MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9311

Total Repeats: 44579

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17001	NC_008319	GCCC	2	8	980641	980648	0 %	0 %	25 %	75 %	113954758
17002	NC_008319	TGG	2	6	980656	980661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954758
17003	NC_008319	ATTG	2	8	980664	980671	25 %	50 %	25 %	0 %	113954758
17004	NC_008319	AT	3	6	981261	981266	50 %	50 %	0 %	0 %	113954913
17005	NC_008319	GCA	2	6	981270	981275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954913
17006	NC_008319	CAC	2	6	981308	981313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954913
17007	NC_008319	GTC	2	6	981337	981342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954913
17008	NC_008319	GCA	3	9	981385	981393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954913
17009	NC_008319	GCTG	2	8	981426	981433	0 %	25 %	50 %	25 %	113954913
17010	NC_008319	GGCA	2	8	981437	981444	25 %	0 %	50 %	25 %	113954913
17011	NC_008319	GGATG	2	10	981446	981455	20 %	20 %	60 %	0 %	113954913
17012	NC_008319	CAACA	2	10	981480	981489	60 %	0 %	0 %	40 %	113954913
17013	NC_008319	ATT	2	6	981687	981692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113953708
17014	NC_008319	AGGC	2	8	981857	981864	25 %	0 %	50 %	25 %	113954205
17015	NC_008319	TGG	2	6	981922	981927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954205
17016	NC_008319	AGC	2	6	981928	981933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954205
17017	NC_008319	GCG	2	6	981984	981989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954205
17018	NC_008319	AGCAAG	2	12	982048	982059	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	113954205
17019	NC_008319	GCA	2	6	982065	982070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954205
17020	NC_008319	AGA	2	6	982154	982159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113954205
17021	NC_008319	TTC	2	6	982207	982212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954205
17022	NC_008319	AAC	2	6	982250	982255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113954205
17023	NC_008319	TCTT	2	8	982258	982265	0 %	75 %	0 %	25 %	113954205
17024	NC_008319	GAT	2	6	982278	982283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954205
17025	NC_008319	GGC	2	6	982304	982309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954205
17026	NC_008319	CTAT	2	8	982310	982317	25 %	50 %	0 %	25 %	113954205
17027	NC_008319	AAT	2	6	982338	982343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113954205
17028	NC_008319	TGC	2	6	982349	982354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954205
17029	NC_008319	ATG	2	6	982356	982361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954205
17030	NC_008319	GAA	3	9	982383	982391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113954205
17031	NC_008319	TAC	2	6	984791	984796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113955030
17032	NC_008319	ATT	2	6	984815	984820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113955030
17033	NC_008319	TGT	2	6	984846	984851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113955030
17034	NC_008319	GAA	2	6	984853	984858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113955030
17035	NC_008319	CTTG	2	8	985140	985147	0 %	50 %	25 %	25 %	113955030
17036	NC_008319	A	6	6	985150	985155	100 %	0 %	0 %	0 %	113955030
17037	NC_008319	TGC	2	6	985218	985223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955030
17038	NC_008319	ATT	2	6	985317	985322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113955030
17039	NC_008319	CTGA	2	8	985373	985380	25 %	25 %	25 %	25 %	113955030
17040	NC_008319	TCA	2	6	985394	985399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953197
17041	NC_008319	CAG	2	6	985414	985419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953197
17042	NC_008319	GAATA	2	10	985556	985565	60 %	20 %	20 %	0 %	113953197
17043	NC_008319	GAT	2	6	985623	985628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953197
17044	NC_008319	ATG	2	6	985675	985680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953197
17045	NC_008319	AAT	2	6	985881	985886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113953197
17046	NC_008319	AAC	2	6	985935	985940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953197
17047	NC_008319	TGT	2	6	986014	986019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953197
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17050	NC_008319	TCA	2	6	986136	986141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953197
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17052	NC_008319	CAAT	2	8	986211	986218	50 %	25 %	0 %	25 %	113953197
17053	NC_008319	GGT	2	6	986226	986231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953197
17054	NC_008319	AATG	2	8	986253	986260	50 %	25 %	25 %	0 %	113953197
17055	NC_008319	AG	3	6	986283	986288	50 %	0 %	50 %	0 %	113953197
17056	NC_008319	GTT	3	9	986292	986300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953197
17057	NC_008319	ATG	2	6	986428	986433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953197
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17060	NC_008319	ATTA	2	8	986564	986571	50 %	50 %	0 %	0 %	113953197
17061	NC_008319	GAA	2	6	986616	986621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113953197
17062	NC_008319	TCA	2	6	986784	986789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953197
17063	NC_008319	ATT	2	6	987546	987551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113953783
17064	NC_008319	TCAG	2	8	987574	987581	25 %	25 %	25 %	25 %	113953783
17065	NC_008319	TTC	2	6	988109	988114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954857
