MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9311

Total Repeats: 44579

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
31001	NC_008319	TGA	2	6	1822717	1822722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954851
31002	NC_008319	AGC	2	6	1822723	1822728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954851
31003	NC_008319	CTG	2	6	1822781	1822786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954851
31004	NC_008319	CGCT	2	8	1822794	1822801	0 %	25 %	25 %	50 %	113954851
31005	NC_008319	TTG	2	6	1822821	1822826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954851
31006	NC_008319	CT	3	6	1822881	1822886	0 %	50 %	0 %	50 %	113954851
31007	NC_008319	GCGA	2	8	1822907	1822914	25 %	0 %	50 %	25 %	113954851
31008	NC_008319	TGA	2	6	1822947	1822952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954851
31009	NC_008319	GGACTC	2	12	1822958	1822969	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	113954851
31010	NC_008319	CA	3	6	1823003	1823008	50 %	0 %	0 %	50 %	113954851
31011	NC_008319	ACTGAA	2	12	1823009	1823020	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	113954851
31012	NC_008319	CGA	2	6	1823051	1823056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954853
31013	NC_008319	AC	3	6	1823064	1823069	50 %	0 %	0 %	50 %	113954853
31014	NC_008319	CCA	2	6	1823070	1823075	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954853
31015	NC_008319	GTC	2	6	1823101	1823106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954853
31016	NC_008319	CAAGC	2	10	1823153	1823162	40 %	0 %	20 %	40 %	113954853
31017	NC_008319	TGG	2	6	1823176	1823181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954853
31018	NC_008319	TCA	2	6	1823186	1823191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954853
31019	NC_008319	CGA	2	6	1823294	1823299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954853
31020	NC_008319	AAG	2	6	1823335	1823340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113954853
31021	NC_008319	TCT	2	6	1823360	1823365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954853
31022	NC_008319	ACC	2	6	1823563	1823568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954853
31023	NC_008319	CAGG	2	8	1823579	1823586	25 %	0 %	50 %	25 %	113954853
31024	NC_008319	CCT	2	6	1823792	1823797	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113954853
31025	NC_008319	GCA	2	6	1823829	1823834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954853
31026	NC_008319	TCAC	2	8	1823852	1823859	25 %	25 %	0 %	50 %	113954853
31027	NC_008319	CGC	3	9	1823890	1823898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113954853
31028	NC_008319	CAG	4	12	1824087	1824098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955472
31029	NC_008319	GCC	2	6	1824224	1824229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113955472
31030	NC_008319	AGC	2	6	1824318	1824323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955472
31031	NC_008319	AACA	2	8	1824349	1824356	75 %	0 %	0 %	25 %	113955472
31032	NC_008319	CCA	2	6	1824376	1824381	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113955472
31033	NC_008319	TTC	2	6	1824409	1824414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113955472
31034	NC_008319	AG	3	6	1824422	1824427	50 %	0 %	50 %	0 %	113955472
31035	NC_008319	CCCCCA	2	12	1824435	1824446	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	113955472
31036	NC_008319	GAC	2	6	1824486	1824491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955472
31037	NC_008319	CAA	2	6	1824493	1824498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113955472
31038	NC_008319	CAG	2	6	1824520	1824525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955472
31039	NC_008319	GGAA	2	8	1824529	1824536	50 %	0 %	50 %	0 %	113955472
31040	NC_008319	C	6	6	1824568	1824573	0 %	0 %	0 %	100 %	113955472
31041	NC_008319	GCA	2	6	1824593	1824598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955472
31042	NC_008319	CCA	2	6	1824647	1824652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113955472
31043	NC_008319	CCA	2	6	1824698	1824703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113955472
31044	NC_008319	ACC	2	6	1824779	1824784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113955472
31045	NC_008319	CCAAG	2	10	1824793	1824802	40 %	0 %	20 %	40 %	113955472
31046	NC_008319	ACC	2	6	1824809	1824814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113955472
31047	NC_008319	CAA	3	9	1824841	1824849	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113955472
31048	NC_008319	ACC	2	6	1824852	1824857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113955472
31049	NC_008319	GC	3	6	1824881	1824886	0 %	0 %	50 %	50 %	113955472
31050	NC_008319	CGTGG	2	10	1824892	1824901	0 %	20 %	60 %	20 %	113955472
31051	NC_008319	AGG	2	6	1824935	1824940	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113955472
