MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9311

Total Repeats: 44579

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
39501	NC_008319	GAT	2	6	2322806	2322811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954025
39502	NC_008319	CAA	3	9	2322851	2322859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113954025
39503	NC_008319	GGT	2	6	2322873	2322878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954025
39504	NC_008319	GCC	2	6	2322882	2322887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113954025
39505	NC_008319	TGA	2	6	2322950	2322955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954025
39506	NC_008319	TCA	2	6	2322967	2322972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954025
39507	NC_008319	CAA	2	6	2322974	2322979	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113954025
39508	NC_008319	CGC	2	6	2322993	2322998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113954025
39509	NC_008319	ACG	2	6	2323117	2323122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954025
39510	NC_008319	AGG	2	6	2323150	2323155	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113954025
39511	NC_008319	CGG	2	6	2323241	2323246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954025
39512	NC_008319	A	6	6	2323329	2323334	100 %	0 %	0 %	0 %	113954025
39513	NC_008319	CAA	2	6	2323421	2323426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113954025
39514	NC_008319	GGC	2	6	2323457	2323462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954025
39515	NC_008319	CAA	2	6	2323469	2323474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113954025
39516	NC_008319	TCCT	2	8	2323483	2323490	0 %	50 %	0 %	50 %	113954025
39517	NC_008319	CAT	2	6	2323520	2323525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954025
39518	NC_008319	TCGA	2	8	2323539	2323546	25 %	25 %	25 %	25 %	113954025
39519	NC_008319	TTC	2	6	2323616	2323621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953048
39520	NC_008319	CCG	2	6	2323638	2323643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113953048
39521	NC_008319	CCAC	2	8	2323663	2323670	25 %	0 %	0 %	75 %	113953048
39522	NC_008319	CTGG	2	8	2323677	2323684	0 %	25 %	50 %	25 %	113953048
39523	NC_008319	GGC	2	6	2323810	2323815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953048
39524	NC_008319	CAT	2	6	2323894	2323899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953048
39525	NC_008319	GCT	2	6	2323924	2323929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953048
39526	NC_008319	TCC	2	6	2324038	2324043	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113955316
39527	NC_008319	CAACG	2	10	2324062	2324071	40 %	0 %	20 %	40 %	113955316
39528	NC_008319	GCC	2	6	2324092	2324097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113955316
39529	NC_008319	CGT	2	6	2324100	2324105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955316
39530	NC_008319	AG	3	6	2324148	2324153	50 %	0 %	50 %	0 %	113955316
39531	NC_008319	CGC	2	6	2324172	2324177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113955316
39532	NC_008319	GCC	2	6	2324179	2324184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113955316
39533	NC_008319	GTG	2	6	2324236	2324241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955316
39534	NC_008319	GGC	2	6	2324275	2324280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113955316
39535	NC_008319	GCT	2	6	2324324	2324329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955316
39536	NC_008319	CTGG	2	8	2324448	2324455	0 %	25 %	50 %	25 %	113955316
39537	NC_008319	CGT	2	6	2324497	2324502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954629
39538	NC_008319	ACA	2	6	2324512	2324517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113954629
39539	NC_008319	GCA	2	6	2324552	2324557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954629
39540	NC_008319	CAT	2	6	2324588	2324593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954629
39541	NC_008319	AGC	2	6	2324641	2324646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954629
39542	NC_008319	GGT	2	6	2324649	2324654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954629
39543	NC_008319	TGC	2	6	2324700	2324705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953847
39544	NC_008319	GAT	2	6	2324750	2324755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953847
39545	NC_008319	TGAC	2	8	2324773	2324780	25 %	25 %	25 %	25 %	113953847
39546	NC_008319	CCGC	2	8	2324814	2324821	0 %	0 %	25 %	75 %	113953847
39547	NC_008319	CAC	2	6	2324828	2324833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953847
39548	NC_008319	ATG	2	6	2324838	2324843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953847
39549	NC_008319	GTT	2	6	2324852	2324857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953847
39550	NC_008319	A	7	7	2324895	2324901	100 %	0 %	0 %	0 %	113953847
