MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9311

Total Repeats: 44579

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_008319	TAT	2	6	187395	187400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113954049
3502	NC_008319	TAA	2	6	187402	187407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113954049
3503	NC_008319	T	7	7	187474	187480	0 %	100 %	0 %	0 %	113954049
3504	NC_008319	TTC	2	6	187507	187512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954049
3505	NC_008319	GCCATT	2	12	187634	187645	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	113954049
3506	NC_008319	TTG	2	6	187706	187711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954049
3507	NC_008319	CAC	2	6	187887	187892	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954049
3508	NC_008319	GAA	2	6	187894	187899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113954049
3509	NC_008319	AAT	2	6	187925	187930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113954049
3510	NC_008319	GAAA	2	8	188005	188012	75 %	0 %	25 %	0 %	113954049
3511	NC_008319	TCC	2	6	188233	188238	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113954049
3512	NC_008319	CAT	2	6	188289	188294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954049
3513	NC_008319	ATT	2	6	188306	188311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113954049
3514	NC_008319	CGT	2	6	188329	188334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954049
3515	NC_008319	TTTAA	2	10	188378	188387	40 %	60 %	0 %	0 %	113954049
3516	NC_008319	CAC	2	6	188388	188393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954049
3517	NC_008319	CGC	2	6	188404	188409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113954049
3518	NC_008319	GATA	2	8	188430	188437	50 %	25 %	25 %	0 %	113954049
3519	NC_008319	GGA	3	9	188456	188464	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113954049
3520	NC_008319	CTT	2	6	188486	188491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954049
3521	NC_008319	ACC	2	6	188566	188571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954049
3522	NC_008319	CAATA	2	10	188574	188583	60 %	20 %	0 %	20 %	113954049
3523	NC_008319	CATTC	2	10	188668	188677	20 %	40 %	0 %	40 %	113954049
3524	NC_008319	CTA	2	6	188681	188686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954049
3525	NC_008319	ATGC	2	8	188712	188719	25 %	25 %	25 %	25 %	113954049
3526	NC_008319	AAGC	2	8	188750	188757	50 %	0 %	25 %	25 %	113954049
3527	NC_008319	CAA	2	6	188770	188775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113954049
3528	NC_008319	TC	3	6	188777	188782	0 %	50 %	0 %	50 %	113954049
3529	NC_008319	AAT	2	6	188875	188880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113954049
3530	NC_008319	AGT	2	6	188900	188905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954049
3531	NC_008319	CTT	2	6	188907	188912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954049
3532	NC_008319	TAT	2	6	188931	188936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113954049
3533	NC_008319	CAT	2	6	188965	188970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954049
3534	NC_008319	ACC	2	6	189013	189018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954049
3535	NC_008319	CA	3	6	189027	189032	50 %	0 %	0 %	50 %	113954049
3536	NC_008319	TGCATA	2	12	189202	189213	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	113953105
3537	NC_008319	ATT	2	6	189262	189267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113953105
3538	NC_008319	CTT	2	6	189344	189349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953105
3539	NC_008319	AT	3	6	189401	189406	50 %	50 %	0 %	0 %	113953105
3540	NC_008319	CCTTG	2	10	189411	189420	0 %	40 %	20 %	40 %	113953105
3541	NC_008319	TGC	2	6	189459	189464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953105
3542	NC_008319	AAC	2	6	189582	189587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953105
3543	NC_008319	TGT	2	6	189603	189608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953105
3544	NC_008319	TAT	2	6	189609	189614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113953105
3545	NC_008319	TTA	2	6	189641	189646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113953105
3546	NC_008319	CT	3	6	189691	189696	0 %	50 %	0 %	50 %	113953105
3547	NC_008319	GCA	2	6	189697	189702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953105
3548	NC_008319	AT	3	6	189752	189757	50 %	50 %	0 %	0 %	113953105
3549	NC_008319	GCTG	2	8	189760	189767	0 %	25 %	50 %	25 %	113953105
3550	NC_008319	ACA	2	6	189781	189786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953105
3551	NC_008319	TTG	2	6	189848	189853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953105
3552	NC_008319	TCAA	2	8	189904	189911	50 %	25 %	0 %	25 %	113953105
3553	NC_008319	GTTT	2	8	190131	190138	0 %	75 %	25 %	0 %	113953105
3554	NC_008319	CGA	2	6	190158	190163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953105
3555	NC_008319	AAG	2	6	190164	190169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113953105
3556	NC_008319	TGC	2	6	190172	190177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953105
3557	NC_008319	ATTA	2	8	190194	190201	50 %	50 %	0 %	0 %	113953105
3558	NC_008319	AAT	2	6	190233	190238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113953105
3559	NC_008319	TAT	3	9	190250	190258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113953105
3560	NC_008319	GCG	2	6	190264	190269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953105
3561	NC_008319	ATC	2	6	190338	190343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953105
3562	NC_008319	T	6	6	190511	190516	0 %	100 %	0 %	0 %	113953105
3563	NC_008319	ATC	2	6	190565	190570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113955370
3564	NC_008319	CTC	2	6	190651	190656	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113955370
3565	NC_008319	CCAT	2	8	190660	190667	25 %	25 %	0 %	50 %	113955370
