MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella sp. MR-4 chromosome

Total Repeats: 71525

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15502	NC_008321	GTG	2	6	1016700	1016705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969208
15503	NC_008321	TGG	2	6	1016725	1016730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969208
15504	NC_008321	CTT	2	6	1016744	1016749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113969208
15505	NC_008321	GCGCC	2	10	1016822	1016831	0 %	0 %	40 %	60 %	113969208
15506	NC_008321	GCCA	2	8	1016838	1016845	25 %	0 %	25 %	50 %	113969208
15507	NC_008321	TGG	2	6	1016869	1016874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969208
15508	NC_008321	ATT	2	6	1016891	1016896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113969208
15509	NC_008321	CGG	2	6	1016897	1016902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969208
15510	NC_008321	TGC	2	6	1016938	1016943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969208
15511	NC_008321	GAA	2	6	1016948	1016953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113969208
15512	NC_008321	GGC	2	6	1017026	1017031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969208
15513	NC_008321	TGG	2	6	1017034	1017039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969208
15514	NC_008321	GT	4	8	1017061	1017068	0 %	50 %	50 %	0 %	113969208
15515	NC_008321	AAT	2	6	1017100	1017105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113969208
15516	NC_008321	TTA	2	6	1017146	1017151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113969209
15517	NC_008321	TTG	2	6	1017170	1017175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113969209
15518	NC_008321	TTA	2	6	1017179	1017184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113969209
15519	NC_008321	TCG	2	6	1017207	1017212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969209
15520	NC_008321	ATC	2	6	1017227	1017232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969209
15521	NC_008321	TTG	2	6	1017270	1017275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113969209
15522	NC_008321	ATC	2	6	1017356	1017361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969209
15523	NC_008321	CACC	2	8	1017390	1017397	25 %	0 %	0 %	75 %	113969209
15524	NC_008321	GC	3	6	1017457	1017462	0 %	0 %	50 %	50 %	113969209
15525	NC_008321	TGA	2	6	1017496	1017501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969209
15526	NC_008321	TCA	2	6	1017507	1017512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969209
15527	NC_008321	CAC	2	6	1017565	1017570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113969209
15528	NC_008321	TGG	2	6	1017586	1017591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969209
15529	NC_008321	GAT	2	6	1017595	1017600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969209
15530	NC_008321	TA	3	6	1017660	1017665	50 %	50 %	0 %	0 %	113969209
15531	NC_008321	AAG	2	6	1017828	1017833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113969209
15532	NC_008321	CTG	2	6	1017845	1017850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969209
15533	NC_008321	CGT	2	6	1017902	1017907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969209
15534	NC_008321	ATG	2	6	1017953	1017958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969209
15535	NC_008321	GTG	2	6	1017959	1017964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969209
15536	NC_008321	CTG	3	9	1017968	1017976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969209
15537	NC_008321	CGC	2	6	1018046	1018051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969209
15538	NC_008321	A	6	6	1018064	1018069	100 %	0 %	0 %	0 %	113969209
15539	NC_008321	TCTGC	2	10	1018105	1018114	0 %	40 %	20 %	40 %	113969209
15540	NC_008321	CGG	2	6	1018120	1018125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969209
15541	NC_008321	TGA	2	6	1018167	1018172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969209
15542	NC_008321	GTT	2	6	1018228	1018233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113969209
15543	NC_008321	ACC	2	6	1018241	1018246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113969209
15544	NC_008321	CGA	2	6	1018432	1018437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969210
15545	NC_008321	TAC	2	6	1018585	1018590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969210
15546	NC_008321	GAA	2	6	1018598	1018603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113969210
15547	NC_008321	GGC	2	6	1018605	1018610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969210
15548	NC_008321	TGA	2	6	1018659	1018664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969210
15549	NC_008321	AGTT	2	8	1018695	1018702	25 %	50 %	25 %	0 %	113969210
15550	NC_008321	GGCG	2	8	1018705	1018712	0 %	0 %	75 %	25 %	113969210
15551	NC_008321	CCG	2	6	1018713	1018718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969210
