MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9311

Total Repeats: 44579

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
27501	NC_008319	ATCG	2	8	1627848	1627855	25 %	25 %	25 %	25 %	113954962
27502	NC_008319	CAAA	2	8	1627856	1627863	75 %	0 %	0 %	25 %	113954962
27503	NC_008319	TGC	2	6	1627893	1627898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954962
27504	NC_008319	AAG	2	6	1627911	1627916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113954962
27505	NC_008319	CCG	2	6	1627940	1627945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113954962
27506	NC_008319	A	6	6	1628011	1628016	100 %	0 %	0 %	0 %	113954962
27507	NC_008319	AAG	2	6	1628070	1628075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113954962
27508	NC_008319	TGA	2	6	1628152	1628157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954962
27509	NC_008319	A	6	6	1628208	1628213	100 %	0 %	0 %	0 %	113954962
27510	NC_008319	AT	3	6	1628258	1628263	50 %	50 %	0 %	0 %	113954962
27511	NC_008319	GAA	2	6	1628289	1628294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113954962
27512	NC_008319	CAA	2	6	1628551	1628556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953394
27513	NC_008319	AAT	2	6	1628629	1628634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113953394
27514	NC_008319	AATTC	2	10	1628697	1628706	40 %	40 %	0 %	20 %	113953394
27515	NC_008319	ATC	2	6	1628786	1628791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953394
27516	NC_008319	TCA	2	6	1628800	1628805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953394
27517	NC_008319	CT	3	6	1628888	1628893	0 %	50 %	0 %	50 %	113953394
27518	NC_008319	GCTG	2	8	1628913	1628920	0 %	25 %	50 %	25 %	113953394
27519	NC_008319	ACC	2	6	1629103	1629108	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953651
27520	NC_008319	CTC	2	6	1629148	1629153	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113953651
27521	NC_008319	TTG	2	6	1629191	1629196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953651
27522	NC_008319	CAG	2	6	1629221	1629226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953651
27523	NC_008319	AAACC	2	10	1629266	1629275	60 %	0 %	0 %	40 %	113953651
27524	NC_008319	ACG	2	6	1629605	1629610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954311
27525	NC_008319	AGT	2	6	1629634	1629639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954311
27526	NC_008319	ATC	3	9	1629667	1629675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954311
27527	NC_008319	CAC	2	6	1629683	1629688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954311
27528	NC_008319	GTG	2	6	1629699	1629704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954311
27529	NC_008319	GTCT	2	8	1629778	1629785	0 %	50 %	25 %	25 %	113954311
27530	NC_008319	GCAAA	2	10	1629995	1630004	60 %	0 %	20 %	20 %	113954311
27531	NC_008319	GAT	2	6	1630046	1630051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955271
27532	NC_008319	G	7	7	1630060	1630066	0 %	0 %	100 %	0 %	113955271
27533	NC_008319	GCT	2	6	1630090	1630095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955271
27534	NC_008319	CAA	2	6	1630116	1630121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113955271
27535	NC_008319	TGGC	2	8	1630203	1630210	0 %	25 %	50 %	25 %	113955271
27536	NC_008319	GCA	2	6	1630240	1630245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955271
27537	NC_008319	GCA	2	6	1630294	1630299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955271
27538	NC_008319	CT	3	6	1630313	1630318	0 %	50 %	0 %	50 %	113955271
27539	NC_008319	CGT	2	6	1630346	1630351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955271
27540	NC_008319	ACCA	2	8	1630367	1630374	50 %	0 %	0 %	50 %	113955271
27541	NC_008319	CAA	2	6	1630450	1630455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113955271
27542	NC_008319	TGG	2	6	1630467	1630472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955271
27543	NC_008319	GCT	2	6	1630526	1630531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955271
27544	NC_008319	GAAC	2	8	1630628	1630635	50 %	0 %	25 %	25 %	113955271
27545	NC_008319	GAT	2	6	1630670	1630675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955271
27546	NC_008319	CCT	2	6	1630712	1630717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113955271
27547	NC_008319	CCT	2	6	1630760	1630765	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113955271
27548	NC_008319	TCCA	2	8	1630932	1630939	25 %	25 %	0 %	50 %	113955271
27549	NC_008319	AGC	2	6	1631003	1631008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955271
27550	NC_008319	GTG	2	6	1631091	1631096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955271
27551	NC_008319	AGG	2	6	1631312	1631317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113953727
27552	NC_008319	GCA	2	6	1631346	1631351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953727
27553	NC_008319	CAT	2	6	1631391	1631396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953727
27554	NC_008319	GAG	2	6	1631489	1631494	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113953727
27555	NC_008319	T	8	8	1631610	1631617	0 %	100 %	0 %	0 %	113954406
27556	NC_008319	CGA	2	6	1631628	1631633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954406
27557	NC_008319	GA	4	8	1631680	1631687	50 %	0 %	50 %	0 %	113954406
27558	NC_008319	AG	3	6	1631858	1631863	50 %	0 %	50 %	0 %	113953161
27559	NC_008319	TTG	2	6	1631924	1631929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953161
27560	NC_008319	TGG	2	6	1631983	1631988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953161
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27562	NC_008319	T	7	7	1632040	1632046	0 %	100 %	0 %	0 %	113953161
27563	NC_008319	GCT	2	6	1632200	1632205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953936
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27567	NC_008319	GTTC	2	8	1632472	1632479	0 %	50 %	25 %	25 %	113953936
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27582	NC_008319	ACC	2	6	1633136	1633141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954904
27583	NC_008319	TG	3	6	1633301	1633306	0 %	50 %	50 %	0 %	113954904
27584	NC_008319	TCA	2	6	1633707	1633712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953003
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27586	NC_008319	GGA	2	6	1633787	1633792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113953003
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27588	NC_008319	T	7	7	1633861	1633867	0 %	100 %	0 %	0 %	113953003
27589	NC_008319	TCCA	2	8	1633892	1633899	25 %	25 %	0 %	50 %	113953003
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27591	NC_008319	AAG	2	6	1634211	1634216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113952759
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27593	NC_008319	A	6	6	1634342	1634347	100 %	0 %	0 %	0 %	113952759
27594	NC_008319	TGC	2	6	1634362	1634367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952759
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27597	NC_008319	TGAT	2	8	1634429	1634436	25 %	50 %	25 %	0 %	113952759
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27600	NC_008319	GATC	2	8	1634569	1634576	25 %	25 %	25 %	25 %	113955598
27601	NC_008319	CAA	2	6	1634604	1634609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113955598
27602	NC_008319	CG	3	6	1634622	1634627	0 %	0 %	50 %	50 %	113955598
27603	NC_008319	CAAC	2	8	1634628	1634635	50 %	0 %	0 %	50 %	113955598
27604	NC_008319	CGA	2	6	1634804	1634809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952744
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27607	NC_008319	ATC	2	6	1635311	1635316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954431
27608	NC_008319	CAA	2	6	1635373	1635378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953594
27609	NC_008319	AGC	2	6	1635453	1635458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953594
27610	NC_008319	CAACT	2	10	1635459	1635468	40 %	20 %	0 %	40 %	113953594
27611	NC_008319	CAG	2	6	1635487	1635492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953594
27612	NC_008319	AGCG	2	8	1635525	1635532	25 %	0 %	50 %	25 %	113953594
27613	NC_008319	AT	4	8	1635686	1635693	50 %	50 %	0 %	0 %	113953594
27614	NC_008319	GGA	2	6	1635706	1635711	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113953594
27615	NC_008319	GCA	2	6	1635729	1635734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953594
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