MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 5 str. 8401 chromosome

Total Repeats: 75589

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21002	NC_008258	TGA	2	6	1262162	1262167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110805206
21003	NC_008258	CTCG	2	8	1262175	1262182	0 %	25 %	25 %	50 %	110805206
21004	NC_008258	AGT	2	6	1262250	1262255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110805206
21005	NC_008258	GAT	2	6	1262316	1262321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110805206
21006	NC_008258	CCA	2	6	1262341	1262346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110805206
21007	NC_008258	ATT	2	6	1262379	1262384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110805206
21008	NC_008258	TG	3	6	1262694	1262699	0 %	50 %	50 %	0 %	110805207
21009	NC_008258	TGTT	2	8	1262701	1262708	0 %	75 %	25 %	0 %	110805207
21010	NC_008258	GCTG	2	8	1262843	1262850	0 %	25 %	50 %	25 %	110805207
21011	NC_008258	CAG	2	6	1262895	1262900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110805207
21012	NC_008258	TGG	2	6	1262962	1262967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110805207
21013	NC_008258	TGTA	2	8	1262969	1262976	25 %	50 %	25 %	0 %	110805207
21014	NC_008258	TA	3	6	1262994	1262999	50 %	50 %	0 %	0 %	110805207
21015	NC_008258	CATTC	2	10	1263057	1263066	20 %	40 %	0 %	40 %	110805207
21016	NC_008258	GTT	2	6	1263090	1263095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110805207
21017	NC_008258	AG	3	6	1263291	1263296	50 %	0 %	50 %	0 %	110805207
21018	NC_008258	CCA	2	6	1263307	1263312	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110805207
21019	NC_008258	GCC	2	6	1263498	1263503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110805207
21020	NC_008258	GTG	2	6	1263517	1263522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110805207
21021	NC_008258	C	6	6	1263682	1263687	0 %	0 %	0 %	100 %	110805207
21022	NC_008258	ACT	2	6	1263813	1263818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110805207
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21024	NC_008258	CAA	2	6	1263869	1263874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110805207
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21028	NC_008258	GATT	2	8	1264118	1264125	25 %	50 %	25 %	0 %	110805207
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21050	NC_008258	CAT	2	6	1265297	1265302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110805207
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21052	NC_008258	CAG	2	6	1265349	1265354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110805207
21053	NC_008258	G	6	6	1265354	1265359	0 %	0 %	100 %	0 %	110805207
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21116	NC_008258	GCA	2	6	1269403	1269408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110805211
21117	NC_008258	ACC	2	6	1269420	1269425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110805211
21118	NC_008258	GAT	2	6	1269438	1269443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110805211
21119	NC_008258	GACC	2	8	1269458	1269465	25 %	0 %	25 %	50 %	110805211
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21231	NC_008258	GGC	2	6	1275673	1275678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110805216
21232	NC_008258	AAT	2	6	1275693	1275698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110805216
21233	NC_008258	GCGA	2	8	1275742	1275749	25 %	0 %	50 %	25 %	110805217
21234	NC_008258	CTG	2	6	1275775	1275780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110805217
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21340	NC_008258	TAGG	2	8	1282401	1282408	25 %	25 %	50 %	0 %	110805223
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21342	NC_008258	ATAAAG	2	12	1282732	1282743	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	110805224
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21346	NC_008258	GAT	3	9	1282827	1282835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110805224
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21354	NC_008258	TGA	2	6	1283139	1283144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110805225
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21462	NC_008258	TTC	2	6	1289513	1289518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110805230
21463	NC_008258	GCTGG	2	10	1289546	1289555	0 %	20 %	60 %	20 %	110805230
21464	NC_008258	GAT	2	6	1289575	1289580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110805230
21465	NC_008258	CGGCA	2	10	1289665	1289674	20 %	0 %	40 %	40 %	110805230
21466	NC_008258	GCG	2	6	1289675	1289680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110805230
21467	NC_008258	TGG	2	6	1289710	1289715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110805230
21468	NC_008258	CTT	2	6	1289716	1289721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110805230
21469	NC_008258	A	6	6	1289846	1289851	100 %	0 %	0 %	0 %	110805230
21470	NC_008258	GGAT	2	8	1290345	1290352	25 %	25 %	50 %	0 %	110805231
21471	NC_008258	GCA	2	6	1290366	1290371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110805231
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21473	NC_008258	CG	3	6	1290527	1290532	0 %	0 %	50 %	50 %	110805231
21474	NC_008258	GAT	2	6	1290582	1290587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110805231
21475	NC_008258	TGA	2	6	1290599	1290604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110805231
21476	NC_008258	GTTC	2	8	1290721	1290728	0 %	50 %	25 %	25 %	110805231
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21481	NC_008258	CCT	2	6	1290919	1290924	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110805231
21482	NC_008258	CTG	2	6	1290968	1290973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110805231
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21486	NC_008258	TGC	2	6	1291187	1291192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110805231
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21489	NC_008258	TGC	2	6	1291310	1291315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110805231
21490	NC_008258	GC	3	6	1291314	1291319	0 %	0 %	50 %	50 %	110805231
21491	NC_008258	AGC	2	6	1291457	1291462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110805231
21492	NC_008258	GAA	2	6	1291480	1291485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110805231
21493	NC_008258	CTG	2	6	1291504	1291509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110805231
21494	NC_008258	TGG	2	6	1291551	1291556	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110805231
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21496	NC_008258	TGC	3	9	1291598	1291606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110805231
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