15552	NC_008321	GAT	2	6	1018739	1018744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969210
15553	NC_008321	TAATT	2	10	1018768	1018777	40 %	60 %	0 %	0 %	113969210
15554	NC_008321	CAG	2	6	1018805	1018810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969210
15555	NC_008321	GTG	2	6	1018881	1018886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969210
15556	NC_008321	GC	3	6	1018922	1018927	0 %	0 %	50 %	50 %	113969210
15557	NC_008321	ATT	2	6	1018988	1018993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113969210
15558	NC_008321	A	6	6	1019011	1019016	100 %	0 %	0 %	0 %	113969210
15559	NC_008321	GGC	2	6	1019147	1019152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969210
15560	NC_008321	TGC	2	6	1019205	1019210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969210
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15564	NC_008321	GCA	2	6	1019473	1019478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969210
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15570	NC_008321	AG	3	6	1019716	1019721	50 %	0 %	50 %	0 %	113969210
15571	NC_008321	GC	3	6	1019789	1019794	0 %	0 %	50 %	50 %	113969210
15572	NC_008321	CGC	2	6	1019834	1019839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969210
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15574	NC_008321	GT	3	6	1019960	1019965	0 %	50 %	50 %	0 %	113969211
15575	NC_008321	CT	3	6	1020006	1020011	0 %	50 %	0 %	50 %	113969211
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15584	NC_008321	TGC	2	6	1020389	1020394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969211
15585	NC_008321	GC	3	6	1020410	1020415	0 %	0 %	50 %	50 %	113969211
15586	NC_008321	GGTT	2	8	1020468	1020475	0 %	50 %	50 %	0 %	113969211
15587	NC_008321	ATT	2	6	1020552	1020557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113969211
15588	NC_008321	CGG	2	6	1020566	1020571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969211
15589	NC_008321	AT	3	6	1020594	1020599	50 %	50 %	0 %	0 %	113969211
15590	NC_008321	CTG	3	9	1020613	1020621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969211
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15599	NC_008321	AAT	2	6	1020982	1020987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113969211
15600	NC_008321	AG	3	6	1021080	1021085	50 %	0 %	50 %	0 %	113969211
15601	NC_008321	CGAA	2	8	1021087	1021094	50 %	0 %	25 %	25 %	113969211
15602	NC_008321	GC	3	6	1021123	1021128	0 %	0 %	50 %	50 %	113969211
15603	NC_008321	GCA	2	6	1021170	1021175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969211
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15607	NC_008321	GGGC	2	8	1021361	1021368	0 %	0 %	75 %	25 %	113969211
15608	NC_008321	GCA	2	6	1021511	1021516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969211
15609	NC_008321	GCAT	2	8	1021520	1021527	25 %	25 %	25 %	25 %	113969211
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15611	NC_008321	A	6	6	1021819	1021824	100 %	0 %	0 %	0 %	113969212
15612	NC_008321	GTT	2	6	1021828	1021833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113969212
15613	NC_008321	TG	3	6	1021874	1021879	0 %	50 %	50 %	0 %	113969212
15614	NC_008321	GAT	2	6	1021886	1021891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969212
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15616	NC_008321	AAC	2	6	1022200	1022205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113969212
15617	NC_008321	GAC	2	6	1022207	1022212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969212
15618	NC_008321	GCATG	2	10	1022266	1022275	20 %	20 %	40 %	20 %	113969213
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15620	NC_008321	CGG	2	6	1022324	1022329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969213
15621	NC_008321	CTG	2	6	1022352	1022357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969213
15622	NC_008321	CAT	2	6	1022444	1022449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969213
15623	NC_008321	CGTGG	2	10	1022463	1022472	0 %	20 %	60 %	20 %	113969213
15624	NC_008321	CACTGG	2	12	1022534	1022545	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	113969213
15625	NC_008321	TGC	2	6	1022652	1022657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969214
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15627	NC_008321	TGA	2	6	1022736	1022741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969214
15628	NC_008321	CTCGA	2	10	1022897	1022906	20 %	20 %	20 %	40 %	113969214
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15631	NC_008321	CGG	2	6	1023070	1023075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969214
15632	NC_008321	CTAT	2	8	1023135	1023142	25 %	50 %	0 %	25 %	113969214
15633	NC_008321	GC	3	6	1023145	1023150	0 %	0 %	50 %	50 %	113969214
15634	NC_008321	TGA	2	6	1023174	1023179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969214
