MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9311

Total Repeats: 44579

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_008319	CTT	2	6	1111500	1111505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113955204
19002	NC_008319	GCA	2	6	1111547	1111552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953697
19003	NC_008319	AGA	2	6	1111579	1111584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113953697
19004	NC_008319	TGG	2	6	1111585	1111590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953697
19005	NC_008319	TTGCT	2	10	1111707	1111716	0 %	60 %	20 %	20 %	113953697
19006	NC_008319	GTG	2	6	1111737	1111742	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953697
19007	NC_008319	CTT	2	6	1111760	1111765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953697
19008	NC_008319	TTGC	2	8	1111840	1111847	0 %	50 %	25 %	25 %	113953072
19009	NC_008319	ATCA	2	8	1112038	1112045	50 %	25 %	0 %	25 %	113953072
19010	NC_008319	TTCA	2	8	1112072	1112079	25 %	50 %	0 %	25 %	113953072
19011	NC_008319	ATC	2	6	1112088	1112093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953072
19012	NC_008319	TGGA	2	8	1112103	1112110	25 %	25 %	50 %	0 %	113953072
19013	NC_008319	TGA	2	6	1112129	1112134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953072
19014	NC_008319	TGA	2	6	1112141	1112146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953072
19015	NC_008319	GA	3	6	1112155	1112160	50 %	0 %	50 %	0 %	113953072
19016	NC_008319	TGG	2	6	1112287	1112292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953072
19017	NC_008319	GTT	2	6	1112312	1112317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953072
19018	NC_008319	TTC	2	6	1112396	1112401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953072
19019	NC_008319	CTC	2	6	1112438	1112443	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113953072
19020	NC_008319	GTC	2	6	1112453	1112458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953072
19021	NC_008319	GCTG	2	8	1112460	1112467	0 %	25 %	50 %	25 %	113953072
19022	NC_008319	TGT	2	6	1112601	1112606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953072
19023	NC_008319	TTG	2	6	1112664	1112669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953072
19024	NC_008319	CTT	2	6	1112686	1112691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953072
19025	NC_008319	GCT	2	6	1112694	1112699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953072
19026	NC_008319	TCC	2	6	1112710	1112715	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113953072
19027	NC_008319	CGG	2	6	1112719	1112724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953072
19028	NC_008319	TCG	2	6	1112742	1112747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953072
19029	NC_008319	CGT	2	6	1112758	1112763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953072
19030	NC_008319	TCT	2	6	1112799	1112804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953072
19031	NC_008319	ATT	2	6	1112811	1112816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113953072
19032	NC_008319	ACT	2	6	1112835	1112840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953072
19033	NC_008319	AGTG	2	8	1112951	1112958	25 %	25 %	50 %	0 %	113953072
19034	NC_008319	ATTG	2	8	1112961	1112968	25 %	50 %	25 %	0 %	113954289
19035	NC_008319	TCT	2	6	1113130	1113135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954289
19036	NC_008319	GCA	2	6	1113169	1113174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954289
19037	NC_008319	AGT	2	6	1113183	1113188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954289
19038	NC_008319	CGTCCT	2	12	1113224	1113235	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	113954908
19039	NC_008319	CAAC	2	8	1113266	1113273	50 %	0 %	0 %	50 %	113954908
19040	NC_008319	CCT	2	6	1113323	1113328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113954908
19041	NC_008319	ATC	2	6	1113340	1113345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954908
19042	NC_008319	TTGG	2	8	1113360	1113367	0 %	50 %	50 %	0 %	113954908
19043	NC_008319	CTT	2	6	1113484	1113489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954908
19044	NC_008319	GCACA	2	10	1113565	1113574	40 %	0 %	20 %	40 %	113954908
19045	NC_008319	GCCCA	2	10	1113596	1113605	20 %	0 %	20 %	60 %	113954908
19046	NC_008319	TGA	2	6	1113683	1113688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954908
19047	NC_008319	CTC	2	6	1114242	1114247	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113954409
19048	NC_008319	AAG	2	6	1114251	1114256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113954409
19049	NC_008319	GTC	2	6	1114281	1114286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954409
19050	NC_008319	TGG	2	6	1114342	1114347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954409
19051	NC_008319	CAA	2	6	1114370	1114375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113954409
19052	NC_008319	CGT	2	6	1114454	1114459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954409
19053	NC_008319	TCT	2	6	1114498	1114503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954409
19054	NC_008319	AGCA	2	8	1114574	1114581	50 %	0 %	25 %	25 %	113954409
19055	NC_008319	TGATT	2	10	1114612	1114621	20 %	60 %	20 %	0 %	113954409
19056	NC_008319	GTGCA	2	10	1114647	1114656	20 %	20 %	40 %	20 %	113954409
