MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella sp. MR-4 chromosome

Total Repeats: 71525

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_008321	GCG	2	6	369846	369851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968689
5502	NC_008321	CGG	2	6	369944	369949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968689
5503	NC_008321	CAT	2	6	369993	369998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968690
5504	NC_008321	GGT	2	6	370038	370043	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968690
5505	NC_008321	GGC	2	6	370078	370083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968690
5506	NC_008321	GTT	2	6	370128	370133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968690
5507	NC_008321	CGG	2	6	370272	370277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968690
5508	NC_008321	CGG	2	6	370330	370335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968690
5509	NC_008321	CGA	2	6	370378	370383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968691
5510	NC_008321	GCG	2	6	370430	370435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968691
5511	NC_008321	GTT	2	6	370484	370489	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968691
5512	NC_008321	TTC	2	6	370655	370660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968691
5513	NC_008321	TCG	2	6	370749	370754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968691
5514	NC_008321	CAG	3	9	370772	370780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968691
5515	NC_008321	TCG	2	6	370836	370841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968691
5516	NC_008321	CCT	2	6	370843	370848	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113968691
5517	NC_008321	CGA	2	6	370854	370859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968691
5518	NC_008321	CCG	2	6	370869	370874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968691
5519	NC_008321	TGC	2	6	370882	370887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968691
5520	NC_008321	GCG	2	6	370935	370940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968691
5521	NC_008321	CCG	2	6	370956	370961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968691
5522	NC_008321	TGA	2	6	371044	371049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968691
5523	NC_008321	GTA	2	6	371075	371080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968691
5524	NC_008321	A	6	6	371115	371120	100 %	0 %	0 %	0 %	113968691
5525	NC_008321	GGC	2	6	371129	371134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968691
5526	NC_008321	ACA	2	6	371155	371160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113968691
5527	NC_008321	CAC	2	6	371290	371295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113968691
5528	NC_008321	TGC	2	6	371296	371301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968691
5529	NC_008321	CT	3	6	371337	371342	0 %	50 %	0 %	50 %	113968691
5530	NC_008321	TGG	2	6	371353	371358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968691
5531	NC_008321	CAG	2	6	371378	371383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968691
5532	NC_008321	ACTC	2	8	371446	371453	25 %	25 %	0 %	50 %	113968691
5533	NC_008321	AAT	2	6	371483	371488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113968691
5534	NC_008321	GCT	2	6	371584	371589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968691
5535	NC_008321	GTT	2	6	371659	371664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968691
5536	NC_008321	AGT	2	6	371697	371702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968691
5537	NC_008321	TTC	2	6	371714	371719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968692
5538	NC_008321	GAG	2	6	371752	371757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113968692
5539	NC_008321	CGG	2	6	371823	371828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968692
5540	NC_008321	GCC	2	6	371834	371839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968692
5541	NC_008321	ATAA	2	8	371855	371862	75 %	25 %	0 %	0 %	113968692
5542	NC_008321	T	6	6	371884	371889	0 %	100 %	0 %	0 %	113968692
5543	NC_008321	CAC	2	6	372007	372012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113968692
5544	NC_008321	ACA	2	6	372021	372026	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113968692
5545	NC_008321	CTTTTG	2	12	372106	372117	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	113968692
5546	NC_008321	CAA	2	6	372136	372141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113968692
5547	NC_008321	CTG	2	6	372168	372173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968692
5548	NC_008321	TCG	2	6	372319	372324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968693
5549	NC_008321	GCATCG	2	12	372430	372441	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	113968693
5550	NC_008321	CCA	2	6	372455	372460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113968693
5551	NC_008321	T	6	6	372609	372614	0 %	100 %	0 %	0 %	113968694
5552	NC_008321	GAGTC	2	10	372649	372658	20 %	20 %	40 %	20 %	113968694
5553	NC_008321	ATC	2	6	372696	372701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968694
5554	NC_008321	TCT	2	6	372712	372717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968694
5555	NC_008321	GAT	2	6	372732	372737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968694
5556	NC_008321	ATT	2	6	372769	372774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113968695
