MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella sp. MR-4 chromosome

Total Repeats: 71525

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_008321	TAA	2	6	824459	824464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113969056
12502	NC_008321	AGC	2	6	824472	824477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969056
12503	NC_008321	GC	3	6	824476	824481	0 %	0 %	50 %	50 %	113969056
12504	NC_008321	TGA	2	6	824506	824511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969056
12505	NC_008321	AGC	2	6	824520	824525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969056
12506	NC_008321	GCC	2	6	824643	824648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969056
12507	NC_008321	CTTGG	2	10	824726	824735	0 %	40 %	40 %	20 %	113969056
12508	NC_008321	TGA	3	9	824920	824928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969056
12509	NC_008321	GTA	2	6	824954	824959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969056
12510	NC_008321	CAC	2	6	824972	824977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113969056
12511	NC_008321	ATT	2	6	824981	824986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113969056
12512	NC_008321	TTTG	2	8	825112	825119	0 %	75 %	25 %	0 %	113969056
12513	NC_008321	GT	3	6	825129	825134	0 %	50 %	50 %	0 %	113969056
12514	NC_008321	CAT	2	6	825145	825150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969056
12515	NC_008321	GCC	2	6	825183	825188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969056
12516	NC_008321	CTT	2	6	825336	825341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113969056
12517	NC_008321	CAG	2	6	825398	825403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969056
12518	NC_008321	CAT	2	6	825410	825415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969056
12519	NC_008321	GCA	3	9	825490	825498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969056
12520	NC_008321	TAA	2	6	825527	825532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113969056
12521	NC_008321	GCG	2	6	825609	825614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969056
12522	NC_008321	CTGC	2	8	825644	825651	0 %	25 %	25 %	50 %	113969056
12523	NC_008321	TGT	2	6	825661	825666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113969056
12524	NC_008321	TTG	2	6	825677	825682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113969056
12525	NC_008321	GGC	2	6	825743	825748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969056
12526	NC_008321	GCG	2	6	825753	825758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969056
12527	NC_008321	CAA	2	6	825812	825817	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113969056
12528	NC_008321	CAC	2	6	825914	825919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113969056
12529	NC_008321	AGT	2	6	825924	825929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969056
12530	NC_008321	CGCGC	2	10	825958	825967	0 %	0 %	40 %	60 %	113969056
12531	NC_008321	GCA	2	6	825979	825984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969056
12532	NC_008321	TCA	2	6	826009	826014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969056
12533	NC_008321	GCG	2	6	826156	826161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969056
12534	NC_008321	GCT	2	6	826183	826188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969056
12535	NC_008321	ATC	2	6	826310	826315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969056
12536	NC_008321	CAC	2	6	826426	826431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113969056
12537	NC_008321	GCT	2	6	826479	826484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969056
12538	NC_008321	GCG	2	6	826542	826547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969056
12539	NC_008321	TCG	2	6	826662	826667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969056
12540	NC_008321	GC	3	6	826687	826692	0 %	0 %	50 %	50 %	113969056
12541	NC_008321	TGG	2	6	826762	826767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969056
12542	NC_008321	GCG	2	6	826831	826836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969056
12543	NC_008321	GGT	2	6	826891	826896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969056
12544	NC_008321	TGT	2	6	826912	826917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113969056
12545	NC_008321	TCA	2	6	826945	826950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969056
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12549	NC_008321	CAG	2	6	827076	827081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969057
12550	NC_008321	TCA	2	6	827104	827109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969057
12551	NC_008321	TCG	2	6	827128	827133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969057
12552	NC_008321	CAG	2	6	827136	827141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969057
12553	NC_008321	AGCC	2	8	827232	827239	25 %	0 %	25 %	50 %	113969057
12554	NC_008321	CGA	2	6	827249	827254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969057
12555	NC_008321	TGT	2	6	827309	827314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113969057
12556	NC_008321	GCG	2	6	827327	827332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969057
12557	NC_008321	CAG	2	6	827334	827339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969057
12558	NC_008321	TTG	2	6	827346	827351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113969057
12559	NC_008321	TGA	2	6	827419	827424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969057
12560	NC_008321	CCGCTG	2	12	827491	827502	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	113969057
12561	NC_008321	GCT	2	6	827570	827575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969057
12562	NC_008321	CAG	2	6	828301	828306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969058
12563	NC_008321	CTTC	2	8	828459	828466	0 %	50 %	0 %	50 %	113969058
12564	NC_008321	GCC	2	6	828467	828472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969058
12565	NC_008321	CCA	2	6	828492	828497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113969058
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12568	NC_008321	TGGC	2	8	828569	828576	0 %	25 %	50 %	25 %	113969058
12569	NC_008321	CTT	2	6	828580	828585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113969058
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12571	NC_008321	GC	3	6	828644	828649	0 %	0 %	50 %	50 %	113969058
12572	NC_008321	GCGG	2	8	828659	828666	0 %	0 %	75 %	25 %	113969058
12573	NC_008321	TAT	2	6	828674	828679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113969058
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12577	NC_008321	GTG	2	6	828995	829000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969058
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12580	NC_008321	CGG	2	6	829134	829139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969058
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12585	NC_008321	GCT	2	6	829395	829400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969058
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12587	NC_008321	GCA	2	6	829796	829801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969059
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12589	NC_008321	A	6	6	830128	830133	100 %	0 %	0 %	0 %	113969059
12590	NC_008321	GTGATG	2	12	830156	830167	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	113969059
12591	NC_008321	TGG	2	6	830227	830232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969059
12592	NC_008321	GGA	2	6	830254	830259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113969059
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12600	NC_008321	GCT	3	9	830721	830729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969059
12601	NC_008321	CGC	2	6	830748	830753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969059
12602	NC_008321	CAA	2	6	830821	830826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113969059
12603	NC_008321	AGC	2	6	830869	830874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969059
12604	NC_008321	CTC	2	6	830896	830901	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113969059
12605	NC_008321	GCTC	2	8	830987	830994	0 %	25 %	25 %	50 %	113969059
12606	NC_008321	GTGA	2	8	831019	831026	25 %	25 %	50 %	0 %	113969059
12607	NC_008321	ATT	2	6	831084	831089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113969059
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12609	NC_008321	GGT	2	6	831187	831192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969059
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12612	NC_008321	GTA	2	6	831464	831469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969059
12613	NC_008321	GGC	2	6	831627	831632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969059
12614	NC_008321	TG	3	6	831753	831758	0 %	50 %	50 %	0 %	113969059
12615	NC_008321	GAA	2	6	831859	831864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113969059
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12619	NC_008321	GCG	2	6	832180	832185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969059
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12977	NC_008321	GCCATT	2	12	853683	853694	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	113969076
12978	NC_008321	GGT	3	9	853762	853770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969076
12979	NC_008321	GGT	2	6	853774	853779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969076
12980	NC_008321	GCG	2	6	853789	853794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969076
12981	NC_008321	CGTTT	2	10	853807	853816	0 %	60 %	20 %	20 %	113969076
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