MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella sp. MR-4 chromosome

Total Repeats: 71525

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_008321	CGATGG	2	12	490808	490819	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	113968777
7502	NC_008321	TGG	2	6	490833	490838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968777
7503	NC_008321	GCG	2	6	490983	490988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968777
7504	NC_008321	AGC	2	6	491050	491055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968777
7505	NC_008321	TCG	2	6	491062	491067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968777
7506	NC_008321	TGA	2	6	491099	491104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968777
7507	NC_008321	GTC	3	9	491113	491121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968777
7508	NC_008321	CAC	2	6	491655	491660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113968778
7509	NC_008321	TGA	2	6	491689	491694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968778
7510	NC_008321	CAT	2	6	491795	491800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968778
7511	NC_008321	TCCT	2	8	491805	491812	0 %	50 %	0 %	50 %	113968778
7512	NC_008321	CAG	2	6	491817	491822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968778
7513	NC_008321	CTT	2	6	491832	491837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968778
7514	NC_008321	TTC	2	6	491875	491880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968778
7515	NC_008321	AT	3	6	492004	492009	50 %	50 %	0 %	0 %	113968778
7516	NC_008321	TGA	2	6	492035	492040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968778
7517	NC_008321	AGCTC	2	10	492046	492055	20 %	20 %	20 %	40 %	113968778
7518	NC_008321	GTT	2	6	492144	492149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968779
7519	NC_008321	T	6	6	492148	492153	0 %	100 %	0 %	0 %	113968779
7520	NC_008321	T	6	6	492180	492185	0 %	100 %	0 %	0 %	113968779
7521	NC_008321	TCT	2	6	492255	492260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968779
7522	NC_008321	TGGGCT	2	12	492408	492419	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	113968779
7523	NC_008321	TG	3	6	492492	492497	0 %	50 %	50 %	0 %	113968779
7524	NC_008321	TGT	2	6	492521	492526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968779
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7526	NC_008321	GGC	2	6	492817	492822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968780
7527	NC_008321	TTGGC	2	10	492977	492986	0 %	40 %	40 %	20 %	113968780
7528	NC_008321	TTG	2	6	493000	493005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968780
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7530	NC_008321	TTG	2	6	493153	493158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968780
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7532	NC_008321	GTT	2	6	493691	493696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968781
7533	NC_008321	CAAA	2	8	493704	493711	75 %	0 %	0 %	25 %	113968781
7534	NC_008321	TGC	2	6	493760	493765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968781
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7537	NC_008321	C	6	6	493884	493889	0 %	0 %	0 %	100 %	113968781
7538	NC_008321	GCT	2	6	493902	493907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968781
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7540	NC_008321	CTG	2	6	494091	494096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968781
7541	NC_008321	CGA	2	6	494261	494266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968781
7542	NC_008321	CG	3	6	494336	494341	0 %	0 %	50 %	50 %	113968781
7543	NC_008321	AGA	2	6	494393	494398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968781
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7545	NC_008321	GAT	2	6	494499	494504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968781
7546	NC_008321	TGG	2	6	494531	494536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968781
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7549	NC_008321	AAATGG	2	12	494623	494634	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	113968781
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7551	NC_008321	GTGC	2	8	494739	494746	0 %	25 %	50 %	25 %	113968781
7552	NC_008321	ATC	2	6	494766	494771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968781
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7554	NC_008321	TGGT	2	8	494887	494894	0 %	50 %	50 %	0 %	113968781
7555	NC_008321	GCGT	2	8	494914	494921	0 %	25 %	50 %	25 %	113968781
7556	NC_008321	TAC	2	6	494969	494974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968781
7557	NC_008321	TGA	2	6	494990	494995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968781
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7559	NC_008321	TCA	2	6	495112	495117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968781
7560	NC_008321	GT	3	6	495130	495135	0 %	50 %	50 %	0 %	113968781
7561	NC_008321	TTA	2	6	495183	495188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113968781
7562	NC_008321	TGG	2	6	495206	495211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968781
7563	NC_008321	CAG	2	6	495250	495255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968781
7564	NC_008321	CTG	2	6	495408	495413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968781
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7570	NC_008321	CGT	2	6	495651	495656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968781
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7573	NC_008321	CAC	2	6	495937	495942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113968781
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7603	NC_008321	GCG	2	6	498078	498083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968783
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7611	NC_008321	TGC	2	6	498994	498999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968784
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7981	NC_008321	CGG	2	6	521712	521717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968803
7982	NC_008321	CCAAT	2	10	521719	521728	40 %	20 %	0 %	40 %	113968803
7983	NC_008321	GCA	2	6	521822	521827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968803
7984	NC_008321	CAT	2	6	521873	521878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968803
7985	NC_008321	GTG	2	6	521941	521946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968803
7986	NC_008321	TCT	2	6	521956	521961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968803
7987	NC_008321	T	6	6	521972	521977	0 %	100 %	0 %	0 %	113968803
7988	NC_008321	GC	3	6	522129	522134	0 %	0 %	50 %	50 %	113968804
7989	NC_008321	TGC	2	6	522145	522150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968804
7990	NC_008321	TCA	2	6	522184	522189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968804
7991	NC_008321	CCA	2	6	522246	522251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113968804
7992	NC_008321	AGCGAT	2	12	522405	522416	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	113968804
7993	NC_008321	CAG	2	6	522567	522572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968804
7994	NC_008321	GGC	2	6	522579	522584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968804
7995	NC_008321	TAA	2	6	522596	522601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113968804
7996	NC_008321	GCAG	2	8	522818	522825	25 %	0 %	50 %	25 %	113968804
7997	NC_008321	CAG	2	6	522859	522864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968804
7998	NC_008321	CGA	2	6	522869	522874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968804
7999	NC_008321	GAC	2	6	522894	522899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968804
8000	NC_008321	GAA	2	6	522915	522920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968804

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