MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9311

Total Repeats: 44579

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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37002	NC_008319	ACG	2	6	2178670	2178675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954153
37003	NC_008319	ACA	2	6	2178799	2178804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113954153
37004	NC_008319	CCAG	2	8	2178810	2178817	25 %	0 %	25 %	50 %	113954153
37005	NC_008319	TTG	2	6	2178870	2178875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954572
37006	NC_008319	CTC	2	6	2178882	2178887	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113954572
37007	NC_008319	ATCG	2	8	2179069	2179076	25 %	25 %	25 %	25 %	113954308
37008	NC_008319	CTG	2	6	2179125	2179130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954308
37009	NC_008319	ACC	2	6	2179216	2179221	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954308
37010	NC_008319	GAA	3	9	2179314	2179322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113954308
37011	NC_008319	TTG	2	6	2179372	2179377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954308
37012	NC_008319	ACG	2	6	2179385	2179390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954308
37013	NC_008319	AAC	2	6	2179419	2179424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113954308
37014	NC_008319	CAT	2	6	2179446	2179451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954308
37015	NC_008319	GTC	2	6	2179465	2179470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954308
37016	NC_008319	GATCAA	2	12	2179509	2179520	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	113954308
37017	NC_008319	AGA	3	9	2179538	2179546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113954308
37018	NC_008319	GA	3	6	2179549	2179554	50 %	0 %	50 %	0 %	113954308
37019	NC_008319	ACT	2	6	2179562	2179567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954308
37020	NC_008319	TGA	2	6	2179598	2179603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954308
37021	NC_008319	GCA	2	6	2179615	2179620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954308
37022	NC_008319	CAC	2	6	2179638	2179643	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954308
37023	NC_008319	GCAT	2	8	2179705	2179712	25 %	25 %	25 %	25 %	113954308
37024	NC_008319	CT	3	6	2179786	2179791	0 %	50 %	0 %	50 %	113954308
37025	NC_008319	CAA	2	6	2179859	2179864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113954308
37026	NC_008319	TCC	2	6	2179922	2179927	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113954308
37027	NC_008319	ATCAA	2	10	2179937	2179946	60 %	20 %	0 %	20 %	113954308
37028	NC_008319	TTGAT	2	10	2179957	2179966	20 %	60 %	20 %	0 %	113954308
37029	NC_008319	A	7	7	2179989	2179995	100 %	0 %	0 %	0 %	113954308
37030	NC_008319	TCT	2	6	2180017	2180022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954308
37031	NC_008319	GCA	2	6	2180027	2180032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954308
37032	NC_008319	CAA	2	6	2180039	2180044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113954308
37033	NC_008319	TGCT	2	8	2180083	2180090	0 %	50 %	25 %	25 %	113954308
37034	NC_008319	AGAC	2	8	2180173	2180180	50 %	0 %	25 %	25 %	113954308
37035	NC_008319	CG	3	6	2180228	2180233	0 %	0 %	50 %	50 %	113954308
37036	NC_008319	ACA	2	6	2180269	2180274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113954308
37037	NC_008319	GCA	2	6	2180313	2180318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954308
37038	NC_008319	CA	3	6	2180317	2180322	50 %	0 %	0 %	50 %	113954308
37039	NC_008319	CAA	2	6	2180435	2180440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113954308
37040	NC_008319	T	6	6	2180837	2180842	0 %	100 %	0 %	0 %	113953046
37041	NC_008319	TTCT	2	8	2180857	2180864	0 %	75 %	0 %	25 %	113953046
37042	NC_008319	CTA	2	6	2180926	2180931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953046
37043	NC_008319	CTA	2	6	2180941	2180946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953046
37044	NC_008319	AGTG	2	8	2180982	2180989	25 %	25 %	50 %	0 %	113953046
37045	NC_008319	CTT	2	6	2181016	2181021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953046
37046	NC_008319	CTG	2	6	2181098	2181103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953046
37047	NC_008319	CGC	2	6	2181108	2181113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113953046
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37049	NC_008319	GAAA	2	8	2181290	2181297	75 %	0 %	25 %	0 %	113953046
37050	NC_008319	A	9	9	2181295	2181303	100 %	0 %	0 %	0 %	113953046
37051	NC_008319	TAT	2	6	2181312	2181317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113953046
37052	NC_008319	CTA	2	6	2181352	2181357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953046
37053	NC_008319	T	6	6	2181388	2181393	0 %	100 %	0 %	0 %	113953046
37054	NC_008319	ACCA	2	8	2181427	2181434	50 %	0 %	0 %	50 %	113953046
37055	NC_008319	TGCTT	2	10	2181449	2181458	0 %	60 %	20 %	20 %	113953046
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37057	NC_008319	CATT	2	8	2181563	2181570	25 %	50 %	0 %	25 %	113953046
37058	NC_008319	CTT	2	6	2181644	2181649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953046
37059	NC_008319	TATC	2	8	2181706	2181713	25 %	50 %	0 %	25 %	113953046
37060	NC_008319	GCA	2	6	2181715	2181720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953046
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37064	NC_008319	ACC	2	6	2182391	2182396	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953683
37065	NC_008319	TGCG	2	8	2182502	2182509	0 %	25 %	50 %	25 %	113953683
37066	NC_008319	CTC	2	6	2182510	2182515	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113953683
37067	NC_008319	AGCCC	2	10	2182563	2182572	20 %	0 %	20 %	60 %	113953683
37068	NC_008319	ATG	2	6	2182579	2182584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953683
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37070	NC_008319	TCT	2	6	2182658	2182663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953683
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37072	NC_008319	GGAT	2	8	2182702	2182709	25 %	25 %	50 %	0 %	113953683
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37075	NC_008319	CAACC	2	10	2182766	2182775	40 %	0 %	0 %	60 %	113953683
