MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9311

Total Repeats: 44579

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
43001	NC_008319	CGT	2	6	2522200	2522205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953598
43002	NC_008319	GTT	2	6	2522230	2522235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953598
43003	NC_008319	CCT	2	6	2522238	2522243	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113953598
43004	NC_008319	CGC	2	6	2522248	2522253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113953598
43005	NC_008319	GGA	2	6	2522294	2522299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113953598
43006	NC_008319	TCCT	2	8	2522306	2522313	0 %	50 %	0 %	50 %	113953598
43007	NC_008319	CTCA	2	8	2522341	2522348	25 %	25 %	0 %	50 %	113953598
43008	NC_008319	ACT	2	6	2522380	2522385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953598
43009	NC_008319	CA	3	6	2522506	2522511	50 %	0 %	0 %	50 %	113953598
43010	NC_008319	GCG	2	6	2522538	2522543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953598
43011	NC_008319	CTG	2	6	2522660	2522665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953598
43012	NC_008319	GT	3	6	2522673	2522678	0 %	50 %	50 %	0 %	113953598
43013	NC_008319	TGC	2	6	2522682	2522687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953598
43014	NC_008319	TCAG	2	8	2522688	2522695	25 %	25 %	25 %	25 %	113953598
43015	NC_008319	T	6	6	2522802	2522807	0 %	100 %	0 %	0 %	113953598
43016	NC_008319	CCT	2	6	2522809	2522814	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113953598
43017	NC_008319	GC	3	6	2522849	2522854	0 %	0 %	50 %	50 %	113953598
43018	NC_008319	CAACG	2	10	2522861	2522870	40 %	0 %	20 %	40 %	113953598
43019	NC_008319	CTG	2	6	2522906	2522911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953598
43020	NC_008319	TTC	2	6	2522922	2522927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953598
43021	NC_008319	GGC	2	6	2523002	2523007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953598
43022	NC_008319	TGG	2	6	2523048	2523053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953598
43023	NC_008319	GCA	2	6	2523071	2523076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953598
43024	NC_008319	GAT	2	6	2523133	2523138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953598
43025	NC_008319	CGT	2	6	2523205	2523210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953598
43026	NC_008319	CAG	2	6	2523211	2523216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953598
43027	NC_008319	TGG	3	9	2523219	2523227	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953598
43028	NC_008319	CAG	2	6	2523282	2523287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953598
43029	NC_008319	GAT	2	6	2523292	2523297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953598
43030	NC_008319	TTG	2	6	2523323	2523328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953598
43031	NC_008319	CAA	2	6	2523338	2523343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953598
43032	NC_008319	AGC	2	6	2523351	2523356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953598
43033	NC_008319	CGA	2	6	2523423	2523428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953598
43034	NC_008319	GGTGC	2	10	2523455	2523464	0 %	20 %	60 %	20 %	113953598
43035	NC_008319	CTG	2	6	2523485	2523490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953598
43036	NC_008319	GCCA	2	8	2523516	2523523	25 %	0 %	25 %	50 %	113953598
43037	NC_008319	TGG	2	6	2523545	2523550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953598
43038	NC_008319	CTT	2	6	2523566	2523571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953598
43039	NC_008319	TGC	2	6	2523663	2523668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953598
43040	NC_008319	CA	3	6	2523715	2523720	50 %	0 %	0 %	50 %	113953598
43041	NC_008319	CTG	2	6	2523741	2523746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953598
43042	NC_008319	TAA	2	6	2523799	2523804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113953583
43043	NC_008319	AAATGC	2	12	2523823	2523834	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	113953583
43044	NC_008319	TCA	2	6	2523934	2523939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953583
43045	NC_008319	CAA	2	6	2523945	2523950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953583
43046	NC_008319	GCT	4	12	2523986	2523997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953583
43047	NC_008319	ACC	2	6	2523999	2524004	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953583
43048	NC_008319	CAC	2	6	2524013	2524018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953583
43049	NC_008319	GAAA	2	8	2524027	2524034	75 %	0 %	25 %	0 %	113953583
43050	NC_008319	GAT	2	6	2524152	2524157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953583
