MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9311

Total Repeats: 44579

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_008319	GTGA	2	8	737486	737493	25 %	25 %	50 %	0 %	113953164
13002	NC_008319	GCG	2	6	737641	737646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953164
13003	NC_008319	CTTG	2	8	737685	737692	0 %	50 %	25 %	25 %	113953164
13004	NC_008319	G	6	6	737695	737700	0 %	0 %	100 %	0 %	113953164
13005	NC_008319	GCT	2	6	737747	737752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953164
13006	NC_008319	GCG	2	6	737777	737782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953164
13007	NC_008319	TC	3	6	737792	737797	0 %	50 %	0 %	50 %	113953164
13008	NC_008319	CCG	2	6	737979	737984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113953164
13009	NC_008319	CAGGCC	2	12	737996	738007	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	113953164
13010	NC_008319	AC	3	6	738103	738108	50 %	0 %	0 %	50 %	113953164
13011	NC_008319	GCT	2	6	738128	738133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953164
13012	NC_008319	GCC	2	6	738143	738148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113953164
13013	NC_008319	CGT	3	9	738177	738185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953164
13014	NC_008319	TCA	2	6	738210	738215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953164
13015	NC_008319	GCA	2	6	738308	738313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952844
13016	NC_008319	GCG	4	12	738342	738353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113952844
13017	NC_008319	GGC	2	6	738365	738370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113952844
13018	NC_008319	AGC	2	6	738391	738396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952844
13019	NC_008319	GGGT	2	8	738400	738407	0 %	25 %	75 %	0 %	113952844
13020	NC_008319	AAG	2	6	738417	738422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113952844
13021	NC_008319	GGC	2	6	738424	738429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113952844
13022	NC_008319	TGG	2	6	738481	738486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113952844
13023	NC_008319	GC	3	6	738491	738496	0 %	0 %	50 %	50 %	113952844
13024	NC_008319	GCA	2	6	738518	738523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952844
13025	NC_008319	GCT	2	6	738524	738529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952844
13026	NC_008319	TGC	2	6	738557	738562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952844
13027	NC_008319	CGG	2	6	738601	738606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113952844
13028	NC_008319	GGCACC	2	12	738628	738639	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	113952844
13029	NC_008319	CAC	3	9	738647	738655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113952844
13030	NC_008319	GAG	2	6	738657	738662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113952844
13031	NC_008319	TTG	2	6	738664	738669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113952844
13032	NC_008319	GGA	2	6	738698	738703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113952844
13033	NC_008319	CAC	2	6	738726	738731	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113952844
13034	NC_008319	GC	3	6	738768	738773	0 %	0 %	50 %	50 %	113952844
13035	NC_008319	TGC	2	6	738811	738816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952844
13036	NC_008319	TCA	2	6	738938	738943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113952844
13037	NC_008319	TGA	2	6	738962	738967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113952844
13038	NC_008319	CTG	2	6	739078	739083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952844
13039	NC_008319	TGG	2	6	739135	739140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113952844
13040	NC_008319	CGC	2	6	739251	739256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113952844
13041	NC_008319	ATTCA	2	10	739295	739304	40 %	40 %	0 %	20 %	113952844
13042	NC_008319	AGT	2	6	739441	739446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953981
13043	NC_008319	CAT	2	6	739454	739459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953981
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13045	NC_008319	T	7	7	739493	739499	0 %	100 %	0 %	0 %	113953981
13046	NC_008319	GTT	2	6	739630	739635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953981
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13050	NC_008319	TCG	2	6	739777	739782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953981
13051	NC_008319	TTC	2	6	739827	739832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953981
13052	NC_008319	CAT	2	6	739841	739846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953981
13053	NC_008319	TTC	2	6	739848	739853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953981
13054	NC_008319	GTG	2	6	739870	739875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953981
13055	NC_008319	AATG	2	8	739922	739929	50 %	25 %	25 %	0 %	113953981
13056	NC_008319	GAT	2	6	739982	739987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953981
13057	NC_008319	CAA	2	6	740000	740005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953981
13058	NC_008319	GTC	2	6	740010	740015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953981
13059	NC_008319	TGAT	2	8	740092	740099	25 %	50 %	25 %	0 %	113953981
13060	NC_008319	TCA	2	6	740107	740112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953981
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13062	NC_008319	CTC	2	6	740235	740240	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113953981
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13067	NC_008319	T	7	7	740361	740367	0 %	100 %	0 %	0 %	113953981
13068	NC_008319	ATTG	2	8	740445	740452	25 %	50 %	25 %	0 %	113953981
13069	NC_008319	GATT	2	8	740518	740525	25 %	50 %	25 %	0 %	113953981
13070	NC_008319	TCT	2	6	740560	740565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953981
13071	NC_008319	ATTG	2	8	740613	740620	25 %	50 %	25 %	0 %	113953981
13072	NC_008319	AGGA	2	8	740742	740749	50 %	0 %	50 %	0 %	113953981
13073	NC_008319	GAGT	2	8	741200	741207	25 %	25 %	50 %	0 %	113954425
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13079	NC_008319	AGCA	2	8	741611	741618	50 %	0 %	25 %	25 %	113953977
13080	NC_008319	AAG	2	6	741698	741703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113953977
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13088	NC_008319	GATC	2	8	742728	742735	25 %	25 %	25 %	25 %	113952778
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13091	NC_008319	TTTTG	2	10	742769	742778	0 %	80 %	20 %	0 %	113952778
13092	NC_008319	TTG	2	6	743025	743030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953599
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13103	NC_008319	GAA	2	6	743710	743715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113954351
13104	NC_008319	TGC	2	6	743739	743744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954351
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13106	NC_008319	TC	3	6	743761	743766	0 %	50 %	0 %	50 %	113954351
13107	NC_008319	GGT	2	6	743767	743772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954351
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13110	NC_008319	TGG	2	6	744029	744034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954351
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13115	NC_008319	TGG	2	6	744164	744169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954351
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13118	NC_008319	G	6	6	744281	744286	0 %	0 %	100 %	0 %	113954351
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13120	NC_008319	CGC	2	6	744384	744389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113954351
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13225	NC_008319	TGG	2	6	749561	749566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953031
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13232	NC_008319	CG	3	6	749996	750001	0 %	0 %	50 %	50 %	113953031
13233	NC_008319	GCAA	2	8	750018	750025	50 %	0 %	25 %	25 %	113953031
13234	NC_008319	CTC	2	6	750026	750031	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113953031
13235	NC_008319	CTG	2	6	750073	750078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953031
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13476	NC_008319	CAG	2	6	763107	763112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955040
13477	NC_008319	GCA	2	6	763134	763139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955040
13478	NC_008319	ATG	2	6	763181	763186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955040
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13480	NC_008319	TCA	2	6	763205	763210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113955040
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