MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9311

Total Repeats: 44579

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
31501	NC_008319	CAA	2	6	1855190	1855195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113954608
31502	NC_008319	GAGG	2	8	1855313	1855320	25 %	0 %	75 %	0 %	113954608
31503	NC_008319	TCA	2	6	1855342	1855347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954608
31504	NC_008319	GCT	2	6	1855364	1855369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954608
31505	NC_008319	CCA	2	6	1855396	1855401	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954608
31506	NC_008319	CTG	2	6	1855406	1855411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954608
31507	NC_008319	TCC	2	6	1855471	1855476	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113954608
31508	NC_008319	GGC	2	6	1855496	1855501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954608
31509	NC_008319	CGC	2	6	1855530	1855535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113954608
31510	NC_008319	GCA	2	6	1855566	1855571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954608
31511	NC_008319	CTC	2	6	1855584	1855589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113954608
31512	NC_008319	CTT	2	6	1855694	1855699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954608
31513	NC_008319	TGG	2	6	1855710	1855715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954608
31514	NC_008319	CAA	2	6	1855761	1855766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113954608
31515	NC_008319	GCA	2	6	1855781	1855786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954608
31516	NC_008319	AGC	2	6	1855837	1855842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954608
31517	NC_008319	CAG	2	6	1855995	1856000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954608
31518	NC_008319	CTC	3	9	1856013	1856021	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113954608
31519	NC_008319	GTT	2	6	1856072	1856077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954608
31520	NC_008319	CTC	2	6	1856110	1856115	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113954449
31521	NC_008319	AG	3	6	1856139	1856144	50 %	0 %	50 %	0 %	113954449
31522	NC_008319	GCT	2	6	1856184	1856189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954449
31523	NC_008319	TTGG	2	8	1856191	1856198	0 %	50 %	50 %	0 %	113954449
31524	NC_008319	ATTGA	2	10	1856425	1856434	40 %	40 %	20 %	0 %	113954449
31525	NC_008319	GCA	2	6	1856449	1856454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954449
31526	NC_008319	AAG	2	6	1856541	1856546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113954449
31527	NC_008319	TCA	2	6	1856552	1856557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954449
31528	NC_008319	CCG	2	6	1856689	1856694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113953629
31529	NC_008319	ACA	2	6	1856825	1856830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953629
31530	NC_008319	GAA	2	6	1856850	1856855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113953629
31531	NC_008319	ATC	2	6	1856872	1856877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953629
31532	NC_008319	TTG	2	6	1856890	1856895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953629
31533	NC_008319	CTG	2	6	1856904	1856909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953629
31534	NC_008319	GGCA	2	8	1856916	1856923	25 %	0 %	50 %	25 %	113953629
31535	NC_008319	AG	3	6	1856934	1856939	50 %	0 %	50 %	0 %	113953629
31536	NC_008319	ACAA	2	8	1856950	1856957	75 %	0 %	0 %	25 %	113953629
31537	NC_008319	TGA	2	6	1857041	1857046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953629
31538	NC_008319	AAG	2	6	1857049	1857054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113953629
31539	NC_008319	TGC	2	6	1857063	1857068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953629
31540	NC_008319	TCAC	2	8	1857133	1857140	25 %	25 %	0 %	50 %	113953629
31541	NC_008319	AGGA	2	8	1857177	1857184	50 %	0 %	50 %	0 %	113953629
31542	NC_008319	CT	3	6	1857226	1857231	0 %	50 %	0 %	50 %	113953629
31543	NC_008319	CCA	2	6	1857232	1857237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953629
31544	NC_008319	TGA	2	6	1857329	1857334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953629
31545	NC_008319	TGGC	2	8	1857343	1857350	0 %	25 %	50 %	25 %	113953629
31546	NC_008319	AAC	2	6	1857457	1857462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953629
31547	NC_008319	CAG	2	6	1857486	1857491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953629
31548	NC_008319	CTGC	2	8	1857545	1857552	0 %	25 %	25 %	50 %	113953629
31549	NC_008319	AG	3	6	1857668	1857673	50 %	0 %	50 %	0 %	113953629
31550	NC_008319	ACC	2	6	1857685	1857690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953629
31551	NC_008319	A	6	6	1857736	1857741	100 %	0 %	0 %	0 %	113953629
31552	NC_008319	CAG	2	6	1857756	1857761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953629
31553	NC_008319	CTC	2	6	1857897	1857902	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113953339
31554	NC_008319	CGG	2	6	1857925	1857930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953339
31555	NC_008319	TCCG	2	8	1858002	1858009	0 %	25 %	25 %	50 %	113953339
31556	NC_008319	AC	3	6	1858052	1858057	50 %	0 %	0 %	50 %	113953339
31557	NC_008319	CTGA	2	8	1858074	1858081	25 %	25 %	25 %	25 %	113953339
31558	NC_008319	GCC	2	6	1858113	1858118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113953339
