MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9311

Total Repeats: 44579

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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28002	NC_008319	ACC	2	6	1657587	1657592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953863
28003	NC_008319	GAG	2	6	1657645	1657650	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113953863
28004	NC_008319	CCA	2	6	1657781	1657786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953863
28005	NC_008319	CCA	3	9	1657818	1657826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953863
28006	NC_008319	TCC	2	6	1657874	1657879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113953863
28007	NC_008319	GATG	2	8	1657901	1657908	25 %	25 %	50 %	0 %	113953863
28008	NC_008319	TGAT	2	8	1657927	1657934	25 %	50 %	25 %	0 %	113953863
28009	NC_008319	TCG	2	6	1658116	1658121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954706
28010	NC_008319	TGG	2	6	1658145	1658150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954706
28011	NC_008319	TGG	3	9	1658187	1658195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954706
28012	NC_008319	GATGC	2	10	1658228	1658237	20 %	20 %	40 %	20 %	113954706
28013	NC_008319	ATC	2	6	1658313	1658318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954706
28014	NC_008319	TCT	2	6	1658373	1658378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954706
28015	NC_008319	TCT	3	9	1658491	1658499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954706
28016	NC_008319	GCT	2	6	1658542	1658547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954706
28017	NC_008319	CAC	2	6	1658561	1658566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954706
28018	NC_008319	GAT	2	6	1658590	1658595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954706
28019	NC_008319	CTG	2	6	1658689	1658694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954706
28020	NC_008319	CAG	2	6	1658809	1658814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954706
28021	NC_008319	TCA	2	6	1658884	1658889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954706
28022	NC_008319	GCG	2	6	1659135	1659140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953815
28023	NC_008319	G	6	6	1659140	1659145	0 %	0 %	100 %	0 %	113953815
28024	NC_008319	GGC	2	6	1659152	1659157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953815
28025	NC_008319	GC	3	6	1659217	1659222	0 %	0 %	50 %	50 %	113953815
28026	NC_008319	GGA	2	6	1659307	1659312	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113953815
28027	NC_008319	GGA	2	6	1659356	1659361	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113953815
28028	NC_008319	CGA	2	6	1659362	1659367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953815
28029	NC_008319	GACG	2	8	1659374	1659381	25 %	0 %	50 %	25 %	113953815
28030	NC_008319	GCCA	2	8	1659439	1659446	25 %	0 %	25 %	50 %	113953815
28031	NC_008319	AACCCC	2	12	1659447	1659458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953815
28032	NC_008319	GCT	2	6	1659476	1659481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953815
28033	NC_008319	CAG	2	6	1659534	1659539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953815
28034	NC_008319	TGAC	2	8	1659573	1659580	25 %	25 %	25 %	25 %	113953815
28035	NC_008319	AAC	2	6	1659581	1659586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953815
28036	NC_008319	GGC	2	6	1659612	1659617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953239
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28038	NC_008319	CAAC	2	8	1659638	1659645	50 %	0 %	0 %	50 %	113953239
28039	NC_008319	CTGG	2	8	1659667	1659674	0 %	25 %	50 %	25 %	113953239
28040	NC_008319	T	7	7	1659719	1659725	0 %	100 %	0 %	0 %	113953239
28041	NC_008319	ACCA	2	8	1659759	1659766	50 %	0 %	0 %	50 %	113953239
28042	NC_008319	GGA	2	6	1659778	1659783	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113953239
28043	NC_008319	CTT	2	6	1659980	1659985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953239
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28047	NC_008319	CGCT	2	8	1660105	1660112	0 %	25 %	25 %	50 %	113953239
28048	NC_008319	GCT	2	6	1660132	1660137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953239
28049	NC_008319	TGA	2	6	1660179	1660184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953239
28050	NC_008319	CAA	2	6	1660201	1660206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953239
28051	NC_008319	ACA	2	6	1660230	1660235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953239
