MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 5 str. 8401 chromosome

Total Repeats: 75589

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19002	NC_008258	TTC	2	6	1142389	1142394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110805097
19003	NC_008258	GTT	2	6	1142428	1142433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110805097
19004	NC_008258	GGC	2	6	1142498	1142503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110805097
19005	NC_008258	CCAG	2	8	1142595	1142602	25 %	0 %	25 %	50 %	110805097
19006	NC_008258	ACG	2	6	1142637	1142642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110805097
19007	NC_008258	GCA	2	6	1142659	1142664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110805097
19008	NC_008258	CGTG	2	8	1142686	1142693	0 %	25 %	50 %	25 %	110805097
19009	NC_008258	AGT	2	6	1142824	1142829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110805097
19010	NC_008258	GGT	2	6	1142851	1142856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110805097
19011	NC_008258	TC	3	6	1142905	1142910	0 %	50 %	0 %	50 %	110805097
19012	NC_008258	CAGC	2	8	1142938	1142945	25 %	0 %	25 %	50 %	110805097
19013	NC_008258	TGG	3	9	1142959	1142967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110805097
19014	NC_008258	TGT	2	6	1142974	1142979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110805097
19015	NC_008258	GCG	2	6	1143012	1143017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110805097
19016	NC_008258	GTG	2	6	1143059	1143064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110805097
19017	NC_008258	CAAT	2	8	1143116	1143123	50 %	25 %	0 %	25 %	110805097
19018	NC_008258	ATC	2	6	1143158	1143163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110805097
19019	NC_008258	TGA	2	6	1143164	1143169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110805097
19020	NC_008258	ACT	2	6	1143183	1143188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162139349
19021	NC_008258	AGCG	2	8	1143237	1143244	25 %	0 %	50 %	25 %	162139349
19022	NC_008258	CGG	2	6	1143251	1143256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162139349
19023	NC_008258	TCCG	2	8	1143263	1143270	0 %	25 %	25 %	50 %	162139349
19024	NC_008258	GAT	2	6	1143303	1143308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162139349
19025	NC_008258	CAG	2	6	1143351	1143356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162139349
19026	NC_008258	GTAT	2	8	1143380	1143387	25 %	50 %	25 %	0 %	162139349
19027	NC_008258	CGG	2	6	1143413	1143418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162139349
19028	NC_008258	GAT	2	6	1143441	1143446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162139349
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19032	NC_008258	GAT	2	6	1143589	1143594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162139349
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19034	NC_008258	CAT	2	6	1143676	1143681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162139349
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19042	NC_008258	GAT	2	6	1145844	1145849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110805099
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19052	NC_008258	CG	3	6	1146565	1146570	0 %	0 %	50 %	50 %	110805099
19053	NC_008258	GCA	2	6	1146642	1146647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110805099
19054	NC_008258	CAT	2	6	1146696	1146701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110805099
19055	NC_008258	GCA	2	6	1146702	1146707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110805099
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19058	NC_008258	ATG	2	6	1147015	1147020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110805100
19059	NC_008258	ACC	2	6	1147033	1147038	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110805100
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19100	NC_008258	CTT	2	6	1148400	1148405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110805100
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19113	NC_008258	AG	3	6	1148896	1148901	50 %	0 %	50 %	0 %	110805100
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19115	NC_008258	GTACCG	2	12	1148927	1148938	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	110805100
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19231	NC_008258	GAT	2	6	1155936	1155941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110805106
19232	NC_008258	GAA	2	6	1155963	1155968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110805106
19233	NC_008258	AGGTC	2	10	1155977	1155986	20 %	20 %	40 %	20 %	110805106
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19236	NC_008258	GCT	2	6	1156074	1156079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110805106
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19251	NC_008258	GCG	2	6	1156920	1156925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110805107
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19335	NC_008258	CAA	2	6	1161704	1161709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110805113
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19347	NC_008258	GATG	2	8	1162309	1162316	25 %	25 %	50 %	0 %	110805113
19348	NC_008258	CAT	2	6	1162328	1162333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110805113
19349	NC_008258	TGTC	2	8	1162455	1162462	0 %	50 %	25 %	25 %	110805113
19350	NC_008258	TCA	2	6	1162485	1162490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110805113
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19352	NC_008258	CAT	2	6	1162565	1162570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110805114
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19462	NC_008258	GCA	2	6	1169067	1169072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110805120
19463	NC_008258	CG	3	6	1169085	1169090	0 %	0 %	50 %	50 %	110805120
19464	NC_008258	ACG	2	6	1169132	1169137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110805120
19465	NC_008258	TGT	2	6	1169194	1169199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110805120
19466	NC_008258	TAT	2	6	1169387	1169392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110805120
19467	NC_008258	CAA	2	6	1169399	1169404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110805120
19468	NC_008258	TGGC	2	8	1169413	1169420	0 %	25 %	50 %	25 %	110805120
19469	NC_008258	GCA	2	6	1169455	1169460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110805120
19470	NC_008258	CGGCG	2	10	1169469	1169478	0 %	0 %	60 %	40 %	110805120
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19472	NC_008258	GTGG	2	8	1169662	1169669	0 %	25 %	75 %	0 %	110805120
19473	NC_008258	CG	3	6	1169714	1169719	0 %	0 %	50 %	50 %	110805120
19474	NC_008258	GTCAG	2	10	1169745	1169754	20 %	20 %	40 %	20 %	110805120
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19481	NC_008258	G	7	7	1169969	1169975	0 %	0 %	100 %	0 %	110805121
19482	NC_008258	GCA	2	6	1170042	1170047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110805121
19483	NC_008258	ATC	2	6	1170055	1170060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110805121
19484	NC_008258	TGG	3	9	1170061	1170069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110805121
19485	NC_008258	GCA	2	6	1170129	1170134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110805121
19486	NC_008258	TGC	2	6	1170143	1170148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110805121
19487	NC_008258	GGC	2	6	1170168	1170173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110805121
19488	NC_008258	GCG	2	6	1170273	1170278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110805121
19489	NC_008258	CA	3	6	1170415	1170420	50 %	0 %	0 %	50 %	110805121
19490	NC_008258	GGCA	2	8	1170685	1170692	25 %	0 %	50 %	25 %	110805121
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19492	NC_008258	GAT	2	6	1170939	1170944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110805122
19493	NC_008258	GCA	2	6	1171068	1171073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110805122
19494	NC_008258	AAG	2	6	1171082	1171087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110805122
19495	NC_008258	GCG	2	6	1171133	1171138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110805122
19496	NC_008258	GT	3	6	1171281	1171286	0 %	50 %	50 %	0 %	110805122
19497	NC_008258	GAA	2	6	1171302	1171307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110805122
19498	NC_008258	ATG	2	6	1171340	1171345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110805122
19499	NC_008258	CAGC	2	8	1171356	1171363	25 %	0 %	25 %	50 %	110805122
19500	NC_008258	CAT	2	6	1171381	1171386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110805122

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