MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9311

Total Repeats: 44579

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18501	NC_008319	AC	3	6	1084747	1084752	50 %	0 %	0 %	50 %	113953489
18502	NC_008319	ATG	2	6	1084774	1084779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953489
18503	NC_008319	ATT	2	6	1084807	1084812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113953489
18504	NC_008319	CAC	2	6	1084826	1084831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953489
18505	NC_008319	CTGG	2	8	1084833	1084840	0 %	25 %	50 %	25 %	113953489
18506	NC_008319	TGC	2	6	1084847	1084852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953489
18507	NC_008319	GACCTC	2	12	1084966	1084977	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	113955517
18508	NC_008319	TGC	2	6	1085023	1085028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955517
18509	NC_008319	AT	3	6	1085256	1085261	50 %	50 %	0 %	0 %	113955517
18510	NC_008319	TCA	2	6	1085298	1085303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113955517
18511	NC_008319	GAT	2	6	1085342	1085347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955517
18512	NC_008319	GGT	2	6	1085383	1085388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955517
18513	NC_008319	CGT	2	6	1085555	1085560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955517
18514	NC_008319	AC	3	6	1085638	1085643	50 %	0 %	0 %	50 %	113955517
18515	NC_008319	CATC	2	8	1085827	1085834	25 %	25 %	0 %	50 %	113953162
18516	NC_008319	GTA	2	6	1085836	1085841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953162
18517	NC_008319	GTG	2	6	1085845	1085850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953162
18518	NC_008319	GAC	2	6	1085879	1085884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953162
18519	NC_008319	CGA	2	6	1085896	1085901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953162
18520	NC_008319	TGG	2	6	1085945	1085950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953162
18521	NC_008319	TGGATG	2	12	1085967	1085978	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	113953162
18522	NC_008319	GTT	2	6	1086125	1086130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953162
18523	NC_008319	CTT	2	6	1086134	1086139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953162
18524	NC_008319	GTT	2	6	1086227	1086232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953162
18525	NC_008319	TCG	2	6	1086241	1086246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953162
18526	NC_008319	GGA	2	6	1086276	1086281	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113953162
18527	NC_008319	TTG	2	6	1086310	1086315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953162
18528	NC_008319	T	6	6	1086403	1086408	0 %	100 %	0 %	0 %	113953162
18529	NC_008319	GCT	3	9	1086429	1086437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953162
18530	NC_008319	GGT	2	6	1086438	1086443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953162
18531	NC_008319	GTG	2	6	1086453	1086458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953162
18532	NC_008319	GTG	2	6	1086478	1086483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953162
18533	NC_008319	GCT	2	6	1086528	1086533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953162
18534	NC_008319	GAT	2	6	1086572	1086577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953162
18535	NC_008319	ATT	2	6	1086630	1086635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113953162
18536	NC_008319	TC	3	6	1086684	1086689	0 %	50 %	0 %	50 %	113953162
18537	NC_008319	GATTG	2	10	1086726	1086735	20 %	40 %	40 %	0 %	113953162
18538	NC_008319	TTC	2	6	1086753	1086758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953162
18539	NC_008319	ACA	2	6	1086765	1086770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953162
18540	NC_008319	TAC	2	6	1086786	1086791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953162
18541	NC_008319	AT	3	6	1086809	1086814	50 %	50 %	0 %	0 %	113953162
18542	NC_008319	G	6	6	1086887	1086892	0 %	0 %	100 %	0 %	113953162
18543	NC_008319	AGT	2	6	1086971	1086976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953162
18544	NC_008319	TCT	2	6	1087199	1087204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953829
18545	NC_008319	TCGT	2	8	1087225	1087232	0 %	50 %	25 %	25 %	113953829
18546	NC_008319	ATC	2	6	1087342	1087347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953829
18547	NC_008319	TCA	2	6	1087425	1087430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953829
18548	NC_008319	GCAA	2	8	1087434	1087441	50 %	0 %	25 %	25 %	113953829
18549	NC_008319	CATT	2	8	1087479	1087486	25 %	50 %	0 %	25 %	113953211
18550	NC_008319	GCC	2	6	1087530	1087535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113953211
18551	NC_008319	TCA	2	6	1087541	1087546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953211