39551	NC_008319	CTG	2	6	2324914	2324919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953847
39552	NC_008319	TTG	2	6	2324928	2324933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953847
39553	NC_008319	AGA	2	6	2324974	2324979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113954128
39554	NC_008319	GCT	2	6	2325077	2325082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954128
39555	NC_008319	AGCC	2	8	2325091	2325098	25 %	0 %	25 %	50 %	113954128
39556	NC_008319	GGCT	2	8	2325116	2325123	0 %	25 %	50 %	25 %	113954128
39557	NC_008319	AGCCC	2	10	2325132	2325141	20 %	0 %	20 %	60 %	113954128
39558	NC_008319	CCA	2	6	2325179	2325184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954128
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39561	NC_008319	GCT	2	6	2325281	2325286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954128
39562	NC_008319	CAC	2	6	2325302	2325307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954128
39563	NC_008319	GCT	2	6	2325393	2325398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954128
39564	NC_008319	CCA	2	6	2325399	2325404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954128
39565	NC_008319	GC	3	6	2325447	2325452	0 %	0 %	50 %	50 %	113954128
39566	NC_008319	CGC	2	6	2325463	2325468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113954128
39567	NC_008319	AC	3	6	2325482	2325487	50 %	0 %	0 %	50 %	113954128
39568	NC_008319	CAT	2	6	2325512	2325517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954128
39569	NC_008319	CAC	2	6	2325527	2325532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954128
39570	NC_008319	GAA	2	6	2325548	2325553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113954128
39571	NC_008319	CCA	3	9	2325572	2325580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954128
39572	NC_008319	CCAG	2	8	2325655	2325662	25 %	0 %	25 %	50 %	113954128
39573	NC_008319	CTC	2	6	2325668	2325673	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113954128
39574	NC_008319	TGC	2	6	2325694	2325699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954128
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39576	NC_008319	CGG	2	6	2325816	2325821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954128
39577	NC_008319	TCA	2	6	2325827	2325832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954128
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39583	NC_008319	CCA	2	6	2326042	2326047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954128
39584	NC_008319	ACACC	2	10	2326055	2326064	40 %	0 %	0 %	60 %	113954128
39585	NC_008319	CGCC	2	8	2326117	2326124	0 %	0 %	25 %	75 %	113954128
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39588	NC_008319	GCC	2	6	2326338	2326343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113954738
39589	NC_008319	CCA	2	6	2326392	2326397	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954738
39590	NC_008319	GAGGC	2	10	2326427	2326436	20 %	0 %	60 %	20 %	113954738
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39596	NC_008319	TCC	2	6	2326761	2326766	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113954738
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39598	NC_008319	CAA	2	6	2326871	2326876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113954738
39599	NC_008319	CAG	2	6	2326906	2326911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954738
39600	NC_008319	GCA	2	6	2326950	2326955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954738
39601	NC_008319	GCT	2	6	2326974	2326979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954738
39602	NC_008319	GCT	2	6	2327006	2327011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954738
39603	NC_008319	ACC	2	6	2327022	2327027	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954738
39604	NC_008319	CAT	2	6	2327036	2327041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954738
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39606	NC_008319	TGC	2	6	2327319	2327324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955548
39607	NC_008319	GCA	2	6	2327358	2327363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955548
39608	NC_008319	GCCGCT	2	12	2327375	2327386	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	113955548
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39611	NC_008319	CAC	2	6	2327515	2327520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113955548
39612	NC_008319	TGA	2	6	2327558	2327563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955548
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39614	NC_008319	CAG	2	6	2327652	2327657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955548
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39616	NC_008319	GCCA	2	8	2327702	2327709	25 %	0 %	25 %	50 %	113955548
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