MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9311

Total Repeats: 44579

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_008319	GAT	2	6	616774	616779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953939
11002	NC_008319	CAC	2	6	616828	616833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953939
11003	NC_008319	GA	3	6	616836	616841	50 %	0 %	50 %	0 %	113953939
11004	NC_008319	CTG	2	6	616895	616900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953939
11005	NC_008319	AG	3	6	616909	616914	50 %	0 %	50 %	0 %	113953939
11006	NC_008319	AGG	2	6	616923	616928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113953939
11007	NC_008319	CAT	2	6	617111	617116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953331
11008	NC_008319	TGC	2	6	617158	617163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953331
11009	NC_008319	ACA	2	6	617212	617217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953331
11010	NC_008319	CGCA	2	8	617261	617268	25 %	0 %	25 %	50 %	113953331
11011	NC_008319	GGC	2	6	617279	617284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953331
11012	NC_008319	GAG	2	6	617292	617297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113953331
11013	NC_008319	AC	3	6	617317	617322	50 %	0 %	0 %	50 %	113953331
11014	NC_008319	CAA	2	6	617477	617482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953331
11015	NC_008319	GATT	2	8	617483	617490	25 %	50 %	25 %	0 %	113953331
11016	NC_008319	AGG	2	6	617518	617523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113953331
11017	NC_008319	ATC	2	6	617535	617540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953331
11018	NC_008319	TTC	2	6	617602	617607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953331
11019	NC_008319	TGA	2	6	617722	617727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953331
11020	NC_008319	GTT	2	6	617756	617761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953331
11021	NC_008319	CAA	2	6	617771	617776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953331
11022	NC_008319	AAGCC	2	10	617956	617965	40 %	0 %	20 %	40 %	113953331
11023	NC_008319	CT	3	6	618042	618047	0 %	50 %	0 %	50 %	113953331
11024	NC_008319	CAG	2	6	618077	618082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953331
11025	NC_008319	TGG	2	6	618235	618240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953331
11026	NC_008319	CAG	2	6	618267	618272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953331
11027	NC_008319	GAG	2	6	618285	618290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113953331
11028	NC_008319	TTC	2	6	618450	618455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953331
11029	NC_008319	ACC	2	6	618499	618504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953331
11030	NC_008319	ACG	2	6	618576	618581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953331
11031	NC_008319	CGAGTA	2	12	618703	618714	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	113953331
11032	NC_008319	AAG	2	6	618771	618776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113953331
11033	NC_008319	GAA	2	6	618785	618790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113953331
11034	NC_008319	AGG	2	6	618844	618849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113953331
11035	NC_008319	TTG	2	6	618896	618901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113955580
11036	NC_008319	AGT	2	6	618934	618939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955580
11037	NC_008319	TGC	2	6	618946	618951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955580
11038	NC_008319	T	7	7	619012	619018	0 %	100 %	0 %	0 %	113955580
11039	NC_008319	T	6	6	619032	619037	0 %	100 %	0 %	0 %	113955580
11040	NC_008319	TGGT	2	8	619095	619102	0 %	50 %	50 %	0 %	113955580
11041	NC_008319	TCA	2	6	619146	619151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113955580
11042	NC_008319	ATCC	2	8	619168	619175	25 %	25 %	0 %	50 %	113955580
11043	NC_008319	GCC	2	6	619187	619192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113955580
11044	NC_008319	TGA	2	6	619369	619374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955580
11045	NC_008319	CGT	2	6	619464	619469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955580
11046	NC_008319	GAA	2	6	619559	619564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113955580
11047	NC_008319	TTC	3	9	619703	619711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113955580
11048	NC_008319	GTT	2	6	619840	619845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113955580
11049	NC_008319	TCCA	2	8	619985	619992	25 %	25 %	0 %	50 %	113955580
11050	NC_008319	TTG	2	6	620165	620170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113955580
11051	NC_008319	CAA	2	6	620225	620230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113955580
11052	NC_008319	T	6	6	620299	620304	0 %	100 %	0 %	0 %	113955580
11053	NC_008319	TGA	2	6	620317	620322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955580
11054	NC_008319	GCA	2	6	620343	620348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955580
