MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9311

Total Repeats: 44579

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_008319	ACT	2	6	646470	646475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113955243
11502	NC_008319	CTA	2	6	646495	646500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113955243
11503	NC_008319	AGA	2	6	646569	646574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113955243
11504	NC_008319	AGA	2	6	646590	646595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113955243
11505	NC_008319	GAT	2	6	646633	646638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955243
11506	NC_008319	AGC	2	6	646649	646654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955243
11507	NC_008319	GCG	2	6	646671	646676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113955243
11508	NC_008319	ACC	2	6	646691	646696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113955243
11509	NC_008319	GAA	2	6	646783	646788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113955243
11510	NC_008319	AGA	2	6	646914	646919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113953210
11511	NC_008319	T	6	6	646968	646973	0 %	100 %	0 %	0 %	113953210
11512	NC_008319	CGC	2	6	646977	646982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113953210
11513	NC_008319	TCT	2	6	647002	647007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953210
11514	NC_008319	TTC	2	6	647020	647025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953210
11515	NC_008319	GTTG	2	8	647038	647045	0 %	50 %	50 %	0 %	113953210
11516	NC_008319	AAGC	2	8	647084	647091	50 %	0 %	25 %	25 %	113953210
11517	NC_008319	CAA	2	6	647141	647146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953210
11518	NC_008319	TTC	2	6	647157	647162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953210
11519	NC_008319	ATTA	2	8	647327	647334	50 %	50 %	0 %	0 %	113955459
11520	NC_008319	TGC	2	6	647399	647404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955459
11521	NC_008319	AAATT	2	10	647414	647423	60 %	40 %	0 %	0 %	113955459
11522	NC_008319	GTG	2	6	647508	647513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955459
11523	NC_008319	TTG	2	6	647557	647562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113955459
11524	NC_008319	CCA	2	6	647696	647701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113955459
11525	NC_008319	CTG	2	6	647732	647737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955459
11526	NC_008319	GATCAT	2	12	647777	647788	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	113955459
11527	NC_008319	CAG	2	6	647912	647917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955459
11528	NC_008319	CCG	2	6	647948	647953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113955459
11529	NC_008319	TGGT	2	8	647993	648000	0 %	50 %	50 %	0 %	113955459
11530	NC_008319	ATGA	2	8	648182	648189	50 %	25 %	25 %	0 %	113955459
11531	NC_008319	CTT	3	9	648734	648742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954847
11532	NC_008319	ATC	2	6	648763	648768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954847
11533	NC_008319	ATT	2	6	648783	648788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113954847
11534	NC_008319	ATAG	2	8	648809	648816	50 %	25 %	25 %	0 %	113954847
11535	NC_008319	GCC	2	6	648817	648822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113954847
11536	NC_008319	ATC	2	6	648843	648848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954847
11537	NC_008319	GTT	2	6	648871	648876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954847
11538	NC_008319	CAG	2	6	648909	648914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954847
11539	NC_008319	TCTTGC	2	12	649066	649077	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	113954847
11540	NC_008319	CAGT	2	8	649109	649116	25 %	25 %	25 %	25 %	113954847
11541	NC_008319	GCT	2	6	649138	649143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954847
11542	NC_008319	CCA	2	6	649199	649204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954847
11543	NC_008319	GCCT	2	8	649262	649269	0 %	25 %	25 %	50 %	113954847
11544	NC_008319	TGGT	2	8	649490	649497	0 %	50 %	50 %	0 %	113955518
11545	NC_008319	TC	3	6	649506	649511	0 %	50 %	0 %	50 %	113955518
11546	NC_008319	TGA	2	6	649552	649557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955518
11547	NC_008319	TGT	2	6	649825	649830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954203
11548	NC_008319	TGA	2	6	649849	649854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954203
11549	NC_008319	TTTG	2	8	649877	649884	0 %	75 %	25 %	0 %	113954203
11550	NC_008319	CAA	2	6	649915	649920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113954203
11551	NC_008319	A	6	6	649919	649924	100 %	0 %	0 %	0 %	113954203
11552	NC_008319	GTT	2	6	649925	649930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954203
11553	NC_008319	T	6	6	649932	649937	0 %	100 %	0 %	0 %	113954203
11554	NC_008319	TTC	2	6	649966	649971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954203
