MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9311

Total Repeats: 44579

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
33001	NC_008319	GCC	2	6	1935701	1935706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113954194
33002	NC_008319	GAC	2	6	1935727	1935732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954194
33003	NC_008319	CAC	2	6	1935737	1935742	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954194
33004	NC_008319	ATCG	2	8	1935745	1935752	25 %	25 %	25 %	25 %	113954194
33005	NC_008319	AGCA	2	8	1935753	1935760	50 %	0 %	25 %	25 %	113954194
33006	NC_008319	ACC	2	6	1935791	1935796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954194
33007	NC_008319	CGA	2	6	1935972	1935977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954194
33008	NC_008319	GCTG	2	8	1936012	1936019	0 %	25 %	50 %	25 %	113954194
33009	NC_008319	GCC	2	6	1936051	1936056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113954194
33010	NC_008319	TGCC	2	8	1936096	1936103	0 %	25 %	25 %	50 %	113954194
33011	NC_008319	CGT	2	6	1936132	1936137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954194
33012	NC_008319	ACA	2	6	1936174	1936179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113954194
33013	NC_008319	ATCC	2	8	1936202	1936209	25 %	25 %	0 %	50 %	113954194
33014	NC_008319	CGC	2	6	1936220	1936225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113954194
33015	NC_008319	A	6	6	1936290	1936295	100 %	0 %	0 %	0 %	113954194
33016	NC_008319	TTG	2	6	1936299	1936304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954194
33017	NC_008319	AGA	2	6	1936356	1936361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113954194
33018	NC_008319	CCA	2	6	1936376	1936381	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954194
33019	NC_008319	GCA	2	6	1936404	1936409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954194
33020	NC_008319	AC	3	6	1936417	1936422	50 %	0 %	0 %	50 %	113954194
33021	NC_008319	TCA	2	6	1936432	1936437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954194
33022	NC_008319	TCA	2	6	1936466	1936471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954598
33023	NC_008319	TCT	2	6	1936531	1936536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954598
33024	NC_008319	AAT	2	6	1936540	1936545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113954598
33025	NC_008319	CGA	2	6	1936659	1936664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954598
33026	NC_008319	TCA	2	6	1936695	1936700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954598
33027	NC_008319	TGC	2	6	1936790	1936795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954598
33028	NC_008319	CCTTC	2	10	1936981	1936990	0 %	40 %	0 %	60 %	113954030
33029	NC_008319	TC	3	6	1937035	1937040	0 %	50 %	0 %	50 %	113954030
33030	NC_008319	TGC	2	6	1937051	1937056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954030
33031	NC_008319	ACT	3	9	1937084	1937092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954030
33032	NC_008319	TGC	2	6	1937180	1937185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954030
33033	NC_008319	CCAC	2	8	1937193	1937200	25 %	0 %	0 %	75 %	113954030
33034	NC_008319	TTCCA	2	10	1937237	1937246	20 %	40 %	0 %	40 %	113954030
33035	NC_008319	CAC	2	6	1937261	1937266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954030
33036	NC_008319	TCA	2	6	1937313	1937318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954030
33037	NC_008319	TCT	2	6	1937440	1937445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954030
33038	NC_008319	GACC	2	8	1937458	1937465	25 %	0 %	25 %	50 %	113954030
33039	NC_008319	CGT	2	6	1937840	1937845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954030
33040	NC_008319	CG	3	6	1937881	1937886	0 %	0 %	50 %	50 %	113954030
33041	NC_008319	GC	3	6	1937970	1937975	0 %	0 %	50 %	50 %	113954030
33042	NC_008319	AGC	2	6	1938083	1938088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954030
33043	NC_008319	CAT	2	6	1938103	1938108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954030
33044	NC_008319	TCCG	2	8	1938116	1938123	0 %	25 %	25 %	50 %	113954030
33045	NC_008319	G	6	6	1938169	1938174	0 %	0 %	100 %	0 %	113954030
33046	NC_008319	CTT	3	9	1938431	1938439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954873
33047	NC_008319	CCT	3	9	1938514	1938522	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113954873
33048	NC_008319	GAA	2	6	1938539	1938544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113954873
33049	NC_008319	GAA	2	6	1938557	1938562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113954873
33050	NC_008319	GAG	2	6	1938637	1938642	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113954873
33051	NC_008319	GCA	2	6	1938694	1938699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955465
33052	NC_008319	TCT	2	6	1938713	1938718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113955465
33053	NC_008319	GT	3	6	1938754	1938759	0 %	50 %	50 %	0 %	113955465
33054	NC_008319	TCG	2	6	1938802	1938807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955465
33055	NC_008319	ACG	2	6	1938816	1938821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955465
33056	NC_008319	GAA	2	6	1938822	1938827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113955465
33057	NC_008319	CAAG	2	8	1938923	1938930	50 %	0 %	25 %	25 %	113955465
33058	NC_008319	TGC	2	6	1938952	1938957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955465
33059	NC_008319	CGAT	2	8	1938994	1939001	25 %	25 %	25 %	25 %	113955465
33060	NC_008319	TCC	2	6	1939154	1939159	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113955465
33061	NC_008319	GAAG	2	8	1939172	1939179	50 %	0 %	50 %	0 %	113955465
33062	NC_008319	TGC	2	6	1939186	1939191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955465
