MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9311

Total Repeats: 44579

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_008319	TGC	2	6	158834	158839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953412
3002	NC_008319	CAG	2	6	158917	158922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953412
3003	NC_008319	GCCTG	2	10	158975	158984	0 %	20 %	40 %	40 %	113953412
3004	NC_008319	ATT	2	6	159026	159031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113953412
3005	NC_008319	CTG	2	6	159079	159084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953412
3006	NC_008319	CCA	2	6	159141	159146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954651
3007	NC_008319	GCC	2	6	159164	159169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113954651
3008	NC_008319	AGCG	2	8	159178	159185	25 %	0 %	50 %	25 %	113954651
3009	NC_008319	TGC	2	6	159238	159243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954651
3010	NC_008319	GGT	2	6	159305	159310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954651
3011	NC_008319	GAACG	2	10	159327	159336	40 %	0 %	40 %	20 %	113954651
3012	NC_008319	CTG	2	6	159348	159353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954651
3013	NC_008319	CT	3	6	159357	159362	0 %	50 %	0 %	50 %	113954651
3014	NC_008319	CCA	2	6	159379	159384	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954651
3015	NC_008319	TTC	2	6	159414	159419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954651
3016	NC_008319	CCGGCA	2	12	159451	159462	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	113954651
3017	NC_008319	CCT	2	6	159506	159511	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113954651
3018	NC_008319	CGA	2	6	159536	159541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954651
3019	NC_008319	AGC	2	6	159574	159579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954651
3020	NC_008319	GCC	2	6	159606	159611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113954651
3021	NC_008319	GGT	2	6	159690	159695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954651
3022	NC_008319	CAA	2	6	159710	159715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113954651
3023	NC_008319	CAA	2	6	159743	159748	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113954651
3024	NC_008319	TTG	2	6	159778	159783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954651
3025	NC_008319	GGC	3	9	159873	159881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954651
3026	NC_008319	GGC	2	6	159885	159890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954651
3027	NC_008319	CGGC	2	8	160048	160055	0 %	0 %	50 %	50 %	113954651
3028	NC_008319	GCTC	2	8	160136	160143	0 %	25 %	25 %	50 %	113954651
3029	NC_008319	CCG	2	6	160215	160220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113954651
3030	NC_008319	GGC	2	6	160228	160233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954651
3031	NC_008319	CGG	2	6	160322	160327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954651
3032	NC_008319	AAC	2	6	160401	160406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113954651
3033	NC_008319	GGC	2	6	160470	160475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954651
3034	NC_008319	GGT	2	6	160521	160526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954651
3035	NC_008319	AAC	2	6	160560	160565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113954651
3036	NC_008319	C	6	6	160708	160713	0 %	0 %	0 %	100 %	113954651
3037	NC_008319	TGG	2	6	160741	160746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954651
3038	NC_008319	CAA	2	6	160748	160753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113954651
3039	NC_008319	ACC	2	6	160794	160799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954651
3040	NC_008319	CT	3	6	160802	160807	0 %	50 %	0 %	50 %	113954651
3041	NC_008319	GCA	2	6	160825	160830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954651
3042	NC_008319	CCG	2	6	160831	160836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113954651
3043	NC_008319	GCT	2	6	160859	160864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954651
3044	NC_008319	CTC	2	6	160928	160933	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113953781
3045	NC_008319	ACC	2	6	160951	160956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953781
3046	NC_008319	GCCC	2	8	160966	160973	0 %	0 %	25 %	75 %	113953781
3047	NC_008319	AGC	2	6	160991	160996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953781
3048	NC_008319	GCT	2	6	161005	161010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953781
3049	NC_008319	CGT	2	6	161012	161017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953781
3050	NC_008319	TTC	2	6	161211	161216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953781
