MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9311

Total Repeats: 44579

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
38001	NC_008319	ATG	2	6	2238545	2238550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113952719
38002	NC_008319	AAG	2	6	2238600	2238605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113952719
38003	NC_008319	GCC	2	6	2238629	2238634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113952719
38004	NC_008319	AACC	2	8	2238669	2238676	50 %	0 %	0 %	50 %	113952719
38005	NC_008319	CG	3	6	2238876	2238881	0 %	0 %	50 %	50 %	113952719
38006	NC_008319	CA	3	6	2238957	2238962	50 %	0 %	0 %	50 %	113952719
38007	NC_008319	AGC	2	6	2239011	2239016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952719
38008	NC_008319	GGA	2	6	2239033	2239038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113952719
38009	NC_008319	TCTCC	2	10	2239178	2239187	0 %	40 %	0 %	60 %	113955535
38010	NC_008319	CTT	2	6	2239208	2239213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113955535
38011	NC_008319	GGC	2	6	2239262	2239267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113955535
38012	NC_008319	TCA	2	6	2239312	2239317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113955535
38013	NC_008319	GCA	2	6	2239354	2239359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955535
38014	NC_008319	ATC	2	6	2239422	2239427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113955535
38015	NC_008319	AC	3	6	2239435	2239440	50 %	0 %	0 %	50 %	113955535
38016	NC_008319	AG	3	6	2239510	2239515	50 %	0 %	50 %	0 %	113954407
38017	NC_008319	TCC	2	6	2239561	2239566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113954407
38018	NC_008319	AGCC	2	8	2239591	2239598	25 %	0 %	25 %	50 %	113954407
38019	NC_008319	CCAT	2	8	2239609	2239616	25 %	25 %	0 %	50 %	113954407
38020	NC_008319	CGT	3	9	2239669	2239677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954407
38021	NC_008319	CTCC	2	8	2239684	2239691	0 %	25 %	0 %	75 %	113954407
38022	NC_008319	TAA	2	6	2239747	2239752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113954407
38023	NC_008319	CAAT	2	8	2239771	2239778	50 %	25 %	0 %	25 %	113954407
38024	NC_008319	CAT	3	9	2239817	2239825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954407
38025	NC_008319	TCG	2	6	2239907	2239912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954407
38026	NC_008319	ACG	2	6	2239928	2239933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954407
38027	NC_008319	TACT	2	8	2239942	2239949	25 %	50 %	0 %	25 %	113954407
38028	NC_008319	ATGC	2	8	2239992	2239999	25 %	25 %	25 %	25 %	113954407
38029	NC_008319	CAC	2	6	2240027	2240032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954407
38030	NC_008319	ATC	2	6	2240142	2240147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954407
38031	NC_008319	CTG	2	6	2240163	2240168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954407
38032	NC_008319	ATT	2	6	2240253	2240258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113954407
38033	NC_008319	ATCA	2	8	2240271	2240278	50 %	25 %	0 %	25 %	113954407
38034	NC_008319	CAT	2	6	2240283	2240288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954407
38035	NC_008319	TGC	2	6	2240301	2240306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954407
38036	NC_008319	TAA	2	6	2240383	2240388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113954407
38037	NC_008319	CGAGC	2	10	2240408	2240417	20 %	0 %	40 %	40 %	113954407
38038	NC_008319	AGC	2	6	2240565	2240570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954407
38039	NC_008319	CTG	2	6	2240625	2240630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954407
38040	NC_008319	TC	3	6	2240639	2240644	0 %	50 %	0 %	50 %	113954407
38041	NC_008319	GCG	2	6	2240696	2240701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954407
38042	NC_008319	CTG	2	6	2240768	2240773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954407
38043	NC_008319	CAAA	2	8	2240789	2240796	75 %	0 %	0 %	25 %	113954407
38044	NC_008319	TGC	2	6	2240876	2240881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953903
38045	NC_008319	GA	3	6	2240902	2240907	50 %	0 %	50 %	0 %	113953903
38046	NC_008319	CAA	2	6	2240926	2240931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953903
38047	NC_008319	AGC	2	6	2240980	2240985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953903
38048	NC_008319	AGC	2	6	2240993	2240998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953903
38049	NC_008319	CGGT	2	8	2241020	2241027	0 %	25 %	50 %	25 %	113953903
38050	NC_008319	TCA	2	6	2241074	2241079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953903
38051	NC_008319	TTG	2	6	2241085	2241090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953903
38052	NC_008319	GCT	2	6	2241144	2241149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953903
38053	NC_008319	ACC	2	6	2241330	2241335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953595
38054	NC_008319	CAG	2	6	2241336	2241341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953595
38055	NC_008319	AGT	2	6	2241388	2241393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953595
38056	NC_008319	AAG	2	6	2241417	2241422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113953595
38057	NC_008319	GCA	2	6	2241445	2241450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953595
38058	NC_008319	A	6	6	2241499	2241504	100 %	0 %	0 %	0 %	113953595
38059	NC_008319	CTG	2	6	2241509	2241514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953595
38060	NC_008319	TGG	2	6	2241553	2241558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953595
38061	NC_008319	GGC	2	6	2241590	2241595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953595
38062	NC_008319	CAA	2	6	2241599	2241604	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953595
38063	NC_008319	GCTG	2	8	2241610	2241617	0 %	25 %	50 %	25 %	113953595
38064	NC_008319	CCG	2	6	2241750	2241755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113953595
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38067	NC_008319	TCCA	2	8	2241807	2241814	25 %	25 %	0 %	50 %	113953595
