MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella sp. MR-4 chromosome

Total Repeats: 71525

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
60001	NC_008321	CGC	2	6	3937994	3937999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113971630
60002	NC_008321	TAAG	2	8	3938030	3938037	50 %	25 %	25 %	0 %	113971630
60003	NC_008321	GCTTT	2	10	3938048	3938057	0 %	60 %	20 %	20 %	113971630
60004	NC_008321	TCA	2	6	3938085	3938090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113971630
60005	NC_008321	AATGCC	2	12	3938099	3938110	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	113971630
60006	NC_008321	CCA	2	6	3938125	3938130	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113971630
60007	NC_008321	TCA	2	6	3938133	3938138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113971630
60008	NC_008321	GGC	2	6	3938299	3938304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113971630
60009	NC_008321	CGG	2	6	3938324	3938329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113971630
60010	NC_008321	GCT	2	6	3938392	3938397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113971630
60011	NC_008321	CCA	2	6	3938410	3938415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113971630
60012	NC_008321	TGC	2	6	3938496	3938501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113971630
60013	NC_008321	GCT	2	6	3938629	3938634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113971630
60014	NC_008321	CAGCG	2	10	3938687	3938696	20 %	0 %	40 %	40 %	113971630
60015	NC_008321	CCG	2	6	3938719	3938724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113971630
60016	NC_008321	CA	3	6	3938750	3938755	50 %	0 %	0 %	50 %	113971630
60017	NC_008321	CAG	2	6	3938795	3938800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113971630
60018	NC_008321	GCT	2	6	3938851	3938856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113971630
60019	NC_008321	CGT	2	6	3938876	3938881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113971630
60020	NC_008321	AGG	2	6	3938920	3938925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113971630
60021	NC_008321	GC	3	6	3938939	3938944	0 %	0 %	50 %	50 %	113971630
60022	NC_008321	CTG	2	6	3938995	3939000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113971630
60023	NC_008321	CCG	2	6	3939028	3939033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113971630
60024	NC_008321	TGA	3	9	3939141	3939149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113971630
60025	NC_008321	TGC	2	6	3939154	3939159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113971630
60026	NC_008321	TAG	2	6	3939162	3939167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113971630
60027	NC_008321	CGG	2	6	3939238	3939243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113971630
60028	NC_008321	CTC	2	6	3939266	3939271	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113971630
60029	NC_008321	GCTTG	2	10	3939421	3939430	0 %	40 %	40 %	20 %	113971630
60030	NC_008321	GCGCCT	2	12	3939439	3939450	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	113971630
60031	NC_008321	TCA	2	6	3939459	3939464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113971630
60032	NC_008321	A	6	6	3939464	3939469	100 %	0 %	0 %	0 %	113971630
60033	NC_008321	AGT	2	6	3939520	3939525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113971630
60034	NC_008321	TAGT	2	8	3939528	3939535	25 %	50 %	25 %	0 %	113971630
60035	NC_008321	GCG	2	6	3939732	3939737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113971630
60036	NC_008321	TTGCCA	2	12	3939740	3939751	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	113971630
60037	NC_008321	ACG	2	6	3939758	3939763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113971630
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60039	NC_008321	ACG	3	9	3939842	3939850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113971630
60040	NC_008321	GGCG	2	8	3940142	3940149	0 %	0 %	75 %	25 %	113971631
60041	NC_008321	A	6	6	3940155	3940160	100 %	0 %	0 %	0 %	113971631
60042	NC_008321	CT	3	6	3940180	3940185	0 %	50 %	0 %	50 %	113971631
60043	NC_008321	AATT	2	8	3940214	3940221	50 %	50 %	0 %	0 %	113971631
60044	NC_008321	AAG	2	6	3940264	3940269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113971631
60045	NC_008321	GAAACG	2	12	3940317	3940328	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	113971631
60046	NC_008321	AGAGAC	2	12	3940346	3940357	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	113971631
60047	NC_008321	ATC	2	6	3940435	3940440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113971631