43051	NC_008319	GAG	2	6	2524205	2524210	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113953583
43052	NC_008319	AGG	2	6	2524285	2524290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113953583
43053	NC_008319	CAGA	2	8	2524320	2524327	50 %	0 %	25 %	25 %	113953583
43054	NC_008319	GAA	2	6	2524364	2524369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113953583
43055	NC_008319	TAA	2	6	2524384	2524389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113953583
43056	NC_008319	CGT	2	6	2524426	2524431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954963
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43058	NC_008319	GAC	2	6	2524543	2524548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954963
43059	NC_008319	GAAT	2	8	2524549	2524556	50 %	25 %	25 %	0 %	113954963
43060	NC_008319	TTC	2	6	2524631	2524636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954963
43061	NC_008319	TCA	2	6	2524659	2524664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954963
43062	NC_008319	CCAA	2	8	2524689	2524696	50 %	0 %	0 %	50 %	113954963
43063	NC_008319	ATG	2	6	2524787	2524792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954963
43064	NC_008319	GCT	2	6	2524804	2524809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954963
43065	NC_008319	AG	4	8	2524968	2524975	50 %	0 %	50 %	0 %	113954963
43066	NC_008319	CCT	2	6	2524992	2524997	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113954963
43067	NC_008319	TGA	2	6	2525020	2525025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954963
43068	NC_008319	CCGC	2	8	2525068	2525075	0 %	0 %	25 %	75 %	113954963
43069	NC_008319	CAG	2	6	2525156	2525161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954963
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43071	NC_008319	AACC	2	8	2525294	2525301	50 %	0 %	0 %	50 %	113953040
43072	NC_008319	ACC	2	6	2525344	2525349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953040
43073	NC_008319	CTCA	2	8	2525380	2525387	25 %	25 %	0 %	50 %	113953040
43074	NC_008319	CATA	2	8	2525400	2525407	50 %	25 %	0 %	25 %	113953040
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43081	NC_008319	CAG	2	6	2525715	2525720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953040
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43085	NC_008319	AC	3	6	2525925	2525930	50 %	0 %	0 %	50 %	113953040
43086	NC_008319	AAG	2	6	2526136	2526141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113953040
43087	NC_008319	CAAAT	2	10	2526155	2526164	60 %	20 %	0 %	20 %	113953040
43088	NC_008319	CAG	2	6	2526205	2526210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953040
43089	NC_008319	GCA	2	6	2526242	2526247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953040
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43098	NC_008319	TCA	2	6	2526820	2526825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953680
43099	NC_008319	ATCC	2	8	2526860	2526867	25 %	25 %	0 %	50 %	113953680
43100	NC_008319	CCA	2	6	2526957	2526962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953680
43101	NC_008319	AC	3	6	2526970	2526975	50 %	0 %	0 %	50 %	113953680
43102	NC_008319	ACC	2	6	2526998	2527003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953680
43103	NC_008319	GAA	2	6	2527048	2527053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113953680
43104	NC_008319	AAGC	2	8	2527105	2527112	50 %	0 %	25 %	25 %	113953680
43105	NC_008319	CTG	2	6	2527130	2527135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953680
43106	NC_008319	CGT	2	6	2527194	2527199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953680
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43110	NC_008319	GCAA	2	8	2527609	2527616	50 %	0 %	25 %	25 %	113954254
43111	NC_008319	GA	3	6	2527731	2527736	50 %	0 %	50 %	0 %	113954254
43112	NC_008319	GAG	2	6	2527770	2527775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113954254
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43114	NC_008319	TGT	2	6	2527866	2527871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954254
43115	NC_008319	ACT	2	6	2527895	2527900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954254
43116	NC_008319	CAG	2	6	2527929	2527934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954254
43117	NC_008319	CTT	2	6	2527939	2527944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954254
43118	NC_008319	CAT	2	6	2527966	2527971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954254
43119	NC_008319	TCC	2	6	2528027	2528032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113954254
43120	NC_008319	CATAA	2	10	2528050	2528059	60 %	20 %	0 %	20 %	113954254
43121	NC_008319	GAA	2	6	2528101	2528106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113954254
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43123	NC_008319	AGC	2	6	2528161	2528166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954254