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15636	NC_008321	TGC	2	6	1023309	1023314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969214
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15732	NC_008321	ATT	2	6	1029569	1029574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113969223
15733	NC_008321	CAT	2	6	1029614	1029619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969223
15734	NC_008321	GGC	2	6	1029658	1029663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969223
15735	NC_008321	GC	3	6	1029712	1029717	0 %	0 %	50 %	50 %	113969223
15736	NC_008321	GAA	2	6	1029731	1029736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113969223
15737	NC_008321	GC	3	6	1029819	1029824	0 %	0 %	50 %	50 %	113969223
15738	NC_008321	CGA	2	6	1029972	1029977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969223
15739	NC_008321	TTACC	2	10	1030032	1030041	20 %	40 %	0 %	40 %	113969223
15740	NC_008321	CG	3	6	1030112	1030117	0 %	0 %	50 %	50 %	113969223
15741	NC_008321	GGC	2	6	1030193	1030198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969223
15742	NC_008321	ATT	3	9	1030324	1030332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113969223
15743	NC_008321	GGC	2	6	1030454	1030459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969223
15744	NC_008321	GGC	2	6	1030480	1030485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969223
15745	NC_008321	TGG	2	6	1030506	1030511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969223
15746	NC_008321	ACA	2	6	1030573	1030578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113969223
15747	NC_008321	T	6	6	1030856	1030861	0 %	100 %	0 %	0 %	113969224
15748	NC_008321	TGC	2	6	1030959	1030964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969224
15749	NC_008321	ATA	2	6	1031013	1031018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113969224
15750	NC_008321	TACGT	2	10	1031179	1031188	20 %	40 %	20 %	20 %	113969224
15751	NC_008321	GAG	2	6	1031239	1031244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113969225
15752	NC_008321	CATC	2	8	1031313	1031320	25 %	25 %	0 %	50 %	113969225
15753	NC_008321	TCG	2	6	1031321	1031326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969225
15754	NC_008321	TTG	2	6	1031338	1031343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113969225
15755	NC_008321	GTT	3	9	1031358	1031366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113969225
15756	NC_008321	T	6	6	1031407	1031412	0 %	100 %	0 %	0 %	113969225
15757	NC_008321	TCA	2	6	1031684	1031689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969226
15758	NC_008321	C	6	6	1031747	1031752	0 %	0 %	0 %	100 %	113969226
15759	NC_008321	GGT	2	6	1031818	1031823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969226
15760	NC_008321	TGG	2	6	1031892	1031897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969226
15761	NC_008321	TTA	2	6	1031907	1031912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113969226
15762	NC_008321	ATT	2	6	1031939	1031944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113969226
15763	NC_008321	TTG	2	6	1031945	1031950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113969226
15764	NC_008321	CTG	2	6	1031954	1031959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969226
15765	NC_008321	AGTG	2	8	1031968	1031975	25 %	25 %	50 %	0 %	113969226
15766	NC_008321	TGA	2	6	1032003	1032008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969226
15767	NC_008321	CTG	2	6	1032062	1032067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969226
15768	NC_008321	GGTGA	2	10	1032104	1032113	20 %	20 %	60 %	0 %	113969226
15769	NC_008321	CCG	2	6	1032126	1032131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969226
15770	NC_008321	CTG	2	6	1032140	1032145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969226
15771	NC_008321	TC	3	6	1032166	1032171	0 %	50 %	0 %	50 %	113969226
15772	NC_008321	GCGCT	2	10	1032176	1032185	0 %	20 %	40 %	40 %	113969226
15773	NC_008321	GAT	2	6	1032214	1032219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969226
15774	NC_008321	GCT	2	6	1032244	1032249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969226
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15776	NC_008321	TGA	2	6	1032450	1032455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969226
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15778	NC_008321	TCC	2	6	1032497	1032502	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113969226
15779	NC_008321	CGC	2	6	1032520	1032525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969226
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15782	NC_008321	TGG	2	6	1032618	1032623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969226
15783	NC_008321	GCC	2	6	1032680	1032685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969226
15784	NC_008321	CTGC	2	8	1032749	1032756	0 %	25 %	25 %	50 %	113969226
15785	NC_008321	CTGCAA	2	12	1032773	1032784	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	113969226
