MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9311

Total Repeats: 44579

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
33501	NC_008319	ATC	2	6	1964141	1964146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954705
33502	NC_008319	CGC	2	6	1964164	1964169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113954705
33503	NC_008319	TCCG	2	8	1964207	1964214	0 %	25 %	25 %	50 %	113954705
33504	NC_008319	ATGA	2	8	1964220	1964227	50 %	25 %	25 %	0 %	113954705
33505	NC_008319	CGGA	2	8	1964248	1964255	25 %	0 %	50 %	25 %	113954705
33506	NC_008319	CAA	2	6	1964407	1964412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113954705
33507	NC_008319	CTC	2	6	1964470	1964475	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113954705
33508	NC_008319	GCT	2	6	1964543	1964548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954705
33509	NC_008319	ATC	2	6	1964654	1964659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954705
33510	NC_008319	AAG	2	6	1964748	1964753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113954705
33511	NC_008319	TCT	2	6	1964794	1964799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954705
33512	NC_008319	CAC	2	6	1964876	1964881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953640
33513	NC_008319	GTG	2	6	1964890	1964895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953640
33514	NC_008319	CCAAA	2	10	1964955	1964964	60 %	0 %	0 %	40 %	113953640
33515	NC_008319	GGCCA	2	10	1965025	1965034	20 %	0 %	40 %	40 %	113953640
33516	NC_008319	GA	3	6	1965059	1965064	50 %	0 %	50 %	0 %	113953640
33517	NC_008319	GCACCA	2	12	1965092	1965103	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	113953640
33518	NC_008319	CGA	2	6	1965108	1965113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953640
33519	NC_008319	GA	3	6	1965122	1965127	50 %	0 %	50 %	0 %	113953640
33520	NC_008319	TTG	2	6	1965128	1965133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953640
33521	NC_008319	CGG	2	6	1965227	1965232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953640
33522	NC_008319	CGC	2	6	1965268	1965273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113953640
33523	NC_008319	GGTGA	2	10	1965274	1965283	20 %	20 %	60 %	0 %	113953640
33524	NC_008319	CCTG	2	8	1965288	1965295	0 %	25 %	25 %	50 %	113953640
33525	NC_008319	CT	6	12	1965315	1965326	0 %	50 %	0 %	50 %	113953640
33526	NC_008319	GCG	2	6	1965431	1965436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953640
33527	NC_008319	GCG	2	6	1965453	1965458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953640
33528	NC_008319	TCCC	2	8	1965554	1965561	0 %	25 %	0 %	75 %	113953640
33529	NC_008319	GTT	2	6	1965667	1965672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953640
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33531	NC_008319	GC	3	6	1965751	1965756	0 %	0 %	50 %	50 %	113953640
33532	NC_008319	GGCC	2	8	1965782	1965789	0 %	0 %	50 %	50 %	113952957
33533	NC_008319	GGT	2	6	1965824	1965829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113952957
33534	NC_008319	GCA	2	6	1965882	1965887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952957
33535	NC_008319	CAG	2	6	1965961	1965966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952957
33536	NC_008319	CAGGG	2	10	1965997	1966006	20 %	0 %	60 %	20 %	113952957
33537	NC_008319	CGG	2	6	1966105	1966110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113952957
33538	NC_008319	GAA	3	9	1966218	1966226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113952957
33539	NC_008319	CT	3	6	1966228	1966233	0 %	50 %	0 %	50 %	113952957
33540	NC_008319	TCT	2	6	1966241	1966246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113952957
33541	NC_008319	GCA	2	6	1966285	1966290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952957
33542	NC_008319	AAG	2	6	1966444	1966449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113952957
33543	NC_008319	A	6	6	1966603	1966608	100 %	0 %	0 %	0 %	113955307
33544	NC_008319	AATC	2	8	1966611	1966618	50 %	25 %	0 %	25 %	113955307
33545	NC_008319	GTG	2	6	1966644	1966649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955307
33546	NC_008319	ATCAA	2	10	1966683	1966692	60 %	20 %	0 %	20 %	113955307
33547	NC_008319	TGC	2	6	1966698	1966703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955307
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33549	NC_008319	TAT	2	6	1967580	1967585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113955309
