MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9311

Total Repeats: 44579

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
32001	NC_008319	AGCC	2	8	1880807	1880814	25 %	0 %	25 %	50 %	113953364
32002	NC_008319	GCC	2	6	1880935	1880940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113953364
32003	NC_008319	CA	3	6	1881047	1881052	50 %	0 %	0 %	50 %	113953364
32004	NC_008319	TCT	2	6	1881114	1881119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953364
32005	NC_008319	TGGC	2	8	1881205	1881212	0 %	25 %	50 %	25 %	113953364
32006	NC_008319	ATC	2	6	1881377	1881382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953986
32007	NC_008319	TCTT	2	8	1881450	1881457	0 %	75 %	0 %	25 %	113953986
32008	NC_008319	GGA	2	6	1881461	1881466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113953986
32009	NC_008319	GTC	2	6	1881536	1881541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953986
32010	NC_008319	GAT	2	6	1881571	1881576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953986
32011	NC_008319	TTG	2	6	1881651	1881656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953986
32012	NC_008319	GTG	2	6	1881662	1881667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953986
32013	NC_008319	GCT	2	6	1881751	1881756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953986
32014	NC_008319	GCTT	2	8	1881780	1881787	0 %	50 %	25 %	25 %	113953986
32015	NC_008319	TCC	2	6	1881877	1881882	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113953986
32016	NC_008319	GCT	2	6	1881884	1881889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953986
32017	NC_008319	TGT	2	6	1881960	1881965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953169
32018	NC_008319	GAA	3	9	1882022	1882030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113953169
32019	NC_008319	CAG	2	6	1882116	1882121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953169
32020	NC_008319	CCA	4	12	1882174	1882185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953169
32021	NC_008319	GCTC	2	8	1882446	1882453	0 %	25 %	25 %	50 %	113953816
32022	NC_008319	CTG	2	6	1882544	1882549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953816
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32024	NC_008319	ATC	2	6	1882594	1882599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953816
32025	NC_008319	GTCA	2	8	1882668	1882675	25 %	25 %	25 %	25 %	113953816
32026	NC_008319	CCA	2	6	1882700	1882705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953816
32027	NC_008319	ACT	2	6	1882815	1882820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953816
32028	NC_008319	TGGAAG	2	12	1882848	1882859	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	113953816
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32033	NC_008319	GTGA	2	8	1883132	1883139	25 %	25 %	50 %	0 %	113952936
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32036	NC_008319	CAG	2	6	1883294	1883299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952936
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32039	NC_008319	CAAAG	2	10	1883398	1883407	60 %	0 %	20 %	20 %	113952936
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32043	NC_008319	TCCC	2	8	1883683	1883690	0 %	25 %	0 %	75 %	113952936
32044	NC_008319	A	6	6	1883759	1883764	100 %	0 %	0 %	0 %	113952936
32045	NC_008319	TGA	2	6	1883802	1883807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113952936
32046	NC_008319	ACA	2	6	1883814	1883819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113952936
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32049	NC_008319	ACCAA	2	10	1883910	1883919	60 %	0 %	0 %	40 %	113952936
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32052	NC_008319	ACA	3	9	1883982	1883990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113952936
32053	NC_008319	CAA	2	6	1884028	1884033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113952936
32054	NC_008319	AGA	2	6	1884045	1884050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113952936
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32062	NC_008319	CAC	2	6	1884571	1884576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113952936
32063	NC_008319	CA	4	8	1884598	1884605	50 %	0 %	0 %	50 %	113952936
32064	NC_008319	G	6	6	1884680	1884685	0 %	0 %	100 %	0 %	113952936
32065	NC_008319	TTGCT	2	10	1884687	1884696	0 %	60 %	20 %	20 %	113952936
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32102	NC_008319	CGG	2	6	1886449	1886454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954902
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32112	NC_008319	C	6	6	1886775	1886780	0 %	0 %	0 %	100 %	113955528
32113	NC_008319	ACC	2	6	1886826	1886831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113955528
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32117	NC_008319	TGGA	2	8	1886956	1886963	25 %	25 %	50 %	0 %	113955528
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32229	NC_008319	TTCG	2	8	1892656	1892663	0 %	50 %	25 %	25 %	113952965
32230	NC_008319	TTC	2	6	1892825	1892830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954113
32231	NC_008319	ATCT	2	8	1892885	1892892	25 %	50 %	0 %	25 %	113954113
32232	NC_008319	CGC	2	6	1892939	1892944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113954113
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32464	NC_008319	AAGCC	2	10	1905020	1905029	40 %	0 %	20 %	40 %	113954161
32465	NC_008319	GAGC	2	8	1905110	1905117	25 %	0 %	50 %	25 %	113954161
32466	NC_008319	GATC	2	8	1905129	1905136	25 %	25 %	25 %	25 %	113954161
32467	NC_008319	TCC	2	6	1905145	1905150	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113954161
32468	NC_008319	AGGC	2	8	1905181	1905188	25 %	0 %	50 %	25 %	113954161
32469	NC_008319	CTC	2	6	1905240	1905245	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113954161
32470	NC_008319	CCA	2	6	1905254	1905259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954161
32471	NC_008319	CAT	2	6	1905272	1905277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954161
32472	NC_008319	GCT	2	6	1905287	1905292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954161
32473	NC_008319	ACC	2	6	1905445	1905450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953445
32474	NC_008319	GAC	2	6	1905522	1905527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953445
32475	NC_008319	CG	4	8	1905547	1905554	0 %	0 %	50 %	50 %	113953445
32476	NC_008319	CAG	2	6	1905575	1905580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953445
32477	NC_008319	CAT	2	6	1905590	1905595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953445
32478	NC_008319	CCG	2	6	1905684	1905689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113953445
32479	NC_008319	GAT	2	6	1905713	1905718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953445
32480	NC_008319	CAA	2	6	1905735	1905740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953445
32481	NC_008319	CCG	2	6	1905743	1905748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113953445
32482	NC_008319	GAC	2	6	1905794	1905799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953445
32483	NC_008319	GGC	2	6	1905800	1905805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953445
32484	NC_008319	ATC	2	6	1905831	1905836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953445
32485	NC_008319	GC	3	6	1905870	1905875	0 %	0 %	50 %	50 %	113953445
32486	NC_008319	TGA	2	6	1905952	1905957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953445
32487	NC_008319	TGC	2	6	1905958	1905963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953445
32488	NC_008319	TTC	2	6	1905969	1905974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953445
32489	NC_008319	GC	3	6	1906025	1906030	0 %	0 %	50 %	50 %	113953445
32490	NC_008319	CTG	2	6	1906080	1906085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953445
32491	NC_008319	ATC	2	6	1906092	1906097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953445
32492	NC_008319	TCC	2	6	1906111	1906116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113953445
32493	NC_008319	CT	3	6	1906124	1906129	0 %	50 %	0 %	50 %	113953445
32494	NC_008319	CCT	2	6	1906145	1906150	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113953445
32495	NC_008319	GCT	2	6	1906172	1906177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953445
32496	NC_008319	GAA	2	6	1906217	1906222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113953445
32497	NC_008319	GTA	2	6	1906230	1906235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953445
32498	NC_008319	TTG	2	6	1906442	1906447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953445
32499	NC_008319	CT	3	6	1906569	1906574	0 %	50 %	0 %	50 %	113953445
32500	NC_008319	GCT	2	6	1906580	1906585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953445

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