11555	NC_008319	ATG	2	6	650001	650006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954203
11556	NC_008319	GTTCC	2	10	650008	650017	0 %	40 %	20 %	40 %	113954203
11557	NC_008319	ATG	2	6	650052	650057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954203
11558	NC_008319	A	6	6	650095	650100	100 %	0 %	0 %	0 %	113954203
11559	NC_008319	CTG	2	6	650260	650265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954203
11560	NC_008319	TGA	2	6	650269	650274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954203
11561	NC_008319	GAT	2	6	650302	650307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954203
11562	NC_008319	TCG	2	6	650330	650335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954203
11563	NC_008319	GCCAA	2	10	650342	650351	40 %	0 %	20 %	40 %	113954203
11564	NC_008319	GTT	2	6	650613	650618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953546
11565	NC_008319	TTC	2	6	650647	650652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953546
11566	NC_008319	CAC	2	6	650705	650710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953546
11567	NC_008319	AAC	2	6	650738	650743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953546
11568	NC_008319	GCT	2	6	650798	650803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953546
11569	NC_008319	CAAA	2	8	650823	650830	75 %	0 %	0 %	25 %	113953546
11570	NC_008319	GGTGGC	2	12	650833	650844	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	113953546
11571	NC_008319	TGG	2	6	650910	650915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953546
11572	NC_008319	GCTGT	2	10	651110	651119	0 %	40 %	40 %	20 %	113953546
11573	NC_008319	CGCA	2	8	651268	651275	25 %	0 %	25 %	50 %	113953546
11574	NC_008319	ACG	2	6	651286	651291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953546
11575	NC_008319	TGC	2	6	651467	651472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952910
11576	NC_008319	CTT	2	6	651485	651490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113952910
11577	NC_008319	CAAT	2	8	651500	651507	50 %	25 %	0 %	25 %	113952910
11578	NC_008319	TCG	2	6	651582	651587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952910
11579	NC_008319	TTG	2	6	651649	651654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113952910
11580	NC_008319	TGGG	2	8	651697	651704	0 %	25 %	75 %	0 %	113952910
11581	NC_008319	TGG	2	6	651714	651719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113952910
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11584	NC_008319	CGC	2	6	651860	651865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113955162
11585	NC_008319	CTG	2	6	651917	651922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955162
11586	NC_008319	CAC	3	9	652081	652089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954498
11587	NC_008319	GGTGG	2	10	652204	652213	0 %	20 %	80 %	0 %	113954498
11588	NC_008319	TGGA	2	8	652353	652360	25 %	25 %	50 %	0 %	113954498
11589	NC_008319	GTGA	2	8	652446	652453	25 %	25 %	50 %	0 %	113954498
11590	NC_008319	CGT	2	6	652491	652496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954299
11591	NC_008319	TGC	2	6	652523	652528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954299
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11593	NC_008319	GTG	2	6	652824	652829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954299
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11596	NC_008319	GTTTG	2	10	652932	652941	0 %	60 %	40 %	0 %	113954299
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11598	NC_008319	CTGGT	2	10	652958	652967	0 %	40 %	40 %	20 %	113954299
11599	NC_008319	C	6	6	653010	653015	0 %	0 %	0 %	100 %	113954299
11600	NC_008319	GGC	2	6	653060	653065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954299
11601	NC_008319	GCG	2	6	653076	653081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954299
11602	NC_008319	CGAT	2	8	653098	653105	25 %	25 %	25 %	25 %	113954299
11603	NC_008319	GATC	2	8	653193	653200	25 %	25 %	25 %	25 %	113954299
11604	NC_008319	CCT	2	6	653423	653428	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113954299
11605	NC_008319	TTTC	2	8	653453	653460	0 %	75 %	0 %	25 %	113954299
11606	NC_008319	CTG	2	6	653469	653474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954299
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11609	NC_008319	TGC	2	6	653590	653595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954299
11610	NC_008319	GCT	2	6	653597	653602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954299
11611	NC_008319	TGG	2	6	653609	653614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954299
11612	NC_008319	CAA	2	6	653669	653674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113954299
11613	NC_008319	GCT	2	6	653675	653680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954299
11614	NC_008319	AGC	3	9	653713	653721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954299
11615	NC_008319	GAGG	2	8	653736	653743	25 %	0 %	75 %	0 %	113954299
11616	NC_008319	GAA	2	6	653788	653793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113954299
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