33550	NC_008319	ACG	2	6	1967607	1967612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955309
33551	NC_008319	GT	3	6	1967679	1967684	0 %	50 %	50 %	0 %	113955309
33552	NC_008319	ACCTT	2	10	1967750	1967759	20 %	40 %	0 %	40 %	113955309
33553	NC_008319	GCA	2	6	1967783	1967788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955309
33554	NC_008319	TTAAA	2	10	1967814	1967823	60 %	40 %	0 %	0 %	113955309
33555	NC_008319	TTGA	2	8	1967861	1967868	25 %	50 %	25 %	0 %	113955309
33556	NC_008319	GA	3	6	1967940	1967945	50 %	0 %	50 %	0 %	113955309
33557	NC_008319	TCA	2	6	1968131	1968136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113955000
33558	NC_008319	TCA	2	6	1968146	1968151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113955000
33559	NC_008319	TCC	2	6	1968203	1968208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113955000
33560	NC_008319	TGC	2	6	1968232	1968237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955000
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33564	NC_008319	AAT	2	6	1968768	1968773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113953751
33565	NC_008319	ACC	2	6	1969023	1969028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113952968
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33567	NC_008319	GCC	2	6	1969175	1969180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113952968
33568	NC_008319	TCT	2	6	1969220	1969225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113952968
33569	NC_008319	ACA	2	6	1969279	1969284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113952968
33570	NC_008319	TAA	2	6	1969306	1969311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113952968
33571	NC_008319	ATCC	2	8	1969312	1969319	25 %	25 %	0 %	50 %	113952968
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33573	NC_008319	CAA	2	6	1969397	1969402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113952968
33574	NC_008319	TGC	2	6	1969404	1969409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952968
33575	NC_008319	TCA	2	6	1969521	1969526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954587
33576	NC_008319	AGACA	2	10	1969527	1969536	60 %	0 %	20 %	20 %	113954587
33577	NC_008319	AGCA	2	8	1969542	1969549	50 %	0 %	25 %	25 %	113954587
33578	NC_008319	TCG	2	6	1969567	1969572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954587
33579	NC_008319	AAAT	2	8	1969588	1969595	75 %	25 %	0 %	0 %	113954587
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33586	NC_008319	TGAT	2	8	1970126	1970133	25 %	50 %	25 %	0 %	113955409
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33589	NC_008319	GTT	2	6	1970225	1970230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954105
33590	NC_008319	CCTG	2	8	1970278	1970285	0 %	25 %	25 %	50 %	113954105
33591	NC_008319	CCAAA	2	10	1970294	1970303	60 %	0 %	0 %	40 %	113954105
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33594	NC_008319	CAC	2	6	1970540	1970545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954105
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33597	NC_008319	TGCC	2	8	1970678	1970685	0 %	25 %	25 %	50 %	113954105
33598	NC_008319	G	6	6	1970698	1970703	0 %	0 %	100 %	0 %	113954105
33599	NC_008319	ACC	2	6	1970731	1970736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954105
33600	NC_008319	AGTG	2	8	1970739	1970746	25 %	25 %	50 %	0 %	113954105
33601	NC_008319	CCA	2	6	1970783	1970788	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954105
33602	NC_008319	AGC	2	6	1970789	1970794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954105
33603	NC_008319	GCA	2	6	1970795	1970800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954105
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33606	NC_008319	GCA	2	6	1971056	1971061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954105
33607	NC_008319	GAT	2	6	1971074	1971079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954105
33608	NC_008319	GCC	2	6	1971097	1971102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113954105
33609	NC_008319	CATCCA	2	12	1971182	1971193	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	113954105
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33611	NC_008319	TC	3	6	1971248	1971253	0 %	50 %	0 %	50 %	113954105
33612	NC_008319	TCC	2	6	1971285	1971290	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113954105
33613	NC_008319	GTA	2	6	1971321	1971326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954105
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