33063	NC_008319	GTC	2	6	1939239	1939244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955465
33064	NC_008319	TCGA	2	8	1939245	1939252	25 %	25 %	25 %	25 %	113955465
33065	NC_008319	TCT	2	6	1939277	1939282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113955465
33066	NC_008319	CAA	2	6	1939298	1939303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113955465
33067	NC_008319	TGG	2	6	1939318	1939323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955465
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33069	NC_008319	GC	3	6	1939439	1939444	0 %	0 %	50 %	50 %	113952895
33070	NC_008319	CAA	3	9	1939520	1939528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113952895
33071	NC_008319	CAA	2	6	1939598	1939603	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113952895
33072	NC_008319	GGGGT	2	10	1939653	1939662	0 %	20 %	80 %	0 %	113952895
33073	NC_008319	CAGC	2	8	1939669	1939676	25 %	0 %	25 %	50 %	113952895
33074	NC_008319	GAT	2	6	1939679	1939684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113952895
33075	NC_008319	CTGAT	2	10	1939710	1939719	20 %	40 %	20 %	20 %	113952895
33076	NC_008319	TGC	2	6	1939770	1939775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952895
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33082	NC_008319	TCC	2	6	1939996	1940001	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113952895
33083	NC_008319	CTG	2	6	1940026	1940031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953735
33084	NC_008319	CAA	2	6	1940193	1940198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953735
33085	NC_008319	ACA	2	6	1940218	1940223	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953735
33086	NC_008319	AGC	2	6	1940235	1940240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953735
33087	NC_008319	ATCT	2	8	1940316	1940323	25 %	50 %	0 %	25 %	113953735
33088	NC_008319	CCATC	2	10	1940351	1940360	20 %	20 %	0 %	60 %	113953735
33089	NC_008319	AGG	2	6	1940383	1940388	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113953735
33090	NC_008319	CGA	3	9	1940523	1940531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953735
33091	NC_008319	TTC	2	6	1940670	1940675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954246
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33093	NC_008319	A	6	6	1940814	1940819	100 %	0 %	0 %	0 %	113954246
33094	NC_008319	GA	3	6	1940822	1940827	50 %	0 %	50 %	0 %	113954246
33095	NC_008319	CTC	2	6	1940842	1940847	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113954246
33096	NC_008319	GGCG	2	8	1940922	1940929	0 %	0 %	75 %	25 %	113954246
33097	NC_008319	GCG	2	6	1940932	1940937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954246
33098	NC_008319	GCA	2	6	1940963	1940968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954246
33099	NC_008319	GTT	2	6	1940973	1940978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954246
33100	NC_008319	CAG	2	6	1941135	1941140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954246
33101	NC_008319	AG	3	6	1941187	1941192	50 %	0 %	50 %	0 %	113954246
33102	NC_008319	GCT	2	6	1941244	1941249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954246
33103	NC_008319	GAGCG	2	10	1941289	1941298	20 %	0 %	60 %	20 %	113954246
33104	NC_008319	CATC	2	8	1941366	1941373	25 %	25 %	0 %	50 %	113954246
33105	NC_008319	GGT	2	6	1941408	1941413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954246
33106	NC_008319	GGT	2	6	1941445	1941450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954246
33107	NC_008319	TGC	2	6	1941468	1941473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954246
33108	NC_008319	ATG	2	6	1941484	1941489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954246
33109	NC_008319	GCA	2	6	1941511	1941516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954246
33110	NC_008319	TGG	2	6	1941578	1941583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954246
33111	NC_008319	CAC	2	6	1941651	1941656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954246
33112	NC_008319	CAA	2	6	1941666	1941671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113954246
33113	NC_008319	CGA	2	6	1941789	1941794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954246
33114	NC_008319	GAC	2	6	1941817	1941822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954246
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33116	NC_008319	A	6	6	1941933	1941938	100 %	0 %	0 %	0 %	113954246
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33233	NC_008319	AAC	2	6	1948503	1948508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113954793
33234	NC_008319	ACC	2	6	1948513	1948518	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954793
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33342	NC_008319	ACT	2	6	1954312	1954317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954151
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33465	NC_008319	AG	3	6	1961179	1961184	50 %	0 %	50 %	0 %	113954060
33466	NC_008319	CTTC	2	8	1961325	1961332	0 %	50 %	0 %	50 %	113954060
33467	NC_008319	TTGCA	2	10	1961482	1961491	20 %	40 %	20 %	20 %	113954060
33468	NC_008319	AGA	2	6	1961508	1961513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113954060
33469	NC_008319	CCT	2	6	1961604	1961609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113954060
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33473	NC_008319	TTC	2	6	1961959	1961964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953428
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33492	NC_008319	CTT	2	6	1962708	1962713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953428
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33499	NC_008319	A	6	6	1964117	1964122	100 %	0 %	0 %	0 %	113954705
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