MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9311

Total Repeats: 44579

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17501	NC_008319	AGA	2	6	1021130	1021135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113954984
17502	NC_008319	TTGT	2	8	1021167	1021174	0 %	75 %	25 %	0 %	113954984
17503	NC_008319	GGC	2	6	1023386	1023391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954539
17504	NC_008319	CTT	2	6	1023393	1023398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954539
17505	NC_008319	AGC	2	6	1023441	1023446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954539
17506	NC_008319	GAA	2	6	1023457	1023462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113954539
17507	NC_008319	GA	3	6	1023478	1023483	50 %	0 %	50 %	0 %	113954539
17508	NC_008319	GCA	2	6	1023488	1023493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954539
17509	NC_008319	TTTG	2	8	1024131	1024138	0 %	75 %	25 %	0 %	113953262
17510	NC_008319	CTG	2	6	1024232	1024237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953262
17511	NC_008319	CAG	2	6	1024242	1024247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953262
17512	NC_008319	CT	3	6	1024267	1024272	0 %	50 %	0 %	50 %	113953262
17513	NC_008319	TC	4	8	1024308	1024315	0 %	50 %	0 %	50 %	113953262
17514	NC_008319	CAAC	2	8	1024321	1024328	50 %	0 %	0 %	50 %	113953262
17515	NC_008319	CAC	2	6	1024357	1024362	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953262
17516	NC_008319	TGC	2	6	1024612	1024617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954144
17517	NC_008319	CCAGA	2	10	1024735	1024744	40 %	0 %	20 %	40 %	113954144
17518	NC_008319	GAC	2	6	1024892	1024897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954144
17519	NC_008319	C	6	6	1024905	1024910	0 %	0 %	0 %	100 %	113954144
17520	NC_008319	CAT	2	6	1024951	1024956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954144
17521	NC_008319	CCA	2	6	1024965	1024970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954144
17522	NC_008319	GA	3	6	1024998	1025003	50 %	0 %	50 %	0 %	113954144
17523	NC_008319	GTC	2	6	1025060	1025065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954144
17524	NC_008319	AGT	2	6	1025110	1025115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954144
17525	NC_008319	CCA	2	6	1025127	1025132	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954144
17526	NC_008319	CAT	2	6	1025167	1025172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954144
17527	NC_008319	GTC	2	6	1025222	1025227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954144
17528	NC_008319	GGT	2	6	1025356	1025361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954144
17529	NC_008319	CTG	2	6	1025383	1025388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954144
17530	NC_008319	TAA	2	6	1025403	1025408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113954144
17531	NC_008319	GT	3	6	1025434	1025439	0 %	50 %	50 %	0 %	113954144
17532	NC_008319	GAAG	2	8	1025457	1025464	50 %	0 %	50 %	0 %	113954144
17533	NC_008319	A	6	6	1025489	1025494	100 %	0 %	0 %	0 %	113954144
17534	NC_008319	TCG	2	6	1025583	1025588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954144
17535	NC_008319	TCC	2	6	1025601	1025606	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113954144
17536	NC_008319	GT	3	6	1025644	1025649	0 %	50 %	50 %	0 %	113954144
17537	NC_008319	ACA	2	6	1025697	1025702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113954144
17538	NC_008319	TGG	2	6	1025743	1025748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954144
17539	NC_008319	AGC	2	6	1025901	1025906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953545
17540	NC_008319	TCT	2	6	1025919	1025924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953545
17541	NC_008319	TGT	2	6	1025969	1025974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953545
17542	NC_008319	GTA	2	6	1026007	1026012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953545
17543	NC_008319	GAAC	2	8	1026021	1026028	50 %	0 %	25 %	25 %	113953545
17544	NC_008319	TGT	2	6	1026035	1026040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953545
17545	NC_008319	CCAG	2	8	1026090	1026097	25 %	0 %	25 %	50 %	113953545
17546	NC_008319	CACT	2	8	1026192	1026199	25 %	25 %	0 %	50 %	113953545
17547	NC_008319	A	7	7	1026221	1026227	100 %	0 %	0 %	0 %	113953545
17548	NC_008319	CTT	2	6	1026242	1026247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953545
17549	NC_008319	G	6	6	1026249	1026254	0 %	0 %	100 %	0 %	113953545
17550	NC_008319	GAG	2	6	1026258	1026263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113953545
17551	NC_008319	CAAT	2	8	1026315	1026322	50 %	25 %	0 %	25 %	113953545
17552	NC_008319	GCA	2	6	1026924	1026929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954747
17553	NC_008319	GAC	2	6	1027012	1027017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954747
17554	NC_008319	TGG	2	6	1027022	1027027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954747
17555	NC_008319	GAT	2	6	1027041	1027046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954747
17556	NC_008319	TC	3	6	1027085	1027090	0 %	50 %	0 %	50 %	113954747
17557	NC_008319	GTA	2	6	1027151	1027156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954747
17558	NC_008319	TGG	2	6	1027209	1027214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954747
17559	NC_008319	GAC	2	6	1027458	1027463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955170
