MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9311

Total Repeats: 44579

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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9502	NC_008319	TTGC	2	8	521362	521369	0 %	50 %	25 %	25 %	113954257
9503	NC_008319	CTT	2	6	521390	521395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954257
9504	NC_008319	TTG	2	6	521777	521782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953248
9505	NC_008319	CCA	2	6	521829	521834	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953248
9506	NC_008319	CAC	2	6	521913	521918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953248
9507	NC_008319	AAG	2	6	521955	521960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113953248
9508	NC_008319	CGG	2	6	521972	521977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953248
9509	NC_008319	CTG	2	6	521981	521986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953248
9510	NC_008319	CGA	2	6	522076	522081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953458
9511	NC_008319	CCA	2	6	522170	522175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953458
9512	NC_008319	ACG	2	6	522189	522194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953458
9513	NC_008319	TCA	2	6	522323	522328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953458
9514	NC_008319	AGA	2	6	522333	522338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113953566
9515	NC_008319	GCG	2	6	522355	522360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953566
9516	NC_008319	GGC	2	6	522426	522431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953566
9517	NC_008319	GCT	2	6	522455	522460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953566
9518	NC_008319	CAT	2	6	522570	522575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953566
9519	NC_008319	CAGC	2	8	522579	522586	25 %	0 %	25 %	50 %	113953566
9520	NC_008319	CAT	2	6	522601	522606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953566
9521	NC_008319	CTG	2	6	522693	522698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953566
9522	NC_008319	GTG	2	6	522710	522715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953566
9523	NC_008319	GCA	2	6	522879	522884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953566
9524	NC_008319	CTTG	2	8	522900	522907	0 %	50 %	25 %	25 %	113953566
9525	NC_008319	AAC	2	6	523030	523035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953566
9526	NC_008319	C	6	6	523100	523105	0 %	0 %	0 %	100 %	113953566
9527	NC_008319	GAAA	2	8	523202	523209	75 %	0 %	25 %	0 %	113952750
9528	NC_008319	CAG	2	6	523240	523245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952750
9529	NC_008319	TC	3	6	523258	523263	0 %	50 %	0 %	50 %	113952750
9530	NC_008319	TCC	2	6	523281	523286	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113952750
9531	NC_008319	CGGA	2	8	523352	523359	25 %	0 %	50 %	25 %	113952750
9532	NC_008319	CCT	2	6	523446	523451	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113952750
9533	NC_008319	TGA	2	6	523497	523502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113952750
9534	NC_008319	CTG	2	6	523562	523567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952750
9535	NC_008319	TTC	2	6	523568	523573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113952750
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9537	NC_008319	TGAGC	2	10	523612	523621	20 %	20 %	40 %	20 %	113952750
9538	NC_008319	TGG	2	6	523831	523836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113952750
9539	NC_008319	CAGC	2	8	523982	523989	25 %	0 %	25 %	50 %	113955589
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9541	NC_008319	TTG	2	6	524105	524110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113955589
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9544	NC_008319	AGCG	2	8	524264	524271	25 %	0 %	50 %	25 %	113955589
9545	NC_008319	CAA	2	6	524297	524302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113955589
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9550	NC_008319	TGC	2	6	524582	524587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955589
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9552	NC_008319	GCA	2	6	524644	524649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955589
9553	NC_008319	GCT	2	6	524678	524683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955589
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9555	NC_008319	GTG	2	6	524825	524830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955589
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9558	NC_008319	AG	3	6	524985	524990	50 %	0 %	50 %	0 %	113955589
9559	NC_008319	CTG	2	6	525106	525111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955589
9560	NC_008319	GTC	2	6	525113	525118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955589
9561	NC_008319	GCC	2	6	525134	525139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113955589
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9564	NC_008319	TCGA	2	8	525235	525242	25 %	25 %	25 %	25 %	113954783
9565	NC_008319	AGC	2	6	525467	525472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954783
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9587	NC_008319	TGA	2	6	526758	526763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953318
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9593	NC_008319	CA	3	6	527102	527107	50 %	0 %	0 %	50 %	113953318
9594	NC_008319	TTGC	2	8	527123	527130	0 %	50 %	25 %	25 %	113953318
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9601	NC_008319	GTT	2	6	527536	527541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113955431
9602	NC_008319	CTT	2	6	527551	527556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113955431
9603	NC_008319	CATT	2	8	527603	527610	25 %	50 %	0 %	25 %	113955431
9604	NC_008319	CCG	2	6	527640	527645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113955431
9605	NC_008319	TCT	2	6	527663	527668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113955431
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9612	NC_008319	GTTG	2	8	528001	528008	0 %	50 %	50 %	0 %	113955192
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9616	NC_008319	CCA	2	6	528138	528143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113955192
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9986	NC_008319	T	6	6	553341	553346	0 %	100 %	0 %	0 %	113955414
9987	NC_008319	TGA	2	6	553417	553422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955414
9988	NC_008319	CGA	2	6	553481	553486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955414
9989	NC_008319	CTT	2	6	553499	553504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113955414
9990	NC_008319	CAAA	2	8	553519	553526	75 %	0 %	0 %	25 %	113955414
9991	NC_008319	TGC	2	6	553533	553538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955414
9992	NC_008319	GAT	2	6	553548	553553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955414
9993	NC_008319	AGAT	2	8	553618	553625	50 %	25 %	25 %	0 %	113955414
9994	NC_008319	TTGT	2	8	553646	553653	0 %	75 %	25 %	0 %	113955414
9995	NC_008319	CG	3	6	553667	553672	0 %	0 %	50 %	50 %	113955414
9996	NC_008319	AGG	2	6	553738	553743	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113955414
9997	NC_008319	CTG	2	6	553755	553760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955414
9998	NC_008319	CCATCT	2	12	553985	553996	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	113954567
9999	NC_008319	GCCA	2	8	554096	554103	25 %	0 %	25 %	50 %	113954567
10000	NC_008319	TTC	2	6	554112	554117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954567

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