5557	NC_008321	GTT	3	9	372780	372788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968695
5558	NC_008321	ATA	2	6	372790	372795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113968695
5559	NC_008321	GTT	2	6	372930	372935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968695
5560	NC_008321	GCA	2	6	373010	373015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968695
5561	NC_008321	AATTA	2	10	373075	373084	60 %	40 %	0 %	0 %	113968695
5562	NC_008321	GAC	2	6	373162	373167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968695
5563	NC_008321	AAG	2	6	373175	373180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968695
5564	NC_008321	GCA	2	6	373434	373439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968695
5565	NC_008321	CGC	2	6	373500	373505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968695
5566	NC_008321	CG	3	6	373534	373539	0 %	0 %	50 %	50 %	113968695
5567	NC_008321	TG	3	6	373581	373586	0 %	50 %	50 %	0 %	113968695
5568	NC_008321	CCAGTG	2	12	373613	373624	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	113968696
5569	NC_008321	GCG	2	6	373687	373692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968696
5570	NC_008321	TGC	2	6	373704	373709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968696
5571	NC_008321	CTG	2	6	373711	373716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968696
5572	NC_008321	AGGGTG	2	12	373728	373739	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	113968696
5573	NC_008321	TCA	2	6	373812	373817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968696
5574	NC_008321	CGGGA	2	10	373826	373835	20 %	0 %	60 %	20 %	113968696
5575	NC_008321	CAG	2	6	373853	373858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968696
5576	NC_008321	CCA	2	6	373894	373899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113968696
5577	NC_008321	GACT	2	8	373998	374005	25 %	25 %	25 %	25 %	113968696
5578	NC_008321	GTT	2	6	374026	374031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968696
5579	NC_008321	AAT	2	6	374036	374041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113968696
5580	NC_008321	GGTGC	2	10	374060	374069	0 %	20 %	60 %	20 %	113968696
5581	NC_008321	CAT	2	6	374141	374146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968696
5582	NC_008321	TCA	2	6	374268	374273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968696
5583	NC_008321	AG	3	6	374306	374311	50 %	0 %	50 %	0 %	113968696
5584	NC_008321	ACT	2	6	374331	374336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968696
5585	NC_008321	GCT	2	6	374723	374728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968697
5586	NC_008321	CAG	2	6	374764	374769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968697
5587	NC_008321	GC	3	6	374775	374780	0 %	0 %	50 %	50 %	113968697
5588	NC_008321	CTC	2	6	374848	374853	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113968697
5589	NC_008321	GAT	2	6	374854	374859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968697
5590	NC_008321	GCG	2	6	374864	374869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968697
5591	NC_008321	GCA	2	6	374889	374894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968697
5592	NC_008321	GCG	2	6	374952	374957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968697
5593	NC_008321	GCTT	2	8	374983	374990	0 %	50 %	25 %	25 %	113968697
5594	NC_008321	CT	3	6	375038	375043	0 %	50 %	0 %	50 %	113968697
5595	NC_008321	GTT	2	6	375205	375210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968697
5596	NC_008321	TGA	2	6	375213	375218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968697
5597	NC_008321	GAC	2	6	375268	375273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968697
5598	NC_008321	TTC	2	6	375274	375279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968697
5599	NC_008321	CGGTTT	2	12	375309	375320	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	113968697
5600	NC_008321	GGC	2	6	375407	375412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968697
5601	NC_008321	GCA	2	6	375417	375422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968697
5602	NC_008321	GTA	2	6	375466	375471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968697
5603	NC_008321	ATA	2	6	375472	375477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113968697
5604	NC_008321	AG	3	6	375487	375492	50 %	0 %	50 %	0 %	113968697
5605	NC_008321	ACG	2	6	375497	375502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968697
5606	NC_008321	CAAAG	2	10	375517	375526	60 %	0 %	20 %	20 %	113968697
5607	NC_008321	ATC	2	6	375565	375570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968697
5608	NC_008321	TTG	2	6	375779	375784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968698
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5610	NC_008321	TGGC	2	8	375846	375853	0 %	25 %	50 %	25 %	113968698
5611	NC_008321	CAT	2	6	375991	375996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968698
5612	NC_008321	AC	3	6	376060	376065	50 %	0 %	0 %	50 %	113968698
5613	NC_008321	CCA	2	6	376201	376206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113968698
5614	NC_008321	T	6	6	376243	376248	0 %	100 %	0 %	0 %	113968698
5615	NC_008321	CGG	2	6	376321	376326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968698
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5620	NC_008321	TGC	2	6	376647	376652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968698
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