11055	NC_008319	GCCATT	2	12	620887	620898	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	113953587
11056	NC_008319	GAG	2	6	620973	620978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113953587
11057	NC_008319	TCT	2	6	621092	621097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953587
11058	NC_008319	GGCTT	2	10	621121	621130	0 %	40 %	40 %	20 %	113953587
11059	NC_008319	GTT	2	6	621138	621143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953587
11060	NC_008319	TGA	2	6	621160	621165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953587
11061	NC_008319	CGA	2	6	621255	621260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953587
11062	NC_008319	GAC	2	6	621297	621302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953587
11063	NC_008319	TCG	2	6	621342	621347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953587
11064	NC_008319	TCTGT	2	10	621440	621449	0 %	60 %	20 %	20 %	113954781
11065	NC_008319	AG	3	6	621514	621519	50 %	0 %	50 %	0 %	113954781
11066	NC_008319	CGCT	2	8	621621	621628	0 %	25 %	25 %	50 %	113954781
11067	NC_008319	TCGA	2	8	621630	621637	25 %	25 %	25 %	25 %	113954781
11068	NC_008319	GGAT	2	8	621644	621651	25 %	25 %	50 %	0 %	113954781
11069	NC_008319	GAC	2	6	621662	621667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954781
11070	NC_008319	TGT	2	6	621727	621732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954781
11071	NC_008319	CTG	2	6	621769	621774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954781
11072	NC_008319	ATC	2	6	621781	621786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954781
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11074	NC_008319	TGC	2	6	621994	621999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954251
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11076	NC_008319	GGAA	2	8	622124	622131	50 %	0 %	50 %	0 %	113954251
11077	NC_008319	TGC	2	6	622155	622160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954251
11078	NC_008319	TGT	2	6	622225	622230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954251
11079	NC_008319	TCG	2	6	622239	622244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954251
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11084	NC_008319	T	6	6	622572	622577	0 %	100 %	0 %	0 %	113954251
11085	NC_008319	TCA	2	6	622581	622586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954251
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11087	NC_008319	GT	3	6	622723	622728	0 %	50 %	50 %	0 %	113954251
11088	NC_008319	GAA	2	6	622780	622785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113954251
11089	NC_008319	CGA	2	6	622798	622803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954251
11090	NC_008319	CTGGG	2	10	622805	622814	0 %	20 %	60 %	20 %	113954251
11091	NC_008319	AGCA	2	8	622907	622914	50 %	0 %	25 %	25 %	113954251
11092	NC_008319	TTG	2	6	622932	622937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954251
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11101	NC_008319	GCTC	2	8	623396	623403	0 %	25 %	25 %	50 %	113954251
11102	NC_008319	GCC	2	6	623537	623542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113952952
11103	NC_008319	GCAA	2	8	623593	623600	50 %	0 %	25 %	25 %	113952952
11104	NC_008319	GCT	2	6	623618	623623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952952
11105	NC_008319	GTA	2	6	623650	623655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113952952
11106	NC_008319	GATTC	2	10	623677	623686	20 %	40 %	20 %	20 %	113952952
11107	NC_008319	TCT	2	6	623735	623740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113952952
11108	NC_008319	TCA	2	6	623763	623768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113952952
11109	NC_008319	CAT	2	6	623845	623850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113952952
11110	NC_008319	TCG	2	6	623859	623864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952952
11111	NC_008319	GGGCA	2	10	623911	623920	20 %	0 %	60 %	20 %	113952952
11112	NC_008319	TAAA	2	8	624466	624473	75 %	25 %	0 %	0 %	113954556
11113	NC_008319	GTC	2	6	624664	624669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955366
11114	NC_008319	TGT	2	6	624700	624705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113955366
11115	NC_008319	CATC	2	8	624716	624723	25 %	25 %	0 %	50 %	113955366
11116	NC_008319	ATC	3	9	624811	624819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113955366
11117	NC_008319	TCT	2	6	624863	624868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113955366
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11119	NC_008319	AGC	3	9	624880	624888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955366
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11478	NC_008319	TTTGG	2	10	644947	644956	0 %	60 %	40 %	0 %	113954844
11479	NC_008319	CAA	2	6	644976	644981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113954844
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11482	NC_008319	AGT	2	6	645272	645277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955442
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