MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9311

Total Repeats: 44579

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18002	NC_008319	GTT	2	6	1054468	1054473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953447
18003	NC_008319	GTG	2	6	1054612	1054617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953447
18004	NC_008319	TGT	2	6	1054638	1054643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953447
18005	NC_008319	ATT	2	6	1054661	1054666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113953447
18006	NC_008319	CCTG	2	8	1054765	1054772	0 %	25 %	25 %	50 %	113953447
18007	NC_008319	TCA	2	6	1054785	1054790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953447
18008	NC_008319	GCT	2	6	1054821	1054826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953447
18009	NC_008319	GTG	2	6	1054866	1054871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953447
18010	NC_008319	GTT	2	6	1054909	1054914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953447
18011	NC_008319	GCA	2	6	1054998	1055003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953447
18012	NC_008319	GGC	2	6	1055113	1055118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953447
18013	NC_008319	CCT	2	6	1055157	1055162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113952889
18014	NC_008319	CTT	2	6	1055172	1055177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113952889
18015	NC_008319	TGT	2	6	1055259	1055264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113952889
18016	NC_008319	TCG	2	6	1055315	1055320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952889
18017	NC_008319	GCA	2	6	1055388	1055393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952889
18018	NC_008319	GTT	2	6	1055394	1055399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113952889
18019	NC_008319	CA	3	6	1055500	1055505	50 %	0 %	0 %	50 %	113952889
18020	NC_008319	ATCG	2	8	1055778	1055785	25 %	25 %	25 %	25 %	113952889
18021	NC_008319	GTTG	2	8	1055793	1055800	0 %	50 %	50 %	0 %	113952889
18022	NC_008319	TTC	2	6	1055806	1055811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113952889
18023	NC_008319	GGAC	2	8	1055826	1055833	25 %	0 %	50 %	25 %	113952889
18024	NC_008319	GAC	2	6	1055845	1055850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952889
18025	NC_008319	GCA	2	6	1055928	1055933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952889
18026	NC_008319	CAC	2	6	1055947	1055952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113952889
18027	NC_008319	CATGGT	2	12	1056063	1056074	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	113952889
18028	NC_008319	ATGGA	2	10	1056099	1056108	40 %	20 %	40 %	0 %	113952889
18029	NC_008319	CCA	2	6	1056177	1056182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113952889
18030	NC_008319	CAG	2	6	1056312	1056317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952889
18031	NC_008319	TGC	2	6	1056364	1056369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953672
18032	NC_008319	CAG	2	6	1056411	1056416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953672
18033	NC_008319	GCG	2	6	1056590	1056595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953672
18034	NC_008319	TTGC	2	8	1056674	1056681	0 %	50 %	25 %	25 %	113953672
18035	NC_008319	CAA	2	6	1056698	1056703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953672
18036	NC_008319	GAC	2	6	1056735	1056740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953672
18037	NC_008319	CCA	2	6	1056840	1056845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953672
18038	NC_008319	GTGAT	2	10	1056849	1056858	20 %	40 %	40 %	0 %	113953672
18039	NC_008319	TCA	2	6	1056915	1056920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953672
18040	NC_008319	TC	3	6	1057040	1057045	0 %	50 %	0 %	50 %	113953672
18041	NC_008319	GCT	2	6	1057112	1057117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953672
18042	NC_008319	CAA	2	6	1057168	1057173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953672
18043	NC_008319	CG	3	6	1057199	1057204	0 %	0 %	50 %	50 %	113953672
18044	NC_008319	GATT	2	8	1057209	1057216	25 %	50 %	25 %	0 %	113953672
18045	NC_008319	TTGC	2	8	1057264	1057271	0 %	50 %	25 %	25 %	113953672
18046	NC_008319	TGC	2	6	1057277	1057282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953672
18047	NC_008319	GGAGA	2	10	1057292	1057301	40 %	0 %	60 %	0 %	113953672
18048	NC_008319	TCCT	2	8	1057379	1057386	0 %	50 %	0 %	50 %	113953672
18049	NC_008319	ATCG	2	8	1057549	1057556	25 %	25 %	25 %	25 %	113953672
18050	NC_008319	TCCT	2	8	1057654	1057661	0 %	50 %	0 %	50 %	113955103
18051	NC_008319	GTTT	2	8	1057703	1057710	0 %	75 %	25 %	0 %	113955103
18052	NC_008319	AGG	2	6	1057718	1057723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113955103
18053	NC_008319	CCT	2	6	1057724	1057729	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113955103
18054	NC_008319	CGGC	2	8	1057749	1057756	0 %	0 %	50 %	50 %	113955103
18055	NC_008319	TGCT	2	8	1057774	1057781	0 %	50 %	25 %	25 %	113955103
18056	NC_008319	CTTGC	2	10	1057782	1057791	0 %	40 %	20 %	40 %	113955103
18057	NC_008319	GCGT	2	8	1057806	1057813	0 %	25 %	50 %	25 %	113955103