19057	NC_008319	TCG	2	6	1114682	1114687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954409
19058	NC_008319	CTGGCT	2	12	1114712	1114723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954409
19059	NC_008319	TGG	2	6	1114732	1114737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954409
19060	NC_008319	TCT	2	6	1114759	1114764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954409
19061	NC_008319	TGA	2	6	1114778	1114783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954409
19062	NC_008319	CT	3	6	1114798	1114803	0 %	50 %	0 %	50 %	113954405
19063	NC_008319	CGG	2	6	1114820	1114825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954405
19064	NC_008319	TGGA	2	8	1114838	1114845	25 %	25 %	50 %	0 %	113954405
19065	NC_008319	TTGG	2	8	1114912	1114919	0 %	50 %	50 %	0 %	113954405
19066	NC_008319	TGT	2	6	1114968	1114973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954405
19067	NC_008319	CAC	2	6	1115029	1115034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954405
19068	NC_008319	TGG	2	6	1115058	1115063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954405
19069	NC_008319	GAT	2	6	1115122	1115127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954405
19070	NC_008319	ATC	2	6	1115203	1115208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954405
19071	NC_008319	GTC	2	6	1115222	1115227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954405
19072	NC_008319	TCG	2	6	1115256	1115261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954405
19073	NC_008319	TGG	2	6	1115280	1115285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954405
19074	NC_008319	CGC	2	6	1115500	1115505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113953028
19075	NC_008319	CCT	2	6	1115522	1115527	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113953028
19076	NC_008319	ACTC	2	8	1115586	1115593	25 %	25 %	0 %	50 %	113953028
19077	NC_008319	TCA	2	6	1115595	1115600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953028
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19083	NC_008319	GTT	2	6	1115901	1115906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953470
19084	NC_008319	GTGA	2	8	1115907	1115914	25 %	25 %	50 %	0 %	113953470
19085	NC_008319	ATT	2	6	1115948	1115953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113953470
19086	NC_008319	TGC	2	6	1115990	1115995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953470
19087	NC_008319	ACT	2	6	1115996	1116001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953470
19088	NC_008319	GGT	2	6	1116002	1116007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953470
19089	NC_008319	CTG	2	6	1116012	1116017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953470
19090	NC_008319	ATC	2	6	1116071	1116076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953470
19091	NC_008319	TC	4	8	1116110	1116117	0 %	50 %	0 %	50 %	113953470
19092	NC_008319	TCGT	2	8	1116125	1116132	0 %	50 %	25 %	25 %	113953470
19093	NC_008319	CGC	3	9	1116135	1116143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113953470
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19095	NC_008319	CAT	2	6	1116213	1116218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954089
19096	NC_008319	TTCA	2	8	1116225	1116232	25 %	50 %	0 %	25 %	113954089
19097	NC_008319	GCC	2	6	1116240	1116245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113954089
19098	NC_008319	CCT	2	6	1116302	1116307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113954089
19099	NC_008319	TTG	2	6	1116342	1116347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954089
19100	NC_008319	TGGG	2	8	1116375	1116382	0 %	25 %	75 %	0 %	113954089
19101	NC_008319	CTT	2	6	1116470	1116475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954089
19102	NC_008319	ATCC	2	8	1116504	1116511	25 %	25 %	0 %	50 %	113954089
19103	NC_008319	TCC	2	6	1116823	1116828	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113955138
19104	NC_008319	A	7	7	1116849	1116855	100 %	0 %	0 %	0 %	113955138
19105	NC_008319	GAT	2	6	1116861	1116866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955138
19106	NC_008319	GAC	3	9	1116877	1116885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955138
19107	NC_008319	TGG	2	6	1116902	1116907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955138
19108	NC_008319	TTGA	2	8	1116916	1116923	25 %	50 %	25 %	0 %	113955138
19109	NC_008319	AGC	2	6	1116959	1116964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955138
19110	NC_008319	TGA	2	6	1117013	1117018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955138
19111	NC_008319	TGA	2	6	1117026	1117031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955138
19112	NC_008319	ATT	2	6	1117120	1117125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113955138
19113	NC_008319	TGA	2	6	1117143	1117148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955138
19114	NC_008319	TTC	2	6	1117166	1117171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113955138
19115	NC_008319	AGG	2	6	1117248	1117253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113955138
19116	NC_008319	GA	3	6	1117268	1117273	50 %	0 %	50 %	0 %	113955138
19117	NC_008319	TGT	2	6	1117320	1117325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113955138
19118	NC_008319	GTG	2	6	1117334	1117339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955138
