MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9311

Total Repeats: 44579

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_008319	CCAA	2	8	554146	554153	50 %	0 %	0 %	50 %	113954567
10002	NC_008319	TGC	2	6	554412	554417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954959
10003	NC_008319	CTG	2	6	554438	554443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954959
10004	NC_008319	AG	3	6	554448	554453	50 %	0 %	50 %	0 %	113954959
10005	NC_008319	AGCG	2	8	554504	554511	25 %	0 %	50 %	25 %	113954959
10006	NC_008319	TGG	2	6	554568	554573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954959
10007	NC_008319	TCA	2	6	554613	554618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954959
10008	NC_008319	GTTA	2	8	554786	554793	25 %	50 %	25 %	0 %	113954959
10009	NC_008319	GTTG	2	8	554885	554892	0 %	50 %	50 %	0 %	113955264
10010	NC_008319	CTT	2	6	554909	554914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113955264
10011	NC_008319	GCA	2	6	554919	554924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955264
10012	NC_008319	TTGA	2	8	554950	554957	25 %	50 %	25 %	0 %	113955264
10013	NC_008319	AGC	2	6	554979	554984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955264
10014	NC_008319	GC	3	6	555055	555060	0 %	0 %	50 %	50 %	113955264
10015	NC_008319	GAG	2	6	555061	555066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113955264
10016	NC_008319	GTT	2	6	555093	555098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113955264
10017	NC_008319	GGC	2	6	555145	555150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113955264
10018	NC_008319	TGG	2	6	555206	555211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955264
10019	NC_008319	GTT	2	6	555249	555254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113955264
10020	NC_008319	GGA	2	6	555270	555275	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113955264
10021	NC_008319	TTG	2	6	555301	555306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113955264
10022	NC_008319	GGA	2	6	555387	555392	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113955264
10023	NC_008319	GGA	2	6	555441	555446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113955264
10024	NC_008319	AAG	2	6	555551	555556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113954776
10025	NC_008319	ACT	2	6	555575	555580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954776
10026	NC_008319	GGAG	2	8	555592	555599	25 %	0 %	75 %	0 %	113954776
10027	NC_008319	AC	3	6	555684	555689	50 %	0 %	0 %	50 %	113954776
10028	NC_008319	T	7	7	555825	555831	0 %	100 %	0 %	0 %	113954001
10029	NC_008319	TTG	2	6	555861	555866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954001
10030	NC_008319	A	6	6	555940	555945	100 %	0 %	0 %	0 %	113954001
10031	NC_008319	TCT	2	6	555956	555961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954001
10032	NC_008319	TCC	2	6	556003	556008	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113954001
10033	NC_008319	AC	3	6	556009	556014	50 %	0 %	0 %	50 %	113954001
10034	NC_008319	GCA	2	6	556053	556058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954001
10035	NC_008319	ATC	2	6	556280	556285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953326
10036	NC_008319	TGC	2	6	556314	556319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953326
10037	NC_008319	CTG	2	6	556325	556330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953326
10038	NC_008319	TCA	2	6	556370	556375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953326
10039	NC_008319	AATCC	2	10	556411	556420	40 %	20 %	0 %	40 %	113953326
10040	NC_008319	TGC	2	6	556422	556427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953326
10041	NC_008319	GAT	2	6	556582	556587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955384
10042	NC_008319	CAAGG	2	10	556594	556603	40 %	0 %	40 %	20 %	113955384
10043	NC_008319	CT	3	6	556627	556632	0 %	50 %	0 %	50 %	113955384
10044	NC_008319	CAT	2	6	556633	556638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113955384
10045	NC_008319	T	6	6	556716	556721	0 %	100 %	0 %	0 %	113955384
10046	NC_008319	A	6	6	557182	557187	100 %	0 %	0 %	0 %	113953656
10047	NC_008319	CAAT	2	8	557295	557302	50 %	25 %	0 %	25 %	113953656
10048	NC_008319	TAA	2	6	557444	557449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113953468
10049	NC_008319	TGA	2	6	557499	557504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953468
10050	NC_008319	GGC	2	6	557548	557553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953468
10051	NC_008319	CTG	2	6	557691	557696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954975
10052	NC_008319	TTC	2	6	557795	557800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954975
10053	NC_008319	ATA	2	6	557810	557815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113954975
10054	NC_008319	TTG	2	6	557927	557932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954975
10055	NC_008319	CTT	2	6	558018	558023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954975
10056	NC_008319	AAC	2	6	558025	558030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113954975
10057	NC_008319	TTTG	2	8	558283	558290	0 %	75 %	25 %	0 %	113954975
10058	NC_008319	TGCA	2	8	558303	558310	25 %	25 %	25 %	25 %	113954975
10059	NC_008319	CTT	2	6	558319	558324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954975
10060	NC_008319	ATGA	2	8	558375	558382	50 %	25 %	25 %	0 %	113954975
10061	NC_008319	TTG	2	6	558898	558903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113955099
10062	NC_008319	ATG	2	6	558920	558925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955099
10063	NC_008319	GGC	2	6	558936	558941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113955099
10064	NC_008319	CCATT	2	10	558955	558964	20 %	40 %	0 %	40 %	113955099
10065	NC_008319	TGAAC	2	10	558980	558989	40 %	20 %	20 %	20 %	113955099
10066	NC_008319	CTTG	2	8	559218	559225	0 %	50 %	25 %	25 %	113954894
10067	NC_008319	CGC	2	6	559271	559276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113954894