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17067	NC_008319	CGC	2	6	988193	988198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113954857
17068	NC_008319	TCGAT	2	10	989086	989095	20 %	40 %	20 %	20 %	113953405
17069	NC_008319	GAA	2	6	989167	989172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113953405
17070	NC_008319	TTC	2	6	989218	989223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953405
17071	NC_008319	ATT	2	6	989231	989236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113953405
17072	NC_008319	AGG	2	6	989287	989292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113953405
17073	NC_008319	TC	4	8	989329	989336	0 %	50 %	0 %	50 %	113953405
17074	NC_008319	CCT	2	6	989383	989388	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113953405
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17079	NC_008319	TTCTT	2	10	989698	989707	0 %	80 %	0 %	20 %	113953405
17080	NC_008319	AGT	2	6	989811	989816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953405
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17082	NC_008319	GATTT	2	10	989866	989875	20 %	60 %	20 %	0 %	113953405
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17084	NC_008319	CGT	2	6	990181	990186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954923
17085	NC_008319	TGCC	2	8	990230	990237	0 %	25 %	25 %	50 %	113954923
17086	NC_008319	AGA	2	6	990246	990251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113954454
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17088	NC_008319	CAA	2	6	990308	990313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113954454
17089	NC_008319	AAC	2	6	990332	990337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113954454
17090	NC_008319	ACCAA	2	10	990338	990347	60 %	0 %	0 %	40 %	113954454
17091	NC_008319	GTT	2	6	990362	990367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953601
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17093	NC_008319	CAT	2	6	990441	990446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953601
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17099	NC_008319	TCG	2	6	990847	990852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953915
17100	NC_008319	GCGACA	2	12	990855	990866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953915
17101	NC_008319	GCTG	2	8	990886	990893	0 %	25 %	50 %	25 %	113953915
17102	NC_008319	GTG	2	6	991184	991189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955246
17103	NC_008319	CAG	2	6	991205	991210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955246
17104	NC_008319	GGA	2	6	991226	991231	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113955246
17105	NC_008319	CAG	2	6	991242	991247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955246
17106	NC_008319	TGG	2	6	991302	991307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955246
17107	NC_008319	GATTG	2	10	991320	991329	20 %	40 %	40 %	0 %	113955246
17108	NC_008319	CAA	2	6	991400	991405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113955246
17109	NC_008319	TGG	2	6	991447	991452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955246
17110	NC_008319	A	6	6	991514	991519	100 %	0 %	0 %	0 %	113955246
17111	NC_008319	TCA	2	6	991549	991554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113955246
17112	NC_008319	TGG	2	6	991584	991589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955246
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17117	NC_008319	GAC	2	6	991799	991804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955246
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17353	NC_008319	TCA	2	6	1010859	1010864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954493
17354	NC_008319	TCT	2	6	1010871	1010876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954493
17355	NC_008319	CTC	2	6	1010990	1010995	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113954493
17356	NC_008319	TCT	2	6	1011043	1011048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954493
17357	NC_008319	TAT	2	6	1011115	1011120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113954493
17358	NC_008319	GTG	2	6	1011142	1011147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954493
17359	NC_008319	GATA	2	8	1011148	1011155	50 %	25 %	25 %	0 %	113954493
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17365	NC_008319	GCT	2	6	1011326	1011331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953290
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17372	NC_008319	CATCT	2	10	1012655	1012664	20 %	40 %	0 %	40 %	113954141
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17377	NC_008319	CTG	2	6	1012987	1012992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954141
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17388	NC_008319	TCACCA	2	12	1013451	1013462	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	113954826
17389	NC_008319	ATGAA	2	10	1013473	1013482	60 %	20 %	20 %	0 %	113954826
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17405	NC_008319	TC	3	6	1014274	1014279	0 %	50 %	0 %	50 %	113955133
17406	NC_008319	GATGA	2	10	1014400	1014409	40 %	20 %	40 %	0 %	113955133
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17458	NC_008319	CAA	2	6	1018301	1018306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113952746
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17460	NC_008319	CTT	2	6	1018356	1018361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113952746
17461	NC_008319	GC	3	6	1018367	1018372	0 %	0 %	50 %	50 %	113952746
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17467	NC_008319	TCGG	2	8	1018618	1018625	0 %	25 %	50 %	25 %	113952746
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