MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella sp. MR-4 chromosome

Total Repeats: 71525

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_008321	GTT	2	6	855831	855836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113969078
13002	NC_008321	ATC	2	6	855889	855894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969078
13003	NC_008321	TGA	2	6	855919	855924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969078
13004	NC_008321	GTA	3	9	855988	855996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969078
13005	NC_008321	GTG	2	6	855997	856002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969078
13006	NC_008321	AAT	2	6	856032	856037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113969078
13007	NC_008321	T	6	6	856055	856060	0 %	100 %	0 %	0 %	113969078
13008	NC_008321	TTG	2	6	856240	856245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113969079
13009	NC_008321	TCC	2	6	856301	856306	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113969079
13010	NC_008321	CAT	2	6	856416	856421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969080
13011	NC_008321	ATA	2	6	856456	856461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113969080
13012	NC_008321	ACC	2	6	856480	856485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113969080
13013	NC_008321	CCA	2	6	856505	856510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113969080
13014	NC_008321	GCTG	2	8	856545	856552	0 %	25 %	50 %	25 %	113969080
13015	NC_008321	GTA	2	6	856657	856662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969080
13016	NC_008321	GCGGT	2	10	856689	856698	0 %	20 %	60 %	20 %	113969080
13017	NC_008321	TTGA	2	8	856792	856799	25 %	50 %	25 %	0 %	113969080
13018	NC_008321	GCG	2	6	856887	856892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969080
13019	NC_008321	CTGCT	2	10	856905	856914	0 %	40 %	20 %	40 %	113969080
13020	NC_008321	GCTCT	2	10	856921	856930	0 %	40 %	20 %	40 %	113969080
13021	NC_008321	GCC	2	6	856963	856968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969080
13022	NC_008321	TAA	2	6	856987	856992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113969080
13023	NC_008321	GCA	2	6	857016	857021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969080
13024	NC_008321	GTC	2	6	857041	857046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969080
13025	NC_008321	GGCGA	2	10	857071	857080	20 %	0 %	60 %	20 %	113969080
13026	NC_008321	AGC	2	6	857094	857099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969080
13027	NC_008321	CTG	2	6	857118	857123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969080
13028	NC_008321	ATGA	2	8	857194	857201	50 %	25 %	25 %	0 %	113969080
13029	NC_008321	CTTG	2	8	857231	857238	0 %	50 %	25 %	25 %	113969080
13030	NC_008321	CCA	2	6	857353	857358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113969080
13031	NC_008321	CGG	2	6	857534	857539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969081
13032	NC_008321	GAA	2	6	857596	857601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113969081
13033	NC_008321	GTT	2	6	857628	857633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113969081
13034	NC_008321	GGC	2	6	857682	857687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969081
13035	NC_008321	ATCG	2	8	857718	857725	25 %	25 %	25 %	25 %	113969081
13036	NC_008321	ACT	2	6	857763	857768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969081
13037	NC_008321	CTG	3	9	857797	857805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969081
13038	NC_008321	ATT	2	6	857889	857894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113969081
13039	NC_008321	GGTT	2	8	858086	858093	0 %	50 %	50 %	0 %	113969082
13040	NC_008321	GGC	2	6	858167	858172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969082
13041	NC_008321	GGC	2	6	858178	858183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969082
13042	NC_008321	TCC	2	6	858242	858247	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113969082
13043	NC_008321	GGA	2	6	858262	858267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113969082
13044	NC_008321	GGC	2	6	858298	858303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969082
13045	NC_008321	CCG	2	6	858315	858320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969082
13046	NC_008321	GGC	2	6	858356	858361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969082
13047	NC_008321	ACC	2	6	858365	858370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113969082
13048	NC_008321	ACC	2	6	858380	858385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113969082
13049	NC_008321	AGCCTT	2	12	858406	858417	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	113969082
13050	NC_008321	GCA	2	6	858424	858429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969082
13051	NC_008321	AGC	2	6	858486	858491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969082
13052	NC_008321	AAT	2	6	858530	858535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113969082
13053	NC_008321	CAAG	2	8	858544	858551	50 %	0 %	25 %	25 %	113969082
13054	NC_008321	TTA	2	6	858582	858587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113969082
13055	NC_008321	GC	3	6	858696	858701	0 %	0 %	50 %	50 %	113969082
13056	NC_008321	AGGCGC	2	12	858765	858776	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	113969082
13057	NC_008321	GTCG	2	8	858799	858806	0 %	25 %	50 %	25 %	113969082
13058	NC_008321	TGA	2	6	858867	858872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969082
13059	NC_008321	CT	3	6	858938	858943	0 %	50 %	0 %	50 %	113969082
13060	NC_008321	GGC	2	6	858944	858949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969082
13061	NC_008321	ATCT	2	8	858991	858998	25 %	50 %	0 %	25 %	113969082
13062	NC_008321	TTTG	2	8	859010	859017	0 %	75 %	25 %	0 %	113969082
13063	NC_008321	GCC	2	6	859060	859065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969082
13064	NC_008321	GCCA	2	8	859109	859116	25 %	0 %	25 %	50 %	113969082
13065	NC_008321	ATC	2	6	859179	859184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969082
13066	NC_008321	GCG	2	6	859265	859270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969082