18058	NC_008319	GCA	2	6	1057889	1057894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955103
18059	NC_008319	TGG	2	6	1058058	1058063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955103
18060	NC_008319	GAG	2	6	1058070	1058075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113955103
18061	NC_008319	GGA	2	6	1058105	1058110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113955103
18062	NC_008319	CT	3	6	1058137	1058142	0 %	50 %	0 %	50 %	113955103
18063	NC_008319	TGA	3	9	1058216	1058224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953025
18064	NC_008319	CGC	2	6	1058233	1058238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113953025
18065	NC_008319	TC	3	6	1058246	1058251	0 %	50 %	0 %	50 %	113953025
18066	NC_008319	CCTGG	2	10	1058271	1058280	0 %	20 %	40 %	40 %	113953025
18067	NC_008319	TTG	3	9	1058455	1058463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953025
18068	NC_008319	CT	3	6	1058517	1058522	0 %	50 %	0 %	50 %	113953025
18069	NC_008319	CAG	3	9	1058530	1058538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953025
18070	NC_008319	ATCGC	2	10	1058556	1058565	20 %	20 %	20 %	40 %	113953025
18071	NC_008319	CCTG	2	8	1058689	1058696	0 %	25 %	25 %	50 %	113953025
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18075	NC_008319	TGGA	2	8	1058878	1058885	25 %	25 %	50 %	0 %	113953025
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18082	NC_008319	TTG	2	6	1059169	1059174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953025
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18084	NC_008319	GATG	2	8	1059529	1059536	25 %	25 %	50 %	0 %	113953834
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18088	NC_008319	GGA	2	6	1059682	1059687	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113953834
18089	NC_008319	AGC	2	6	1059691	1059696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953834
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18099	NC_008319	TGCA	2	8	1060292	1060299	25 %	25 %	25 %	25 %	113954658
18100	NC_008319	CGG	2	6	1060336	1060341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954658
18101	NC_008319	CGA	2	6	1060405	1060410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954658
18102	NC_008319	TGA	2	6	1060435	1060440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954658
18103	NC_008319	AC	3	6	1060554	1060559	50 %	0 %	0 %	50 %	113954658
18104	NC_008319	TGG	3	9	1060608	1060616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954658
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18106	NC_008319	TGG	2	6	1060657	1060662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954658
18107	NC_008319	GCT	2	6	1060730	1060735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954658
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18111	NC_008319	CAG	2	6	1061207	1061212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954658
18112	NC_008319	CAT	2	6	1061669	1061674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113952771
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18114	NC_008319	TTC	2	6	1061728	1061733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113952771
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18466	NC_008319	CCA	2	6	1082662	1082667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953489
18467	NC_008319	GTT	2	6	1082779	1082784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953489
18468	NC_008319	G	9	9	1082839	1082847	0 %	0 %	100 %	0 %	113953489
18469	NC_008319	ACCG	2	8	1082848	1082855	25 %	0 %	25 %	50 %	113953489
18470	NC_008319	TGT	2	6	1082938	1082943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953489
18471	NC_008319	TGA	2	6	1083065	1083070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953489
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18480	NC_008319	AGT	2	6	1083492	1083497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953489
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18486	NC_008319	AGG	2	6	1083845	1083850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113953489
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18489	NC_008319	ATC	2	6	1083925	1083930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953489
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18491	NC_008319	TGG	2	6	1084013	1084018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953489
18492	NC_008319	TTGC	2	8	1084070	1084077	0 %	50 %	25 %	25 %	113953489
18493	NC_008319	TCG	2	6	1084115	1084120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953489
18494	NC_008319	GATT	2	8	1084159	1084166	25 %	50 %	25 %	0 %	113953489
18495	NC_008319	GGTT	2	8	1084331	1084338	0 %	50 %	50 %	0 %	113953489
18496	NC_008319	CCT	2	6	1084356	1084361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113953489
18497	NC_008319	GAAG	2	8	1084373	1084380	50 %	0 %	50 %	0 %	113953489
18498	NC_008319	TCTT	2	8	1084537	1084544	0 %	75 %	0 %	25 %	113953489
18499	NC_008319	GC	3	6	1084584	1084589	0 %	0 %	50 %	50 %	113953489
18500	NC_008319	TGG	2	6	1084724	1084729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953489

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