MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9311

Total Repeats: 44579

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_008319	CCCT	2	8	347754	347761	0 %	25 %	0 %	75 %	113952876
6502	NC_008319	T	7	7	347768	347774	0 %	100 %	0 %	0 %	113952876
6503	NC_008319	GCC	2	6	347775	347780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113952876
6504	NC_008319	ATTG	2	8	347803	347810	25 %	50 %	25 %	0 %	113952876
6505	NC_008319	GCT	2	6	347811	347816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952876
6506	NC_008319	TATGTG	2	12	347963	347974	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	113952876
6507	NC_008319	CCA	2	6	347986	347991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113952876
6508	NC_008319	GAAT	2	8	348154	348161	50 %	25 %	25 %	0 %	113952876
6509	NC_008319	ACC	2	6	348209	348214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113952876
6510	NC_008319	TC	3	6	348228	348233	0 %	50 %	0 %	50 %	113952876
6511	NC_008319	GAC	2	6	348406	348411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954497
6512	NC_008319	TTCG	2	8	348443	348450	0 %	50 %	25 %	25 %	113954497
6513	NC_008319	T	6	6	348511	348516	0 %	100 %	0 %	0 %	113954497
6514	NC_008319	GCACGC	2	12	348524	348535	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	113954497
6515	NC_008319	GCA	2	6	348536	348541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954497
6516	NC_008319	GCC	2	6	348553	348558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113954497
6517	NC_008319	CAG	2	6	348597	348602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954497
6518	NC_008319	GC	3	6	348637	348642	0 %	0 %	50 %	50 %	113954497
6519	NC_008319	CCAG	2	8	348782	348789	25 %	0 %	25 %	50 %	113954497
6520	NC_008319	TTG	2	6	348875	348880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954497
6521	NC_008319	GTG	2	6	348886	348891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954497
6522	NC_008319	GCC	2	6	348960	348965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113954497
6523	NC_008319	T	6	6	348993	348998	0 %	100 %	0 %	0 %	113954497
6524	NC_008319	CTGT	2	8	349077	349084	0 %	50 %	25 %	25 %	113954497
6525	NC_008319	TGA	2	6	349100	349105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954497
6526	NC_008319	TCCA	2	8	349226	349233	25 %	25 %	0 %	50 %	113954497
6527	NC_008319	GAC	2	6	349276	349281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954497
6528	NC_008319	GTC	2	6	349377	349382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954497
6529	NC_008319	GTA	2	6	349431	349436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955113
6530	NC_008319	GCT	2	6	349444	349449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955113
6531	NC_008319	AGC	2	6	349555	349560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955113
6532	NC_008319	TGA	2	6	349563	349568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955113
6533	NC_008319	TGC	2	6	349573	349578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955113
6534	NC_008319	GCG	2	6	349651	349656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113955113
6535	NC_008319	CA	3	6	349660	349665	50 %	0 %	0 %	50 %	113955113
6536	NC_008319	CAG	2	6	349712	349717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955113
6537	NC_008319	TGC	2	6	349739	349744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955113
6538	NC_008319	CGA	2	6	349808	349813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955113
6539	NC_008319	CCGC	2	8	349816	349823	0 %	0 %	25 %	75 %	113955113
6540	NC_008319	ACC	2	6	349897	349902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113955113
6541	NC_008319	CAA	2	6	349940	349945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113955113
6542	NC_008319	ATCG	2	8	349974	349981	25 %	25 %	25 %	25 %	113955113
6543	NC_008319	TTGT	2	8	350051	350058	0 %	75 %	25 %	0 %	113955113
6544	NC_008319	ATCG	2	8	350195	350202	25 %	25 %	25 %	25 %	113955113
6545	NC_008319	GAT	2	6	350217	350222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955113
6546	NC_008319	ATC	2	6	350229	350234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113955113
6547	NC_008319	C	6	6	350316	350321	0 %	0 %	0 %	100 %	113955113
6548	NC_008319	CAC	2	6	350331	350336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113955113
6549	NC_008319	GCG	2	6	350403	350408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113955113
6550	NC_008319	TTC	2	6	350463	350468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113955113
6551	NC_008319	TGC	2	6	350483	350488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955113
6552	NC_008319	T	6	6	350528	350533	0 %	100 %	0 %	0 %	113955113
