MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella sp. MR-4 chromosome

Total Repeats: 71525

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_008321	TAA	2	6	1047454	1047459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113969240
16002	NC_008321	TTA	2	6	1047468	1047473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113969240
16003	NC_008321	AGTA	2	8	1047693	1047700	50 %	25 %	25 %	0 %	113969241
16004	NC_008321	CGG	2	6	1047744	1047749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969241
16005	NC_008321	TG	3	6	1047757	1047762	0 %	50 %	50 %	0 %	113969241
16006	NC_008321	AT	3	6	1047780	1047785	50 %	50 %	0 %	0 %	113969241
16007	NC_008321	TGG	2	6	1047792	1047797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969241
16008	NC_008321	TGG	2	6	1047804	1047809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969241
16009	NC_008321	CGG	2	6	1047822	1047827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969241
16010	NC_008321	GGCCGT	2	12	1047916	1047927	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	113969241
16011	NC_008321	GATTT	2	10	1047952	1047961	20 %	60 %	20 %	0 %	113969241
16012	NC_008321	TGA	3	9	1047990	1047998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969241
16013	NC_008321	ACC	2	6	1048024	1048029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113969241
16014	NC_008321	GCT	2	6	1048164	1048169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969241
16015	NC_008321	GTT	2	6	1048170	1048175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113969241
16016	NC_008321	CG	3	6	1048228	1048233	0 %	0 %	50 %	50 %	113969241
16017	NC_008321	ACG	2	6	1048273	1048278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969241
16018	NC_008321	ACCTA	2	10	1048284	1048293	40 %	20 %	0 %	40 %	113969241
16019	NC_008321	ATC	2	6	1048429	1048434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969241
16020	NC_008321	TCG	2	6	1048484	1048489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969241
16021	NC_008321	GCAA	2	8	1048519	1048526	50 %	0 %	25 %	25 %	113969241
16022	NC_008321	CTG	2	6	1048558	1048563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969241
16023	NC_008321	GCT	2	6	1048680	1048685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969241
16024	NC_008321	TCC	2	6	1048704	1048709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113969241
16025	NC_008321	ATC	2	6	1048763	1048768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969241
16026	NC_008321	CAAT	2	8	1048784	1048791	50 %	25 %	0 %	25 %	113969241
16027	NC_008321	TGA	3	9	1048824	1048832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969241
16028	NC_008321	ATA	2	6	1048863	1048868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113969241
16029	NC_008321	GAA	2	6	1048984	1048989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113969242
16030	NC_008321	CAGC	2	8	1048992	1048999	25 %	0 %	25 %	50 %	113969242
16031	NC_008321	ACG	3	9	1049092	1049100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969242
16032	NC_008321	TGTT	2	8	1049158	1049165	0 %	75 %	25 %	0 %	113969242
16033	NC_008321	CCG	2	6	1049236	1049241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969242
16034	NC_008321	TGA	2	6	1049255	1049260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969242
16035	NC_008321	T	6	6	1049326	1049331	0 %	100 %	0 %	0 %	113969242
16036	NC_008321	GGC	2	6	1049472	1049477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969242
16037	NC_008321	GGC	2	6	1049481	1049486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969242
16038	NC_008321	GT	3	6	1049489	1049494	0 %	50 %	50 %	0 %	113969242
16039	NC_008321	GAT	2	6	1049517	1049522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969242
16040	NC_008321	G	6	6	1049638	1049643	0 %	0 %	100 %	0 %	113969242
16041	NC_008321	GC	3	6	1049758	1049763	0 %	0 %	50 %	50 %	113969243
16042	NC_008321	CACG	2	8	1049788	1049795	25 %	0 %	25 %	50 %	113969243
16043	NC_008321	TGC	2	6	1049800	1049805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969243
16044	NC_008321	TGC	2	6	1049837	1049842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969243
16045	NC_008321	ACTATC	2	12	1049859	1049870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969243
16046	NC_008321	CGC	2	6	1049893	1049898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969243
16047	NC_008321	GAT	2	6	1049930	1049935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969243
16048	NC_008321	GTCA	2	8	1049997	1050004	25 %	25 %	25 %	25 %	113969243
16049	NC_008321	GCCTT	2	10	1050073	1050082	0 %	40 %	20 %	40 %	113969243
16050	NC_008321	CTG	2	6	1050090	1050095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969243
