MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9311

Total Repeats: 44579

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
40001	NC_008319	CAAA	2	8	2348903	2348910	75 %	0 %	0 %	25 %	113955137
40002	NC_008319	A	6	6	2348908	2348913	100 %	0 %	0 %	0 %	113955137
40003	NC_008319	CAC	2	6	2349387	2349392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954447
40004	NC_008319	A	6	6	2349393	2349398	100 %	0 %	0 %	0 %	113954447
40005	NC_008319	CAAT	2	8	2349435	2349442	50 %	25 %	0 %	25 %	113954447
40006	NC_008319	CCA	2	6	2349494	2349499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954447
40007	NC_008319	A	6	6	2349509	2349514	100 %	0 %	0 %	0 %	113954447
40008	NC_008319	TTG	2	6	2349557	2349562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954447
40009	NC_008319	CAA	2	6	2349736	2349741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113954447
40010	NC_008319	AGA	2	6	2349744	2349749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113954447
40011	NC_008319	ATAA	2	8	2349751	2349758	75 %	25 %	0 %	0 %	113954447
40012	NC_008319	CTGAT	2	10	2350168	2350177	20 %	40 %	20 %	20 %	113953865
40013	NC_008319	GTC	2	6	2350191	2350196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953865
40014	NC_008319	CGA	2	6	2350202	2350207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953865
40015	NC_008319	ACC	2	6	2350284	2350289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953865
40016	NC_008319	AC	3	6	2350388	2350393	50 %	0 %	0 %	50 %	113953865
40017	NC_008319	TCG	2	6	2350411	2350416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953865
40018	NC_008319	TCA	2	6	2350480	2350485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953865
40019	NC_008319	CTCA	2	8	2350524	2350531	25 %	25 %	0 %	50 %	113953865
40020	NC_008319	CCA	2	6	2350603	2350608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953865
40021	NC_008319	CAT	2	6	2350676	2350681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953865
40022	NC_008319	GCAA	2	8	2350712	2350719	50 %	0 %	25 %	25 %	113953865
40023	NC_008319	GCA	2	6	2350771	2350776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953865
40024	NC_008319	TCGT	2	8	2350836	2350843	0 %	50 %	25 %	25 %	113953865
40025	NC_008319	CGG	2	6	2350863	2350868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953865
40026	NC_008319	ACC	2	6	2350878	2350883	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953865
40027	NC_008319	CCT	2	6	2351069	2351074	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113953865
40028	NC_008319	GGT	2	6	2351081	2351086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953865
40029	NC_008319	AC	3	6	2351117	2351122	50 %	0 %	0 %	50 %	113953865
40030	NC_008319	GCA	3	9	2351168	2351176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953865
40031	NC_008319	ACA	2	6	2351354	2351359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953865
40032	NC_008319	ATC	2	6	2351364	2351369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953865
40033	NC_008319	GGT	2	6	2351371	2351376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953865
40034	NC_008319	CGT	2	6	2351396	2351401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953865
40035	NC_008319	TCC	2	6	2351431	2351436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113953865
40036	NC_008319	ACC	2	6	2351476	2351481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953865
40037	NC_008319	CTG	2	6	2351511	2351516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953865
40038	NC_008319	GTT	2	6	2351568	2351573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953865
40039	NC_008319	TGC	2	6	2351645	2351650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953865
40040	NC_008319	GTG	2	6	2351731	2351736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953865
40041	NC_008319	AGC	2	6	2351938	2351943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952948
40042	NC_008319	CTG	2	6	2351984	2351989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952948
40043	NC_008319	TGG	2	6	2352013	2352018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113952948
40044	NC_008319	GGC	2	6	2352062	2352067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113952948
40045	NC_008319	GCC	2	6	2352192	2352197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113952948
40046	NC_008319	GTC	2	6	2352303	2352308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952948
40047	NC_008319	GC	3	6	2352384	2352389	0 %	0 %	50 %	50 %	113952948
40048	NC_008319	TGA	2	6	2352425	2352430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113952948
40049	NC_008319	GCC	2	6	2352432	2352437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113952948
40050	NC_008319	GGA	2	6	2352440	2352445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113952948
40051	NC_008319	CGA	2	6	2352539	2352544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952948
40052	NC_008319	AGG	2	6	2352578	2352583	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113952948
40053	NC_008319	GTT	2	6	2352593	2352598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113952948
40054	NC_008319	GGC	2	6	2352635	2352640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113952948
40055	NC_008319	GCC	2	6	2352666	2352671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113952948
40056	NC_008319	GGCA	2	8	2352682	2352689	25 %	0 %	50 %	25 %	113952948
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40058	NC_008319	TGG	2	6	2352754	2352759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113952948
40059	NC_008319	GA	3	6	2352777	2352782	50 %	0 %	50 %	0 %	113952948
40060	NC_008319	GAA	2	6	2352796	2352801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113952948
40061	NC_008319	GAA	2	6	2353043	2353048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113954769
40062	NC_008319	AGC	2	6	2353080	2353085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954769
40063	NC_008319	TC	3	6	2353099	2353104	0 %	50 %	0 %	50 %	113954769
40064	NC_008319	ACGC	2	8	2353118	2353125	25 %	0 %	25 %	50 %	113954769
40065	NC_008319	CAG	2	6	2353132	2353137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954769