31559	NC_008319	CGA	2	6	1858132	1858137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953339
31560	NC_008319	CG	3	6	1858164	1858169	0 %	0 %	50 %	50 %	113953339
31561	NC_008319	C	7	7	1858251	1858257	0 %	0 %	0 %	100 %	113953339
31562	NC_008319	TCT	2	6	1858270	1858275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953339
31563	NC_008319	TTG	2	6	1858307	1858312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954492
31564	NC_008319	TTC	2	6	1858328	1858333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954492
31565	NC_008319	GCA	2	6	1858438	1858443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954492
31566	NC_008319	CAC	2	6	1858496	1858501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954492
31567	NC_008319	GAC	2	6	1858543	1858548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954492
31568	NC_008319	TCA	2	6	1858594	1858599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954492
31569	NC_008319	TCAAGC	2	12	1858730	1858741	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	113954076
31570	NC_008319	ACG	2	6	1858766	1858771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954076
31571	NC_008319	TG	3	6	1858793	1858798	0 %	50 %	50 %	0 %	113954076
31572	NC_008319	CCA	2	6	1858851	1858856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954076
31573	NC_008319	AGCC	2	8	1858960	1858967	25 %	0 %	25 %	50 %	113953437
31574	NC_008319	GCC	2	6	1859168	1859173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113953437
31575	NC_008319	CTT	2	6	1859174	1859179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953437
31576	NC_008319	GTA	2	6	1859291	1859296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953437
31577	NC_008319	GTT	2	6	1859351	1859356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953437
31578	NC_008319	TCTG	2	8	1859631	1859638	0 %	50 %	25 %	25 %	113954031
31579	NC_008319	GGC	2	6	1859645	1859650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954031
31580	NC_008319	CCT	2	6	1859678	1859683	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113954031
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31582	NC_008319	CTG	2	6	1859751	1859756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954031
31583	NC_008319	GCA	2	6	1859806	1859811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954031
31584	NC_008319	GTC	2	6	1859833	1859838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954031
31585	NC_008319	CATC	2	8	1859897	1859904	25 %	25 %	0 %	50 %	113954031
31586	NC_008319	CAA	2	6	1859930	1859935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113954031
31587	NC_008319	GGT	2	6	1859952	1859957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954031
31588	NC_008319	CAC	2	6	1859960	1859965	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954031
31589	NC_008319	AAC	2	6	1860009	1860014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113954895
31590	NC_008319	GCA	2	6	1860097	1860102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954895
31591	NC_008319	CAC	2	6	1860128	1860133	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954895
31592	NC_008319	CTC	2	6	1860143	1860148	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113954895
31593	NC_008319	CGA	2	6	1860208	1860213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954895
31594	NC_008319	GCC	2	6	1860306	1860311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113954895
31595	NC_008319	GCT	2	6	1860326	1860331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954895
31596	NC_008319	TTC	2	6	1860359	1860364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954895
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31598	NC_008319	GTT	2	6	1860461	1860466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954895
31599	NC_008319	GAA	2	6	1860472	1860477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113954895
31600	NC_008319	ACA	2	6	1860582	1860587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113954895
31601	NC_008319	CCT	2	6	1860651	1860656	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113954895
31602	NC_008319	GCA	2	6	1860670	1860675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954895
31603	NC_008319	CGG	2	6	1860729	1860734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954895
31604	NC_008319	TC	3	6	1860872	1860877	0 %	50 %	0 %	50 %	113955047
31605	NC_008319	GCT	2	6	1860886	1860891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955047
31606	NC_008319	GAT	2	6	1860892	1860897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955047
31607	NC_008319	CTC	2	6	1860939	1860944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113955047
31608	NC_008319	AGG	2	6	1860955	1860960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113955047
31609	NC_008319	GCT	2	6	1860985	1860990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955047
31610	NC_008319	ATC	2	6	1861001	1861006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113955047
31611	NC_008319	GGTT	2	8	1861064	1861071	0 %	50 %	50 %	0 %	113955047
31612	NC_008319	TGAT	2	8	1861086	1861093	25 %	50 %	25 %	0 %	113955047
31613	NC_008319	CTG	2	6	1861097	1861102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955047
31614	NC_008319	TGAT	2	8	1861161	1861168	25 %	50 %	25 %	0 %	113955047
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31616	NC_008319	TGG	2	6	1861304	1861309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955047
31617	NC_008319	GGC	2	6	1861369	1861374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113955047
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