31052	NC_008319	ACC	2	6	1824958	1824963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113955472
31053	NC_008319	AAAG	2	8	1824968	1824975	75 %	0 %	25 %	0 %	113955472
31054	NC_008319	TCC	2	6	1824994	1824999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113952851
31055	NC_008319	AG	4	8	1825024	1825031	50 %	0 %	50 %	0 %	113952851
31056	NC_008319	AC	3	6	1825073	1825078	50 %	0 %	0 %	50 %	113952851
31057	NC_008319	AATC	2	8	1825146	1825153	50 %	25 %	0 %	25 %	113952851
31058	NC_008319	CGG	2	6	1825180	1825185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113952851
31059	NC_008319	GCA	2	6	1825187	1825192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952851
31060	NC_008319	GCTCCC	2	12	1825205	1825216	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	113952851
31061	NC_008319	CCA	2	6	1825242	1825247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113952851
31062	NC_008319	T	6	6	1825314	1825319	0 %	100 %	0 %	0 %	113952851
31063	NC_008319	CCT	2	6	1825418	1825423	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113952851
31064	NC_008319	CAC	2	6	1825425	1825430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113952851
31065	NC_008319	TTCTG	2	10	1825449	1825458	0 %	60 %	20 %	20 %	113952851
31066	NC_008319	GCA	2	6	1825484	1825489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952851
31067	NC_008319	AAT	2	6	1825565	1825570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113952851
31068	NC_008319	GTG	2	6	1825606	1825611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113952851
31069	NC_008319	CAG	3	9	1825616	1825624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952851
31070	NC_008319	GAG	2	6	1825641	1825646	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113952851
31071	NC_008319	CCG	2	6	1825679	1825684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113952851
31072	NC_008319	G	7	7	1825738	1825744	0 %	0 %	100 %	0 %	113952851
31073	NC_008319	AATA	2	8	1825751	1825758	75 %	25 %	0 %	0 %	113952851
31074	NC_008319	CGA	2	6	1825796	1825801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952851
31075	NC_008319	CCA	2	6	1825805	1825810	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113952851
31076	NC_008319	AAG	2	6	1825922	1825927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113952851
31077	NC_008319	CGG	2	6	1825954	1825959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113952851
31078	NC_008319	G	8	8	1825979	1825986	0 %	0 %	100 %	0 %	113952851
31079	NC_008319	TTC	2	6	1825992	1825997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113952851
31080	NC_008319	CCA	2	6	1826029	1826034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113952851
31081	NC_008319	TGAG	2	8	1826054	1826061	25 %	25 %	50 %	0 %	113952851
31082	NC_008319	TGCA	2	8	1826082	1826089	25 %	25 %	25 %	25 %	113952851
31083	NC_008319	ACA	3	9	1826138	1826146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113952851
31084	NC_008319	CAAT	2	8	1826170	1826177	50 %	25 %	0 %	25 %	113952851
31085	NC_008319	GCT	2	6	1826266	1826271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953522
31086	NC_008319	C	6	6	1826332	1826337	0 %	0 %	0 %	100 %	113953522
31087	NC_008319	G	6	6	1826379	1826384	0 %	0 %	100 %	0 %	113953522
31088	NC_008319	CAG	2	6	1826401	1826406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953522
31089	NC_008319	GAA	2	6	1826419	1826424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113953522
31090	NC_008319	ACG	2	6	1826435	1826440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953522
31091	NC_008319	CAA	2	6	1826533	1826538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953522
31092	NC_008319	TCC	2	6	1826562	1826567	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113953522
31093	NC_008319	CCA	2	6	1826572	1826577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953522
31094	NC_008319	TCCCA	2	10	1826657	1826666	20 %	20 %	0 %	60 %	113953522
31095	NC_008319	CGCAAC	2	12	1826780	1826791	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	113953522
31096	NC_008319	AGG	2	6	1826809	1826814	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113953522
31097	NC_008319	TCCC	2	8	1826869	1826876	0 %	25 %	0 %	75 %	113953722
31098	NC_008319	AAG	2	6	1826932	1826937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113953722
31099	NC_008319	CAC	2	6	1827064	1827069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953722
31100	NC_008319	GAA	2	6	1827118	1827123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113953722
31101	NC_008319	GTC	2	6	1827124	1827129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953722
31102	NC_008319	GCT	2	6	1827240	1827245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953722
31103	NC_008319	ACC	2	6	1827269	1827274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953722
31104	NC_008319	TCC	2	6	1827324	1827329	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113953722
