MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella sp. MR-4 chromosome

Total Repeats: 71525

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
58001	NC_008321	GGC	2	6	3809468	3809473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113971522
58002	NC_008321	TGG	2	6	3809515	3809520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113971522
58003	NC_008321	AC	3	6	3809535	3809540	50 %	0 %	0 %	50 %	113971522
58004	NC_008321	GGC	2	6	3809624	3809629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113971522
58005	NC_008321	GAA	2	6	3809630	3809635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113971522
58006	NC_008321	CTG	2	6	3809761	3809766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113971522
58007	NC_008321	CGC	2	6	3809818	3809823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113971522
58008	NC_008321	ACTGA	2	10	3809840	3809849	40 %	20 %	20 %	20 %	113971522
58009	NC_008321	ACAA	2	8	3809850	3809857	75 %	0 %	0 %	25 %	113971522
58010	NC_008321	CTT	2	6	3809866	3809871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113971522
58011	NC_008321	CGA	2	6	3809941	3809946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113971522
58012	NC_008321	CTG	2	6	3809987	3809992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113971522
58013	NC_008321	ACA	2	6	3809997	3810002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113971522
58014	NC_008321	AAC	2	6	3810353	3810358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113971522
58015	NC_008321	AGTA	2	8	3810520	3810527	50 %	25 %	25 %	0 %	113971522
58016	NC_008321	TGA	2	6	3810589	3810594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113971522
58017	NC_008321	GCT	2	6	3810595	3810600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113971522
58018	NC_008321	CCG	2	6	3810640	3810645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113971522
58019	NC_008321	CGGT	2	8	3810776	3810783	0 %	25 %	50 %	25 %	113971523
58020	NC_008321	CTTT	2	8	3810789	3810796	0 %	75 %	0 %	25 %	113971523
58021	NC_008321	CA	3	6	3810805	3810810	50 %	0 %	0 %	50 %	113971523
58022	NC_008321	TTCT	2	8	3810856	3810863	0 %	75 %	0 %	25 %	113971523
58023	NC_008321	CTGC	2	8	3810885	3810892	0 %	25 %	25 %	50 %	113971523
58024	NC_008321	GC	3	6	3810979	3810984	0 %	0 %	50 %	50 %	113971523
58025	NC_008321	TGG	2	6	3810987	3810992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113971523
58026	NC_008321	TCTG	2	8	3811027	3811034	0 %	50 %	25 %	25 %	113971523
58027	NC_008321	CGG	2	6	3811134	3811139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113971523
58028	NC_008321	AT	3	6	3811211	3811216	50 %	50 %	0 %	0 %	113971524
58029	NC_008321	TCT	2	6	3811322	3811327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113971524
58030	NC_008321	AAT	2	6	3811329	3811334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113971524
58031	NC_008321	GCA	2	6	3811373	3811378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113971524
58032	NC_008321	GCAG	2	8	3811385	3811392	25 %	0 %	50 %	25 %	113971524
58033	NC_008321	GCCA	2	8	3811401	3811408	25 %	0 %	25 %	50 %	113971524
58034	NC_008321	GCT	2	6	3811413	3811418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113971524
58035	NC_008321	GCC	2	6	3811430	3811435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113971524
58036	NC_008321	ATC	2	6	3811471	3811476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113971524
58037	NC_008321	CAA	2	6	3811524	3811529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113971524
58038	NC_008321	CAC	2	6	3811633	3811638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113971524
58039	NC_008321	ATC	2	6	3811657	3811662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113971524
58040	NC_008321	T	6	6	3811714	3811719	0 %	100 %	0 %	0 %	113971524
58041	NC_008321	TGC	2	6	3811916	3811921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113971525
58042	NC_008321	GAA	2	6	3811951	3811956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113971525
58043	NC_008321	ATT	2	6	3811983	3811988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113971525
58044	NC_008321	AT	3	6	3812030	3812035	50 %	50 %	0 %	0 %	113971525
58045	NC_008321	CTG	2	6	3812038	3812043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113971525
58046	NC_008321	TGA	2	6	3812061	3812066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113971525
58047	NC_008321	CT	3	6	3812142	3812147	0 %	50 %	0 %	50 %	113971525
58048	NC_008321	GTG	2	6	3812246	3812251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113971525
58049	NC_008321	GC	3	6	3812332	3812337	0 %	0 %	50 %	50 %	113971525
58050	NC_008321	CCA	2	6	3812468	3812473	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113971525
58051	NC_008321	A	6	6	3812519	3812524	100 %	0 %	0 %	0 %	113971525
58052	NC_008321	A	6	6	3812541	3812546	100 %	0 %	0 %	0 %	113971525
58053	NC_008321	TGAACA	2	12	3812610	3812621	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	113971525
58054	NC_008321	AGA	2	6	3812736	3812741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113971525
58055	NC_008321	AAG	2	6	3812759	3812764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113971525
