MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9311

Total Repeats: 44579

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_008319	AAT	2	6	802555	802560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113954145
14002	NC_008319	TG	3	6	802631	802636	0 %	50 %	50 %	0 %	113954145
14003	NC_008319	AAT	2	6	802756	802761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113954145
14004	NC_008319	CTG	2	6	802782	802787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954145
14005	NC_008319	AGG	2	6	802799	802804	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113954145
14006	NC_008319	CAC	2	6	802813	802818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954145
14007	NC_008319	TGGG	2	8	802850	802857	0 %	25 %	75 %	0 %	113954145
14008	NC_008319	A	6	6	802859	802864	100 %	0 %	0 %	0 %	113954145
14009	NC_008319	ATTGCC	2	12	802883	802894	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	113954145
14010	NC_008319	TCG	2	6	802915	802920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954145
14011	NC_008319	CCA	2	6	802958	802963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954145
14012	NC_008319	GGAC	2	8	802967	802974	25 %	0 %	50 %	25 %	113954145
14013	NC_008319	GTTGG	2	10	803021	803030	0 %	40 %	60 %	0 %	113954145
14014	NC_008319	TTG	2	6	803044	803049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954145
14015	NC_008319	ATTC	2	8	803154	803161	25 %	50 %	0 %	25 %	113954145
14016	NC_008319	TCAGC	2	10	803178	803187	20 %	20 %	20 %	40 %	113954145
14017	NC_008319	GCT	2	6	803281	803286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953260
14018	NC_008319	CT	3	6	803350	803355	0 %	50 %	0 %	50 %	113953260
14019	NC_008319	CAC	2	6	803418	803423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953260
14020	NC_008319	CTG	2	6	803436	803441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953260
14021	NC_008319	CTT	2	6	803450	803455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953260
14022	NC_008319	TGGTT	2	10	803517	803526	0 %	60 %	40 %	0 %	113953260
14023	NC_008319	GGT	2	6	803527	803532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953260
14024	NC_008319	CGT	2	6	803548	803553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953260
14025	NC_008319	TGCT	2	8	803608	803615	0 %	50 %	25 %	25 %	113955027
14026	NC_008319	TC	3	6	803661	803666	0 %	50 %	0 %	50 %	113955027
14027	NC_008319	GTG	2	6	803697	803702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955027
14028	NC_008319	TGA	2	6	803728	803733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955027
14029	NC_008319	TCC	2	6	803899	803904	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113954171
14030	NC_008319	TTG	2	6	803944	803949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954171
14031	NC_008319	CGTTG	2	10	803959	803968	0 %	40 %	40 %	20 %	113954171
14032	NC_008319	GCTG	2	8	803992	803999	0 %	25 %	50 %	25 %	113954171
14033	NC_008319	TGT	2	6	804004	804009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954171
14034	NC_008319	TC	3	6	804036	804041	0 %	50 %	0 %	50 %	113954171
14035	NC_008319	ATGCG	2	10	804054	804063	20 %	20 %	40 %	20 %	113954171
14036	NC_008319	AGCG	2	8	804126	804133	25 %	0 %	50 %	25 %	113954171
14037	NC_008319	GTC	2	6	804193	804198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954171
14038	NC_008319	CGC	2	6	804227	804232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113954171
14039	NC_008319	GAC	2	6	804271	804276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954171
14040	NC_008319	TCCA	2	8	804281	804288	25 %	25 %	0 %	50 %	113954171
14041	NC_008319	TGC	2	6	804339	804344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954171
14042	NC_008319	TGC	2	6	804353	804358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954171
14043	NC_008319	GA	3	6	804368	804373	50 %	0 %	50 %	0 %	113954171
14044	NC_008319	TGT	2	6	804379	804384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954171
14045	NC_008319	CTT	2	6	804392	804397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954171
14046	NC_008319	CCCTTG	2	12	804436	804447	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	113954171
14047	NC_008319	CCAG	2	8	804485	804492	25 %	0 %	25 %	50 %	113954171
14048	NC_008319	T	7	7	804844	804850	0 %	100 %	0 %	0 %	113955052
14049	NC_008319	TGA	2	6	805098	805103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953873
14050	NC_008319	CTGG	2	8	805119	805126	0 %	25 %	50 %	25 %	113953873
14051	NC_008319	GCAA	2	8	805178	805185	50 %	0 %	25 %	25 %	113953873
14052	NC_008319	TCA	2	6	805186	805191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953873
14053	NC_008319	GCAGA	2	10	805452	805461	40 %	0 %	40 %	20 %	113954507
14054	NC_008319	GCA	2	6	805537	805542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954507
14055	NC_008319	ACG	2	6	805564	805569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954507
14056	NC_008319	AGG	2	6	806208	806213	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113955443
14057	NC_008319	TTGTC	2	10	806221	806230	0 %	60 %	20 %	20 %	113955443
14058	NC_008319	GGTT	2	8	806264	806271	0 %	50 %	50 %	0 %	113955443
14059	NC_008319	AGA	2	6	806282	806287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113955443
14060	NC_008319	CAA	2	6	806290	806295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113955443
14061	NC_008319	AC	3	6	806362	806367	50 %	0 %	0 %	50 %	113955443
14062	NC_008319	A	6	6	807168	807173	100 %	0 %	0 %	0 %	113953168
14063	NC_008319	GC	5	10	807237	807246	0 %	0 %	50 %	50 %	113953168
14064	NC_008319	G	6	6	807399	807404	0 %	0 %	100 %	0 %	113953168
14065	NC_008319	TCT	2	6	807405	807410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953168
14066	NC_008319	GAG	2	6	807469	807474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113953168
14067	NC_008319	CA	3	6	807510	807515	50 %	0 %	0 %	50 %	113953168
14068	NC_008319	A	7	7	807564	807570	100 %	0 %	0 %	0 %	113953168
14069	NC_008319	CGA	2	6	807580	807585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953168
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14071	NC_008319	TGC	2	6	807628	807633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953168
14072	NC_008319	TTG	2	6	807651	807656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953168
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14074	NC_008319	TTG	2	6	807878	807883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954435
