MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9311

Total Repeats: 44579

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
43501	NC_008319	CAA	2	6	2550047	2550052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953080
43502	NC_008319	CAA	2	6	2550084	2550089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953080
43503	NC_008319	GATG	2	8	2550197	2550204	25 %	25 %	50 %	0 %	113953080
43504	NC_008319	CTG	2	6	2550268	2550273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953080
43505	NC_008319	CAAG	2	8	2550274	2550281	50 %	0 %	25 %	25 %	113953080
43506	NC_008319	CCA	2	6	2550332	2550337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953080
43507	NC_008319	AAC	2	6	2550359	2550364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953080
43508	NC_008319	GGT	2	6	2550402	2550407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953080
43509	NC_008319	TCAT	2	8	2550410	2550417	25 %	50 %	0 %	25 %	113953080
43510	NC_008319	AAG	2	6	2550864	2550869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113953367
43511	NC_008319	AGC	2	6	2550893	2550898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953367
43512	NC_008319	GAA	2	6	2550954	2550959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113953367
43513	NC_008319	ATC	2	6	2551069	2551074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953367
43514	NC_008319	AGC	2	6	2551075	2551080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953367
43515	NC_008319	CTG	2	6	2551170	2551175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953367
43516	NC_008319	CAATC	2	10	2551225	2551234	40 %	20 %	0 %	40 %	113953367
43517	NC_008319	ATC	2	6	2551296	2551301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953367
43518	NC_008319	CAC	2	6	2551316	2551321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953367
43519	NC_008319	CCTC	2	8	2551376	2551383	0 %	25 %	0 %	75 %	113953367
43520	NC_008319	GGA	2	6	2551494	2551499	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113953367
43521	NC_008319	TC	3	6	2551502	2551507	0 %	50 %	0 %	50 %	113953367
43522	NC_008319	AATG	2	8	2551514	2551521	50 %	25 %	25 %	0 %	113953367
43523	NC_008319	CGAA	2	8	2551610	2551617	50 %	0 %	25 %	25 %	113953367
43524	NC_008319	GAAGT	2	10	2551678	2551687	40 %	20 %	40 %	0 %	113953367
43525	NC_008319	CCAC	2	8	2551763	2551770	25 %	0 %	0 %	75 %	113953367
43526	NC_008319	GAC	2	6	2551816	2551821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953367
43527	NC_008319	TCA	2	6	2551906	2551911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953367
43528	NC_008319	TCA	2	6	2551923	2551928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953367
43529	NC_008319	TTG	2	6	2551959	2551964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953367
43530	NC_008319	CGC	2	6	2551994	2551999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113953367
43531	NC_008319	CACCAA	2	12	2552045	2552056	50 %	0 %	0 %	50 %	113953367
43532	NC_008319	TGC	3	9	2552069	2552077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953367
43533	NC_008319	AAC	2	6	2552080	2552085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953367
43534	NC_008319	GGA	2	6	2552241	2552246	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113953367
43535	NC_008319	AGA	2	6	2552300	2552305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113953367
43536	NC_008319	TTC	2	6	2552317	2552322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953367
43537	NC_008319	CCTA	2	8	2552658	2552665	25 %	25 %	0 %	50 %	113954457
43538	NC_008319	TCG	2	6	2552672	2552677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954457
43539	NC_008319	CGG	2	6	2552694	2552699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954457
43540	NC_008319	A	6	6	2552701	2552706	100 %	0 %	0 %	0 %	113954457
43541	NC_008319	CTG	2	6	2552728	2552733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954457
43542	NC_008319	TCT	2	6	2552826	2552831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954457
43543	NC_008319	TGC	2	6	2552897	2552902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954457
43544	NC_008319	ATC	2	6	2553001	2553006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954457
43545	NC_008319	TGC	3	9	2553039	2553047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954457
43546	NC_008319	TCT	2	6	2553152	2553157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954457
43547	NC_008319	GTT	2	6	2553175	2553180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954457
43548	NC_008319	TGGT	2	8	2553187	2553194	0 %	50 %	50 %	0 %	113954457
43549	NC_008319	TTGC	2	8	2553244	2553251	0 %	50 %	25 %	25 %	113954457
43550	NC_008319	CTG	2	6	2553252	2553257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954457
43551	NC_008319	TTG	2	6	2553299	2553304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954457
43552	NC_008319	CGTTC	2	10	2553348	2553357	0 %	40 %	20 %	40 %	113954457
43553	NC_008319	TCC	2	6	2553380	2553385	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113954457
43554	NC_008319	TTG	2	6	2553404	2553409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954457