58056	NC_008321	AAG	2	6	3812855	3812860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113971525
58057	NC_008321	AGA	2	6	3812865	3812870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113971525
58058	NC_008321	CCG	2	6	3812879	3812884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113971525
58059	NC_008321	ACA	2	6	3812973	3812978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113971525
58060	NC_008321	TTG	2	6	3813002	3813007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113971525
58061	NC_008321	AAAG	2	8	3813015	3813022	75 %	0 %	25 %	0 %	113971525
58062	NC_008321	AAC	2	6	3813048	3813053	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113971525
58063	NC_008321	CAG	2	6	3813078	3813083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113971525
58064	NC_008321	AAAC	2	8	3813096	3813103	75 %	0 %	0 %	25 %	113971525
58065	NC_008321	AAAT	2	8	3813156	3813163	75 %	25 %	0 %	0 %	113971525
58066	NC_008321	CTG	2	6	3813181	3813186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113971525
58067	NC_008321	CAAG	2	8	3813228	3813235	50 %	0 %	25 %	25 %	113971525
58068	NC_008321	AT	3	6	3813305	3813310	50 %	50 %	0 %	0 %	113971525
58069	NC_008321	CAG	2	6	3813334	3813339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113971525
58070	NC_008321	CAAA	2	8	3813345	3813352	75 %	0 %	0 %	25 %	113971525
58071	NC_008321	A	6	6	3813350	3813355	100 %	0 %	0 %	0 %	113971525
58072	NC_008321	ATT	2	6	3813370	3813375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113971525
58073	NC_008321	ATT	2	6	3813386	3813391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113971525
58074	NC_008321	CGG	2	6	3813501	3813506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113971525
58075	NC_008321	TTA	2	6	3813523	3813528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113971525
58076	NC_008321	TAC	2	6	3813534	3813539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113971525
58077	NC_008321	ACTG	2	8	3813624	3813631	25 %	25 %	25 %	25 %	113971525
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58082	NC_008321	TGC	2	6	3814080	3814085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113971526
58083	NC_008321	TAA	2	6	3814100	3814105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113971526
58084	NC_008321	CTG	2	6	3814118	3814123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113971526
58085	NC_008321	GCA	2	6	3814126	3814131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113971526
58086	NC_008321	GC	3	6	3814135	3814140	0 %	0 %	50 %	50 %	113971526
58087	NC_008321	CGA	2	6	3814162	3814167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113971526
58088	NC_008321	CGC	2	6	3814172	3814177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113971526
58089	NC_008321	ATTG	2	8	3814192	3814199	25 %	50 %	25 %	0 %	113971526
58090	NC_008321	TGG	2	6	3814243	3814248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113971526
58091	NC_008321	T	6	6	3814369	3814374	0 %	100 %	0 %	0 %	113971526
58092	NC_008321	ATTG	2	8	3814399	3814406	25 %	50 %	25 %	0 %	113971526
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58101	NC_008321	ATG	2	6	3814948	3814953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113971527
58102	NC_008321	GCCC	2	8	3814957	3814964	0 %	0 %	25 %	75 %	113971527
58103	NC_008321	GGAT	2	8	3815006	3815013	25 %	25 %	50 %	0 %	113971527
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58106	NC_008321	A	6	6	3815124	3815129	100 %	0 %	0 %	0 %	113971527
58107	NC_008321	GCC	2	6	3815176	3815181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113971527
58108	NC_008321	CACT	2	8	3815263	3815270	25 %	25 %	0 %	50 %	113971527
58109	NC_008321	TTC	2	6	3815299	3815304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113971527
58110	NC_008321	TCCAA	2	10	3815346	3815355	40 %	20 %	0 %	40 %	113971527
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58470	NC_008321	TGC	2	6	3838499	3838504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113971543
58471	NC_008321	CAT	2	6	3838531	3838536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113971543
58472	NC_008321	CAC	2	6	3838587	3838592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113971543
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58474	NC_008321	GGC	2	6	3838666	3838671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113971543
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58476	NC_008321	CAT	2	6	3838683	3838688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113971543
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58481	NC_008321	GTAT	2	8	3839887	3839894	25 %	50 %	25 %	0 %	113971544
58482	NC_008321	CTT	2	6	3840003	3840008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113971544
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58497	NC_008321	TCA	2	6	3840937	3840942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113971547
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58500	NC_008321	A	6	6	3841088	3841093	100 %	0 %	0 %	0 %	113971547

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