31105	NC_008319	AATC	2	8	1827363	1827370	50 %	25 %	0 %	25 %	113953722
31106	NC_008319	TCG	2	6	1827392	1827397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953722
31107	NC_008319	CGGT	2	8	1827403	1827410	0 %	25 %	50 %	25 %	113953722
31108	NC_008319	AAC	2	6	1827421	1827426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953722
31109	NC_008319	GGCT	2	8	1827649	1827656	0 %	25 %	50 %	25 %	113953194
31110	NC_008319	TCA	2	6	1827672	1827677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953194
31111	NC_008319	GAGCA	2	10	1827691	1827700	40 %	0 %	40 %	20 %	113953194
31112	NC_008319	CAA	3	9	1827703	1827711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953194
31113	NC_008319	TCA	2	6	1827887	1827892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953194
31114	NC_008319	TGT	2	6	1827941	1827946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953194
31115	NC_008319	GCTC	2	8	1828140	1828147	0 %	25 %	25 %	50 %	113953194
31116	NC_008319	TGC	2	6	1828196	1828201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953194
31117	NC_008319	AACA	2	8	1828237	1828244	75 %	0 %	0 %	25 %	113953194
31118	NC_008319	TTCC	2	8	1828281	1828288	0 %	50 %	0 %	50 %	113953194
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31120	NC_008319	TCA	2	6	1828444	1828449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954357
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31124	NC_008319	CTG	2	6	1828793	1828798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953146
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31130	NC_008319	CCTG	2	8	1829106	1829113	0 %	25 %	25 %	50 %	113953146
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31146	NC_008319	CGC	2	6	1829837	1829842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113954481
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31220	NC_008319	CA	3	6	1834667	1834672	50 %	0 %	0 %	50 %	113954754
31221	NC_008319	T	6	6	1834675	1834680	0 %	100 %	0 %	0 %	113954754
31222	NC_008319	TTC	3	9	1834942	1834950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953970
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31227	NC_008319	TTG	2	6	1835190	1835195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953970
31228	NC_008319	CTGC	2	8	1835220	1835227	0 %	25 %	25 %	50 %	113953970
31229	NC_008319	ATGTC	2	10	1835229	1835238	20 %	40 %	20 %	20 %	113953970
31230	NC_008319	CGG	2	6	1835324	1835329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953970
31231	NC_008319	ACA	2	6	1835719	1835724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953129
31232	NC_008319	TGA	2	6	1835811	1835816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953129
31233	NC_008319	GAA	2	6	1835926	1835931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113953129
31234	NC_008319	ATCA	2	8	1836053	1836060	50 %	25 %	0 %	25 %	113955183
31235	NC_008319	TCA	2	6	1836072	1836077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113955183
31236	NC_008319	TCA	2	6	1836102	1836107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113955183
31237	NC_008319	CTG	2	6	1836128	1836133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955183
31238	NC_008319	TGA	2	6	1836227	1836232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955183
31239	NC_008319	ATCAA	2	10	1836246	1836255	60 %	20 %	0 %	20 %	113955183
31240	NC_008319	ACC	2	6	1836563	1836568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954184
31241	NC_008319	TCGA	2	8	1836600	1836607	25 %	25 %	25 %	25 %	113954184
31242	NC_008319	AG	3	6	1836612	1836617	50 %	0 %	50 %	0 %	113954184
31243	NC_008319	TGC	3	9	1836710	1836718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954184
31244	NC_008319	TGC	2	6	1836733	1836738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954184
31245	NC_008319	AG	3	6	1836775	1836780	50 %	0 %	50 %	0 %	113954184
31246	NC_008319	CAAC	2	8	1836810	1836817	50 %	0 %	0 %	50 %	113954184
31247	NC_008319	ACC	2	6	1837164	1837169	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954645
31248	NC_008319	CTG	2	6	1837215	1837220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954645
31249	NC_008319	TCA	2	6	1837232	1837237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954645
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31251	NC_008319	CAT	2	6	1837253	1837258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954645
31252	NC_008319	TCA	2	6	1837291	1837296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954645
31253	NC_008319	CTTTC	2	10	1837329	1837338	0 %	60 %	0 %	40 %	113954645
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31256	NC_008319	GCT	2	6	1837580	1837585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955424
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31261	NC_008319	CAT	2	6	1838263	1838268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113952845
31262	NC_008319	CGA	2	6	1838304	1838309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952845