28052	NC_008319	CTT	2	6	1660247	1660252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953239
28053	NC_008319	A	7	7	1660274	1660280	100 %	0 %	0 %	0 %	113953239
28054	NC_008319	GCC	2	6	1660454	1660459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113953239
28055	NC_008319	ATGA	2	8	1660502	1660509	50 %	25 %	25 %	0 %	113953239
28056	NC_008319	TGC	2	6	1660530	1660535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953239
28057	NC_008319	GCAACA	2	12	1660565	1660576	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	113953239
28058	NC_008319	CAAG	2	8	1660916	1660923	50 %	0 %	25 %	25 %	113953015
28059	NC_008319	GCT	2	6	1660948	1660953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953015
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28061	NC_008319	GGC	2	6	1661171	1661176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953015
28062	NC_008319	TC	3	6	1661188	1661193	0 %	50 %	0 %	50 %	113953015
28063	NC_008319	GGT	2	6	1661209	1661214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953015
28064	NC_008319	CAC	2	6	1661263	1661268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953015
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28066	NC_008319	TC	3	6	1661307	1661312	0 %	50 %	0 %	50 %	113953015
28067	NC_008319	CCCA	2	8	1661435	1661442	25 %	0 %	0 %	75 %	113953015
28068	NC_008319	A	6	6	1661506	1661511	100 %	0 %	0 %	0 %	113953015
28069	NC_008319	TTC	2	6	1661546	1661551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113955303
28070	NC_008319	GCT	2	6	1661642	1661647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955303
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28072	NC_008319	TCA	2	6	1661696	1661701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113955303
28073	NC_008319	CAA	2	6	1661815	1661820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113955303
28074	NC_008319	CAG	2	6	1661827	1661832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955303
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28076	NC_008319	GCA	2	6	1661915	1661920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954220
28077	NC_008319	ACC	2	6	1661921	1661926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954220
28078	NC_008319	TTA	2	6	1662082	1662087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113954220
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28085	NC_008319	AGA	2	6	1662484	1662489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113954220
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28089	NC_008319	G	7	7	1662640	1662646	0 %	0 %	100 %	0 %	113954220
28090	NC_008319	GCT	2	6	1662652	1662657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954220
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28092	NC_008319	CCGAT	2	10	1662836	1662845	20 %	20 %	20 %	40 %	113954220
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28100	NC_008319	AGC	2	6	1663471	1663476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954220
28101	NC_008319	ATCG	2	8	1663493	1663500	25 %	25 %	25 %	25 %	113954220
28102	NC_008319	A	6	6	1663539	1663544	100 %	0 %	0 %	0 %	113954220
28103	NC_008319	GCTG	2	8	1663558	1663565	0 %	25 %	50 %	25 %	113954220
28104	NC_008319	GCC	2	6	1663611	1663616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113954220
28105	NC_008319	CCAA	2	8	1663674	1663681	50 %	0 %	0 %	50 %	113954220
28106	NC_008319	CTTT	2	8	1663697	1663704	0 %	75 %	0 %	25 %	113954220
28107	NC_008319	GAA	2	6	1663724	1663729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113954220
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28109	NC_008319	CCT	2	6	1663874	1663879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113953612
28110	NC_008319	CCAT	2	8	1663933	1663940	25 %	25 %	0 %	50 %	113953612
28111	NC_008319	CCAA	2	8	1663988	1663995	50 %	0 %	0 %	50 %	113953612
28112	NC_008319	AGGC	2	8	1664024	1664031	25 %	0 %	50 %	25 %	113953612
28113	NC_008319	CTT	2	6	1664043	1664048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953612
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28115	NC_008319	CGG	2	6	1664318	1664323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954678
28116	NC_008319	ACTCC	2	10	1664381	1664390	20 %	20 %	0 %	60 %	113954678
28117	NC_008319	GCT	2	6	1664399	1664404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954678
28118	NC_008319	TGC	2	6	1664433	1664438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954678
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28124	NC_008319	TGC	2	6	1664855	1664860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954678