18552	NC_008319	AAC	2	6	1087590	1087595	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953211
18553	NC_008319	CAATCA	2	12	1087634	1087645	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	113953211
18554	NC_008319	GCTT	2	8	1087663	1087670	0 %	50 %	25 %	25 %	113953211
18555	NC_008319	TGG	2	6	1087715	1087720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953211
18556	NC_008319	GAT	2	6	1087848	1087853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953211
18557	NC_008319	TG	3	6	1087900	1087905	0 %	50 %	50 %	0 %	113953211
18558	NC_008319	AATCG	2	10	1087918	1087927	40 %	20 %	20 %	20 %	113953211
18559	NC_008319	A	6	6	1087946	1087951	100 %	0 %	0 %	0 %	113953211
18560	NC_008319	GCT	2	6	1087953	1087958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953211
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18562	NC_008319	CG	4	8	1087994	1088001	0 %	0 %	50 %	50 %	113953211
18563	NC_008319	TCA	2	6	1088023	1088028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953211
18564	NC_008319	A	6	6	1088075	1088080	100 %	0 %	0 %	0 %	113953211
18565	NC_008319	CGT	2	6	1088082	1088087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953211
18566	NC_008319	CAA	2	6	1088108	1088113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953211
18567	NC_008319	CCA	2	6	1088117	1088122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953211
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18569	NC_008319	CTG	2	6	1088307	1088312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953211
18570	NC_008319	CAG	2	6	1088355	1088360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953211
18571	NC_008319	GCT	2	6	1088409	1088414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953211
18572	NC_008319	GCT	2	6	1088425	1088430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953211
18573	NC_008319	CAA	2	6	1088492	1088497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953211
18574	NC_008319	TCT	2	6	1088539	1088544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953211
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18577	NC_008319	ATC	2	6	1088665	1088670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953211
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18582	NC_008319	GAC	2	6	1088875	1088880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953211
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18584	NC_008319	AG	3	6	1088974	1088979	50 %	0 %	50 %	0 %	113953211
18585	NC_008319	AG	3	6	1089137	1089142	50 %	0 %	50 %	0 %	113953211
18586	NC_008319	GCC	2	6	1089158	1089163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113953211
18587	NC_008319	GCA	2	6	1089173	1089178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953211
18588	NC_008319	GACT	2	8	1089247	1089254	25 %	25 %	25 %	25 %	113954627
18589	NC_008319	ATGG	2	8	1089287	1089294	25 %	25 %	50 %	0 %	113954627
18590	NC_008319	G	6	6	1089335	1089340	0 %	0 %	100 %	0 %	113954627
18591	NC_008319	GTC	2	6	1089379	1089384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954627
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18593	NC_008319	TGG	3	9	1089610	1089618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955302
18594	NC_008319	GCTGA	2	10	1089648	1089657	20 %	20 %	40 %	20 %	113955302
18595	NC_008319	CCAG	2	8	1089682	1089689	25 %	0 %	25 %	50 %	113955302
18596	NC_008319	GGGA	2	8	1089700	1089707	25 %	0 %	75 %	0 %	113955302
18597	NC_008319	TGA	2	6	1089812	1089817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955302
18598	NC_008319	ATCA	2	8	1089822	1089829	50 %	25 %	0 %	25 %	113955302
18599	NC_008319	TTGT	2	8	1089868	1089875	0 %	75 %	25 %	0 %	113955302
18600	NC_008319	CGA	2	6	1089887	1089892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955302
18601	NC_008319	GCAGC	2	10	1089893	1089902	20 %	0 %	40 %	40 %	113955302
18602	NC_008319	CGT	2	6	1089927	1089932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955302
18603	NC_008319	GTTG	2	8	1089971	1089978	0 %	50 %	50 %	0 %	113955302
18604	NC_008319	GATT	2	8	1090051	1090058	25 %	50 %	25 %	0 %	113955302
18605	NC_008319	GGC	2	6	1090167	1090172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113955302
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18607	NC_008319	GCGTC	2	10	1090350	1090359	0 %	20 %	40 %	40 %	113953357
18608	NC_008319	GAA	2	6	1090434	1090439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113953357
18609	NC_008319	TGC	2	6	1090520	1090525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953357
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18612	NC_008319	ACG	2	6	1091005	1091010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953357
18613	NC_008319	GCA	2	6	1091089	1091094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954812
18614	NC_008319	CCAAGC	2	12	1091103	1091114	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	113954812
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