MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella sp. MR-4 chromosome

Total Repeats: 71525

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_008321	AG	3	6	655902	655907	50 %	0 %	50 %	0 %	113968917
10002	NC_008321	TTGG	2	8	655914	655921	0 %	50 %	50 %	0 %	113968917
10003	NC_008321	GCT	3	9	655959	655967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968917
10004	NC_008321	TAT	2	6	656035	656040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113968917
10005	NC_008321	AAT	2	6	656095	656100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113968917
10006	NC_008321	ATC	2	6	656193	656198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968917
10007	NC_008321	GC	3	6	656208	656213	0 %	0 %	50 %	50 %	113968917
10008	NC_008321	GCG	2	6	656258	656263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968917
10009	NC_008321	CTT	2	6	656309	656314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968917
10010	NC_008321	CG	3	6	656360	656365	0 %	0 %	50 %	50 %	113968917
10011	NC_008321	CAA	2	6	656395	656400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113968917
10012	NC_008321	GCG	2	6	656518	656523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968918
10013	NC_008321	CCG	2	6	656642	656647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968918
10014	NC_008321	TGA	2	6	656762	656767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968918
10015	NC_008321	AAT	2	6	656818	656823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113968918
10016	NC_008321	CGG	2	6	656837	656842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968918
10017	NC_008321	TGCTC	2	10	656939	656948	0 %	40 %	20 %	40 %	113968918
10018	NC_008321	GCC	2	6	656995	657000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968918
10019	NC_008321	GCGG	2	8	657043	657050	0 %	0 %	75 %	25 %	113968918
10020	NC_008321	GCA	2	6	657088	657093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968918
10021	NC_008321	CGG	2	6	657134	657139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968918
10022	NC_008321	TGG	2	6	657146	657151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968918
10023	NC_008321	T	6	6	657177	657182	0 %	100 %	0 %	0 %	113968918
10024	NC_008321	GAAC	2	8	657196	657203	50 %	0 %	25 %	25 %	113968918
10025	NC_008321	ATC	2	6	657222	657227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968918
10026	NC_008321	CGC	2	6	657279	657284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968918
10027	NC_008321	CGG	2	6	657440	657445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968918
10028	NC_008321	AGGCT	2	10	657473	657482	20 %	20 %	40 %	20 %	113968918
10029	NC_008321	ATA	2	6	657496	657501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113968918
10030	NC_008321	TTC	2	6	657975	657980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968919
10031	NC_008321	AAT	2	6	657991	657996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113968919
10032	NC_008321	TGC	2	6	658031	658036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968919
10033	NC_008321	CAG	2	6	658119	658124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968919
10034	NC_008321	TCG	2	6	658256	658261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968919
10035	NC_008321	CAT	2	6	658413	658418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968919
10036	NC_008321	GAT	2	6	658437	658442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968919
10037	NC_008321	TCT	2	6	658459	658464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968919
10038	NC_008321	CGC	2	6	658565	658570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968919
10039	NC_008321	CAG	2	6	658587	658592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968919
10040	NC_008321	CGA	2	6	658685	658690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968919
10041	NC_008321	TTC	2	6	658840	658845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968919
10042	NC_008321	TAA	2	6	658881	658886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113968919
10043	NC_008321	TGGC	2	8	658921	658928	0 %	25 %	50 %	25 %	113968919
10044	NC_008321	GCC	2	6	658983	658988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968919
10045	NC_008321	TTC	2	6	658989	658994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968919
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10047	NC_008321	CTT	2	6	659087	659092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968919
10048	NC_008321	GAT	2	6	659124	659129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968919
10049	NC_008321	TGC	2	6	659141	659146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968919
10050	NC_008321	CCA	2	6	659196	659201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113968919
10051	NC_008321	ACC	2	6	659283	659288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113968919
10052	NC_008321	CAT	2	6	659289	659294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968919
10053	NC_008321	TTG	2	6	659460	659465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968919
10054	NC_008321	GGC	2	6	659553	659558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968919
10055	NC_008321	CGG	2	6	659591	659596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968919
10056	NC_008321	TTC	2	6	659622	659627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968919
10057	NC_008321	TCGTAG	2	12	659641	659652	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	113968919
10058	NC_008321	TAA	2	6	659724	659729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113968919
10059	NC_008321	ACT	2	6	659743	659748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968919
10060	NC_008321	CTT	2	6	659789	659794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968919
10061	NC_008321	GTG	2	6	659808	659813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968919
10062	NC_008321	TCG	2	6	659818	659823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968919
10063	NC_008321	CAG	2	6	659829	659834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968919
