MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 5 str. 8401 chromosome

Total Repeats: 75589

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19501	NC_008258	GATTGT	2	12	1171910	1171921	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	110805123
19502	NC_008258	CGG	3	9	1171922	1171930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110805123
19503	NC_008258	TGG	2	6	1171934	1171939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110805123
19504	NC_008258	A	6	6	1171983	1171988	100 %	0 %	0 %	0 %	110805123
19505	NC_008258	CTG	2	6	1172037	1172042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110805123
19506	NC_008258	TGA	2	6	1172066	1172071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110805123
19507	NC_008258	GC	3	6	1172103	1172108	0 %	0 %	50 %	50 %	110805123
19508	NC_008258	TCCAGT	2	12	1172119	1172130	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	110805123
19509	NC_008258	ATTGAT	2	12	1172142	1172153	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	110805123
19510	NC_008258	CGA	2	6	1172189	1172194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110805123
19511	NC_008258	CCA	2	6	1172339	1172344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110805123
19512	NC_008258	CGG	3	9	1172417	1172425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110805123
19513	NC_008258	CTG	2	6	1172575	1172580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110805123
19514	NC_008258	TGA	2	6	1172645	1172650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110805123
19515	NC_008258	GGC	2	6	1172652	1172657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110805123
19516	NC_008258	AT	3	6	1172678	1172683	50 %	50 %	0 %	0 %	110805123
19517	NC_008258	CTGAT	2	10	1172689	1172698	20 %	40 %	20 %	20 %	110805123
19518	NC_008258	GGT	2	6	1172745	1172750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110805123
19519	NC_008258	TGG	3	9	1172776	1172784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110805123
19520	NC_008258	CCG	2	6	1172871	1172876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110805123
19521	NC_008258	AAC	2	6	1172916	1172921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110805123
19522	NC_008258	CG	3	6	1173034	1173039	0 %	0 %	50 %	50 %	110805123
19523	NC_008258	ATG	2	6	1173045	1173050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110805123
19524	NC_008258	GC	3	6	1173066	1173071	0 %	0 %	50 %	50 %	110805123
19525	NC_008258	TA	3	6	1173076	1173081	50 %	50 %	0 %	0 %	110805123
19526	NC_008258	ATG	2	6	1173138	1173143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110805123
19527	NC_008258	TGG	2	6	1173145	1173150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110805123
19528	NC_008258	TCCG	2	8	1173169	1173176	0 %	25 %	25 %	50 %	110805123
19529	NC_008258	GTT	2	6	1173529	1173534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110805124
19530	NC_008258	TCG	2	6	1173603	1173608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110805124
19531	NC_008258	TGG	2	6	1173660	1173665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110805124
19532	NC_008258	TGG	3	9	1173684	1173692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110805124
19533	NC_008258	TGT	2	6	1173714	1173719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110805124
19534	NC_008258	GTG	2	6	1173731	1173736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110805124
19535	NC_008258	CT	3	6	1173762	1173767	0 %	50 %	0 %	50 %	110805124
19536	NC_008258	A	6	6	1173830	1173835	100 %	0 %	0 %	0 %	110805124
19537	NC_008258	ATG	2	6	1173845	1173850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110805124
19538	NC_008258	CAG	2	6	1173871	1173876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110805124
19539	NC_008258	AAT	2	6	1174121	1174126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110805125
19540	NC_008258	GTCAC	2	10	1174152	1174161	20 %	20 %	20 %	40 %	110805125
19541	NC_008258	CG	3	6	1174180	1174185	0 %	0 %	50 %	50 %	110805125
19542	NC_008258	CTG	2	6	1174205	1174210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110805125
19543	NC_008258	GTG	2	6	1174281	1174286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110805125
19544	NC_008258	GTT	2	6	1174289	1174294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110805125
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19546	NC_008258	GCA	2	6	1174347	1174352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110805125
19547	NC_008258	CAGC	2	8	1174360	1174367	25 %	0 %	25 %	50 %	110805125
19548	NC_008258	CGAT	2	8	1174425	1174432	25 %	25 %	25 %	25 %	110805125
19549	NC_008258	TTG	2	6	1174467	1174472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110805125
19550	NC_008258	CGA	2	6	1174516	1174521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110805125
19551	NC_008258	GGC	2	6	1174609	1174614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110805125
19552	NC_008258	T	8	8	1174621	1174628	0 %	100 %	0 %	0 %	110805125
19553	NC_008258	ATG	2	6	1174653	1174658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110805125
19554	NC_008258	TGAA	2	8	1174678	1174685	50 %	25 %	25 %	0 %	110805125
19555	NC_008258	TTA	2	6	1174689	1174694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110805125
19556	NC_008258	AAT	2	6	1174699	1174704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110805125
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19559	NC_008258	CAG	2	6	1175132	1175137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110805126
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19561	NC_008258	CGG	2	6	1175262	1175267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110805127
19562	NC_008258	CATC	2	8	1175293	1175300	25 %	25 %	0 %	50 %	110805127
19563	NC_008258	TGC	2	6	1175330	1175335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110805127
19564	NC_008258	ATTGC	2	10	1175347	1175356	20 %	40 %	20 %	20 %	110805127
19565	NC_008258	GCA	2	6	1175374	1175379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110805127
19566	NC_008258	TCA	2	6	1175391	1175396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110805127
19567	NC_008258	TCT	2	6	1175398	1175403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110805127
19568	NC_008258	TGA	2	6	1175473	1175478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110805127
19569	NC_008258	CGC	2	6	1175608	1175613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110805127
19570	NC_008258	GCC	2	6	1175619	1175624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110805127
19571	NC_008258	ATG	2	6	1175636	1175641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110805127
19572	NC_008258	GGT	2	6	1175762	1175767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110805127
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19574	NC_008258	CGG	2	6	1175843	1175848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110805127
19575	NC_008258	GTA	2	6	1175849	1175854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110805127
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19577	NC_008258	CG	4	8	1175945	1175952	0 %	0 %	50 %	50 %	110805127
19578	NC_008258	T	6	6	1176011	1176016	0 %	100 %	0 %	0 %	110805127
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19583	NC_008258	AGCGCC	2	12	1176126	1176137	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	110805127
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19588	NC_008258	TGC	2	6	1176457	1176462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110805128
19589	NC_008258	GCA	2	6	1176473	1176478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110805128
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19598	NC_008258	GCG	2	6	1177034	1177039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110805128
19599	NC_008258	CAG	2	6	1177041	1177046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110805128
19600	NC_008258	TGA	2	6	1177060	1177065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110805128
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19602	NC_008258	TGA	2	6	1177207	1177212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110805128
19603	NC_008258	TCAT	2	8	1177219	1177226	25 %	50 %	0 %	25 %	110805128
19604	NC_008258	TCGCGC	2	12	1177240	1177251	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	110805128
19605	NC_008258	CGG	2	6	1177307	1177312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110805128
19606	NC_008258	CAT	2	6	1177331	1177336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110805128
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19611	NC_008258	GGGC	2	8	1177442	1177449	0 %	0 %	75 %	25 %	110805128
19612	NC_008258	CG	3	6	1177545	1177550	0 %	0 %	50 %	50 %	110805128
19613	NC_008258	TTC	2	6	1177593	1177598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110805128
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19615	NC_008258	GCA	2	6	1177643	1177648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110805128
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