MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9311

Total Repeats: 44579

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
36001	NC_008319	CGA	2	6	2109589	2109594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954879
36002	NC_008319	AGCG	2	8	2109601	2109608	25 %	0 %	50 %	25 %	113954879
36003	NC_008319	AAG	2	6	2109611	2109616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113954879
36004	NC_008319	CCA	2	6	2109653	2109658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954879
36005	NC_008319	AGA	2	6	2109691	2109696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113954879
36006	NC_008319	AGGG	2	8	2109710	2109717	25 %	0 %	75 %	0 %	113954879
36007	NC_008319	G	6	6	2110022	2110027	0 %	0 %	100 %	0 %	113955480
36008	NC_008319	TGA	2	6	2110079	2110084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955480
36009	NC_008319	GCA	2	6	2110086	2110091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955480
36010	NC_008319	CGA	2	6	2110094	2110099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955480
36011	NC_008319	GCG	2	6	2110125	2110130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113955480
36012	NC_008319	CAG	2	6	2110167	2110172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955480
36013	NC_008319	CAG	2	6	2110179	2110184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955480
36014	NC_008319	CCA	2	6	2110235	2110240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113955480
36015	NC_008319	ATTA	3	12	2110283	2110294	50 %	50 %	0 %	0 %	113955480
36016	NC_008319	CTG	2	6	2110580	2110585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952862
36017	NC_008319	CAG	2	6	2110634	2110639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952862
36018	NC_008319	AAT	2	6	2110664	2110669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113952862
36019	NC_008319	T	6	6	2110686	2110691	0 %	100 %	0 %	0 %	113952862
36020	NC_008319	AC	3	6	2110703	2110708	50 %	0 %	0 %	50 %	113952862
36021	NC_008319	GAC	2	6	2110758	2110763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952862
36022	NC_008319	CTCAAT	2	12	2110809	2110820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113952862
36023	NC_008319	GCC	2	6	2110876	2110881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113952862
36024	NC_008319	TTG	2	6	2111361	2111366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953463
36025	NC_008319	ATG	2	6	2111558	2111563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953107
36026	NC_008319	CG	3	6	2111606	2111611	0 %	0 %	50 %	50 %	113953107
36027	NC_008319	A	7	7	2111626	2111632	100 %	0 %	0 %	0 %	113953107
36028	NC_008319	GGC	2	6	2111637	2111642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953107
36029	NC_008319	AAGC	2	8	2111855	2111862	50 %	0 %	25 %	25 %	113953670
36030	NC_008319	GCA	2	6	2111911	2111916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953670
36031	NC_008319	AAC	2	6	2111918	2111923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953670
36032	NC_008319	CTCTTT	2	12	2111955	2111966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953670
36033	NC_008319	AGG	3	9	2111971	2111979	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113953670
36034	NC_008319	GCTGC	2	10	2113165	2113174	0 %	20 %	40 %	40 %	113952831
36035	NC_008319	GAA	2	6	2113281	2113286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113952831
36036	NC_008319	CTGA	2	8	2113291	2113298	25 %	25 %	25 %	25 %	113952831
36037	NC_008319	TGC	2	6	2113754	2113759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955577
36038	NC_008319	TATCAG	2	12	2113815	2113826	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	113955577
36039	NC_008319	CAA	2	6	2113863	2113868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113955577
36040	NC_008319	ATT	2	6	2113871	2113876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113955577
36041	NC_008319	GCA	2	6	2113878	2113883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955577
36042	NC_008319	ACA	2	6	2113976	2113981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113955577
36043	NC_008319	AATA	2	8	2113982	2113989	75 %	25 %	0 %	0 %	113955577
36044	NC_008319	ACA	3	9	2114078	2114086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113955577
36045	NC_008319	AGC	2	6	2114757	2114762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954810
36046	NC_008319	AATA	2	8	2114794	2114801	75 %	25 %	0 %	0 %	113954810
36047	NC_008319	GAG	2	6	2114888	2114893	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113954810
36048	NC_008319	TGA	2	6	2114923	2114928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954810
36049	NC_008319	A	6	6	2114996	2115001	100 %	0 %	0 %	0 %	113954810
36050	NC_008319	CCT	2	6	2115054	2115059	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113954810
36051	NC_008319	TGA	2	6	2115076	2115081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954810
36052	NC_008319	CTGC	2	8	2115136	2115143	0 %	25 %	25 %	50 %	113954810
36053	NC_008319	CT	3	6	2117066	2117071	0 %	50 %	0 %	50 %	113954624
36054	NC_008319	TGG	2	6	2117133	2117138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954624
36055	NC_008319	GCA	2	6	2117144	2117149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954624
36056	NC_008319	GAG	2	6	2117284	2117289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113954624
36057	NC_008319	GTG	2	6	2117336	2117341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954624