6553	NC_008319	CTT	2	6	350553	350558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113955113
6554	NC_008319	CAG	2	6	350583	350588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955113
6555	NC_008319	GCT	2	6	350603	350608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955113
6556	NC_008319	CTA	2	6	350651	350656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113955113
6557	NC_008319	AAG	2	6	350676	350681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113955113
6558	NC_008319	ATCA	2	8	350709	350716	50 %	25 %	0 %	25 %	113955113
6559	NC_008319	CTGC	2	8	350732	350739	0 %	25 %	25 %	50 %	113955113
6560	NC_008319	CAC	2	6	350787	350792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113955113
6561	NC_008319	TTC	2	6	350814	350819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113955113
6562	NC_008319	GAAA	2	8	350837	350844	75 %	0 %	25 %	0 %	113955113
6563	NC_008319	CAG	2	6	350849	350854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955113
6564	NC_008319	AAG	2	6	351171	351176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113954749
6565	NC_008319	GAT	2	6	351483	351488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955576
6566	NC_008319	TAG	2	6	351497	351502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955576
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6569	NC_008319	GCCCA	2	10	351718	351727	20 %	0 %	20 %	60 %	113954734
6570	NC_008319	TGA	2	6	351753	351758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954734
6571	NC_008319	AGTG	2	8	351834	351841	25 %	25 %	50 %	0 %	113954734
6572	NC_008319	CGC	2	6	352110	352115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113953935
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6574	NC_008319	GT	3	6	352163	352168	0 %	50 %	50 %	0 %	113953935
6575	NC_008319	GTT	2	6	352183	352188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953935
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6578	NC_008319	ATTG	2	8	352270	352277	25 %	50 %	25 %	0 %	113953935
6579	NC_008319	TCC	2	6	352295	352300	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113953935
6580	NC_008319	CGAT	2	8	352306	352313	25 %	25 %	25 %	25 %	113953935
6581	NC_008319	ACA	2	6	352372	352377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953935
6582	NC_008319	GTTGA	2	10	352754	352763	20 %	40 %	40 %	0 %	113953154
6583	NC_008319	TGC	2	6	352816	352821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953154
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6585	NC_008319	CTG	3	9	352860	352868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953154
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6587	NC_008319	ATCC	2	8	352949	352956	25 %	25 %	0 %	50 %	113953154
6588	NC_008319	CTC	3	9	352998	353006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113953154
6589	NC_008319	GTT	2	6	353031	353036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953154
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6591	NC_008319	T	6	6	353275	353280	0 %	100 %	0 %	0 %	113953154
6592	NC_008319	TTG	2	6	353291	353296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953154
6593	NC_008319	GTTG	2	8	353359	353366	0 %	50 %	50 %	0 %	113953154
6594	NC_008319	GTC	2	6	353380	353385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953154
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6598	NC_008319	TTGC	2	8	353660	353667	0 %	50 %	25 %	25 %	113953154
6599	NC_008319	TTGG	2	8	353786	353793	0 %	50 %	50 %	0 %	113953154
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6603	NC_008319	GCA	2	6	353843	353848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953154
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6606	NC_008319	TTCT	2	8	353923	353930	0 %	75 %	0 %	25 %	113953154
6607	NC_008319	GT	3	6	353941	353946	0 %	50 %	50 %	0 %	113953154
6608	NC_008319	GCCGT	2	10	354100	354109	0 %	20 %	40 %	40 %	113953154
6609	NC_008319	T	6	6	354132	354137	0 %	100 %	0 %	0 %	113953154
6610	NC_008319	ATGT	2	8	354185	354192	25 %	50 %	25 %	0 %	113953154
6611	NC_008319	T	6	6	354205	354210	0 %	100 %	0 %	0 %	113953154
6612	NC_008319	TTG	2	6	354322	354327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953154
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6617	NC_008319	T	6	6	354496	354501	0 %	100 %	0 %	0 %	113953154
6618	NC_008319	TGT	2	6	354540	354545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953154
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6620	NC_008319	TTG	2	6	354570	354575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953154
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6623	NC_008319	TGCT	2	8	355052	355059	0 %	50 %	25 %	25 %	113954209
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