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14076	NC_008319	TTTG	2	8	808011	808018	0 %	75 %	25 %	0 %	113954435
14077	NC_008319	TCGC	2	8	808054	808061	0 %	25 %	25 %	50 %	113954435
14078	NC_008319	TCTT	2	8	808087	808094	0 %	75 %	0 %	25 %	113954435
14079	NC_008319	TCT	2	6	808103	808108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954435
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14087	NC_008319	T	7	7	808356	808362	0 %	100 %	0 %	0 %	113954435
14088	NC_008319	CT	3	6	808372	808377	0 %	50 %	0 %	50 %	113954435
14089	NC_008319	TTG	2	6	808440	808445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954435
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14092	NC_008319	GGC	2	6	808498	808503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954435
14093	NC_008319	TTCT	2	8	808512	808519	0 %	75 %	0 %	25 %	113954435
14094	NC_008319	TGC	2	6	808572	808577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954435
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14096	NC_008319	TGCA	2	8	808697	808704	25 %	25 %	25 %	25 %	113954435
14097	NC_008319	ATT	2	6	808737	808742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113954435
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14100	NC_008319	A	6	6	808838	808843	100 %	0 %	0 %	0 %	113954435
14101	NC_008319	AAC	2	6	808849	808854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113954435
14102	NC_008319	CT	3	6	808876	808881	0 %	50 %	0 %	50 %	113955206
14103	NC_008319	TGACT	2	10	809084	809093	20 %	40 %	20 %	20 %	113955206
14104	NC_008319	CTT	2	6	809145	809150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113955206
14105	NC_008319	ACT	2	6	809163	809168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113955206
14106	NC_008319	CAG	2	6	809169	809174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955206
14107	NC_008319	CGA	2	6	809192	809197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955206
14108	NC_008319	AGG	2	6	809207	809212	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113955206
14109	NC_008319	GC	3	6	809387	809392	0 %	0 %	50 %	50 %	113955206
14110	NC_008319	TAA	2	6	809423	809428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113955206
14111	NC_008319	TAA	2	6	809438	809443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113955206
14112	NC_008319	TTC	2	6	809461	809466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113955206
14113	NC_008319	GCTCA	2	10	809495	809504	20 %	20 %	20 %	40 %	113955206
14114	NC_008319	TAC	2	6	809622	809627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113955206
14115	NC_008319	TGG	2	6	809651	809656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955206
14116	NC_008319	TCT	2	6	809663	809668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113955206
14117	NC_008319	CTT	2	6	809725	809730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113955206
14118	NC_008319	AAAT	2	8	809736	809743	75 %	25 %	0 %	0 %	113955206
14119	NC_008319	GCAG	2	8	810848	810855	25 %	0 %	50 %	25 %	113952717
14120	NC_008319	CTT	2	6	810889	810894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113952717
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14122	NC_008319	AAC	2	6	811083	811088	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953607
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14242	NC_008319	GAT	2	6	817800	817805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953456
14243	NC_008319	GAA	2	6	817851	817856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113953456
14244	NC_008319	TTG	2	6	817870	817875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953456
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14343	NC_008319	GCACT	2	10	823415	823424	20 %	20 %	20 %	40 %	113954221
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14347	NC_008319	GTG	2	6	823644	823649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954221
14348	NC_008319	CTG	2	6	823740	823745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954221
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14353	NC_008319	GCC	2	6	824081	824086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113952951
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14355	NC_008319	TAC	3	9	824237	824245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113952951
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14480	NC_008319	GGC	2	6	832156	832161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954043
14481	NC_008319	TGA	2	6	832225	832230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954043
14482	NC_008319	CTG	2	6	832234	832239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954886
14483	NC_008319	GTT	2	6	832242	832247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954886
14484	NC_008319	CGAT	2	8	832255	832262	25 %	25 %	25 %	25 %	113954886
14485	NC_008319	CTG	2	6	832275	832280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954886
14486	NC_008319	ATC	2	6	832425	832430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954886
14487	NC_008319	TGG	2	6	832445	832450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954886
14488	NC_008319	CTG	2	6	832542	832547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954886
14489	NC_008319	GATC	2	8	832642	832649	25 %	25 %	25 %	25 %	113954886
14490	NC_008319	CCG	2	6	832704	832709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113954886
14491	NC_008319	GC	3	6	832725	832730	0 %	0 %	50 %	50 %	113954886
14492	NC_008319	CATTG	2	10	832742	832751	20 %	40 %	20 %	20 %	113954886
14493	NC_008319	GGT	2	6	832754	832759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954886
14494	NC_008319	GAT	2	6	832781	832786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954886
14495	NC_008319	GCT	2	6	832811	832816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954886
14496	NC_008319	GCT	2	6	832832	832837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954886
14497	NC_008319	CGG	2	6	832862	832867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954886
14498	NC_008319	GTG	2	6	832881	832886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954886
14499	NC_008319	TC	3	6	832888	832893	0 %	50 %	0 %	50 %	113954886
14500	NC_008319	GCT	5	15	832917	832931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954886

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