3051	NC_008319	GCG	2	6	161268	161273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953781
3052	NC_008319	CG	3	6	161282	161287	0 %	0 %	50 %	50 %	113953781
3053	NC_008319	GCTT	2	8	161370	161377	0 %	50 %	25 %	25 %	113953781
3054	NC_008319	GGCC	2	8	161451	161458	0 %	0 %	50 %	50 %	113953781
3055	NC_008319	ACC	3	9	161492	161500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953781
3056	NC_008319	CAG	2	6	161617	161622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953647
3057	NC_008319	GCT	2	6	161626	161631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953647
3058	NC_008319	AC	3	6	161658	161663	50 %	0 %	0 %	50 %	113953647
3059	NC_008319	TCC	2	6	161672	161677	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113953647
3060	NC_008319	TGC	2	6	161678	161683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953647
3061	NC_008319	GGC	2	6	161710	161715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953647
3062	NC_008319	ACC	2	6	161720	161725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953647
3063	NC_008319	AC	3	6	161748	161753	50 %	0 %	0 %	50 %	113953647
3064	NC_008319	CCA	2	6	161778	161783	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953647
3065	NC_008319	CCAA	2	8	161801	161808	50 %	0 %	0 %	50 %	113953647
3066	NC_008319	AGC	2	6	161828	161833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953647
3067	NC_008319	GC	3	6	161832	161837	0 %	0 %	50 %	50 %	113953647
3068	NC_008319	C	6	6	161887	161892	0 %	0 %	0 %	100 %	113953647
3069	NC_008319	GGC	2	6	161935	161940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953647
3070	NC_008319	AC	3	6	161991	161996	50 %	0 %	0 %	50 %	113953647
3071	NC_008319	CAC	2	6	162001	162006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953647
3072	NC_008319	TGCC	2	8	162022	162029	0 %	25 %	25 %	50 %	113953647
3073	NC_008319	GCAGGG	2	12	162098	162109	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	113953647
3074	NC_008319	CAA	2	6	162148	162153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953647
3075	NC_008319	CAC	2	6	162256	162261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953647
3076	NC_008319	GGT	2	6	162271	162276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953647
3077	NC_008319	CAAA	2	8	162279	162286	75 %	0 %	0 %	25 %	113953647
3078	NC_008319	GCA	2	6	162348	162353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953647
3079	NC_008319	CGC	2	6	162373	162378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113953647
3080	NC_008319	CAA	2	6	162391	162396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953647
3081	NC_008319	CCAAG	2	10	162451	162460	40 %	0 %	20 %	40 %	113953647
3082	NC_008319	AGC	2	6	162494	162499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953647
3083	NC_008319	CAG	2	6	162538	162543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953647
3084	NC_008319	CAC	2	6	162571	162576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953647
3085	NC_008319	CCA	2	6	162582	162587	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953647
3086	NC_008319	CCA	2	6	162887	162892	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953258
3087	NC_008319	CCAA	2	8	162923	162930	50 %	0 %	0 %	50 %	113953258
3088	NC_008319	GAC	2	6	162935	162940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953258
3089	NC_008319	GCA	2	6	162950	162955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953258
3090	NC_008319	GTT	2	6	162956	162961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953258
3091	NC_008319	CAGCA	2	10	162967	162976	40 %	0 %	20 %	40 %	113953258
3092	NC_008319	AGC	2	6	163027	163032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953258
3093	NC_008319	GCAA	2	8	163033	163040	50 %	0 %	25 %	25 %	113953258
3094	NC_008319	AGC	2	6	163042	163047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953258
3095	NC_008319	CCA	2	6	163073	163078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953258
3096	NC_008319	GAT	2	6	163091	163096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953258
3097	NC_008319	AGC	2	6	163111	163116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953258
3098	NC_008319	GGATCC	2	12	163159	163170	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	113953258
3099	NC_008319	CCAAAC	2	12	163202	163213	50 %	0 %	0 %	50 %	113953258
3100	NC_008319	GCG	2	6	163296	163301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953258
3101	NC_008319	TCA	2	6	163340	163345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953258
3102	NC_008319	GCT	2	6	163383	163388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953258
3103	NC_008319	GGC	2	6	163417	163422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953258
3104	NC_008319	GCAA	2	8	163463	163470	50 %	0 %	25 %	25 %	113953258
3105	NC_008319	AGC	2	6	163522	163527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953258
