MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 5 str. 8401 chromosome

Total Repeats: 75589

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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20002	NC_008258	GGA	2	6	1198286	1198291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	110805144
20003	NC_008258	TGA	2	6	1198303	1198308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110805144
20004	NC_008258	GCG	2	6	1198312	1198317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110805144
20005	NC_008258	GCAG	2	8	1198386	1198393	25 %	0 %	50 %	25 %	110805144
20006	NC_008258	AGCC	2	8	1198435	1198442	25 %	0 %	25 %	50 %	110805144
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20011	NC_008258	CAT	2	6	1199223	1199228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110805145
20012	NC_008258	TG	3	6	1199237	1199242	0 %	50 %	50 %	0 %	110805145
20013	NC_008258	A	7	7	1199324	1199330	100 %	0 %	0 %	0 %	110805145
20014	NC_008258	A	6	6	1199358	1199363	100 %	0 %	0 %	0 %	110805145
20015	NC_008258	TGG	2	6	1199448	1199453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110805146
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20116	NC_008258	CGT	2	6	1207082	1207087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110805154
20117	NC_008258	A	6	6	1207128	1207133	100 %	0 %	0 %	0 %	110805154
20118	NC_008258	GCG	2	6	1207161	1207166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110805154
20119	NC_008258	GAA	2	6	1207245	1207250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110805154
20120	NC_008258	CCG	2	6	1207308	1207313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110805155
20121	NC_008258	CAGC	2	8	1207326	1207333	25 %	0 %	25 %	50 %	110805155
20122	NC_008258	GTT	2	6	1207390	1207395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110805155
20123	NC_008258	ATG	2	6	1207430	1207435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110805155
20124	NC_008258	CGC	2	6	1207486	1207491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110805155
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20127	NC_008258	CGG	2	6	1207552	1207557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110805155
20128	NC_008258	T	6	6	1207916	1207921	0 %	100 %	0 %	0 %	110805156
20129	NC_008258	ATC	2	6	1207996	1208001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110805156
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20132	NC_008258	CGA	2	6	1208434	1208439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110805157
20133	NC_008258	GCTT	2	8	1208545	1208552	0 %	50 %	25 %	25 %	110805157
20134	NC_008258	CAT	2	6	1208569	1208574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110805157
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20140	NC_008258	GCA	2	6	1208959	1208964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110805157
20141	NC_008258	CGT	2	6	1209005	1209010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110805157
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20143	NC_008258	CTT	2	6	1209136	1209141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110805157
20144	NC_008258	CCA	2	6	1209170	1209175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110805157
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20147	NC_008258	CAG	2	6	1209206	1209211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110805157
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20218	NC_008258	GACA	2	8	1212960	1212967	50 %	0 %	25 %	25 %	110805161
20219	NC_008258	TGT	2	6	1213007	1213012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110805161
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20223	NC_008258	T	6	6	1213236	1213241	0 %	100 %	0 %	0 %	110805161
20224	NC_008258	GACCA	2	10	1213251	1213260	40 %	0 %	20 %	40 %	110805161
20225	NC_008258	GCA	2	6	1213388	1213393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110805161
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20227	NC_008258	ACGT	2	8	1213422	1213429	25 %	25 %	25 %	25 %	110805161
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20230	NC_008258	GCA	2	6	1213588	1213593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110805161
20231	NC_008258	CCGCTG	2	12	1213655	1213666	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	110805161
20232	NC_008258	CGT	2	6	1213682	1213687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110805161
20233	NC_008258	CTT	2	6	1213688	1213693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110805161
20234	NC_008258	TTC	2	6	1213699	1213704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110805161
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20247	NC_008258	GC	3	6	1214149	1214154	0 %	0 %	50 %	50 %	110805162
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20349	NC_008258	T	7	7	1220757	1220763	0 %	100 %	0 %	0 %	110805169
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20352	NC_008258	CTA	2	6	1221341	1221346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110805170
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20463	NC_008258	TG	3	6	1229281	1229286	0 %	50 %	50 %	0 %	162139346
20464	NC_008258	GATG	2	8	1229318	1229325	25 %	25 %	50 %	0 %	162139346
20465	NC_008258	CGA	2	6	1229333	1229338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162139346
20466	NC_008258	CGT	2	6	1229406	1229411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162139346
20467	NC_008258	ATTAA	2	10	1229433	1229442	60 %	40 %	0 %	0 %	162139346
20468	NC_008258	TACT	2	8	1229536	1229543	25 %	50 %	0 %	25 %	162139346
20469	NC_008258	TAAA	2	8	1229635	1229642	75 %	25 %	0 %	0 %	162139346
20470	NC_008258	TGT	2	6	1231141	1231146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110805182
20471	NC_008258	GCA	2	6	1231227	1231232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110805182
20472	NC_008258	ACTT	2	8	1231290	1231297	25 %	50 %	0 %	25 %	110805182
20473	NC_008258	GTG	2	6	1231309	1231314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110805182
20474	NC_008258	TGAT	2	8	1231321	1231328	25 %	50 %	25 %	0 %	110805182
20475	NC_008258	GCCA	2	8	1231377	1231384	25 %	0 %	25 %	50 %	110805182
20476	NC_008258	GCT	2	6	1231401	1231406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110805182
20477	NC_008258	A	6	6	1231428	1231433	100 %	0 %	0 %	0 %	110805182
20478	NC_008258	TGGTG	2	10	1231523	1231532	0 %	40 %	60 %	0 %	110805182
20479	NC_008258	CGT	2	6	1231538	1231543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110805182
20480	NC_008258	GGT	2	6	1231636	1231641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110805183
20481	NC_008258	AAT	2	6	1231652	1231657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110805183
20482	NC_008258	CAAA	2	8	1231726	1231733	75 %	0 %	0 %	25 %	110805183
20483	NC_008258	TCG	2	6	1231744	1231749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110805183
20484	NC_008258	TGTGG	2	10	1231751	1231760	0 %	40 %	60 %	0 %	110805183
20485	NC_008258	AGC	2	6	1231769	1231774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110805183
20486	NC_008258	GAA	2	6	1231823	1231828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110805183
20487	NC_008258	TGA	2	6	1231858	1231863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110805183
20488	NC_008258	CTGA	2	8	1231904	1231911	25 %	25 %	25 %	25 %	110805183
20489	NC_008258	A	7	7	1232017	1232023	100 %	0 %	0 %	0 %	110805183
20490	NC_008258	GGGTG	2	10	1232038	1232047	0 %	20 %	80 %	0 %	110805183
20491	NC_008258	CGG	2	6	1232123	1232128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110805183
20492	NC_008258	A	6	6	1232135	1232140	100 %	0 %	0 %	0 %	110805183
20493	NC_008258	GCG	2	6	1232247	1232252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110805183
20494	NC_008258	CGA	2	6	1232283	1232288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110805183
20495	NC_008258	GCG	2	6	1232378	1232383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110805183
20496	NC_008258	TTA	2	6	1232430	1232435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110805183
20497	NC_008258	TTA	2	6	1232464	1232469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110805183
20498	NC_008258	CTG	2	6	1232492	1232497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110805183
20499	NC_008258	CAG	2	6	1232512	1232517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110805183
20500	NC_008258	GCT	2	6	1232531	1232536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110805183

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