10064	NC_008321	TCA	2	6	659962	659967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968919
10065	NC_008321	GCG	2	6	659991	659996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968919
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10067	NC_008321	TCG	2	6	660124	660129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968919
10068	NC_008321	GCG	2	6	660143	660148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968919
10069	NC_008321	TGG	2	6	660184	660189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968919
10070	NC_008321	TGA	2	6	660244	660249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968919
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10072	NC_008321	GGCT	2	8	660368	660375	0 %	25 %	50 %	25 %	113968919
10073	NC_008321	GAC	2	6	660408	660413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968919
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10076	NC_008321	GAC	2	6	661065	661070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968920
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10081	NC_008321	CCGAG	2	10	661299	661308	20 %	0 %	40 %	40 %	113968920
10082	NC_008321	CCA	2	6	661439	661444	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113968920
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10084	NC_008321	GAT	2	6	661548	661553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968920
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10086	NC_008321	A	6	6	661793	661798	100 %	0 %	0 %	0 %	113968920
10087	NC_008321	GCT	2	6	661856	661861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968920
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10089	NC_008321	CTG	2	6	661917	661922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968920
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10100	NC_008321	GGT	2	6	662405	662410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968920
10101	NC_008321	GAA	2	6	662436	662441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968920
10102	NC_008321	T	6	6	662735	662740	0 %	100 %	0 %	0 %	113968921
10103	NC_008321	CAG	2	6	662809	662814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968921
10104	NC_008321	AGC	2	6	662819	662824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968921
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10106	NC_008321	AAG	2	6	663146	663151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968921
10107	NC_008321	TAT	2	6	663175	663180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113968921
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10109	NC_008321	CGCAG	2	10	663293	663302	20 %	0 %	40 %	40 %	113968921
10110	NC_008321	ACC	2	6	663352	663357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113968921
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10113	NC_008321	CAGC	2	8	663549	663556	25 %	0 %	25 %	50 %	113968921
10114	NC_008321	ATT	2	6	663616	663621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113968921
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10117	NC_008321	CGC	2	6	663793	663798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968921
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10119	NC_008321	CCG	2	6	663865	663870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968921
10120	NC_008321	A	6	6	663872	663877	100 %	0 %	0 %	0 %	113968921
10121	NC_008321	CTG	2	6	663904	663909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968921
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10124	NC_008321	GTT	2	6	664044	664049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968921
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10355	NC_008321	ATC	2	6	677243	677248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968931
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10362	NC_008321	TTAA	2	8	677621	677628	50 %	50 %	0 %	0 %	113968931
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10476	NC_008321	CCG	2	6	685276	685281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968937
10477	NC_008321	AGC	2	6	685366	685371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968937
10478	NC_008321	AAT	2	6	685428	685433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113968937
10479	NC_008321	GC	4	8	685453	685460	0 %	0 %	50 %	50 %	113968937
10480	NC_008321	CAG	2	6	685516	685521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968937
10481	NC_008321	CAG	2	6	685593	685598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968937
10482	NC_008321	TGC	2	6	685661	685666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968937
10483	NC_008321	TGG	2	6	685790	685795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968937
10484	NC_008321	TTC	2	6	685875	685880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968937
10485	NC_008321	CGG	2	6	685904	685909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968937
10486	NC_008321	GGT	2	6	685986	685991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968937
10487	NC_008321	TCGCC	2	10	686015	686024	0 %	20 %	20 %	60 %	113968937
10488	NC_008321	GGT	3	9	686177	686185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968937
10489	NC_008321	TG	3	6	686259	686264	0 %	50 %	50 %	0 %	113968937
10490	NC_008321	CGATGC	2	12	686267	686278	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	113968937
10491	NC_008321	AACT	2	8	686312	686319	50 %	25 %	0 %	25 %	113968937
10492	NC_008321	CG	3	6	686348	686353	0 %	0 %	50 %	50 %	113968937
10493	NC_008321	TGC	2	6	686396	686401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968937
10494	NC_008321	CGTG	2	8	686402	686409	0 %	25 %	50 %	25 %	113968937
10495	NC_008321	GCA	2	6	686414	686419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968937
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10499	NC_008321	GCG	2	6	686527	686532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968937
10500	NC_008321	TAT	2	6	686546	686551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113968937

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