16051	NC_008321	ACA	2	6	1050200	1050205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113969244
16052	NC_008321	TG	3	6	1050373	1050378	0 %	50 %	50 %	0 %	113969244
16053	NC_008321	GGC	2	6	1050402	1050407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969244
16054	NC_008321	GGT	2	6	1050436	1050441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969244
16055	NC_008321	ATT	2	6	1050459	1050464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113969244
16056	NC_008321	AC	3	6	1050476	1050481	50 %	0 %	0 %	50 %	113969244
16057	NC_008321	T	6	6	1050522	1050527	0 %	100 %	0 %	0 %	113969244
16058	NC_008321	A	7	7	1050618	1050624	100 %	0 %	0 %	0 %	113969244
16059	NC_008321	A	6	6	1050974	1050979	100 %	0 %	0 %	0 %	113969245
16060	NC_008321	AAAG	2	8	1050983	1050990	75 %	0 %	25 %	0 %	113969245
16061	NC_008321	TTG	2	6	1051043	1051048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113969245
16062	NC_008321	CGAATG	2	12	1051065	1051076	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	113969245
16063	NC_008321	GCT	3	9	1051220	1051228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969245
16064	NC_008321	GAA	2	6	1051235	1051240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113969245
16065	NC_008321	ATC	2	6	1051246	1051251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969245
16066	NC_008321	GCA	2	6	1051663	1051668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969246
16067	NC_008321	CAT	2	6	1051688	1051693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969246
16068	NC_008321	GACT	2	8	1051708	1051715	25 %	25 %	25 %	25 %	113969246
16069	NC_008321	TGC	2	6	1051791	1051796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969246
16070	NC_008321	GCA	2	6	1051820	1051825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969246
16071	NC_008321	TTG	2	6	1051836	1051841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113969246
16072	NC_008321	GC	4	8	1051927	1051934	0 %	0 %	50 %	50 %	113969246
16073	NC_008321	CAG	2	6	1051959	1051964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969246
16074	NC_008321	TTG	2	6	1052035	1052040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113969246
16075	NC_008321	CTT	2	6	1052126	1052131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113969246
16076	NC_008321	TCG	2	6	1052161	1052166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969246
16077	NC_008321	TTG	2	6	1052181	1052186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113969246
16078	NC_008321	GTCGCA	2	12	1052209	1052220	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	113969246
16079	NC_008321	CGT	2	6	1052256	1052261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969246
16080	NC_008321	CTG	2	6	1052291	1052296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969246
16081	NC_008321	CAG	2	6	1052297	1052302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969246
16082	NC_008321	CGA	2	6	1052330	1052335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969246
16083	NC_008321	ATC	2	6	1052406	1052411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969246
16084	NC_008321	TGA	3	9	1052504	1052512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969246
16085	NC_008321	CGG	2	6	1052513	1052518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969246
16086	NC_008321	TGG	2	6	1052579	1052584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969246
16087	NC_008321	TTA	2	6	1052617	1052622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113969246
16088	NC_008321	ATG	2	6	1052668	1052673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969246
16089	NC_008321	GCC	3	9	1052686	1052694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969246
16090	NC_008321	AGC	2	6	1052749	1052754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969246
16091	NC_008321	T	6	6	1052763	1052768	0 %	100 %	0 %	0 %	113969246
16092	NC_008321	TGG	2	6	1052930	1052935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969246
16093	NC_008321	TGA	2	6	1052936	1052941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969246
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16095	NC_008321	CAT	2	6	1053047	1053052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969246
16096	NC_008321	CGG	2	6	1053053	1053058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969246
16097	NC_008321	TGT	2	6	1053331	1053336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113969246
16098	NC_008321	GTG	2	6	1053361	1053366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969246
16099	NC_008321	CAT	2	6	1053396	1053401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969246
16100	NC_008321	AAC	2	6	1053451	1053456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113969246