38068	NC_008319	AGCA	2	8	2241822	2241829	50 %	0 %	25 %	25 %	113953595
38069	NC_008319	ACG	2	6	2241877	2241882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953090
38070	NC_008319	GCAT	2	8	2241883	2241890	25 %	25 %	25 %	25 %	113953090
38071	NC_008319	GCATT	2	10	2241899	2241908	20 %	40 %	20 %	20 %	113953090
38072	NC_008319	GC	3	6	2241991	2241996	0 %	0 %	50 %	50 %	113953090
38073	NC_008319	GCT	2	6	2242138	2242143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953090
38074	NC_008319	TGGCCA	2	12	2242210	2242221	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	113953090
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38083	NC_008319	CGAA	2	8	2242533	2242540	50 %	0 %	25 %	25 %	113953090
38084	NC_008319	AG	3	6	2242557	2242562	50 %	0 %	50 %	0 %	113953090
38085	NC_008319	ACC	2	6	2242590	2242595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953090
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38088	NC_008319	CGG	2	6	2242726	2242731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953090
38089	NC_008319	TGA	2	6	2242733	2242738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953090
38090	NC_008319	CGT	2	6	2242767	2242772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953090
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38099	NC_008319	GGT	2	6	2243121	2243126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955447
38100	NC_008319	CTG	2	6	2243205	2243210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955447
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38103	NC_008319	GCA	4	12	2243504	2243515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954664
38104	NC_008319	GCT	2	6	2243562	2243567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954664
38105	NC_008319	GTC	2	6	2243587	2243592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954664
38106	NC_008319	CTG	2	6	2243681	2243686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954664
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38110	NC_008319	GCA	2	6	2243932	2243937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953377
38111	NC_008319	TGG	2	6	2243973	2243978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953377
38112	NC_008319	GCAA	2	8	2244024	2244031	50 %	0 %	25 %	25 %	113953377
38113	NC_008319	TCA	2	6	2244055	2244060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953377
38114	NC_008319	GCTC	2	8	2244073	2244080	0 %	25 %	25 %	50 %	113953377
38115	NC_008319	ACT	2	6	2244097	2244102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953377
38116	NC_008319	GGGA	2	8	2244119	2244126	25 %	0 %	75 %	0 %	113953377
38117	NC_008319	A	6	6	2244126	2244131	100 %	0 %	0 %	0 %	113953377
38118	NC_008319	TCGA	2	8	2244134	2244141	25 %	25 %	25 %	25 %	113953377
38119	NC_008319	TGA	2	6	2244160	2244165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953377
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38121	NC_008319	CATG	2	8	2244181	2244188	25 %	25 %	25 %	25 %	113953377
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38123	NC_008319	TG	3	6	2244281	2244286	0 %	50 %	50 %	0 %	113953377
38124	NC_008319	GCTCAC	2	12	2244361	2244372	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	113953377
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38130	NC_008319	CTC	2	6	2244630	2244635	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113952856
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38132	NC_008319	TCA	2	6	2244715	2244720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113952856
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38137	NC_008319	TCAA	2	8	2244814	2244821	50 %	25 %	0 %	25 %	113952856
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38152	NC_008319	G	7	7	2245907	2245913	0 %	0 %	100 %	0 %	113955031
38153	NC_008319	GGA	2	6	2245925	2245930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113955031
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38340	NC_008319	AGCAAG	2	12	2255375	2255386	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	113954439
38341	NC_008319	C	6	6	2255401	2255406	0 %	0 %	0 %	100 %	113954439
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38464	NC_008319	CAC	2	6	2261944	2261949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113952946
38465	NC_008319	GTT	2	6	2261953	2261958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113952946
38466	NC_008319	CTT	2	6	2261967	2261972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113952946
38467	NC_008319	GCC	3	9	2262007	2262015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113952946
38468	NC_008319	CCA	2	6	2262041	2262046	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113952946
38469	NC_008319	CAG	3	9	2262135	2262143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952946
38470	NC_008319	CAA	2	6	2262165	2262170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113952946
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38481	NC_008319	GCCA	2	8	2262874	2262881	25 %	0 %	25 %	50 %	113954830
38482	NC_008319	AGGC	2	8	2262907	2262914	25 %	0 %	50 %	25 %	113954830
38483	NC_008319	ATC	2	6	2263534	2263539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953777
38484	NC_008319	CAT	2	6	2263578	2263583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953777
38485	NC_008319	TCA	2	6	2263619	2263624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953777
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38492	NC_008319	ACC	2	6	2264092	2264097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953777
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38494	NC_008319	ACC	2	6	2264864	2264869	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953402
38495	NC_008319	GGA	2	6	2264987	2264992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113953402
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38497	NC_008319	TCC	2	6	2265096	2265101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113953402
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38499	NC_008319	GTT	2	6	2265127	2265132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953402
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