MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 5 str. 8401 chromosome

Total Repeats: 75589

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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20502	NC_008258	CAA	3	9	1232747	1232755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110805183
20503	NC_008258	CAC	2	6	1232781	1232786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110805183
20504	NC_008258	AAAT	2	8	1232822	1232829	75 %	25 %	0 %	0 %	110805183
20505	NC_008258	T	6	6	1232894	1232899	0 %	100 %	0 %	0 %	110805184
20506	NC_008258	CAC	2	6	1232921	1232926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110805184
20507	NC_008258	AGC	2	6	1232964	1232969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110805184
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20509	NC_008258	GCA	2	6	1233231	1233236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110805184
20510	NC_008258	CGA	2	6	1233626	1233631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110805185
20511	NC_008258	AG	3	6	1233681	1233686	50 %	0 %	50 %	0 %	110805185
20512	NC_008258	CAG	2	6	1233714	1233719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110805185
20513	NC_008258	CAG	2	6	1233792	1233797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110805185
20514	NC_008258	CAG	2	6	1233894	1233899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110805185
20515	NC_008258	AAT	2	6	1233960	1233965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110805185
20516	NC_008258	GTT	2	6	1233977	1233982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110805185
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20518	NC_008258	AAT	2	6	1234104	1234109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110805185
20519	NC_008258	CCAG	2	8	1234163	1234170	25 %	0 %	25 %	50 %	110805185
20520	NC_008258	AAT	2	6	1234176	1234181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110805185
20521	NC_008258	TGG	2	6	1234222	1234227	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110805185
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20529	NC_008258	GAT	2	6	1234592	1234597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110805185
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20534	NC_008258	CAG	2	6	1234701	1234706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110805185
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20540	NC_008258	CGA	2	6	1234964	1234969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110805185
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20542	NC_008258	ATG	2	6	1235011	1235016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110805185
20543	NC_008258	A	6	6	1235050	1235055	100 %	0 %	0 %	0 %	110805185
20544	NC_008258	GC	3	6	1235066	1235071	0 %	0 %	50 %	50 %	110805185
20545	NC_008258	ATG	2	6	1235089	1235094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110805185
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20549	NC_008258	AATT	2	8	1235426	1235433	50 %	50 %	0 %	0 %	110805186
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20551	NC_008258	CGA	2	6	1235513	1235518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110805186
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20553	NC_008258	ACA	2	6	1235747	1235752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110805186
20554	NC_008258	GTC	2	6	1235837	1235842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110805186
20555	NC_008258	GC	3	6	1235863	1235868	0 %	0 %	50 %	50 %	110805186
20556	NC_008258	GC	3	6	1235918	1235923	0 %	0 %	50 %	50 %	110805186
20557	NC_008258	TGC	2	6	1236126	1236131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110805187
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20562	NC_008258	CGA	2	6	1236322	1236327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110805187
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20585	NC_008258	ATCG	2	8	1237600	1237607	25 %	25 %	25 %	25 %	110805187
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20601	NC_008258	CGT	2	6	1238922	1238927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110805188
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20607	NC_008258	GCCGC	2	10	1239321	1239330	0 %	0 %	40 %	60 %	110805189
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