10068	NC_008319	TCC	2	6	559280	559285	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113954894
10069	NC_008319	A	7	7	559295	559301	100 %	0 %	0 %	0 %	113954894
10070	NC_008319	A	6	6	559445	559450	100 %	0 %	0 %	0 %	113954894
10071	NC_008319	CTGAT	2	10	559512	559521	20 %	40 %	20 %	20 %	113954894
10072	NC_008319	T	7	7	559563	559569	0 %	100 %	0 %	0 %	113954894
10073	NC_008319	GCTT	2	8	559639	559646	0 %	50 %	25 %	25 %	113954894
10074	NC_008319	TGC	2	6	559730	559735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954894
10075	NC_008319	TCA	2	6	559801	559806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954894
10076	NC_008319	TGC	2	6	559969	559974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953871
10077	NC_008319	CG	3	6	559979	559984	0 %	0 %	50 %	50 %	113953871
10078	NC_008319	TGCCGA	2	12	560023	560034	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	113953871
10079	NC_008319	GCG	2	6	560080	560085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953871
10080	NC_008319	TGG	2	6	560106	560111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953871
10081	NC_008319	GGC	2	6	560139	560144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953871
10082	NC_008319	CGA	2	6	560174	560179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953871
10083	NC_008319	GGT	2	6	560188	560193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953871
10084	NC_008319	TTTGC	2	10	560194	560203	0 %	60 %	20 %	20 %	113953871
10085	NC_008319	AGC	2	6	560259	560264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953871
10086	NC_008319	GCT	2	6	560321	560326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953871
10087	NC_008319	GCT	2	6	560515	560520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953871
10088	NC_008319	GGGTG	2	10	560544	560553	0 %	20 %	80 %	0 %	113953871
10089	NC_008319	CCT	2	6	560678	560683	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113952956
10090	NC_008319	TGA	2	6	560714	560719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113952956
10091	NC_008319	TTTG	2	8	560721	560728	0 %	75 %	25 %	0 %	113952956
10092	NC_008319	GGT	2	6	560736	560741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113952956
10093	NC_008319	GCG	2	6	560778	560783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113952956
10094	NC_008319	G	6	6	560851	560856	0 %	0 %	100 %	0 %	113952956
10095	NC_008319	TGG	2	6	560873	560878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113952956
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10102	NC_008319	GCCT	2	8	561054	561061	0 %	25 %	25 %	50 %	113952956
10103	NC_008319	GGT	2	6	561115	561120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113952956
10104	NC_008319	GCC	2	6	561145	561150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113952956
10105	NC_008319	GTG	2	6	561151	561156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113952956
10106	NC_008319	TGT	3	9	561213	561221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113952956
10107	NC_008319	TTG	2	6	561226	561231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113952956
10108	NC_008319	TGC	2	6	561299	561304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952861
10109	NC_008319	TGG	2	6	561337	561342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113952861
10110	NC_008319	GCAA	2	8	561365	561372	50 %	0 %	25 %	25 %	113952861
10111	NC_008319	TGCC	2	8	561391	561398	0 %	25 %	25 %	50 %	113952861
10112	NC_008319	CGGC	2	8	561415	561422	0 %	0 %	50 %	50 %	113952861
10113	NC_008319	CAGC	2	8	561427	561434	25 %	0 %	25 %	50 %	113952861
10114	NC_008319	GCA	2	6	561625	561630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952861
10115	NC_008319	C	6	6	561643	561648	0 %	0 %	0 %	100 %	113952861
10116	NC_008319	GTC	2	6	561649	561654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952861
10117	NC_008319	GA	3	6	561692	561697	50 %	0 %	50 %	0 %	113952861
10118	NC_008319	CAG	2	6	561716	561721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952861
10119	NC_008319	CTG	2	6	561798	561803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952861
10120	NC_008319	CAG	2	6	561823	561828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952861
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10122	NC_008319	GCA	3	9	561873	561881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952861
10123	NC_008319	CCAG	2	8	561997	562004	25 %	0 %	25 %	50 %	113952861
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10125	NC_008319	GCATCA	2	12	562152	562163	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	113952861
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10227	NC_008319	AGGG	2	8	567986	567993	25 %	0 %	75 %	0 %	113954743
10228	NC_008319	CTG	2	6	568060	568065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954743
10229	NC_008319	GAGCG	2	10	568145	568154	20 %	0 %	60 %	20 %	113953798
10230	NC_008319	GAAG	2	8	568207	568214	50 %	0 %	50 %	0 %	113953798
10231	NC_008319	CAT	2	6	568315	568320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953798
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10233	NC_008319	GCT	2	6	568357	568362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953798
10234	NC_008319	AGC	2	6	568379	568384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953798
10235	NC_008319	CAG	2	6	568415	568420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952848
10236	NC_008319	CTG	2	6	568488	568493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952848
10237	NC_008319	GCC	2	6	568536	568541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113952848
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10479	NC_008319	CTG	2	6	585300	585305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953056
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10482	NC_008319	GCA	2	6	585359	585364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953056
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