3106	NC_008319	TGC	2	6	163575	163580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953258
3107	NC_008319	GCT	2	6	163607	163612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953258
3108	NC_008319	AGCC	2	8	163656	163663	25 %	0 %	25 %	50 %	113953258
3109	NC_008319	CAG	2	6	163691	163696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953258
3110	NC_008319	CCA	3	9	163703	163711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953258
3111	NC_008319	GCC	2	6	163718	163723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113953258
3112	NC_008319	GGCA	2	8	163768	163775	25 %	0 %	50 %	25 %	113953258
3113	NC_008319	CAC	2	6	163800	163805	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953258
3114	NC_008319	CTG	2	6	163964	163969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952828
3115	NC_008319	AGC	2	6	163971	163976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952828
3116	NC_008319	CAAT	2	8	163993	164000	50 %	25 %	0 %	25 %	113952828
3117	NC_008319	CAGC	2	8	164032	164039	25 %	0 %	25 %	50 %	113952828
3118	NC_008319	GTG	2	6	164046	164051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113952828
3119	NC_008319	TGC	2	6	164127	164132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952828
3120	NC_008319	TGC	2	6	164274	164279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952828
3121	NC_008319	CAGTG	2	10	164318	164327	20 %	20 %	40 %	20 %	113952828
3122	NC_008319	AAC	2	6	164401	164406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113952828
3123	NC_008319	GCA	2	6	164410	164415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952828
3124	NC_008319	CGC	2	6	164517	164522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113952828
3125	NC_008319	CAA	2	6	164616	164621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113952828
3126	NC_008319	AGC	2	6	164694	164699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952828
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3128	NC_008319	CTGA	2	8	164750	164757	25 %	25 %	25 %	25 %	113952828
3129	NC_008319	GGA	2	6	164773	164778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113952828
3130	NC_008319	AGC	2	6	164801	164806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952828
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3132	NC_008319	CAGG	2	8	164877	164884	25 %	0 %	50 %	25 %	113952828
3133	NC_008319	ACG	2	6	164900	164905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952828
3134	NC_008319	GCA	2	6	164946	164951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952828
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3136	NC_008319	AGC	2	6	165039	165044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952828
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3144	NC_008319	GCC	2	6	165522	165527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113952828
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3153	NC_008319	GCA	2	6	165994	165999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952828
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3164	NC_008319	AG	4	8	166523	166530	50 %	0 %	50 %	0 %	113952828
3165	NC_008319	CCAC	2	8	166546	166553	25 %	0 %	0 %	75 %	113952828
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3226	NC_008319	GCT	2	6	170176	170181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952828
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3229	NC_008319	CGGCG	2	10	170260	170269	0 %	0 %	60 %	40 %	113952828
3230	NC_008319	CGGATC	2	12	170294	170305	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	113952828
3231	NC_008319	AGG	2	6	170333	170338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113952828
3232	NC_008319	AGA	2	6	170370	170375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113952828
3233	NC_008319	TCG	2	6	170385	170390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952828
3234	NC_008319	ACC	2	6	170402	170407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113952828
3235	NC_008319	CTT	2	6	170443	170448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113952828
3236	NC_008319	GAT	2	6	170467	170472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113952828
3237	NC_008319	CGAA	2	8	170515	170522	50 %	0 %	25 %	25 %	113953482
3238	NC_008319	GAT	2	6	170589	170594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953482
3239	NC_008319	CCAG	2	8	170595	170602	25 %	0 %	25 %	50 %	113953482
3240	NC_008319	TAA	2	6	170617	170622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113953482
3241	NC_008319	GCA	2	6	170641	170646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953482
3242	NC_008319	TGCCT	2	10	170654	170663	0 %	40 %	20 %	40 %	113953482
3243	NC_008319	CTG	2	6	170733	170738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953482
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