MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9311

Total Repeats: 44579

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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41002	NC_008319	TC	3	6	2406105	2406110	0 %	50 %	0 %	50 %	113954277
41003	NC_008319	TG	3	6	2406215	2406220	0 %	50 %	50 %	0 %	113954277
41004	NC_008319	CAAC	2	8	2406252	2406259	50 %	0 %	0 %	50 %	113954277
41005	NC_008319	GGT	2	6	2406381	2406386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955197
41006	NC_008319	AGAC	2	8	2406465	2406472	50 %	0 %	25 %	25 %	113955197
41007	NC_008319	CTG	2	6	2406566	2406571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955197
41008	NC_008319	GCC	2	6	2406643	2406648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113955197
41009	NC_008319	ACG	2	6	2406698	2406703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955197
41010	NC_008319	GC	3	6	2406717	2406722	0 %	0 %	50 %	50 %	113955197
41011	NC_008319	AGCCTC	2	12	2406732	2406743	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	113955197
41012	NC_008319	CAGG	2	8	2406774	2406781	25 %	0 %	50 %	25 %	113955197
41013	NC_008319	GC	3	6	2406810	2406815	0 %	0 %	50 %	50 %	113955197
41014	NC_008319	CTC	2	6	2406843	2406848	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113955197
41015	NC_008319	GCA	2	6	2406872	2406877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955197
41016	NC_008319	AAG	2	6	2406898	2406903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113955197
41017	NC_008319	ACGA	2	8	2406947	2406954	50 %	0 %	25 %	25 %	113955197
41018	NC_008319	CACGG	2	10	2406957	2406966	20 %	0 %	40 %	40 %	113955197
41019	NC_008319	ATC	2	6	2407048	2407053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113955197
41020	NC_008319	AGC	2	6	2407155	2407160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955197
41021	NC_008319	AG	3	6	2407195	2407200	50 %	0 %	50 %	0 %	113955197
41022	NC_008319	AAG	2	6	2407212	2407217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113955197
41023	NC_008319	AGC	2	6	2407280	2407285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955197
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41027	NC_008319	CA	3	6	2407469	2407474	50 %	0 %	0 %	50 %	113955197
41028	NC_008319	CGC	2	6	2407545	2407550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113955197
41029	NC_008319	AGT	2	6	2407566	2407571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955197
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41033	NC_008319	GAG	2	6	2408067	2408072	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113954146
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41035	NC_008319	GCA	2	6	2408162	2408167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954146
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41043	NC_008319	GGTT	2	8	2408556	2408563	0 %	50 %	50 %	0 %	113954806
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41051	NC_008319	GCA	2	6	2408909	2408914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954806
41052	NC_008319	CGG	2	6	2408926	2408931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954806
41053	NC_008319	CAAC	2	8	2408973	2408980	50 %	0 %	0 %	50 %	113954806
41054	NC_008319	GGA	2	6	2409032	2409037	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113954806
41055	NC_008319	TAC	2	6	2409114	2409119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954806
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41059	NC_008319	TCA	2	6	2409271	2409276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113955578
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41065	NC_008319	ACG	2	6	2409574	2409579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955578
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41067	NC_008319	CG	3	6	2409622	2409627	0 %	0 %	50 %	50 %	113955578
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41084	NC_008319	CGG	3	9	2410823	2410831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953960
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41087	NC_008319	GC	3	6	2410984	2410989	0 %	0 %	50 %	50 %	113953960
41088	NC_008319	TTG	2	6	2410998	2411003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953960
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41093	NC_008319	AG	3	6	2411179	2411184	50 %	0 %	50 %	0 %	113953960
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41100	NC_008319	TCAA	2	8	2411550	2411557	50 %	25 %	0 %	25 %	113953960
41101	NC_008319	CGCTG	2	10	2411563	2411572	0 %	20 %	40 %	40 %	113953960
41102	NC_008319	TGG	2	6	2411609	2411614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953960
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41107	NC_008319	CAG	2	6	2411982	2411987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953095
41108	NC_008319	TGA	2	6	2412156	2412161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953095
41109	NC_008319	CCA	2	6	2412165	2412170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953095