3566	NC_008319	CAAA	2	8	190705	190712	75 %	0 %	0 %	25 %	113955370
3567	NC_008319	TTA	2	6	190761	190766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113955370
3568	NC_008319	ATT	2	6	190794	190799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113955370
3569	NC_008319	AAT	2	6	190800	190805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113955370
3570	NC_008319	CTT	2	6	190869	190874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113955370
3571	NC_008319	CCAC	2	8	190929	190936	25 %	0 %	0 %	75 %	113955370
3572	NC_008319	ATT	2	6	191012	191017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113955370
3573	NC_008319	ATA	2	6	191113	191118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113955370
3574	NC_008319	AT	3	6	191125	191130	50 %	50 %	0 %	0 %	113955370
3575	NC_008319	TAC	2	6	191153	191158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113955370
3576	NC_008319	AGC	2	6	191174	191179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955370
3577	NC_008319	CGAT	2	8	191186	191193	25 %	25 %	25 %	25 %	113955370
3578	NC_008319	TTA	2	6	191197	191202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113955370
3579	NC_008319	AAAT	2	8	191226	191233	75 %	25 %	0 %	0 %	113955370
3580	NC_008319	GTA	2	6	191252	191257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955370
3581	NC_008319	TAG	2	6	191288	191293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955370
3582	NC_008319	AATA	2	8	191345	191352	75 %	25 %	0 %	0 %	113955370
3583	NC_008319	CAC	2	6	191410	191415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113955370
3584	NC_008319	AATG	2	8	191519	191526	50 %	25 %	25 %	0 %	113955370
3585	NC_008319	CAA	2	6	191537	191542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113955370
3586	NC_008319	TGG	2	6	191686	191691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955078
3587	NC_008319	ATTC	2	8	191716	191723	25 %	50 %	0 %	25 %	113955078
3588	NC_008319	ATT	2	6	191770	191775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113955078
3589	NC_008319	TCA	2	6	191894	191899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113955078
3590	NC_008319	GCTA	2	8	191953	191960	25 %	25 %	25 %	25 %	113955078
3591	NC_008319	TCA	2	6	191975	191980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113955078
3592	NC_008319	GTG	2	6	191983	191988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955078
3593	NC_008319	TAG	2	6	192010	192015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955078
3594	NC_008319	GATA	2	8	192020	192027	50 %	25 %	25 %	0 %	113955078
3595	NC_008319	TC	3	6	192049	192054	0 %	50 %	0 %	50 %	113955078
3596	NC_008319	TGG	2	6	192064	192069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955078
3597	NC_008319	AGC	2	6	192121	192126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955078
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3600	NC_008319	ATTAA	2	10	192332	192341	60 %	40 %	0 %	0 %	113955078
3601	NC_008319	CTT	2	6	192373	192378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113955078
3602	NC_008319	CTC	2	6	192436	192441	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113955078
3603	NC_008319	GT	3	6	192447	192452	0 %	50 %	50 %	0 %	113955078
3604	NC_008319	TCT	2	6	192470	192475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113955078
3605	NC_008319	CT	3	6	192518	192523	0 %	50 %	0 %	50 %	113955078
3606	NC_008319	A	6	6	192556	192561	100 %	0 %	0 %	0 %	113955078
3607	NC_008319	AAT	2	6	192580	192585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113955078
3608	NC_008319	TC	3	6	192653	192658	0 %	50 %	0 %	50 %	113954070
3609	NC_008319	AT	3	6	192840	192845	50 %	50 %	0 %	0 %	113954070
3610	NC_008319	GCA	2	6	192847	192852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954070
3611	NC_008319	AAAGC	2	10	192856	192865	60 %	0 %	20 %	20 %	113954070
3612	NC_008319	TTG	2	6	192872	192877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954070
3613	NC_008319	TTG	2	6	192930	192935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954070
3614	NC_008319	GCA	2	6	193030	193035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954070
3615	NC_008319	CTG	3	9	193043	193051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954070
3616	NC_008319	CAT	2	6	193130	193135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954070
3617	NC_008319	TA	3	6	193184	193189	50 %	50 %	0 %	0 %	113954070
3618	NC_008319	TGCT	2	8	193211	193218	0 %	50 %	25 %	25 %	113954070
3619	NC_008319	TAC	2	6	193248	193253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954070
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3987	NC_008319	CTG	2	6	212043	212048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953821
3988	NC_008319	CTT	2	6	212078	212083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953821
3989	NC_008319	CAG	2	6	212109	212114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953821
3990	NC_008319	GTT	2	6	212115	212120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953821
3991	NC_008319	ATAA	2	8	212153	212160	75 %	25 %	0 %	0 %	113953821
3992	NC_008319	T	6	6	212168	212173	0 %	100 %	0 %	0 %	113953821
3993	NC_008319	TCA	2	6	212216	212221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953821
3994	NC_008319	GGC	2	6	212264	212269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953821
3995	NC_008319	GAGC	2	8	212279	212286	25 %	0 %	50 %	25 %	113953821
3996	NC_008319	GAA	2	6	212298	212303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113953821
3997	NC_008319	GCATCA	2	12	212332	212343	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	113953821
3998	NC_008319	GCT	2	6	212409	212414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953821
3999	NC_008319	G	6	6	212421	212426	0 %	0 %	100 %	0 %	113953821
4000	NC_008319	TTTTG	2	10	212442	212451	0 %	80 %	20 %	0 %	113953821

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