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31302	NC_008319	GCTTCG	2	12	1841254	1841265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954232
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31311	NC_008319	GAC	2	6	1842131	1842136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953580
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31314	NC_008319	T	7	7	1842268	1842274	0 %	100 %	0 %	0 %	113955218
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31320	NC_008319	TGC	2	6	1842962	1842967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955571
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31323	NC_008319	AGAA	2	8	1843002	1843009	75 %	0 %	25 %	0 %	113955571
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31333	NC_008319	TCTCT	2	10	1844328	1844337	0 %	60 %	0 %	40 %	113954759
31334	NC_008319	T	6	6	1844354	1844359	0 %	100 %	0 %	0 %	113954759
31335	NC_008319	CTT	2	6	1844445	1844450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954759
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31340	NC_008319	GAAA	2	8	1844803	1844810	75 %	0 %	25 %	0 %	113954759
31341	NC_008319	G	6	6	1844937	1844942	0 %	0 %	100 %	0 %	113954759
31342	NC_008319	CAG	2	6	1844976	1844981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954759
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31345	NC_008319	CCTG	2	8	1845149	1845156	0 %	25 %	25 %	50 %	113954759
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31347	NC_008319	CAA	2	6	1845259	1845264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113954759
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31349	NC_008319	AGA	2	6	1845283	1845288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113954759
31350	NC_008319	TGC	2	6	1845316	1845321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954759
31351	NC_008319	CCA	2	6	1845324	1845329	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954759
31352	NC_008319	TCT	2	6	1845377	1845382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954759
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31356	NC_008319	TTA	2	6	1845473	1845478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113954759
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31449	NC_008319	T	7	7	1851833	1851839	0 %	100 %	0 %	0 %	113953354
31450	NC_008319	ATC	2	6	1851859	1851864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953354
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31454	NC_008319	GTC	2	6	1852050	1852055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954015
31455	NC_008319	AGC	2	6	1852100	1852105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954015
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31457	NC_008319	CTG	2	6	1852231	1852236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954015
31458	NC_008319	CCATT	2	10	1852440	1852449	20 %	40 %	0 %	40 %	113954015
31459	NC_008319	GA	3	6	1852466	1852471	50 %	0 %	50 %	0 %	113954015
31460	NC_008319	TC	3	6	1852521	1852526	0 %	50 %	0 %	50 %	113954015
31461	NC_008319	CTG	2	6	1852603	1852608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954015
31462	NC_008319	AGC	2	6	1852691	1852696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954015
31463	NC_008319	CT	3	6	1852731	1852736	0 %	50 %	0 %	50 %	113954015
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31465	NC_008319	TCG	2	6	1852796	1852801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954015
31466	NC_008319	CAG	2	6	1852966	1852971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954015
31467	NC_008319	TGC	2	6	1852987	1852992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954015
31468	NC_008319	CTGG	2	8	1853029	1853036	0 %	25 %	50 %	25 %	113953126
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31481	NC_008319	GGA	2	6	1853706	1853711	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113953126
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31491	NC_008319	GTG	2	6	1854501	1854506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955378
31492	NC_008319	CTA	2	6	1854652	1854657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954608
31493	NC_008319	CCGT	2	8	1854820	1854827	0 %	25 %	25 %	50 %	113954608
31494	NC_008319	ATG	2	6	1854892	1854897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954608
31495	NC_008319	TCA	2	6	1854940	1854945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954608
31496	NC_008319	CCTT	2	8	1854953	1854960	0 %	50 %	0 %	50 %	113954608
31497	NC_008319	CCA	2	6	1855001	1855006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954608
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31499	NC_008319	TCA	2	6	1855114	1855119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954608
31500	NC_008319	GTGC	2	8	1855171	1855178	0 %	25 %	50 %	25 %	113954608

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