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41111	NC_008319	A	6	6	2412178	2412183	100 %	0 %	0 %	0 %	113953095
41112	NC_008319	CAGC	2	8	2412216	2412223	25 %	0 %	25 %	50 %	113953095
41113	NC_008319	GCT	2	6	2412240	2412245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953095
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41115	NC_008319	TC	3	6	2412291	2412296	0 %	50 %	0 %	50 %	113953095
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41117	NC_008319	TGG	2	6	2412630	2412635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953852
41118	NC_008319	CCT	2	6	2412667	2412672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113953852
41119	NC_008319	CGA	2	6	2412682	2412687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953852
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41121	NC_008319	CAAC	2	8	2412790	2412797	50 %	0 %	0 %	50 %	113953852
41122	NC_008319	AGGC	2	8	2412855	2412862	25 %	0 %	50 %	25 %	113953852
41123	NC_008319	CT	4	8	2412885	2412892	0 %	50 %	0 %	50 %	113953852
41124	NC_008319	GAC	2	6	2412899	2412904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953852
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41220	NC_008319	CTG	4	12	2418080	2418091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952813
41221	NC_008319	GAAG	2	8	2418132	2418139	50 %	0 %	50 %	0 %	113952813
41222	NC_008319	TTA	2	6	2418143	2418148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113952813
41223	NC_008319	GCT	2	6	2418222	2418227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952813
41224	NC_008319	ATC	2	6	2418439	2418444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113952813
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41228	NC_008319	GCA	2	6	2418635	2418640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952813
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41230	NC_008319	AGCA	2	8	2418663	2418670	50 %	0 %	25 %	25 %	113952813
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41232	NC_008319	CTT	2	6	2418751	2418756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113952813
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41234	NC_008319	A	6	6	2418826	2418831	100 %	0 %	0 %	0 %	113952813
41235	NC_008319	G	6	6	2418853	2418858	0 %	0 %	100 %	0 %	113952813
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41344	NC_008319	GCG	2	6	2425319	2425324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113952947
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41457	NC_008319	CAA	2	6	2431619	2431624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953738
41458	NC_008319	AT	3	6	2431645	2431650	50 %	50 %	0 %	0 %	113953738
41459	NC_008319	CCT	2	6	2431667	2431672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113953738
41460	NC_008319	GCA	2	6	2431693	2431698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953738
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41462	NC_008319	AGC	2	6	2431737	2431742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953738
41463	NC_008319	T	6	6	2431830	2431835	0 %	100 %	0 %	0 %	113953738
41464	NC_008319	ATT	2	6	2431938	2431943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113953738
41465	NC_008319	CAC	2	6	2431968	2431973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953738
41466	NC_008319	CAC	2	6	2432042	2432047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953738
41467	NC_008319	A	6	6	2432059	2432064	100 %	0 %	0 %	0 %	113953738
41468	NC_008319	TTGT	2	8	2432097	2432104	0 %	75 %	25 %	0 %	113953738
41469	NC_008319	ATC	2	6	2432137	2432142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953738
41470	NC_008319	TCT	2	6	2432320	2432325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953976
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41479	NC_008319	TTC	2	6	2432736	2432741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953976
41480	NC_008319	TCC	2	6	2432745	2432750	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113953976
41481	NC_008319	CAA	2	6	2432770	2432775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953976
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41492	NC_008319	CGG	2	6	2433285	2433290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953976
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41495	NC_008319	GAC	2	6	2433398	2433403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953976
41496	NC_008319	CACC	2	8	2433451	2433458	25 %	0 %	0 %	75 %	113953976
41497	NC_008319	ACC	2	6	2433461	2433466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953976
41498	NC_008319	GT	3	6	2433484	2433489	0 %	50 %	50 %	0 %	113953976
41499	NC_008319	CAC	2	6	2433497	2433502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953976
41500	NC_008319	CAC	2	6	2433506	2433511	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953976

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