43124	NC_008319	AGT	2	6	2528214	2528219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954254
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43128	NC_008319	A	6	6	2528397	2528402	100 %	0 %	0 %	0 %	113954254
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43132	NC_008319	AT	3	6	2528597	2528602	50 %	50 %	0 %	0 %	113954254
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43139	NC_008319	ACG	2	6	2528883	2528888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954254
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43143	NC_008319	TCC	2	6	2529066	2529071	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113955216
43144	NC_008319	GATC	2	8	2529129	2529136	25 %	25 %	25 %	25 %	113955216
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43146	NC_008319	ATCA	2	8	2529211	2529218	50 %	25 %	0 %	25 %	113955216
43147	NC_008319	TCAC	2	8	2529323	2529330	25 %	25 %	0 %	50 %	113955216
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43210	NC_008319	CTGT	2	8	2533114	2533121	0 %	50 %	25 %	25 %	113954876
43211	NC_008319	GATG	2	8	2533135	2533142	25 %	25 %	50 %	0 %	113954876
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43215	NC_008319	CCAAC	2	10	2533314	2533323	40 %	0 %	0 %	60 %	113954876
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43217	NC_008319	TGC	2	6	2533447	2533452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954876
43218	NC_008319	ATC	2	6	2533487	2533492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954876
43219	NC_008319	AGA	2	6	2533588	2533593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113954876
43220	NC_008319	ACC	2	6	2533611	2533616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954876
43221	NC_008319	CAG	2	6	2533672	2533677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954876
43222	NC_008319	TTG	2	6	2533758	2533763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954876
43223	NC_008319	GTCCA	2	10	2533827	2533836	20 %	20 %	20 %	40 %	113954876
43224	NC_008319	TGC	2	6	2533852	2533857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954876
43225	NC_008319	ACA	2	6	2533917	2533922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113954876
43226	NC_008319	CTG	2	6	2534114	2534119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954876
43227	NC_008319	ACC	2	6	2534131	2534136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113955098
43228	NC_008319	TGG	2	6	2534147	2534152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955098
43229	NC_008319	GCA	2	6	2534154	2534159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955098
43230	NC_008319	ATCG	2	8	2534161	2534168	25 %	25 %	25 %	25 %	113955098
43231	NC_008319	GGA	2	6	2534296	2534301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113955098
43232	NC_008319	CAACA	2	10	2534380	2534389	60 %	0 %	0 %	40 %	113955098
43233	NC_008319	GCT	2	6	2534434	2534439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955098
43234	NC_008319	ACC	2	6	2534472	2534477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113955098
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43236	NC_008319	TGC	2	6	2534573	2534578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955098
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43238	NC_008319	TCA	2	6	2534629	2534634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113955098
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43243	NC_008319	AACCA	2	10	2534877	2534886	60 %	0 %	0 %	40 %	113955098
43244	NC_008319	ACCA	2	8	2535159	2535166	50 %	0 %	0 %	50 %	113953101
43245	NC_008319	ACGA	2	8	2535351	2535358	50 %	0 %	25 %	25 %	113953101
43246	NC_008319	TCC	2	6	2535360	2535365	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113953101
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43464	NC_008319	AAG	3	9	2547584	2547592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113954987
43465	NC_008319	TCC	2	6	2547635	2547640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113953063
43466	NC_008319	T	6	6	2547645	2547650	0 %	100 %	0 %	0 %	113953063
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43468	NC_008319	GCA	2	6	2547806	2547811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953063
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43470	NC_008319	AGC	2	6	2547939	2547944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953063
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43483	NC_008319	CAC	2	6	2549009	2549014	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113955355
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43490	NC_008319	CGA	2	6	2549303	2549308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955355
43491	NC_008319	TCG	2	6	2549315	2549320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955355
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