MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9311

Total Repeats: 44579

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19501	NC_008319	CAT	2	6	1145646	1145651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954490
19502	NC_008319	ACC	2	6	1145739	1145744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954490
19503	NC_008319	T	6	6	1145775	1145780	0 %	100 %	0 %	0 %	113954490
19504	NC_008319	TCC	2	6	1145812	1145817	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113954490
19505	NC_008319	GTT	2	6	1145961	1145966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954490
19506	NC_008319	GCT	2	6	1146143	1146148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954840
19507	NC_008319	CCG	2	6	1146204	1146209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113954840
19508	NC_008319	GTC	2	6	1146212	1146217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954840
19509	NC_008319	TGA	2	6	1146262	1146267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954840
19510	NC_008319	GCG	2	6	1146355	1146360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953819
19511	NC_008319	ATCTCC	2	12	1146378	1146389	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	113953819
19512	NC_008319	ATT	2	6	1146390	1146395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113953819
19513	NC_008319	GTC	2	6	1146402	1146407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953819
19514	NC_008319	TCT	2	6	1146417	1146422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953819
19515	NC_008319	TCT	2	6	1146452	1146457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953819
19516	NC_008319	CAG	2	6	1146503	1146508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953819
19517	NC_008319	TTCA	2	8	1146512	1146519	25 %	50 %	0 %	25 %	113953819
19518	NC_008319	AAT	2	6	1146533	1146538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113953819
19519	NC_008319	TTG	2	6	1146570	1146575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953819
19520	NC_008319	TGA	2	6	1146596	1146601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953819
19521	NC_008319	TGA	2	6	1146623	1146628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113952858
19522	NC_008319	ATCA	2	8	1146680	1146687	50 %	25 %	0 %	25 %	113952858
19523	NC_008319	TGC	2	6	1146795	1146800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952858
19524	NC_008319	CTA	2	6	1146887	1146892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113952858
19525	NC_008319	TTG	2	6	1146914	1146919	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113952858
19526	NC_008319	TTG	2	6	1146930	1146935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113952858
19527	NC_008319	CAT	2	6	1146994	1146999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113952858
19528	NC_008319	AGC	2	6	1147034	1147039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952858
19529	NC_008319	TCG	2	6	1147077	1147082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952858
19530	NC_008319	AGG	2	6	1147097	1147102	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113952858
19531	NC_008319	AAC	2	6	1147205	1147210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113952858
19532	NC_008319	CGA	2	6	1147251	1147256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952858
19533	NC_008319	GTG	2	6	1147281	1147286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113952858
19534	NC_008319	TGC	2	6	1147294	1147299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955586
19535	NC_008319	TGG	2	6	1147321	1147326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955586
19536	NC_008319	AGC	2	6	1147367	1147372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955586
19537	NC_008319	TGGA	2	8	1147565	1147572	25 %	25 %	50 %	0 %	113955586
19538	NC_008319	ACT	2	6	1147623	1147628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113955586
19539	NC_008319	TTG	2	6	1147646	1147651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113955586
19540	NC_008319	GCC	2	6	1147703	1147708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113955586
19541	NC_008319	TGC	2	6	1147732	1147737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955586
19542	NC_008319	TCA	2	6	1147809	1147814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113955586
19543	NC_008319	AG	3	6	1147835	1147840	50 %	0 %	50 %	0 %	113955586
19544	NC_008319	GAG	2	6	1147929	1147934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113955586
19545	NC_008319	GATC	2	8	1147936	1147943	25 %	25 %	25 %	25 %	113955586
19546	NC_008319	GTT	2	6	1147958	1147963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113955586
19547	NC_008319	GTC	2	6	1147986	1147991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955586
19548	NC_008319	TTGGAT	2	12	1148009	1148020	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	113955586
19549	NC_008319	A	6	6	1148032	1148037	100 %	0 %	0 %	0 %	113955586
19550	NC_008319	TGG	2	6	1148040	1148045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955586
19551	NC_008319	GATCTT	2	12	1148075	1148086	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	113955586
19552	NC_008319	AGC	2	6	1148092	1148097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955586
19553	NC_008319	T	6	6	1148150	1148155	0 %	100 %	0 %	0 %	113955586
19554	NC_008319	TCCTT	2	10	1148185	1148194	0 %	60 %	0 %	40 %	113955586
19555	NC_008319	ATT	2	6	1148428	1148433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113955586
19556	NC_008319	TGT	2	6	1148449	1148454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113955586