19119	NC_008319	AGC	2	6	1117353	1117358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955138
19120	NC_008319	GCA	2	6	1117365	1117370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955138
19121	NC_008319	GCA	2	6	1117442	1117447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955138
19122	NC_008319	CAG	2	6	1117689	1117694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953144
19123	NC_008319	C	8	8	1117775	1117782	0 %	0 %	0 %	100 %	113953144
19124	NC_008319	CAG	2	6	1117855	1117860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953144
19125	NC_008319	CGC	2	6	1117981	1117986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113953144
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19128	NC_008319	GGGC	2	8	1118071	1118078	0 %	0 %	75 %	25 %	113953144
19129	NC_008319	GGC	2	6	1118088	1118093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953144
19130	NC_008319	GTG	2	6	1118191	1118196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953144
19131	NC_008319	GGC	2	6	1118249	1118254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953144
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19136	NC_008319	GCTG	2	8	1118477	1118484	0 %	25 %	50 %	25 %	113953144
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19201	NC_008319	AGA	2	6	1123397	1123402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113953556
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19207	NC_008319	AAC	2	6	1124198	1124203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113954701
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19211	NC_008319	GAT	2	6	1124272	1124277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954701
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19219	NC_008319	GCA	2	6	1125009	1125014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955338
19220	NC_008319	CTT	2	6	1125025	1125030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113955338
19221	NC_008319	AAC	2	6	1125041	1125046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113955338
19222	NC_008319	ATG	2	6	1125137	1125142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955338
19223	NC_008319	CAGG	2	8	1125199	1125206	25 %	0 %	50 %	25 %	113955338
19224	NC_008319	TGG	2	6	1125210	1125215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955338
19225	NC_008319	CT	4	8	1125224	1125231	0 %	50 %	0 %	50 %	113955338
19226	NC_008319	CGCTAA	2	12	1125267	1125278	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	113955338
19227	NC_008319	AAC	2	6	1125295	1125300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113955338
19228	NC_008319	AGC	2	6	1125301	1125306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955338
19229	NC_008319	ACC	2	6	1125331	1125336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113955338
19230	NC_008319	TCA	2	6	1125346	1125351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113955338
19231	NC_008319	GCTG	2	8	1125365	1125372	0 %	25 %	50 %	25 %	113955338
19232	NC_008319	GCC	2	6	1125419	1125424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113955338
19233	NC_008319	AGA	2	6	1125473	1125478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113955338
19234	NC_008319	TTC	2	6	1125484	1125489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113955338
19235	NC_008319	CAG	2	6	1125490	1125495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955338
19236	NC_008319	TCA	2	6	1125638	1125643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113955338
19237	NC_008319	TAC	3	9	1125670	1125678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113955338
19238	NC_008319	CGGG	2	8	1125720	1125727	0 %	0 %	75 %	25 %	113955338
19239	NC_008319	CAG	2	6	1125755	1125760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955338
19240	NC_008319	ACG	2	6	1125776	1125781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955338
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19244	NC_008319	CAT	2	6	1125890	1125895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113955338
19245	NC_008319	ATA	2	6	1125928	1125933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113955338
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19250	NC_008319	GATT	2	8	1126111	1126118	25 %	50 %	25 %	0 %	113955338
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19334	NC_008319	CTG	2	6	1132117	1132122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954263
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19340	NC_008319	GGC	2	6	1132483	1132488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954263
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19342	NC_008319	GCA	2	6	1132766	1132771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954263
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19344	NC_008319	CAAG	2	8	1132785	1132792	50 %	0 %	25 %	25 %	113954263
19345	NC_008319	GCA	2	6	1132794	1132799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954263
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19347	NC_008319	T	7	7	1132848	1132854	0 %	100 %	0 %	0 %	113954263
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19464	NC_008319	GTT	2	6	1143680	1143685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954490
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19496	NC_008319	TTGA	2	8	1145467	1145474	25 %	50 %	25 %	0 %	113954490
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