37076	NC_008319	TTC	2	6	2182864	2182869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953683
37077	NC_008319	TGA	2	6	2182940	2182945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953683
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37083	NC_008319	GAG	2	6	2183765	2183770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113954480
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37085	NC_008319	TCA	2	6	2183834	2183839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954480
37086	NC_008319	CAA	3	9	2183852	2183860	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113954480
37087	NC_008319	GGAT	2	8	2183928	2183935	25 %	25 %	50 %	0 %	113954480
37088	NC_008319	AGT	2	6	2184012	2184017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954480
37089	NC_008319	GAT	2	6	2184042	2184047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954480
37090	NC_008319	A	8	8	2184123	2184130	100 %	0 %	0 %	0 %	113954480
37091	NC_008319	AGCA	2	8	2184135	2184142	50 %	0 %	25 %	25 %	113954480
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37097	NC_008319	GAA	2	6	2184443	2184448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113954480
37098	NC_008319	TTCC	2	8	2184487	2184494	0 %	50 %	0 %	50 %	113954480
37099	NC_008319	CTT	2	6	2185075	2185080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953457
37100	NC_008319	CTT	2	6	2185303	2185308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954711
37101	NC_008319	GCT	2	6	2185395	2185400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954711
37102	NC_008319	AG	3	6	2185417	2185422	50 %	0 %	50 %	0 %	113954711
37103	NC_008319	ATC	2	6	2185475	2185480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954711
37104	NC_008319	AAG	2	6	2185526	2185531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113954711
37105	NC_008319	CGT	2	6	2185599	2185604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954711
37106	NC_008319	CAA	2	6	2186292	2186297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113954212
37107	NC_008319	GCG	2	6	2186302	2186307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954212
37108	NC_008319	AGA	2	6	2186330	2186335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113954212
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37110	NC_008319	AAG	2	6	2186388	2186393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113954212
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37112	NC_008319	TGG	2	6	2186408	2186413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954212
37113	NC_008319	CCTT	2	8	2186469	2186476	0 %	50 %	0 %	50 %	113954212
37114	NC_008319	AGA	2	6	2186505	2186510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113954212
37115	NC_008319	ACA	3	9	2186588	2186596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113954212
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37117	NC_008319	CGC	2	6	2186613	2186618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113954212
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37466	NC_008319	GATC	2	8	2203594	2203601	25 %	25 %	25 %	25 %	113955140
37467	NC_008319	ATC	2	6	2203684	2203689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113955140
37468	NC_008319	GCTGT	2	10	2203702	2203711	0 %	40 %	40 %	20 %	113955140
37469	NC_008319	ACG	2	6	2203769	2203774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955140
37470	NC_008319	GACA	2	8	2203825	2203832	50 %	0 %	25 %	25 %	113955140
37471	NC_008319	ATTC	2	8	2203840	2203847	25 %	50 %	0 %	25 %	113955140
37472	NC_008319	GGA	2	6	2203891	2203896	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113955140
37473	NC_008319	TGG	3	9	2203923	2203931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955140
37474	NC_008319	TCA	2	6	2203972	2203977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113955140
37475	NC_008319	GTG	2	6	2204015	2204020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955140
37476	NC_008319	CCAA	2	8	2204022	2204029	50 %	0 %	0 %	50 %	113955140
37477	NC_008319	CGAT	2	8	2204052	2204059	25 %	25 %	25 %	25 %	113955140
37478	NC_008319	ATCT	2	8	2204087	2204094	25 %	50 %	0 %	25 %	113955140
37479	NC_008319	AACC	2	8	2204163	2204170	50 %	0 %	0 %	50 %	113955140
37480	NC_008319	CAT	2	6	2204193	2204198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113955140
37481	NC_008319	TCA	2	6	2204244	2204249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953066
37482	NC_008319	TCC	2	6	2204267	2204272	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113953066
37483	NC_008319	ACG	2	6	2204280	2204285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953066
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37485	NC_008319	ATTG	2	8	2204319	2204326	25 %	50 %	25 %	0 %	113953066
37486	NC_008319	AG	3	6	2204336	2204341	50 %	0 %	50 %	0 %	113953066
37487	NC_008319	CGC	2	6	2204397	2204402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113953675
37488	NC_008319	CTT	2	6	2204513	2204518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953675
37489	NC_008319	GTGACA	2	12	2204535	2204546	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	113953675
37490	NC_008319	ATG	2	6	2204607	2204612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953675
37491	NC_008319	ACC	2	6	2204745	2204750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953675
37492	NC_008319	CACT	2	8	2204764	2204771	25 %	25 %	0 %	50 %	113953675
37493	NC_008319	GGA	2	6	2204838	2204843	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113953675
37494	NC_008319	CT	3	6	2204860	2204865	0 %	50 %	0 %	50 %	113953675
37495	NC_008319	ACA	2	6	2204884	2204889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953675
37496	NC_008319	CAA	2	6	2204936	2204941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953675
37497	NC_008319	GAC	2	6	2205034	2205039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953675
37498	NC_008319	TCT	2	6	2205083	2205088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953675
37499	NC_008319	TGGGG	2	10	2205157	2205166	0 %	20 %	80 %	0 %	113953675
37500	NC_008319	CAC	2	6	2205221	2205226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953675

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