MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9311

Total Repeats: 44579

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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42002	NC_008319	TGA	2	6	2461538	2461543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954590
42003	NC_008319	CGA	2	6	2461551	2461556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954590
42004	NC_008319	TAC	2	6	2461558	2461563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954590
42005	NC_008319	ACT	2	6	2461641	2461646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954590
42006	NC_008319	GCC	2	6	2461681	2461686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113954590
42007	NC_008319	C	6	6	2461741	2461746	0 %	0 %	0 %	100 %	113955354
42008	NC_008319	TCG	2	6	2461766	2461771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955354
42009	NC_008319	GCT	2	6	2461810	2461815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955354
42010	NC_008319	TGG	2	6	2461890	2461895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955354
42011	NC_008319	TGG	2	6	2461935	2461940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955354
42012	NC_008319	GCC	2	6	2461949	2461954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113955354
42013	NC_008319	AG	3	6	2462053	2462058	50 %	0 %	50 %	0 %	113955354
42014	NC_008319	TGC	2	6	2462060	2462065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955354
42015	NC_008319	CTG	2	6	2462068	2462073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955354
42016	NC_008319	CAG	2	6	2462144	2462149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955354
42017	NC_008319	CCTT	2	8	2462228	2462235	0 %	50 %	0 %	50 %	113955354
42018	NC_008319	TGGG	2	8	2462248	2462255	0 %	25 %	75 %	0 %	113955354
42019	NC_008319	GC	3	6	2462277	2462282	0 %	0 %	50 %	50 %	113955354
42020	NC_008319	AGC	2	6	2462321	2462326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955354
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42023	NC_008319	GCG	2	6	2462465	2462470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113955354
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42031	NC_008319	CT	3	6	2462823	2462828	0 %	50 %	0 %	50 %	113955354
42032	NC_008319	ACT	2	6	2462878	2462883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113955354
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42043	NC_008319	GA	3	6	2463369	2463374	50 %	0 %	50 %	0 %	113955354
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42054	NC_008319	CAA	2	6	2463860	2463865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953274
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42063	NC_008319	CT	3	6	2464279	2464284	0 %	50 %	0 %	50 %	113953274
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42067	NC_008319	TACA	2	8	2464915	2464922	50 %	25 %	0 %	25 %	113953420
42068	NC_008319	TGATC	2	10	2464928	2464937	20 %	40 %	20 %	20 %	113953420
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42101	NC_008319	ATTG	2	8	2467310	2467317	25 %	50 %	25 %	0 %	113954560
42102	NC_008319	CAC	2	6	2467358	2467363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954560
42103	NC_008319	CCT	2	6	2467420	2467425	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113954560
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42107	NC_008319	GGGCCA	2	12	2467573	2467584	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	113952769
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42111	NC_008319	C	8	8	2467684	2467691	0 %	0 %	0 %	100 %	113952769
42112	NC_008319	AACT	2	8	2467722	2467729	50 %	25 %	0 %	25 %	113952769
42113	NC_008319	CTT	2	6	2467823	2467828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113952769
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42115	NC_008319	TTA	2	6	2468841	2468846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113955019
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42351	NC_008319	TGC	2	6	2482252	2482257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954334
42352	NC_008319	GCA	2	6	2482273	2482278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954334
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42355	NC_008319	CAA	2	6	2482465	2482470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113954334
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42449	NC_008319	CA	3	6	2487719	2487724	50 %	0 %	0 %	50 %	113952904
42450	NC_008319	GCG	2	6	2487742	2487747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113952904
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42455	NC_008319	CAG	2	6	2488028	2488033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952904
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42459	NC_008319	GC	3	6	2488188	2488193	0 %	0 %	50 %	50 %	113954820
42460	NC_008319	GCA	2	6	2488382	2488387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954820
42461	NC_008319	GCC	2	6	2488435	2488440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113954820
42462	NC_008319	GCCTGC	2	12	2488444	2488455	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	113954820
42463	NC_008319	GGC	2	6	2488535	2488540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954820
42464	NC_008319	ACGAA	2	10	2488546	2488555	60 %	0 %	20 %	20 %	113954820
42465	NC_008319	GCA	2	6	2488618	2488623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954820
42466	NC_008319	CAT	2	6	2488652	2488657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954820
42467	NC_008319	CAG	2	6	2488718	2488723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954820
42468	NC_008319	CTTG	2	8	2488808	2488815	0 %	50 %	25 %	25 %	113954820
42469	NC_008319	GCA	2	6	2488837	2488842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954820
42470	NC_008319	ACG	2	6	2488869	2488874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954820
42471	NC_008319	CAT	2	6	2488904	2488909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954820
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42473	NC_008319	CG	3	6	2488988	2488993	0 %	0 %	50 %	50 %	113954820
42474	NC_008319	CTG	2	6	2489057	2489062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954820
42475	NC_008319	TCA	2	6	2489081	2489086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954820
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42477	NC_008319	GATC	2	8	2489264	2489271	25 %	25 %	25 %	25 %	113954820
42478	NC_008319	CAT	2	6	2489373	2489378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954820
42479	NC_008319	GAT	2	6	2489403	2489408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954820
42480	NC_008319	CCA	2	6	2489606	2489611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954820
42481	NC_008319	GTG	2	6	2489620	2489625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954820
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42490	NC_008319	CTG	2	6	2490224	2490229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954820
42491	NC_008319	GTG	2	6	2490256	2490261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954820
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42493	NC_008319	CCT	2	6	2490326	2490331	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113954820
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42497	NC_008319	GCT	2	6	2490620	2490625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954820
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42499	NC_008319	GCCA	2	8	2490690	2490697	25 %	0 %	25 %	50 %	113954820
42500	NC_008319	GCG	2	6	2490776	2490781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954820

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