MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9311

Total Repeats: 44579

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_008319	T	6	6	679575	679580	0 %	100 %	0 %	0 %	113952713
12002	NC_008319	TTCGAT	2	12	679651	679662	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	113952713
12003	NC_008319	TCGC	2	8	679664	679671	0 %	25 %	25 %	50 %	113952713
12004	NC_008319	TGCC	2	8	679749	679756	0 %	25 %	25 %	50 %	113952713
12005	NC_008319	CAA	2	6	679759	679764	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113952713
12006	NC_008319	TGC	2	6	679899	679904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952713
12007	NC_008319	CGA	2	6	679935	679940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952713
12008	NC_008319	ATCA	2	8	680237	680244	50 %	25 %	0 %	25 %	113954996
12009	NC_008319	CTT	2	6	680260	680265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954996
12010	NC_008319	CAG	2	6	680296	680301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954996
12011	NC_008319	AG	3	6	680300	680305	50 %	0 %	50 %	0 %	113954996
12012	NC_008319	TTC	2	6	680306	680311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954996
12013	NC_008319	TTG	2	6	680358	680363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954996
12014	NC_008319	GCA	2	6	680365	680370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954996
12015	NC_008319	CG	3	6	680407	680412	0 %	0 %	50 %	50 %	113954996
12016	NC_008319	GTTGA	2	10	680625	680634	20 %	40 %	40 %	0 %	113954996
12017	NC_008319	TCAGT	2	10	680695	680704	20 %	40 %	20 %	20 %	113954996
12018	NC_008319	TAA	2	6	680835	680840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113954996
12019	NC_008319	CTC	2	6	680912	680917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113954728
12020	NC_008319	CTTGCT	2	12	680939	680950	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	113954728
12021	NC_008319	TGC	3	9	680956	680964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954728
12022	NC_008319	CGT	2	6	680991	680996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954728
12023	NC_008319	CAC	2	6	681038	681043	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954728
12024	NC_008319	CTC	2	6	681077	681082	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113954728
12025	NC_008319	ACC	2	6	681087	681092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954728
12026	NC_008319	TCT	2	6	681129	681134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954728
12027	NC_008319	TCA	2	6	681165	681170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954728
12028	NC_008319	TCA	2	6	681217	681222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954728
12029	NC_008319	TTTC	2	8	681229	681236	0 %	75 %	0 %	25 %	113954728
12030	NC_008319	GCC	2	6	681281	681286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113954728
12031	NC_008319	GAG	2	6	681299	681304	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113954728
12032	NC_008319	TGG	2	6	681433	681438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954728
12033	NC_008319	TGC	2	6	681450	681455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954728
12034	NC_008319	TCG	2	6	681459	681464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954728
12035	NC_008319	GAT	2	6	681536	681541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954728
12036	NC_008319	TTG	2	6	681613	681618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954728
12037	NC_008319	A	6	6	681680	681685	100 %	0 %	0 %	0 %	113954728
12038	NC_008319	AGC	2	6	681744	681749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954728
12039	NC_008319	CTG	2	6	681842	681847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954728
12040	NC_008319	GCAGCC	2	12	681856	681867	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	113954728
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12043	NC_008319	GCA	2	6	682366	682371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955415
12044	NC_008319	CTG	2	6	682372	682377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955415
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12046	NC_008319	GA	3	6	682450	682455	50 %	0 %	50 %	0 %	113955415
12047	NC_008319	TCT	2	6	682461	682466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113955415
12048	NC_008319	GCAG	2	8	682556	682563	25 %	0 %	50 %	25 %	113955415
12049	NC_008319	GCGAG	2	10	682773	682782	20 %	0 %	60 %	20 %	113955415
12050	NC_008319	GCC	2	6	682807	682812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113955415
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12052	NC_008319	GCCAG	2	10	682882	682891	20 %	0 %	40 %	40 %	113955415
12053	NC_008319	GTG	2	6	682925	682930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955415
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12056	NC_008319	CCT	2	6	683015	683020	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113955415
12057	NC_008319	GCTT	2	8	683054	683061	0 %	50 %	25 %	25 %	113955415
12058	NC_008319	GAT	2	6	683089	683094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955415
12059	NC_008319	GCTGC	2	10	683109	683118	0 %	20 %	40 %	40 %	113955415
12060	NC_008319	GC	3	6	683203	683208	0 %	0 %	50 %	50 %	113955415
12061	NC_008319	TGG	2	6	683303	683308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955415
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12064	NC_008319	CT	3	6	683332	683337	0 %	50 %	0 %	50 %	113955415
12065	NC_008319	TTGGC	2	10	683420	683429	0 %	40 %	40 %	20 %	113953246
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12068	NC_008319	GCCGAT	2	12	683486	683497	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	113953246
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12084	NC_008319	CGG	2	6	684356	684361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954583
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12102	NC_008319	CAG	2	6	685184	685189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954583
12103	NC_008319	TGC	2	6	685277	685282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954583
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12117	NC_008319	GAAAG	2	10	686078	686087	60 %	0 %	40 %	0 %	113953605
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12119	NC_008319	CGCT	2	8	686122	686129	0 %	25 %	25 %	50 %	113953605
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12235	NC_008319	GATGGA	2	12	693333	693344	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	113953404
12236	NC_008319	GATGC	2	10	693379	693388	20 %	20 %	40 %	20 %	113953404
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12477	NC_008319	GCT	2	6	705942	705947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954461
12478	NC_008319	TGG	2	6	706106	706111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113952972
12479	NC_008319	GCT	2	6	706129	706134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952972
12480	NC_008319	TCC	2	6	706145	706150	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113952972
12481	NC_008319	TC	3	6	706154	706159	0 %	50 %	0 %	50 %	113952972
12482	NC_008319	GTGGC	2	10	706176	706185	0 %	20 %	60 %	20 %	113952972
12483	NC_008319	GCT	2	6	706268	706273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952972
12484	NC_008319	CTG	2	6	706310	706315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952972
12485	NC_008319	TGG	2	6	706398	706403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113952972
12486	NC_008319	TGG	2	6	706444	706449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113952972
12487	NC_008319	GCTT	2	8	706452	706459	0 %	50 %	25 %	25 %	113952972
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12489	NC_008319	CTG	2	6	706526	706531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952972
12490	NC_008319	TGG	2	6	706538	706543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113952972
12491	NC_008319	CTG	2	6	706592	706597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952972
12492	NC_008319	CGG	2	6	706600	706605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113952972
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12495	NC_008319	GCT	2	6	706645	706650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952972
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12497	NC_008319	GCT	2	6	706802	706807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952972
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12499	NC_008319	TGA	2	6	706884	706889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113952972
12500	NC_008319	TGG	2	6	706938	706943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113952972

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