MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9311

Total Repeats: 44579

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_008319	GGA	2	6	888194	888199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113955524
15502	NC_008319	GA	3	6	888198	888203	50 %	0 %	50 %	0 %	113955524
15503	NC_008319	CTC	2	6	888205	888210	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113955524
15504	NC_008319	TGT	2	6	888255	888260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113952914
15505	NC_008319	TG	3	6	888394	888399	0 %	50 %	50 %	0 %	113952914
15506	NC_008319	TTC	2	6	888672	888677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953532
15507	NC_008319	CT	3	6	888784	888789	0 %	50 %	0 %	50 %	113953532
15508	NC_008319	GGCA	2	8	888799	888806	25 %	0 %	50 %	25 %	113953532
15509	NC_008319	TGG	2	6	888816	888821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953532
15510	NC_008319	CGGA	2	8	888862	888869	25 %	0 %	50 %	25 %	113953532
15511	NC_008319	AAC	2	6	888890	888895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953532
15512	NC_008319	GCA	2	6	888955	888960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953532
15513	NC_008319	CT	3	6	888975	888980	0 %	50 %	0 %	50 %	113953532
15514	NC_008319	ATC	2	6	888987	888992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953532
15515	NC_008319	TGAAG	2	10	889120	889129	40 %	20 %	40 %	0 %	113953532
15516	NC_008319	GTT	2	6	889132	889137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953532
15517	NC_008319	CTG	2	6	889185	889190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953532
15518	NC_008319	GATG	2	8	889205	889212	25 %	25 %	50 %	0 %	113953532
15519	NC_008319	GACG	2	8	889284	889291	25 %	0 %	50 %	25 %	113953657
15520	NC_008319	GATG	2	8	889304	889311	25 %	25 %	50 %	0 %	113953657
15521	NC_008319	CAG	2	6	889336	889341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953657
15522	NC_008319	CT	3	6	889393	889398	0 %	50 %	0 %	50 %	113953657
15523	NC_008319	CGC	2	6	889427	889432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113953657
15524	NC_008319	TGA	2	6	889572	889577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953203
15525	NC_008319	TTG	2	6	889626	889631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953203
15526	NC_008319	GCC	2	6	889655	889660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113953203
15527	NC_008319	CTG	2	6	889719	889724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953203
15528	NC_008319	CTTG	2	8	889822	889829	0 %	50 %	25 %	25 %	113953203
15529	NC_008319	GGGGA	2	10	889836	889845	20 %	0 %	80 %	0 %	113953203
15530	NC_008319	CTT	2	6	889904	889909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953203
15531	NC_008319	GTG	2	6	889935	889940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953203
15532	NC_008319	T	6	6	890026	890031	0 %	100 %	0 %	0 %	113953912
15533	NC_008319	TGC	2	6	890169	890174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953912
15534	NC_008319	GTT	2	6	890215	890220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953912
15535	NC_008319	CCCA	2	8	890319	890326	25 %	0 %	0 %	75 %	113953912
15536	NC_008319	GCTC	2	8	890413	890420	0 %	25 %	25 %	50 %	113953912
15537	NC_008319	CAT	2	6	890476	890481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953912
15538	NC_008319	CGATC	2	10	890485	890494	20 %	20 %	20 %	40 %	113953912
15539	NC_008319	CAT	2	6	890499	890504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953912
15540	NC_008319	CTGGG	2	10	890505	890514	0 %	20 %	60 %	20 %	113953912
15541	NC_008319	TCT	2	6	890597	890602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953912
15542	NC_008319	GGGAT	2	10	890650	890659	20 %	20 %	60 %	0 %	113954012
15543	NC_008319	GCAT	2	8	890704	890711	25 %	25 %	25 %	25 %	113954012
15544	NC_008319	GC	3	6	890769	890774	0 %	0 %	50 %	50 %	113954012
15545	NC_008319	TCGCTG	2	12	890806	890817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954012
15546	NC_008319	G	7	7	890823	890829	0 %	0 %	100 %	0 %	113954012
15547	NC_008319	CAGC	2	8	890858	890865	25 %	0 %	25 %	50 %	113954012
15548	NC_008319	TTTC	2	8	890879	890886	0 %	75 %	0 %	25 %	113954012
15549	NC_008319	GCTTG	2	10	890945	890954	0 %	40 %	40 %	20 %	113954012
15550	NC_008319	A	6	6	890962	890967	100 %	0 %	0 %	0 %	113954012
15551	NC_008319	GT	3	6	891106	891111	0 %	50 %	50 %	0 %	113954012
15552	NC_008319	ATC	2	6	891253	891258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954012
15553	NC_008319	CGA	2	6	891288	891293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954012
15554	NC_008319	GCA	2	6	891302	891307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954012
15555	NC_008319	CAG	2	6	891372	891377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954012
15556	NC_008319	CAG	2	6	891384	891389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954012
15557	NC_008319	CAT	2	6	891399	891404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954012
15558	NC_008319	CAG	2	6	891417	891422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954012
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15560	NC_008319	GCA	2	6	891533	891538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954012
15561	NC_008319	GCG	2	6	891592	891597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954012
15562	NC_008319	CGC	2	6	891600	891605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113954012
15563	NC_008319	CAG	2	6	891621	891626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954012
15564	NC_008319	CACT	2	8	891644	891651	25 %	25 %	0 %	50 %	113954012
15565	NC_008319	CCAGG	2	10	891684	891693	20 %	0 %	40 %	40 %	113954012
15566	NC_008319	TGG	2	6	891698	891703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954012
15567	NC_008319	GTGG	2	8	891730	891737	0 %	25 %	75 %	0 %	113954012
15568	NC_008319	TGA	2	6	891794	891799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954012
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15574	NC_008319	CGT	2	6	891962	891967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954012
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15580	NC_008319	CTGG	2	8	892147	892154	0 %	25 %	50 %	25 %	113954012
15581	NC_008319	TGA	2	6	892188	892193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954012
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15591	NC_008319	GCA	2	6	892655	892660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954012
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15593	NC_008319	AGA	2	6	892711	892716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113954012
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15601	NC_008319	TGGA	2	8	893073	893080	25 %	25 %	50 %	0 %	113953591
15602	NC_008319	GCTGCC	2	12	893092	893103	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	113953591
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