16101	NC_008321	AAC	2	6	1053471	1053476	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113969246
16102	NC_008321	T	6	6	1053622	1053627	0 %	100 %	0 %	0 %	113969247
16103	NC_008321	T	7	7	1053631	1053637	0 %	100 %	0 %	0 %	113969247
16104	NC_008321	T	6	6	1053644	1053649	0 %	100 %	0 %	0 %	113969247
16105	NC_008321	GCC	2	6	1053745	1053750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969247
16106	NC_008321	ATT	2	6	1053822	1053827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113969247
16107	NC_008321	TGG	2	6	1054065	1054070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969247
16108	NC_008321	ATG	2	6	1054087	1054092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969247
16109	NC_008321	TGC	2	6	1054126	1054131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969247
16110	NC_008321	GCG	2	6	1054175	1054180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969247
16111	NC_008321	GAGC	2	8	1054223	1054230	25 %	0 %	50 %	25 %	113969247
16112	NC_008321	CAA	2	6	1054421	1054426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113969247
16113	NC_008321	AAT	2	6	1054427	1054432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113969247
16114	NC_008321	TAA	2	6	1054467	1054472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113969248
16115	NC_008321	TCG	2	6	1054502	1054507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969248
16116	NC_008321	ACCAT	2	10	1054534	1054543	40 %	20 %	0 %	40 %	113969248
16117	NC_008321	CATA	2	8	1054550	1054557	50 %	25 %	0 %	25 %	113969248
16118	NC_008321	G	6	6	1054611	1054616	0 %	0 %	100 %	0 %	113969248
16119	NC_008321	CGA	2	6	1054634	1054639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969248
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16121	NC_008321	GGC	2	6	1054710	1054715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969248
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16123	NC_008321	TGC	2	6	1054841	1054846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969248
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16125	NC_008321	CTTG	2	8	1055013	1055020	0 %	50 %	25 %	25 %	113969249
16126	NC_008321	TTA	2	6	1055024	1055029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113969249
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16130	NC_008321	TTG	2	6	1055243	1055248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113969249
16131	NC_008321	GCA	2	6	1055268	1055273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969249
16132	NC_008321	CTT	2	6	1055277	1055282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113969249
16133	NC_008321	GCA	2	6	1055286	1055291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969249
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16140	NC_008321	CGG	2	6	1055966	1055971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969250
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16144	NC_008321	TTC	2	6	1056042	1056047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113969250
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16171	NC_008321	CTGCAA	2	12	1057764	1057775	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	113969251
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16217	NC_008321	ATG	2	6	1061115	1061120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969253
16218	NC_008321	AG	3	6	1061167	1061172	50 %	0 %	50 %	0 %	113969253
16219	NC_008321	TGG	2	6	1061235	1061240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969253
16220	NC_008321	TGAT	2	8	1061325	1061332	25 %	50 %	25 %	0 %	113969253
16221	NC_008321	GCA	3	9	1061431	1061439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969253
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16223	NC_008321	GGC	2	6	1061539	1061544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969253
16224	NC_008321	CAG	2	6	1061720	1061725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969253
16225	NC_008321	CTGA	2	8	1062022	1062029	25 %	25 %	25 %	25 %	113969254
16226	NC_008321	CGA	2	6	1062089	1062094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969254
16227	NC_008321	TGGT	2	8	1062130	1062137	0 %	50 %	50 %	0 %	113969254
16228	NC_008321	CAT	2	6	1062245	1062250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969254
16229	NC_008321	GAT	2	6	1062268	1062273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969254
16230	NC_008321	TGC	2	6	1062293	1062298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969254
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16232	NC_008321	GGT	2	6	1062623	1062628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969255
16233	NC_008321	T	6	6	1062680	1062685	0 %	100 %	0 %	0 %	113969255
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