13067	NC_008321	CGG	2	6	859271	859276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969082
13068	NC_008321	CGG	2	6	859308	859313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969082
13069	NC_008321	TGC	2	6	859326	859331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969082
13070	NC_008321	GTC	2	6	859357	859362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969082
13071	NC_008321	AGG	2	6	859368	859373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113969082
13072	NC_008321	AG	3	6	859378	859383	50 %	0 %	50 %	0 %	113969082
13073	NC_008321	TCG	2	6	859419	859424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969082
13074	NC_008321	CT	3	6	859472	859477	0 %	50 %	0 %	50 %	113969082
13075	NC_008321	GTCA	2	8	859494	859501	25 %	25 %	25 %	25 %	113969082
13076	NC_008321	CG	3	6	859591	859596	0 %	0 %	50 %	50 %	113969082
13077	NC_008321	TGCA	2	8	859658	859665	25 %	25 %	25 %	25 %	113969083
13078	NC_008321	GGC	2	6	859685	859690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969083
13079	NC_008321	ATT	2	6	859743	859748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113969083
13080	NC_008321	A	6	6	859767	859772	100 %	0 %	0 %	0 %	113969083
13081	NC_008321	TGGA	2	8	859796	859803	25 %	25 %	50 %	0 %	113969083
13082	NC_008321	GT	3	6	859864	859869	0 %	50 %	50 %	0 %	113969083
13083	NC_008321	GCT	2	6	859896	859901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969083
13084	NC_008321	GAT	2	6	859961	859966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969083
13085	NC_008321	TAAG	2	8	860065	860072	50 %	25 %	25 %	0 %	113969083
13086	NC_008321	TGCGC	2	10	860210	860219	0 %	20 %	40 %	40 %	113969084
13087	NC_008321	CAT	2	6	860229	860234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969084
13088	NC_008321	CTG	2	6	860253	860258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969084
13089	NC_008321	GGC	2	6	860291	860296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969084
13090	NC_008321	ATCCCA	2	12	860328	860339	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	113969084
13091	NC_008321	CAG	2	6	860424	860429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969084
13092	NC_008321	ATTCAC	2	12	860436	860447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969084
13093	NC_008321	GCT	2	6	860477	860482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969084
13094	NC_008321	TCT	2	6	860622	860627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113969085
13095	NC_008321	TTC	2	6	860654	860659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113969085
13096	NC_008321	CGG	2	6	860878	860883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969085
13097	NC_008321	GGC	2	6	860921	860926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969085
13098	NC_008321	TGG	2	6	860949	860954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969085
13099	NC_008321	CGATA	2	10	861047	861056	40 %	20 %	20 %	20 %	113969085
13100	NC_008321	TGGT	2	8	861120	861127	0 %	50 %	50 %	0 %	113969085
13101	NC_008321	TCG	2	6	861132	861137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969085
13102	NC_008321	TAA	2	6	861167	861172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113969085
13103	NC_008321	ACC	2	6	861251	861256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113969085
13104	NC_008321	GCG	2	6	861316	861321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969085
13105	NC_008321	GGCG	2	8	861585	861592	0 %	0 %	75 %	25 %	113969085
13106	NC_008321	GCTT	2	8	861672	861679	0 %	50 %	25 %	25 %	113969085
13107	NC_008321	CGA	2	6	861709	861714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969085
13108	NC_008321	TTG	2	6	861740	861745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113969085
13109	NC_008321	TGC	2	6	861765	861770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969085
13110	NC_008321	TAA	2	6	861819	861824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113969085
13111	NC_008321	TCG	2	6	861867	861872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969085
13112	NC_008321	TCTAAG	2	12	861951	861962	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	113969085
13113	NC_008321	TGGT	2	8	861963	861970	0 %	50 %	50 %	0 %	113969085
13114	NC_008321	TCG	2	6	861975	861980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969085
13115	NC_008321	AGC	2	6	861981	861986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969085
13116	NC_008321	CAG	2	6	862004	862009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969085
13117	NC_008321	ACC	2	6	862040	862045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113969085
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13119	NC_008321	CAT	2	6	862180	862185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969085
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13235	NC_008321	CGT	2	6	871384	871389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969092
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13477	NC_008321	GCG	2	6	886787	886792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969104
13478	NC_008321	ACC	2	6	886811	886816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113969104
13479	NC_008321	GCG	2	6	886941	886946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969104
13480	NC_008321	CG	3	6	886945	886950	0 %	0 %	50 %	50 %	113969104
13481	NC_008321	CGA	2	6	887001	887006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969104
13482	NC_008321	GCA	2	6	887035	887040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969104
13483	NC_008321	GTT	2	6	887063	887068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113969104
13484	NC_008321	GAT	2	6	887134	887139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969104
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13486	NC_008321	CCTT	2	8	887216	887223	0 %	50 %	0 %	50 %	113969104
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13490	NC_008321	CAAT	2	8	887926	887933	50 %	25 %	0 %	25 %	113969105
13491	NC_008321	GAA	2	6	888069	888074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113969105
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