MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella sp. MR-4 chromosome

Total Repeats: 71525

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
68501	NC_008321	ACTGT	2	10	4511487	4511496	20 %	40 %	20 %	20 %	113972104
68502	NC_008321	ACC	2	6	4511509	4511514	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113972104
68503	NC_008321	ACA	2	6	4511636	4511641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113972104
68504	NC_008321	CGA	3	9	4511646	4511654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113972104
68505	NC_008321	TCA	2	6	4511706	4511711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113972104
68506	NC_008321	ATGA	2	8	4512207	4512214	50 %	25 %	25 %	0 %	113972105
68507	NC_008321	ATGC	2	8	4512290	4512297	25 %	25 %	25 %	25 %	113972105
68508	NC_008321	ACCA	2	8	4512318	4512325	50 %	0 %	0 %	50 %	113972105
68509	NC_008321	TC	3	6	4512356	4512361	0 %	50 %	0 %	50 %	113972105
68510	NC_008321	TGA	2	6	4512385	4512390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113972105
68511	NC_008321	TAT	2	6	4512584	4512589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113972106
68512	NC_008321	TTAA	2	8	4512600	4512607	50 %	50 %	0 %	0 %	113972106
68513	NC_008321	GCA	2	6	4512669	4512674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113972106
68514	NC_008321	TGT	2	6	4512701	4512706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113972106
68515	NC_008321	GAC	2	6	4512810	4512815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113972106
68516	NC_008321	TTA	2	6	4512928	4512933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113972106
68517	NC_008321	GCCACA	2	12	4512971	4512982	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	113972106
68518	NC_008321	AAT	2	6	4513039	4513044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113972106
68519	NC_008321	ATT	2	6	4513136	4513141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113972107
68520	NC_008321	CA	3	6	4513158	4513163	50 %	0 %	0 %	50 %	113972107
68521	NC_008321	TCG	2	6	4513204	4513209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113972107
68522	NC_008321	GCC	2	6	4513305	4513310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113972107
68523	NC_008321	ATG	2	6	4513311	4513316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113972107
68524	NC_008321	AGC	2	6	4513399	4513404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113972107
68525	NC_008321	CTG	2	6	4513406	4513411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113972107
68526	NC_008321	CAC	2	6	4513418	4513423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113972107
68527	NC_008321	CCG	2	6	4513578	4513583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113972107
68528	NC_008321	TAGCC	2	10	4513585	4513594	20 %	20 %	20 %	40 %	113972107
68529	NC_008321	GT	3	6	4513864	4513869	0 %	50 %	50 %	0 %	113972108
68530	NC_008321	CAC	2	6	4513893	4513898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113972108
68531	NC_008321	CAC	2	6	4514064	4514069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113972108
68532	NC_008321	A	6	6	4514114	4514119	100 %	0 %	0 %	0 %	113972109
68533	NC_008321	CAG	2	6	4514147	4514152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113972109
68534	NC_008321	TGC	2	6	4514198	4514203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113972109
68535	NC_008321	GAAG	2	8	4514345	4514352	50 %	0 %	50 %	0 %	113972109
68536	NC_008321	AAGAGG	2	12	4514353	4514364	50 %	0 %	50 %	0 %	113972109
68537	NC_008321	ATC	2	6	4514389	4514394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113972109
68538	NC_008321	GCG	2	6	4514418	4514423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113972109
68539	NC_008321	ATT	2	6	4514520	4514525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113972109
68540	NC_008321	CGG	2	6	4514582	4514587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113972109
68541	NC_008321	GCA	2	6	4514620	4514625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113972109
68542	NC_008321	GCA	2	6	4514627	4514632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113972109
68543	NC_008321	ACG	2	6	4514710	4514715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113972109
68544	NC_008321	CTGG	2	8	4514749	4514756	0 %	25 %	50 %	25 %	113972109
68545	NC_008321	TGA	2	6	4514767	4514772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113972109
68546	NC_008321	A	6	6	4514796	4514801	100 %	0 %	0 %	0 %	113972109
68547	NC_008321	CTAT	2	8	4514855	4514862	25 %	50 %	0 %	25 %	113972109
68548	NC_008321	AAT	2	6	4514892	4514897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113972109
68549	NC_008321	ATGA	2	8	4514952	4514959	50 %	25 %	25 %	0 %	113972109
68550	NC_008321	CAA	2	6	4514970	4514975	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113972109
68551	NC_008321	GTG	2	6	4515276	4515281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113972109