36058	NC_008319	GA	3	6	2117366	2117371	50 %	0 %	50 %	0 %	113954624
36059	NC_008319	TCCCTC	2	12	2117376	2117387	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113954624
36060	NC_008319	TGT	2	6	2117389	2117394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954624
36061	NC_008319	GCT	2	6	2117435	2117440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954624
36062	NC_008319	CAA	2	6	2117446	2117451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113954624
36063	NC_008319	TC	3	6	2117476	2117481	0 %	50 %	0 %	50 %	113954624
36064	NC_008319	GGC	2	6	2117600	2117605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954624
36065	NC_008319	CCTG	2	8	2117642	2117649	0 %	25 %	25 %	50 %	113954624
36066	NC_008319	CGA	2	6	2117659	2117664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954624
36067	NC_008319	GGA	2	6	2118014	2118019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113953805
36068	NC_008319	GA	3	6	2118018	2118023	50 %	0 %	50 %	0 %	113953805
36069	NC_008319	AGT	2	6	2118079	2118084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953805
36070	NC_008319	TGC	2	6	2118142	2118147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953805
36071	NC_008319	AAG	2	6	2118151	2118156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113953805
36072	NC_008319	GAG	2	6	2118167	2118172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113953805
36073	NC_008319	GAC	2	6	2118192	2118197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953805
36074	NC_008319	GTT	2	6	2118239	2118244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953805
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36077	NC_008319	GAG	2	6	2118641	2118646	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113953908
36078	NC_008319	TAAC	2	8	2118707	2118714	50 %	25 %	0 %	25 %	113953908
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36081	NC_008319	GCT	3	9	2119395	2119403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953425
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36083	NC_008319	TGC	2	6	2119508	2119513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953425
36084	NC_008319	GGGA	2	8	2119532	2119539	25 %	0 %	75 %	0 %	113953425
36085	NC_008319	TTC	2	6	2119558	2119563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953425
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36087	NC_008319	AAT	2	6	2119601	2119606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113953425
36088	NC_008319	CTCC	2	8	2119618	2119625	0 %	25 %	0 %	75 %	113953425
36089	NC_008319	TGAC	2	8	2119990	2119997	25 %	25 %	25 %	25 %	113953243
36090	NC_008319	TCG	2	6	2120026	2120031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953243
36091	NC_008319	TGA	2	6	2120062	2120067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953243
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36096	NC_008319	TCA	2	6	2120391	2120396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954569
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36100	NC_008319	AATT	2	8	2120781	2120788	50 %	50 %	0 %	0 %	113953014
36101	NC_008319	TCC	2	6	2120859	2120864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113953014
36102	NC_008319	AGT	2	6	2120942	2120947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953014
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36104	NC_008319	TCAT	2	8	2121067	2121074	25 %	50 %	0 %	25 %	113953014
36105	NC_008319	A	6	6	2121316	2121321	100 %	0 %	0 %	0 %	113953014
36106	NC_008319	TTAT	2	8	2121322	2121329	25 %	75 %	0 %	0 %	113953014
36107	NC_008319	TTG	2	6	2121431	2121436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953014
36108	NC_008319	TGT	2	6	2121440	2121445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953014
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36110	NC_008319	GCAA	2	8	2121475	2121482	50 %	0 %	25 %	25 %	113953014
36111	NC_008319	TGA	2	6	2121522	2121527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953014
36112	NC_008319	A	6	6	2121529	2121534	100 %	0 %	0 %	0 %	113953014
36113	NC_008319	TGA	2	6	2121614	2121619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953014
36114	NC_008319	GTC	2	6	2121744	2121749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953014
36115	NC_008319	GTCT	2	8	2121776	2121783	0 %	50 %	25 %	25 %	113953014
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36117	NC_008319	T	6	6	2121805	2121810	0 %	100 %	0 %	0 %	113953014
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36467	NC_008319	CAA	2	6	2149857	2149862	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113954217
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36492	NC_008319	CGTCCC	2	12	2151055	2151066	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	113954133
36493	NC_008319	TCGG	2	8	2151110	2151117	0 %	25 %	50 %	25 %	113954133
36494	NC_008319	TCA	2	6	2151136	2151141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954133
36495	NC_008319	CCG	2	6	2151197	2151202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113954133
36496	NC_008319	GA	3	6	2151224	2151229	50 %	0 %	50 %	0 %	113954133
36497	NC_008319	TTG	2	6	2151310	2151315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954133
36498	NC_008319	CT	3	6	2151326	2151331	0 %	50 %	0 %	50 %	113954133
36499	NC_008319	TCA	2	6	2151367	2151372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954133
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