40066	NC_008319	TCA	2	6	2353170	2353175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954769
40067	NC_008319	CCG	2	6	2353182	2353187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113954769
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40069	NC_008319	AGG	2	6	2353347	2353352	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113954769
40070	NC_008319	GAA	2	6	2353366	2353371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113954769
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40072	NC_008319	GTCGCT	2	12	2353520	2353531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954769
40073	NC_008319	TCG	2	6	2353605	2353610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954769
40074	NC_008319	GC	3	6	2353638	2353643	0 %	0 %	50 %	50 %	113954769
40075	NC_008319	CGCT	2	8	2353686	2353693	0 %	25 %	25 %	50 %	113954769
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40083	NC_008319	CCT	2	6	2354195	2354200	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113954769
40084	NC_008319	CTG	2	6	2354201	2354206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954769
40085	NC_008319	TAA	2	6	2355359	2355364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113954245
40086	NC_008319	CGA	2	6	2355669	2355674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954050
40087	NC_008319	CACAA	2	10	2355727	2355736	60 %	0 %	0 %	40 %	113954050
40088	NC_008319	TTGA	2	8	2355745	2355752	25 %	50 %	25 %	0 %	113954050
40089	NC_008319	CGTTC	2	10	2355773	2355782	0 %	40 %	20 %	40 %	113954050
40090	NC_008319	CCG	2	6	2355846	2355851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113954050
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40093	NC_008319	GCGG	2	8	2356021	2356028	0 %	0 %	75 %	25 %	113954050
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40096	NC_008319	CAG	2	6	2356119	2356124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954050
40097	NC_008319	TC	3	6	2356188	2356193	0 %	50 %	0 %	50 %	113954050
40098	NC_008319	CGAG	2	8	2356223	2356230	25 %	0 %	50 %	25 %	113954050
40099	NC_008319	TCA	2	6	2356253	2356258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954050
40100	NC_008319	GAGGC	2	10	2356294	2356303	20 %	0 %	60 %	20 %	113954050
40101	NC_008319	GAC	2	6	2356309	2356314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954050
40102	NC_008319	ATG	2	6	2356318	2356323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954050
40103	NC_008319	CAG	2	6	2356348	2356353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954050
40104	NC_008319	CGGGGC	2	12	2356397	2356408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954050
40105	NC_008319	GCG	2	6	2356425	2356430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954050
40106	NC_008319	TGCC	2	8	2356500	2356507	0 %	25 %	25 %	50 %	113954050
40107	NC_008319	TGG	2	6	2356620	2356625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954050
40108	NC_008319	GGC	2	6	2356639	2356644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954050
40109	NC_008319	GTT	2	6	2356802	2356807	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954050
40110	NC_008319	CAA	2	6	2356831	2356836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113954050
40111	NC_008319	GTC	2	6	2356837	2356842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954050
40112	NC_008319	CAATCA	2	12	2356854	2356865	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	113954050
40113	NC_008319	CTG	2	6	2356891	2356896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954050
40114	NC_008319	TG	3	6	2356969	2356974	0 %	50 %	50 %	0 %	113954050
40115	NC_008319	AGCA	2	8	2357044	2357051	50 %	0 %	25 %	25 %	113954050
40116	NC_008319	GTG	2	6	2357075	2357080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954050
40117	NC_008319	TTCC	2	8	2357148	2357155	0 %	50 %	0 %	50 %	113954050
40118	NC_008319	AAAC	2	8	2357198	2357205	75 %	0 %	0 %	25 %	113954050
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40228	NC_008319	CTGCC	2	10	2364872	2364881	0 %	20 %	20 %	60 %	113953632
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40234	NC_008319	CGC	2	6	2365054	2365059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113953632
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40262	NC_008319	TCC	2	6	2366745	2366750	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113953663
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40336	NC_008319	CGG	2	6	2370615	2370620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113955241
40337	NC_008319	TGA	2	6	2370630	2370635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955241
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40341	NC_008319	TCG	3	9	2370742	2370750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955241
40342	NC_008319	TCAA	2	8	2370866	2370873	50 %	25 %	0 %	25 %	113953728
40343	NC_008319	CCA	3	9	2370973	2370981	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953728
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40346	NC_008319	A	7	7	2371102	2371108	100 %	0 %	0 %	0 %	113953728
40347	NC_008319	TCA	2	6	2371166	2371171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953728
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40349	NC_008319	CGG	2	6	2371273	2371278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953728
40350	NC_008319	GCA	2	6	2371284	2371289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953728
40351	NC_008319	GCTG	2	8	2371337	2371344	0 %	25 %	50 %	25 %	113953728
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40466	NC_008319	TCA	2	6	2377724	2377729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953625
40467	NC_008319	TGGGA	2	10	2377741	2377750	20 %	20 %	60 %	0 %	113953625
40468	NC_008319	ATGA	2	8	2377767	2377774	50 %	25 %	25 %	0 %	113953625
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40472	NC_008319	ACCAC	2	10	2377896	2377905	40 %	0 %	0 %	60 %	113953625
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40481	NC_008319	CTG	2	6	2378295	2378300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953625
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