17560	NC_008319	TGC	2	6	1027476	1027481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955170
17561	NC_008319	TCA	2	6	1027486	1027491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113955170
17562	NC_008319	CTG	2	6	1027551	1027556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955170
17563	NC_008319	ATT	2	6	1027652	1027657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113955170
17564	NC_008319	TTTGT	2	10	1027673	1027682	0 %	80 %	20 %	0 %	113955170
17565	NC_008319	ATT	2	6	1027778	1027783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113955170
17566	NC_008319	GAT	2	6	1027949	1027954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955170
17567	NC_008319	AAG	2	6	1028002	1028007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113955170
17568	NC_008319	TGA	2	6	1028038	1028043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955170
17569	NC_008319	ATC	2	6	1028088	1028093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113955170
17570	NC_008319	GTC	2	6	1028106	1028111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955170
17571	NC_008319	GGA	3	9	1028282	1028290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113955170
17572	NC_008319	GGA	2	6	1028330	1028335	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113955170
17573	NC_008319	GTT	2	6	1028343	1028348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113955170
17574	NC_008319	TTG	2	6	1028388	1028393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113955170
17575	NC_008319	AGT	2	6	1028474	1028479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113952734
17576	NC_008319	CGCT	2	8	1028591	1028598	0 %	25 %	25 %	50 %	113952734
17577	NC_008319	CAT	2	6	1028635	1028640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113952734
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17579	NC_008319	TACA	2	8	1028706	1028713	50 %	25 %	0 %	25 %	113952734
17580	NC_008319	AATT	2	8	1028734	1028741	50 %	50 %	0 %	0 %	113952734
17581	NC_008319	AATT	2	8	1028749	1028756	50 %	50 %	0 %	0 %	113952734
17582	NC_008319	ATC	3	9	1028770	1028778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113952734
17583	NC_008319	TGA	2	6	1029023	1029028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954222
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17585	NC_008319	AAG	2	6	1029206	1029211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113954222
17586	NC_008319	GTT	2	6	1029283	1029288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954222
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17588	NC_008319	CTG	2	6	1029377	1029382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954222
17589	NC_008319	TGCC	2	8	1029431	1029438	0 %	25 %	25 %	50 %	113954222
17590	NC_008319	GAA	2	6	1029463	1029468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113954222
17591	NC_008319	AGCT	2	8	1029506	1029513	25 %	25 %	25 %	25 %	113954222
17592	NC_008319	TGC	2	6	1029530	1029535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954222
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17596	NC_008319	CCAGCT	2	12	1029702	1029713	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	113955100
17597	NC_008319	GAT	2	6	1029714	1029719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955100
17598	NC_008319	GTT	2	6	1029800	1029805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953825
17599	NC_008319	TCA	2	6	1029910	1029915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953825
17600	NC_008319	GCA	2	6	1029942	1029947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953825
17601	NC_008319	CAG	2	6	1029964	1029969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953825
17602	NC_008319	GCA	2	6	1029977	1029982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953825
17603	NC_008319	TTG	2	6	1029986	1029991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953825
17604	NC_008319	GAA	2	6	1029995	1030000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113953825
17605	NC_008319	CGG	2	6	1030057	1030062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953825
17606	NC_008319	GCA	2	6	1030094	1030099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953825
17607	NC_008319	CGA	2	6	1030114	1030119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953825
17608	NC_008319	TCG	2	6	1030138	1030143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953825
17609	NC_008319	AGA	2	6	1030144	1030149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113953825
17610	NC_008319	CGA	2	6	1030222	1030227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953825
17611	NC_008319	TTC	2	6	1030262	1030267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953825
17612	NC_008319	T	6	6	1030459	1030464	0 %	100 %	0 %	0 %	113953825
17613	NC_008319	GCT	2	6	1030470	1030475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953825
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17615	NC_008319	CGC	2	6	1030586	1030591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113953825
17616	NC_008319	GGC	2	6	1030641	1030646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953825
17617	NC_008319	G	6	6	1030683	1030688	0 %	0 %	100 %	0 %	113953825
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17642	NC_008319	TGC	2	6	1031972	1031977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953321
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17724	NC_008319	CTT	2	6	1037617	1037622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113952748
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