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28215	NC_008319	CAGT	2	8	1669431	1669438	25 %	25 %	25 %	25 %	113955522
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28218	NC_008319	GAG	2	6	1669813	1669818	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113955522
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28229	NC_008319	TGA	2	6	1670308	1670313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954340
28230	NC_008319	GCA	2	6	1670317	1670322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954340
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28343	NC_008319	GTCA	2	8	1677279	1677286	25 %	25 %	25 %	25 %	113954688
28344	NC_008319	GAG	2	6	1677299	1677304	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113954688
28345	NC_008319	CT	3	6	1677324	1677329	0 %	50 %	0 %	50 %	113954688
28346	NC_008319	CAA	2	6	1677437	1677442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113954688
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28355	NC_008319	CGT	2	6	1677900	1677905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954688
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28464	NC_008319	GAG	2	6	1684541	1684546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113953608
28465	NC_008319	AGCC	2	8	1684602	1684609	25 %	0 %	25 %	50 %	113953608
28466	NC_008319	TTTG	2	8	1684659	1684666	0 %	75 %	25 %	0 %	113953608
28467	NC_008319	C	6	6	1684679	1684684	0 %	0 %	0 %	100 %	113953608
28468	NC_008319	GCATC	2	10	1684734	1684743	20 %	20 %	20 %	40 %	113953608
28469	NC_008319	GCT	3	9	1684830	1684838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953608
28470	NC_008319	GAC	2	6	1684846	1684851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953608
28471	NC_008319	TGC	2	6	1684950	1684955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953608
28472	NC_008319	TC	3	6	1684969	1684974	0 %	50 %	0 %	50 %	113953608
28473	NC_008319	AGA	2	6	1684998	1685003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113953608
28474	NC_008319	TGT	2	6	1685067	1685072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953608
28475	NC_008319	AAC	3	9	1685090	1685098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953608
28476	NC_008319	ATC	2	6	1685170	1685175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953608
28477	NC_008319	GGCT	2	8	1685330	1685337	0 %	25 %	50 %	25 %	113954698
28478	NC_008319	ATC	2	6	1685351	1685356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954698
28479	NC_008319	TC	3	6	1685360	1685365	0 %	50 %	0 %	50 %	113954698
28480	NC_008319	GTT	2	6	1685401	1685406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954698
28481	NC_008319	TCA	2	6	1685478	1685483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954698
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28483	NC_008319	CGAGCA	2	12	1685559	1685570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954698
28484	NC_008319	ATGG	2	8	1685598	1685605	25 %	25 %	50 %	0 %	113954698
28485	NC_008319	CAA	2	6	1685680	1685685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113954698
28486	NC_008319	GCA	2	6	1685787	1685792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954698
28487	NC_008319	GGC	2	6	1685800	1685805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954698
28488	NC_008319	GTT	2	6	1685814	1685819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954698
28489	NC_008319	GAA	2	6	1685833	1685838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113954698
28490	NC_008319	ATG	2	6	1685972	1685977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954698
28491	NC_008319	TCG	2	6	1686000	1686005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954698
28492	NC_008319	CTG	2	6	1686068	1686073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954698
28493	NC_008319	CTG	2	6	1686148	1686153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954698
28494	NC_008319	TGGT	2	8	1686273	1686280	0 %	50 %	50 %	0 %	113954698
28495	NC_008319	CGA	2	6	1686309	1686314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954698
28496	NC_008319	ATC	2	6	1686361	1686366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954698
28497	NC_008319	GCTT	2	8	1686405	1686412	0 %	50 %	25 %	25 %	113954698
28498	NC_008319	CTT	2	6	1686516	1686521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954698
28499	NC_008319	ATT	2	6	1686605	1686610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113954698
28500	NC_008319	GGC	2	6	1686646	1686651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954698

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