MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9311

Total Repeats: 44579

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_008319	CTT	2	6	862085	862090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113955200
15002	NC_008319	CAC	2	6	862094	862099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113955200
15003	NC_008319	T	6	6	862122	862127	0 %	100 %	0 %	0 %	113955200
15004	NC_008319	CAG	2	6	862194	862199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955200
15005	NC_008319	CCG	3	9	862267	862275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113955200
15006	NC_008319	GAG	2	6	862296	862301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113955200
15007	NC_008319	TCTT	2	8	862342	862349	0 %	75 %	0 %	25 %	113955200
15008	NC_008319	GCG	2	6	862703	862708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954737
15009	NC_008319	CTC	2	6	862779	862784	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113954737
15010	NC_008319	TGT	2	6	862817	862822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954737
15011	NC_008319	TGG	2	6	862828	862833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954737
15012	NC_008319	TC	3	6	862891	862896	0 %	50 %	0 %	50 %	113954737
15013	NC_008319	AGGC	2	8	862954	862961	25 %	0 %	50 %	25 %	113954737
15014	NC_008319	TTG	2	6	863076	863081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953214
15015	NC_008319	CAG	2	6	863135	863140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953214
15016	NC_008319	ATCA	2	8	863145	863152	50 %	25 %	0 %	25 %	113953214
15017	NC_008319	GTT	2	6	863212	863217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953214
15018	NC_008319	GTC	2	6	863221	863226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953214
15019	NC_008319	AGC	2	6	863227	863232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953214
15020	NC_008319	GCT	3	9	863246	863254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953214
15021	NC_008319	ATT	2	6	863257	863262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113953214
15022	NC_008319	GTT	2	6	863711	863716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953698
15023	NC_008319	TTTC	2	8	863732	863739	0 %	75 %	0 %	25 %	113953698
15024	NC_008319	CAA	2	6	863795	863800	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953698
15025	NC_008319	G	6	6	863868	863873	0 %	0 %	100 %	0 %	113953938
15026	NC_008319	TGG	2	6	863898	863903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953938
15027	NC_008319	GTG	2	6	863956	863961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953938
15028	NC_008319	CTG	2	6	863972	863977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953938
15029	NC_008319	GAT	2	6	864004	864009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953938
15030	NC_008319	TAATC	2	10	864382	864391	40 %	40 %	0 %	20 %	113955008
15031	NC_008319	GCT	2	6	864402	864407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955008
15032	NC_008319	TGT	2	6	864447	864452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113955008
15033	NC_008319	TTG	2	6	864632	864637	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113955008
15034	NC_008319	GCTT	2	8	864650	864657	0 %	50 %	25 %	25 %	113955008
15035	NC_008319	TGA	2	6	864672	864677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955008
15036	NC_008319	TTGG	2	8	864683	864690	0 %	50 %	50 %	0 %	113955008
15037	NC_008319	ATG	2	6	864895	864900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954170
15038	NC_008319	AGC	2	6	864901	864906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954170
15039	NC_008319	TCC	2	6	864920	864925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113954170
15040	NC_008319	TTC	2	6	864965	864970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954170
15041	NC_008319	AAT	2	6	865033	865038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113954170
15042	NC_008319	TTG	2	6	865052	865057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954170
15043	NC_008319	CTTC	2	8	865143	865150	0 %	50 %	0 %	50 %	113954170
15044	NC_008319	GAA	2	6	865271	865276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113954170
15045	NC_008319	TTTGG	2	10	865292	865301	0 %	60 %	40 %	0 %	113954170
15046	NC_008319	TGT	2	6	865336	865341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954170
15047	NC_008319	GT	3	6	865343	865348	0 %	50 %	50 %	0 %	113954170
15048	NC_008319	TAG	2	6	865381	865386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954170
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15050	NC_008319	CTGG	2	8	865507	865514	0 %	25 %	50 %	25 %	113954170
15051	NC_008319	CCA	2	6	865611	865616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954170
15052	NC_008319	TCGA	2	8	865769	865776	25 %	25 %	25 %	25 %	113954170
15053	NC_008319	TTG	2	6	865824	865829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954170
15054	NC_008319	CGT	2	6	865839	865844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954170
15055	NC_008319	AGG	2	6	865876	865881	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113954170
15056	NC_008319	CTA	2	6	865915	865920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954170
15057	NC_008319	CTGTCT	2	12	865972	865983	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	113954170
15058	NC_008319	GCAT	2	8	866028	866035	25 %	25 %	25 %	25 %	113954170
15059	NC_008319	TCC	2	6	866114	866119	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113954170
15060	NC_008319	GCCATT	2	12	866195	866206	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	113954170
15061	NC_008319	TTG	2	6	866219	866224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954170
15062	NC_008319	GAT	2	6	866464	866469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954170
15063	NC_008319	GT	3	6	866506	866511	0 %	50 %	50 %	0 %	113954170
15064	NC_008319	TAG	2	6	866513	866518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954170
15065	NC_008319	AAT	2	6	866521	866526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113954170
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15068	NC_008319	TCT	2	6	866618	866623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954170
15069	NC_008319	CAT	2	6	866627	866632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954170
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15073	NC_008319	ATTTT	2	10	867025	867034	20 %	80 %	0 %	0 %	113954807
15074	NC_008319	GAAG	2	8	867035	867042	50 %	0 %	50 %	0 %	113954807
15075	NC_008319	TTA	2	6	867055	867060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113954807
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15078	NC_008319	TGA	2	6	867172	867177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954807
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15085	NC_008319	TAA	2	6	867460	867465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113954327
15086	NC_008319	GCT	2	6	867470	867475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954327
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15088	NC_008319	ATA	2	6	867488	867493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113954327
15089	NC_008319	TC	3	6	867496	867501	0 %	50 %	0 %	50 %	113954327
15090	NC_008319	T	6	6	867528	867533	0 %	100 %	0 %	0 %	113954327
15091	NC_008319	T	6	6	867548	867553	0 %	100 %	0 %	0 %	113954327
15092	NC_008319	TGCT	2	8	867563	867570	0 %	50 %	25 %	25 %	113954327
15093	NC_008319	CAG	2	6	867574	867579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954327
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15096	NC_008319	TGC	2	6	867941	867946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953398
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15101	NC_008319	GGCTG	2	10	868140	868149	0 %	20 %	60 %	20 %	113953220
15102	NC_008319	TAC	2	6	868167	868172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953220
15103	NC_008319	CAG	2	6	868761	868766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953230
15104	NC_008319	CAT	2	6	868767	868772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953230
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15106	NC_008319	TGG	2	6	868876	868881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953230
15107	NC_008319	AC	3	6	868926	868931	50 %	0 %	0 %	50 %	113953230
15108	NC_008319	CCA	2	6	869046	869051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953230
15109	NC_008319	CTTCG	2	10	869061	869070	0 %	40 %	20 %	40 %	113953230
15110	NC_008319	ATC	2	6	869102	869107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953230
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15113	NC_008319	GCAG	2	8	869340	869347	25 %	0 %	50 %	25 %	113955492
15114	NC_008319	GGC	2	6	869401	869406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113955492
15115	NC_008319	TGC	2	6	869416	869421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955492
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15120	NC_008319	ATCG	2	8	869685	869692	25 %	25 %	25 %	25 %	113955492
15121	NC_008319	CTT	2	6	869715	869720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113955492
15122	NC_008319	CCAG	2	8	869794	869801	25 %	0 %	25 %	50 %	113955492
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15233	NC_008319	CGAT	2	8	874931	874938	25 %	25 %	25 %	25 %	113954336
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