68552	NC_008321	AAT	2	6	4515285	4515290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113972109
68553	NC_008321	CGG	2	6	4515338	4515343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113972109
68554	NC_008321	ATG	2	6	4515462	4515467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113972109
68555	NC_008321	GTG	2	6	4515516	4515521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113972109
68556	NC_008321	AGC	2	6	4515582	4515587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113972109
68557	NC_008321	AT	3	6	4515620	4515625	50 %	50 %	0 %	0 %	113972110
68558	NC_008321	ATG	2	6	4515672	4515677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113972110
68559	NC_008321	CGC	2	6	4515712	4515717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113972110
68560	NC_008321	ATT	2	6	4515753	4515758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113972110
68561	NC_008321	GAA	2	6	4515795	4515800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113972110
68562	NC_008321	TATGTG	2	12	4515885	4515896	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	113972110
68563	NC_008321	CAG	2	6	4515962	4515967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113972110
68564	NC_008321	TGGGT	2	10	4516018	4516027	0 %	40 %	60 %	0 %	113972110
68565	NC_008321	GGC	2	6	4516152	4516157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113972110
68566	NC_008321	CGC	2	6	4516220	4516225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113972110
68567	NC_008321	AAGC	2	8	4516230	4516237	50 %	0 %	25 %	25 %	113972110
68568	NC_008321	GGT	2	6	4516263	4516268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113972110
68569	NC_008321	GCCGAA	2	12	4516284	4516295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113972110
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68571	NC_008321	TTG	2	6	4516383	4516388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113972110
68572	NC_008321	CCGT	2	8	4516405	4516412	0 %	25 %	25 %	50 %	113972110
68573	NC_008321	GGCGAA	2	12	4516452	4516463	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	113972110
68574	NC_008321	GAA	2	6	4516644	4516649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113972110
68575	NC_008321	GT	3	6	4516668	4516673	0 %	50 %	50 %	0 %	113972110
68576	NC_008321	CTG	2	6	4516674	4516679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113972110
68577	NC_008321	TGC	2	6	4516684	4516689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113972110
68578	NC_008321	GC	3	6	4516692	4516697	0 %	0 %	50 %	50 %	113972110
68579	NC_008321	TGA	2	6	4516753	4516758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113972110
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68582	NC_008321	AGGA	2	8	4517020	4517027	50 %	0 %	50 %	0 %	113972110
68583	NC_008321	GGC	3	9	4517069	4517077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113972110
68584	NC_008321	AGCG	2	8	4517142	4517149	25 %	0 %	50 %	25 %	113972110
68585	NC_008321	GCCC	2	8	4517297	4517304	0 %	0 %	25 %	75 %	113972110
68586	NC_008321	GCC	2	6	4517364	4517369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113972110
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68589	NC_008321	CGC	2	6	4517467	4517472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113972110
68590	NC_008321	CAT	2	6	4517543	4517548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113972110
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68596	NC_008321	GC	3	6	4518037	4518042	0 %	0 %	50 %	50 %	113972110
68597	NC_008321	TATCGA	2	12	4518086	4518097	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	113972110
68598	NC_008321	AT	3	6	4518116	4518121	50 %	50 %	0 %	0 %	113972110
68599	NC_008321	TACAGC	2	12	4518171	4518182	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	113972110
68600	NC_008321	CAAG	2	8	4518227	4518234	50 %	0 %	25 %	25 %	113972110
68601	NC_008321	CTG	2	6	4518267	4518272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113972110
68602	NC_008321	ATG	2	6	4518273	4518278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113972110
68603	NC_008321	ATT	2	6	4518306	4518311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113972110
68604	NC_008321	GTT	2	6	4518350	4518355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113972110
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68607	NC_008321	CGC	2	6	4518419	4518424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113972110
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68610	NC_008321	TTGA	2	8	4518522	4518529	25 %	50 %	25 %	0 %	113972110
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68612	NC_008321	CAT	2	6	4518596	4518601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113972110
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68614	NC_008321	CGC	2	6	4518641	4518646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113972110
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