19557	NC_008319	GTGAT	2	10	1148472	1148481	20 %	40 %	40 %	0 %	113955586
19558	NC_008319	AAT	2	6	1148489	1148494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113955586
19559	NC_008319	GAG	2	6	1148648	1148653	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113955586
19560	NC_008319	TGC	2	6	1148707	1148712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955586
19561	NC_008319	CAGTTG	2	12	1148720	1148731	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	113955586
19562	NC_008319	GCA	2	6	1148740	1148745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955586
19563	NC_008319	TGG	2	6	1148818	1148823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955586
19564	NC_008319	TGT	2	6	1148898	1148903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113955586
19565	NC_008319	TGT	2	6	1148974	1148979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113955586
19566	NC_008319	CGG	2	6	1149118	1149123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954516
19567	NC_008319	TG	3	6	1149133	1149138	0 %	50 %	50 %	0 %	113954516
19568	NC_008319	GGT	2	6	1149166	1149171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954516
19569	NC_008319	ACA	2	6	1149253	1149258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113954516
19570	NC_008319	CTG	2	6	1149436	1149441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953611
19571	NC_008319	CT	3	6	1149479	1149484	0 %	50 %	0 %	50 %	113953611
19572	NC_008319	CT	4	8	1149687	1149694	0 %	50 %	0 %	50 %	113953611
19573	NC_008319	AGTTTG	2	12	1149732	1149743	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	113953611
19574	NC_008319	CTT	3	9	1149798	1149806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953611
19575	NC_008319	GCT	2	6	1149807	1149812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953611
19576	NC_008319	CCA	2	6	1149844	1149849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953611
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19580	NC_008319	CTT	2	6	1150181	1150186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954333
19581	NC_008319	AAT	2	6	1150192	1150197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113954333
19582	NC_008319	CTG	2	6	1150222	1150227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954333
19583	NC_008319	GAT	2	6	1150322	1150327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954333
19584	NC_008319	CAA	2	6	1150391	1150396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113954333
19585	NC_008319	TGC	2	6	1150410	1150415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954333
19586	NC_008319	GTA	2	6	1150421	1150426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954333
19587	NC_008319	CCA	2	6	1150441	1150446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954333
19588	NC_008319	CTT	2	6	1150460	1150465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954333
19589	NC_008319	AGG	2	6	1150523	1150528	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113954333
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19591	NC_008319	CTGC	2	8	1150726	1150733	0 %	25 %	25 %	50 %	113954333
19592	NC_008319	ACAA	2	8	1150738	1150745	75 %	0 %	0 %	25 %	113954333
19593	NC_008319	ACC	2	6	1150746	1150751	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954333
19594	NC_008319	AAC	2	6	1150816	1150821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113954333
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19596	NC_008319	CAA	2	6	1150919	1150924	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113954333
19597	NC_008319	CT	3	6	1151022	1151027	0 %	50 %	0 %	50 %	113953687
19598	NC_008319	AGT	2	6	1151116	1151121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953687
19599	NC_008319	GGTT	2	8	1151160	1151167	0 %	50 %	50 %	0 %	113953687
19600	NC_008319	CAG	2	6	1151175	1151180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953687
19601	NC_008319	CGT	2	6	1151221	1151226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953687
19602	NC_008319	TGT	2	6	1151227	1151232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953687
19603	NC_008319	CTC	2	6	1151307	1151312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113953687
19604	NC_008319	ACC	2	6	1151392	1151397	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953687
19605	NC_008319	GCCG	2	8	1151593	1151600	0 %	0 %	50 %	50 %	113953687
19606	NC_008319	TGT	2	6	1151609	1151614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953687
19607	NC_008319	CGTT	2	8	1151740	1151747	0 %	50 %	25 %	25 %	113955295
19608	NC_008319	GAA	2	6	1151900	1151905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113955295
19609	NC_008319	TCA	2	6	1151948	1151953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113955295
19610	NC_008319	GAG	2	6	1151999	1152004	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113955295
19611	NC_008319	AGC	2	6	1152075	1152080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955295
19612	NC_008319	TGT	2	6	1152091	1152096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113955295
19613	NC_008319	ATC	2	6	1152150	1152155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113955295
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19615	NC_008319	GAT	2	6	1152342	1152347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955131
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19617	NC_008319	CGT	2	6	1152379	1152384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955131
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