60048	NC_008321	ATTCG	2	10	3940475	3940484	20 %	40 %	20 %	20 %	113971631
60049	NC_008321	CTCG	2	8	3940547	3940554	0 %	25 %	25 %	50 %	113971631
60050	NC_008321	TTTG	2	8	3940565	3940572	0 %	75 %	25 %	0 %	113971631
60051	NC_008321	TGAAG	2	10	3940577	3940586	40 %	20 %	40 %	0 %	113971631
60052	NC_008321	ATC	2	6	3940603	3940608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113971631
60053	NC_008321	AAG	2	6	3940618	3940623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113971631
60054	NC_008321	ATG	2	6	3940761	3940766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113971631
60055	NC_008321	CGC	2	6	3940799	3940804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113971631
60056	NC_008321	TCAA	2	8	3940818	3940825	50 %	25 %	0 %	25 %	113971631
60057	NC_008321	AAG	2	6	3940867	3940872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113971631
60058	NC_008321	CGC	2	6	3940902	3940907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113971631
60059	NC_008321	TGG	2	6	3940948	3940953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113971631
60060	NC_008321	CTG	3	9	3941213	3941221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113971632
60061	NC_008321	ATCA	2	8	3941225	3941232	50 %	25 %	0 %	25 %	113971632
60062	NC_008321	TAAG	2	8	3941279	3941286	50 %	25 %	25 %	0 %	113971632
60063	NC_008321	CTT	2	6	3941441	3941446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113971632
60064	NC_008321	TAC	2	6	3941564	3941569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113971632
60065	NC_008321	ATA	2	6	3941634	3941639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113971632
60066	NC_008321	T	6	6	3941678	3941683	0 %	100 %	0 %	0 %	113971632
60067	NC_008321	ATG	2	6	3941733	3941738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113971632
60068	NC_008321	CGGCCT	2	12	3942092	3942103	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	113971633
60069	NC_008321	GTA	2	6	3942133	3942138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113971633
60070	NC_008321	TTGC	2	8	3942382	3942389	0 %	50 %	25 %	25 %	113971633
60071	NC_008321	CAT	2	6	3942390	3942395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113971633
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60084	NC_008321	GC	3	6	3943189	3943194	0 %	0 %	50 %	50 %	113971633
60085	NC_008321	GTC	2	6	3943199	3943204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113971633
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60115	NC_008321	TGC	2	6	3945760	3945765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113971635
60116	NC_008321	ATG	2	6	3945792	3945797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113971635
60117	NC_008321	GCG	2	6	3945842	3945847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113971635
60118	NC_008321	CGGAT	2	10	3946042	3946051	20 %	20 %	40 %	20 %	113971635
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60122	NC_008321	T	6	6	3946215	3946220	0 %	100 %	0 %	0 %	113971635
60123	NC_008321	CCTGCA	2	12	3946277	3946288	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	113971635
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60131	NC_008321	GGC	2	6	3946791	3946796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113971635
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60147	NC_008321	AACC	2	8	3948148	3948155	50 %	0 %	0 %	50 %	113971636
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60152	NC_008321	AAT	2	6	3948546	3948551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113971637
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60344	NC_008321	GCA	2	6	3961280	3961285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113971648
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60463	NC_008321	TCG	2	6	3968966	3968971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113971653
60464	NC_008321	GC	3	6	3969168	3969173	0 %	0 %	50 %	50 %	113971654
60465	NC_008321	TGTT	2	8	3969192	3969199	0 %	75 %	25 %	0 %	113971654
60466	NC_008321	TAA	2	6	3969288	3969293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113971654
60467	NC_008321	GCA	2	6	3969360	3969365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113971654
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60484	NC_008321	GGCTCT	2	12	3971098	3971109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113971656
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60499	NC_008321	A	6	6	3971929	3971934	100 %	0 %	0 %	0 %	113971657
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