15786	NC_008321	TGA	2	6	1032840	1032845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969226
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15789	NC_008321	GCA	2	6	1032942	1032947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969226
15790	NC_008321	CTA	2	6	1033038	1033043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969226
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15793	NC_008321	GCG	2	6	1033176	1033181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969226
15794	NC_008321	GGT	2	6	1033193	1033198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969226
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15798	NC_008321	TGA	2	6	1033323	1033328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969226
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15800	NC_008321	TCG	2	6	1033413	1033418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969226
15801	NC_008321	GCT	2	6	1033483	1033488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969226
15802	NC_008321	TCAA	2	8	1033691	1033698	50 %	25 %	0 %	25 %	113969227
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15804	NC_008321	ACCA	2	8	1033834	1033841	50 %	0 %	0 %	50 %	113969227
15805	NC_008321	TGGC	2	8	1033865	1033872	0 %	25 %	50 %	25 %	113969227
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15808	NC_008321	TGC	2	6	1034255	1034260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969227
15809	NC_008321	ACC	2	6	1034293	1034298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113969227
15810	NC_008321	TTAA	2	8	1034417	1034424	50 %	50 %	0 %	0 %	113969227
15811	NC_008321	ACC	2	6	1034464	1034469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113969227
15812	NC_008321	TGT	2	6	1034641	1034646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113969227
15813	NC_008321	ACC	2	6	1034647	1034652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113969227
15814	NC_008321	ACT	2	6	1034834	1034839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969227
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15817	NC_008321	CCCG	2	8	1034957	1034964	0 %	0 %	25 %	75 %	113969227
15818	NC_008321	GGC	2	6	1034977	1034982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969227
15819	NC_008321	CGATC	2	10	1035018	1035027	20 %	20 %	20 %	40 %	113969227
15820	NC_008321	GCT	2	6	1035100	1035105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969227
15821	NC_008321	TGA	2	6	1035178	1035183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969227
15822	NC_008321	ATGCC	2	10	1035219	1035228	20 %	20 %	20 %	40 %	113969227
15823	NC_008321	T	6	6	1035552	1035557	0 %	100 %	0 %	0 %	113969228
15824	NC_008321	AAC	2	6	1035567	1035572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113969228
15825	NC_008321	T	6	6	1035585	1035590	0 %	100 %	0 %	0 %	113969228
15826	NC_008321	TTG	2	6	1035774	1035779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113969228
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15828	NC_008321	GGGC	2	8	1035878	1035885	0 %	0 %	75 %	25 %	113969228
15829	NC_008321	TGA	2	6	1035974	1035979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969228
15830	NC_008321	ACC	2	6	1036009	1036014	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113969228
15831	NC_008321	TAA	2	6	1036176	1036181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113969228
15832	NC_008321	TTC	2	6	1036209	1036214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113969228
15833	NC_008321	ATT	2	6	1036236	1036241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113969228
15834	NC_008321	TCA	2	6	1036296	1036301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969229
15835	NC_008321	CTGC	2	8	1036374	1036381	0 %	25 %	25 %	50 %	113969229
15836	NC_008321	TTGA	2	8	1036385	1036392	25 %	50 %	25 %	0 %	113969229
15837	NC_008321	TCA	2	6	1036424	1036429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969229
15838	NC_008321	TTC	2	6	1036435	1036440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113969229
15839	NC_008321	AAG	2	6	1036802	1036807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113969230
15840	NC_008321	GGTA	2	8	1037043	1037050	25 %	25 %	50 %	0 %	113969230
15841	NC_008321	TAT	2	6	1037061	1037066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113969230
15842	NC_008321	CGG	2	6	1037067	1037072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969230
15843	NC_008321	CTGT	2	8	1037089	1037096	0 %	50 %	25 %	25 %	113969230
15844	NC_008321	CAAC	2	8	1037151	1037158	50 %	0 %	0 %	50 %	113969230
15845	NC_008321	ATTC	2	8	1037229	1037236	25 %	50 %	0 %	25 %	113969230
15846	NC_008321	TTTG	2	8	1037259	1037266	0 %	75 %	25 %	0 %	113969230
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15848	NC_008321	CGC	2	6	1037445	1037450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969230
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