	NC_008321	GTC	2	6	1115593	1115598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969296
16999	NC_008321	ACA	2	6	1115646	1115651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113969297
17000	NC_008321	ATG	2	6	1115816	1115821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969297

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