43555	NC_008319	ATG	2	6	2553485	2553490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954457
43556	NC_008319	CGC	2	6	2553510	2553515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113954457
43557	NC_008319	TGA	2	6	2553557	2553562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955059
43558	NC_008319	GGA	2	6	2553595	2553600	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113955059
43559	NC_008319	GCTG	2	8	2553616	2553623	0 %	25 %	50 %	25 %	113955059
43560	NC_008319	GA	3	6	2553625	2553630	50 %	0 %	50 %	0 %	113955059
43561	NC_008319	TGA	2	6	2553650	2553655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955059
43562	NC_008319	ATC	2	6	2553711	2553716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113955059
43563	NC_008319	AAC	2	6	2553808	2553813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113955059
43564	NC_008319	CCAAT	2	10	2553818	2553827	40 %	20 %	0 %	40 %	113955059
43565	NC_008319	TCT	2	6	2553944	2553949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113955059
43566	NC_008319	TCA	2	6	2553962	2553967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113955059
43567	NC_008319	TAC	2	6	2553985	2553990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113955059
43568	NC_008319	TGT	2	6	2554028	2554033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113955059
43569	NC_008319	TAC	2	6	2554051	2554056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113955059
43570	NC_008319	GAC	2	6	2554065	2554070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955059
43571	NC_008319	TTA	2	6	2554075	2554080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113955059
43572	NC_008319	GCT	2	6	2554122	2554127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955059
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43574	NC_008319	AAGC	2	8	2554224	2554231	50 %	0 %	25 %	25 %	113955059
43575	NC_008319	ATGA	2	8	2554255	2554262	50 %	25 %	25 %	0 %	113955059
43576	NC_008319	CAC	2	6	2554312	2554317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113955368
43577	NC_008319	CA	3	6	2554340	2554345	50 %	0 %	0 %	50 %	113955368
43578	NC_008319	TGCAG	2	10	2554552	2554561	20 %	20 %	40 %	20 %	113955368
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43581	NC_008319	AG	3	6	2554640	2554645	50 %	0 %	50 %	0 %	113955368
43582	NC_008319	GCC	2	6	2554717	2554722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113955368
43583	NC_008319	AGC	2	6	2554755	2554760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955368
43584	NC_008319	AGT	2	6	2554782	2554787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953621
43585	NC_008319	TAA	2	6	2554792	2554797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113953621
43586	NC_008319	TTTC	2	8	2554998	2555005	0 %	75 %	0 %	25 %	113954540
43587	NC_008319	TCAA	2	8	2555023	2555030	50 %	25 %	0 %	25 %	113954540
43588	NC_008319	CTG	2	6	2555124	2555129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954540
43589	NC_008319	TTA	2	6	2555141	2555146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113954540
43590	NC_008319	TCCAT	2	10	2555165	2555174	20 %	40 %	0 %	40 %	113954540
43591	NC_008319	CGAAG	2	10	2555398	2555407	40 %	0 %	40 %	20 %	113955363
43592	NC_008319	TCG	2	6	2555487	2555492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955363
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43596	NC_008319	AGGG	2	8	2555681	2555688	25 %	0 %	75 %	0 %	113955363
43597	NC_008319	GAT	2	6	2555863	2555868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955363
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43599	NC_008319	GCT	2	6	2555901	2555906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955363
43600	NC_008319	CAC	2	6	2555926	2555931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113955363
43601	NC_008319	CCA	2	6	2555956	2555961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113955363
43602	NC_008319	ATC	2	6	2556010	2556015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113955363
43603	NC_008319	GGC	2	6	2556034	2556039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113955363
43604	NC_008319	GCT	2	6	2556131	2556136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955363
43605	NC_008319	GAT	2	6	2556142	2556147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955363
43606	NC_008319	AGA	2	6	2556162	2556167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113955363
43607	NC_008319	CTT	2	6	2556196	2556201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113955363
43608	NC_008319	GCT	2	6	2556242	2556247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955363
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43611	NC_008319	GCT	2	6	2556442	2556447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953266
43612	NC_008319	TGC	2	6	2556483	2556488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953266
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43993	NC_008319	CAA	2	6	2575175	2575180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953854
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